13 sierpnia 2017
Ta publikacja przedstawia protokół pokazujący, jak mierzyć aktywność rekombinowanej podjednostki katalitycznej fosfatazy białkowej 2A (PP2Ac) w odpowiedzi na rekombinowane białka α-synukleiny, β-synukleiny lub γ-synukleiny za pomocą prostego testu kolorymetrycznego. Pokazujemy wyniki dotyczące swoistości α-synukleiny wobec PP2Ac w mózgu myszy.
Rekombinowane synukleiny alfa, beta i gamma stymulują aktywność podjednostki katalitycznej fosfatazy białkowej 2A w testach bezkomórkowych. Cześć, nazywam się Sovanarak Lek. Jestem studentem medycyny w Texas Tech University Health Sciences Center, El Paso, Paul L.Foster School of Medicine.
W tym filmie zademonstruję dwukierunkowy test metryczny fosfatazy białkowej z użyciem rekombinowanych białek synukleinowych. Przygotowanie i radiantów. Przygotowanie buforu fosforanowego p-nitrofenolu.
Aby przygotować 50 milicali buforu pNPP, rozpuść zasadę Trizma w 25 mililitrach ultraczystej wody dejonizowanej w zlewce. Dodaj czystą mieszadło i umieść na mieszadle magnetycznym. Gdy Trizma się rozpuści, dodać chlorek wapnia, ciągle mieszając.
Dostosuj pH do 7,0. Przenieść roztwór do cylindra z podziałką. Doprowadź końcową całkowitą objętość do 50 milicali za pomocą ultraczystej wody dejonizowanej.
Przygotowanie zielonego roztworu malachitu. Zielony roztwór malachitu wymaga trzech roztworów, części A, B i C. Roztwór A to czteromolowy kwas solny. Roztwór jest połączeniem molibdenianu amonu i roztworu A. Roztwór C to 0,045% soli zielonego szczawianu malachitu.
Aby przygotować roztwór D, wymieszaj jedną część B z trzema częściami C, w stosunku jeden do trzech. Mieszaj godzinę w temperaturze pokojowej. Na koniec przefiltruj roztwór D przez membranę o średnicy 22 mikremów i przechowuj w temperaturze czterech stopni Celsjusza.
Chronić przed światłem. Przygotowanie aktywatora. Aktywator to jednoprocentowe rozwiązanie Tween 20.
Pippette 10 mikrolitrów Tween 20 w 990 mikrolitrach ultraczystej wody dejonizowanej. Wiruj, aż animacja 20 całkowicie się rozpuści. Przygotowanie zieleni malachitowej plus roztwór roboczy Tween 20.
Dodać aktywator do roztworu D w proporcji 1 do 100. Przygotowanie fosfopeptydu treoniny. Aby przygotować roztwór podstawowy o wartości dwóch mM pT, dodaj 550 mikrolitrów ultraczystej wody dejonizowanej do jednego miligrama pT.
Wirować, aż fosfopeptyd całkowicie się rozpuści. Umieść na lodzie do natychmiastowego użycia. Przechowywać dodatkowe porcje pT w temperaturze minus 20 stopni Celsjusza.
Preparat synukleiny. Zawiesić ponownie jeden miligram synukleiny w ultraczystej wodzie dejonizowanej mil o końcowym stężeniu jednego miligrama na promil. Delikatnie wiruj, aby się rozpuścił.
Zużyć natychmiast i przechowywać niewykorzystane podwielokrotności w temperaturze minus 80 stopni Celsjusza. Przygotowanie wzorców fosforanowych. Wzorce fosforanowe krok pierwszy.
Aby przygotować 1 mM roztwór podstawowy fosforanu, rozpuść fosforan potasu w ultraczystej wodzie dejonizowanej w zlewce z mieszadłem. Przenieś do cylindra podziałki i doprowadź końcową objętość do 100 mils. Jest to rozwiązanie o mocy 10 mM.
Przefiltruj cały roztwór przez filtr 22 mikros za pomocą dużej strzykawki. Rozcieńczyć to do 1 do 100, aby uzyskać 1 mM roztwór fosforanu, który ma być stosowany do wzorców testowych. Wzorce fosforanowe krok drugi.
Dodaj odpowiednią ilość fosforanu i ultraczystej wody dejonizowanej do probówek o wielkości 1,5 mililitra zgodnie z tabelą. W ten sposób uzyska się probówki zawierające 150, 300, 600, 1, 200 i 2 400 pmol fosforanu. I przechowuj podwielokrotności w temperaturze minus 20 stopni Celsjusza.
Test aktywności PP2A. Przygotować test PP2A w probówkach o średnicy 1,5 mililitra na lodzie. Dodaj 43 mikrolitry buforu pNPP.
Dodać jeden mikrolitr ludzkiego rekombinowanego PP2Ac. Dodaj synukleinę i inkubuj PP2A plus synukleinę przez 30 minut na nutatorze w temperaturze czterech stopni Celsjusza. Następnie dodaj 16 mikrolitrów 2mM pT.
Inkubować 10 minut w temperaturze 30 stopni Celsjusza w łaźni wodnej. Na 96-dołkowej płytce z płaskim dnem dodaj 25 mikrolitrów każdego wzorca fosforanowego po dwóch od niskiego do wysokiego. Odpipetować 24 mikrolitry każdego testu PP2A w dwóch egzemplarzach na tę samą 96-dołkową płytkę z wzorcami.
Odmierzyć pipetą 75 mikrolitrów roztworu D zawierającego Tween 20 do każdej próbki i wzorca. Po dodaniu MGT zobaczysz zmianę koloru w studzienkach, gdy obecne są wolne fosforany. Analiza fotometryczna.
Analizuj na spektrofotometrze ustawionym na 630 nanometrów. Reprezentatywne wyniki. Tutaj mamy reprezentatywny test PP2A i wykres przedstawiający krzywą standardową.
Po lewej stronie znajdują się wzorce fosforanowe. Im więcej fosforanów zawierają studnie, tym ciemniejszy odcień zieleni. Po prawej stronie mamy PP2A, który był inkubowany z synukleinami alfa, beta lub gamma w różnych stężeniach molowych.
Wyższe stężenia były bardziej skuteczne w stymulowaniu aktywności podjednostki katalitycznej PP2A. Tutaj widzimy graficzne przedstawienie aktywności PP2A w odpowiedzi na różne stężenia alfa synukleiny, beta synukleiny i synukleiny gamma. Alfa synukleina, beta synukleina i gamma synukleina były istotnymi stymulatorami aktywności PP2A w stężeniu od jednego do dwóch mikromolowców.
Tylko alfa synukleina i beta synukleina były istotnymi stymulatorami aktywności PP2A przy stężeniu 0,5 mikromolowym. Rycina trzecia przedstawia interakcję PP2Ac z endogennymi synukleinami w mózgu myszy. W A rekombinowane synukleiny alfa, beta i gamma są pokazane jako kontrole pozytywne.
W B koimmunoprecypitację przeprowadzono przy użyciu przeciwciała swoistego dla PP2Ac 1D6, które obniżyło PP2Ac, a także obniżyło znaczną ilość interaktywującej alfa synukleiny, ale prawie nie beta-synukleiny. Żadna synukleina gamma nie spadła z PP2Ac w koimmunoprecypitacji. Te dane dotyczące koimmunoprecypitacji sugerują, że alfa synukleina jest endogennym modulatorem PP2Ac in vivo.
Chcemy podziękować wszystkim, którzy pomogli nam w realizacji tego filmu. Podsumowując, jest to Ruth Perez. Sonavarak Lek.
Javier Vargas Życzę wielu sukcesów. Do widzenia i powodzenia.
Niniejsza publikacja przedstawia protokół pomiaru aktywności rekombinowanej podjednostki katalitycznej fosfatazy białkowej 2A (PP2Ac) w odpowiedzi na rekombinowane białka α-synukleina, β-synukleina lub γ-synukleina z wykorzystaniem testu kolorymetrycznego. Wyniki wskazują na specyficzność α-synukleiny wobec PP2Ac w mózgu myszy.
Niniejsze badanie wprowadza analizę bezkomórkową do oceny modulacji aktywności PP2Ac przez synukleiny, zapewniając narzędzie mechanistyczne do walidacji celu w badaniach nad chorobami neurodegeneracyjnymi. Wykazując, że wszystkie trzy izoformy synukleiny mogą stymulować PP2Ac in vitro, metoda ta wspiera testowanie hipotez dotyczących zachowanej homologii funkcjonalnej i jej znaczenia dla ograniczania ryzyka w analizie szlaków sygnałowych. Dane z ko-immunoprecypitacji dodatkowo doprecyzowują specyficzność celu, wskazując na α-synukleinę jako endogenny modulator in vivo, co pomaga w ustaleniu priorytetów dla hipotez terapeutycznych i redukuje niejednoznaczność mechanistyczną we wczesnej fazie odkrywania leków.
Test ten wpisuje się w początkowy etap procesu odkrywania leków, wspierając walidację celu oraz identyfikację związków wiodących poprzez dostarczanie ilościowych odczytów opartych na mechanizmie działania, co pozwala na podjęcie decyzji o kontynuacji lub przerwaniu badań przed znacznymi nakładami na optymalizację związków.