Name: Optymalizacja wykorzystania robota do obsługi cieczy w celu przeprowadzenia wysokoprzepustowego badania przesiewowego genetyki chemicznej Arabidopsis thaliana (Wideo) | JoVE Journal
Uploaded: 2018-04-30T13:30:00.000+00:00
Duration: 11 min 58 s
Description: Poznaj metodę wysokoprzepustowego badania przesiewowego genetyki chemicznej Arabidopsis thaliana z wykorzystaniem robota do obsługi cieczy. Ta technika umożliwia szybkie odkrywanie nowych małych cząsteczek wpływających na fizjologię roślin.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Dziękujemy Jozsefowi Storkowi, Mitchelowi Richmondowi, Jarradowi Gollihue i Andrei Sanchez za konstruktywną i krytyczną dyskusję. Dr Sharyn Perry za zdjęcia fenotypowe. Niniejszy materiał oparty jest na pracach wspieranych przez Narodową Fundację Nauki na podstawie umowy o współpracy nr 1355438.

1. Tworzenie biblioteki rozcieńczeń
<ol>
	<li>Oznacz ręcznie płytki 625 Dilution Library, upewniając się, że pasują do odpowiadającej im płytki z biblioteki chemicznej. Dodatkowo podłącz węże zasilające i odpływowe do automatycznego pozycjonera sprzętu laboratoryjnego (ALP) Multichannel Tip Wash (ALP), przepuszczając je przez napęd konsoli do zbiornika o pojemności 5 galonów (patrz tabela materiałów).</li>
	<li>Uzyskaj dostęp do komputera i włącz pompę myjącą poprzez połączenie sterownika urządzenia z wielokanałowym myciem końcówek ALP w celu cyrkulacji wody. Spowoduje to automatyczne wyłączenie po zakończeniu protokołu.</li>
	<li>Załaduj ręcznie Stacker 10 przymocowany do karuzeli Stacker w następującej kolejności w hotelach A - D (Rysunek 4, Stacker); jedno pudełko końcówek do pipet AP96 P20 w pomieszczeniu 1, cztery 96-dołkowe płytki z dnem w kształcie litery V w pomieszczeniach 2 - 5, przy czym dwie górne płytki zawierają stężenia zapasów z zamówionej biblioteki i dwie dolne płytki są puste (Rysunek 5, Wózek widłowy). Dodatkowo załaduj jedno pudełko końcówek do pipet AP96 P20 w pomieszczeniu 6 i cztery 96-dołkowe płytki z dnem w kształcie litery V w pomieszczeniach 7 - 9 z dwiema górnymi płytkami zawierającymi stężenia wyjściowe z zamówionej biblioteki i dwiema dolnymi płytkami pustymi (<silna klasa="xfig">Rysunek 5, Układarka).</li>
	<li>Ustaw ręcznie pokład ze zbiornikiem na wodę o pojemności 300 ml na P3, kąpielą 300 ml 70% EtOH na P7, ładowarką do końcówek ALP (TL1) i wielokanałową myjką do końcówek ALP (TW1) (<silna klasa = "xfig" >Rysunek 4, Pokład i <silna klasa = "xfig" > Rysunek 5, Pokład).</li>
	<li>Korzystając z oprogramowania operacyjnego, wyjmij końcówki do pipet AP96 P20 z wózka widłowego 10 i przenieś je do podajnika końcówek ALP. 
	UWAGA: od 1.5 do 1.12 wszystkie są wykonywane za pomocą oprogramowania operacyjnego robota do obsługi cieczy; patrz Tabela materiałów.</li>
	<li>Umieść pokój 2 w hotelu A i oddziel wszystkie cztery 96-dołkowe płyty dolne w kształcie litery V na pokładzie, umieszczając dwie dolne na P4 i P8, a dwie górne na P5 i P9 (<silna klasa="xfig">Rysunek 4).</li>
	<li>Załaduj końcówki do pipet AP96 P20 za pomocą podajnika końcówek ALP na 96-kanałową głowicę o pojemności 200 μl. Odessać 90 μl ze zbiornika na wodę o pojemności 300 ml i przelać do 96-dołkowej płytki rozcieńczającej V-Bottom na P4. Powtórz ten krok dla tabliczki na P8.</li>
	<li>Wymieszaj płytkę biblioteki chemicznej z P5, wielokrotnie zasysając i dozując trzykrotnie 15 μl. Dodatkowo odessać 10 μl z płytki biblioteki chemicznej na P5 i dozować 10 μl do płytki rozcieńczającej na P4.</li>
	<li>Wymieszać roztwory z płytki na P4, wielokrotnie zasysając i dozując łącznie 50 μl w sumie. Po wymieszaniu wyczyść końcówki do pipet AP96 P20, zasysając i dozując 70 μl 70% EtOH z P7, a następnie myjąc je w Multichannel Tip Wash ALP, zasysając i dozując czterokrotnie 110% objętości wody.</li>
	<li>Powtórz kroki 1.8 - 1.9 dla drugiej pary płytek na P8 i P9. Po utworzeniu drugiej 96-dołkowej płytki rozcieńczającej V-Bottom, ułóż płytki w następującej kolejności od dołu do góry: P9, P5, P8 i P4. Następnie umieść stos na jednym pustym statycznym ALP; P1, P2, P6, P10, P11, P12 lub P13.</li>
	<li>Powtarzaj kroki od 1.6 do 1.10, aż pokój 5 w hotelu A będzie pusty. Powtórz krok 1.5 po dotarciu do pomieszczenia 6, przenosząc nowe końcówki do pipet AP96 P20 do podajnika końcówek ALP i umieszczając zużyte końcówki do pipet AP96 P20 na pustym statycznym ALP.</li>
	<li>Powtarzaj kroki od 1.6 do 1.10, aż pokój 9 w hotelu A będzie pusty. Jednak, aby udać się do hotelu B, talerze i końcówki znajdujące się na pokładzie muszą zostać ponownie załadowane do hotelu A.</li>
	<li>Ponownie napełnij ręcznie zbiornik na wodę o pojemności 300 ml. Ten krok jest kluczowy, a program komputerowy może włączyć pauzę szczegółowo opisującą ten komunikat, wymagając od użytkownika naciśnięcia przycisku "kontynuuj" przed wykonaniem następnego kroku.</li>
	<li>Powtórz kroki 1.5 - 1.13 dla pozostałych hoteli, upewniając się, że zbiornik na wodę o pojemności 300 ml jest pełny 300 ml za każdym razem przed przejściem do następnego hotelu.</li>
</ol>
2. Dodawanie mieszanki pożywki i nasion do płyt przesiewających
<ol>
	<li>Przygotować 1/2 pożywki Murashige i Skoog (MS) z 0,1% agarem przez dodanie 4,3 g soli MS, 0,50 g MES, 1,0 g agaru do 1 l DI H2O. Dostosuj pH do 5,7 poprzez dodanie 5 M wodorotlenku potasu, monitorując za pomocą sondy pH.</li>
	<li>Wysterylizuj nasiona, potrząsając nimi w 1% wybielaczu i SDS między 15 a 30 minutami, a następnie spłucz 4 razy równą objętością wody przez odwirowanie. Gdy nasiona są sterylne, umieść je w temperaturze 4 °C od 24 godzin do 7 dni w celu wernilizacji. Centrum Zasobów Biologicznych Arabidopsis opisuje dodatkowe metody sterylizacji, wernilizacji i wzrostu22.</li>
	<li>Ręcznie dodawać nasiona do podłoża o gęstości 0,1 g/100 ml. Gęstość ta daje średnio od 3 do 10 nasion na dołek na 96-dołkowej płytce.</li>
	<li>Umieść ręcznie cztery 96-dołkowe talerze z płaskim dnem w pokojach 1 i 2 hotelu A (<silna klasa="xfig">Rysunek 6, Hotel A). Umieść pudełko końcówek do pipet AP96 P250 na ładowarce końcówek ALP, zbiorniku o pojemności 300 ml wypełnionym mieszanką pożywki i nasion utworzoną w krokach 2.1 - 2.3 na P3 oraz zbiorniku o pojemności 300 ml wypełnionym 70% EtOH na P7 (<silna klasa="xfig">Rysunek 4, Pokład i <silna klasa="xfig">Rysunek 6, Pokład). 
	UWAGA: Wersje od 2.5 do 2.8 są wykonywane za pomocą oprogramowania operacyjnego.</li>
	<li>Przedstaw pokoje 1 i 2 w hotelu A i oddziel stosy czterech talerzy. Umieść jedną płytkę na każdym z pustych statycznych ALP (P4, P5, P6, P8, P9, P10, P11 i P12). Załaduj końcówki do pipet AP96 P250 do 96-kanałowej głowicy o pojemności 200 μl.</li>
	<li>Odessać 90 μl z 300 ml zbiornika na nasiona podłoża na P3 i dozować do pierwszej 96-dołkowej płytki z płaskim dnem. Powtarzaj ten proces, aż wszystkie osiem płytek będzie zawierało mieszaninę pożywki i nasion.</li>
	<li>Wyczyść końcówki pipet AP96 P250, zasysając i dozując 70 μl ze zbiornika o pojemności 300 ml wypełnionego 70% EtOH na P7. Umyj końcówki w Multichannel Tip Wash ALP, zasysając i dozując czterokrotnie 110% objętości wody, rozładuj końcówki w TL1 i zbierz płytki ręcznie.</li>
</ol>
3. Dodawanie małych cząsteczek do płytek przesiewowych
<ol>
	<li>Załaduj ręcznie pudełko końcówek do pipet AP96 P250 do pokoju 1 hotelu A, dwie 96-dołkowe płytki biblioteczne do rozcieńczania w kształcie litery V z dnem do pomieszczeń 2, 4, 6 i 8 oraz dwie 96-dołkowe płaskodenne płytki przesiewowe do pomieszczeń 3, 5, 7 i 9 (<silna klasa = "xfig" >Rysunek 4, Układarka i <silna klasa = "xfig" > Rysunek 7, Hotel A). Dodatkowo podłącz węże do iz Multichannel Tip Wash ALP do zbiornika o pojemności 5 galonów. 
	UWAGA: Wersje od 3.2 do 3.10 są wykonywane za pomocą oprogramowania operacyjnego.</li>
	<li>Skonfiguruj pokład tak, aby zawierał 300 ml 70% zbiornika płuczącego EtOH w P7; zbiornik na nasiona pożywki można pozostawić na pokładzie w P3 (<silna klasa = "xfig" >Rysunek 4, Pokład i <silna klasa = "xfig" >Rysunek 7, Pokład). Dodatkowo włącz Console Drive przez połączenie kontrolera urządzenia, aby cyrkulować wodę przez Multichannel Tip Wash ALP. Spowoduje to automatyczne wyłączenie po zakończeniu protokołu.</li>
	<li>Przedstaw pudełko na końcówki do pipet AP96 P250 z hotelu A i przenieś je do ładowarki końcówek ALP.</li>
	<li>Przedstaw 96-dołkowe tabliczki biblioteczne z rozcieńczaniem w kształcie litery V z dnem z pokoju 2 hotelu A na pokład i umieść jedną na statycznym ALP P4 i jedną na P8. Przedstaw 96-dołkowe płaskodenne płyty przesiewowe z pokoju 3 hotelu A na pokład i umieść jedną na statycznym ALP P5, a drugą na P9.</li>
	<li>Załaduj końcówki do pipet AP96 P250 za pomocą podajnika końcówek ALP na 96-kanałową głowicę o pojemności 200 μl.</li>
	<li>Wymieszaj 96-dołkową płytkę rozcieńczającą V-Bottom na P4, zasysając i dozując 50 μl trzy razy. Następnie odessać 10 μl z tej płytki i dozować do 96-dołkowej płaskodennej płytki przesiewającej na P5.</li>
	<li>Wymieszać roztwory w płytce w temperaturze P5, zasysając i dozując trzykrotnie 50 μl. Wyczyść końcówki pipet AP96 P250 etanolem, zasysając i dozując 70 μl 70% EtOH ze zbiornika w P7, a następnie umyj końcówki w Multichannel Tip Wash ALP, zasysając i dozując czterokrotnie 110% objętości wody.</li>
	<li>Powtórz kroki 3.5 i 3.6 dla drugiej 96-dołkowej płytki bibliotecznej z dnem rozcieńczania w kształcie litery V (P8) i 96-dołkowej płytki przesiewającej z płaskim dnem (P9).</li>
	<li>Ułóż razem dwie 96-dołkowe płytki biblioteczne do rozcieńczania z dnem w kształcie litery V i dwie 96-dołkowe płytki przesiewające z płaskim dnem. Przenieś płytki do statycznych ALP P1, P2, P6, P10, P11, P12 lub P13.</li>
	<li>Powtórz kroki 3.4 - 3.9 trzy razy, dodając rozcieńczone chemikalia do płytek sitowych w sumie osiem razy. Na koniec sprawdź liczbę nasion w każdym dołku płytek sitowych poprzez konformację wizualną i uzupełnij te studzienki mniej niż trzema nasionami dodatkowymi nasionami sterylizowanymi i wernalizowanymi.</li>
</ol>
4. Inkubacja i wizualizacja płyt przesiewowych
<ol>
	<li>Inkubować 96-dołkowe płaskodenne płytki sitowe przez cztery dni w komorze środowiskowej w temperaturze 22 °C w cyklu 16/8 światło/ciemność w pojemniku odpornym na wysuszanie. Wizualizuj 96-dołkowe płaskodenne płytki przesiewowe pod mikroskopem preparacyjnym. Zapisz wszystkie nieprawidłowe fenotypy w celu dalszych badań.</li>
</ol>

<ol><li>Blackwell, H. E., Zhao, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chemical+genetic+approaches+to+plant+biology%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiol%22%5BJournal%5D)">Chemical genetic approaches to plant biology.</a> Plant Physiol. 133 (2), 448-455 (2003).</li>
<li>Dejonghe, W., Russinova, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plant+chemical+genetics%3A+From+phenotype-based+screens+to+synthetic+biology%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiol%22%5BJournal%5D)">Plant chemical genetics: From phenotype-based screens to synthetic biology.</a> Plant Physiol. 174 (1), 5-20 (2017).</li>
<li>McCourt, P., Desveaux, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plant+chemical+genetics%5BTitle%5D)+AND+%22New+Phytol%22%5BJournal%5D)">Plant chemical genetics.</a> New Phytol. 185 (1), 15-26 (2010).</li>
<li>Lumba, S., Cutler, S., McCourt, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plant+nuclear+hormone+receptors%3A+A+role+for+small+molecules+in+protein-protein+interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Annu+Rev+Cell+Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">Plant nuclear hormone receptors: A role for small molecules in protein-protein interactions.</a> Annu Rev Cell Dev Biol. 26, 445-469 (2010).</li>
<li>Hicks, G. R., Raikhel, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Opportunities+and+challenges+in+plant+chemical+biology%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Chem+Biol%22%5BJournal%5D)">Opportunities and challenges in plant chemical biology.</a> Nat Chem Biol. 5 (5), 268-272 (2009).</li>
<li>De Rybel, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+role+for+the+root+cap+in+root+branching+revealed+by+the+non-auxin+probe+naxillin%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Chem+Biol%22%5BJournal%5D)">A role for the root cap in root branching revealed by the non-auxin probe naxillin.</a> Nat Chem Biol. 8 (9), 798-805 (2012).</li>
<li>Koornneef, M., Meinke, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+development+of+Arabidopsis+as+a+model+plant%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+J%22%5BJournal%5D)">The development of Arabidopsis as a model plant.</a> Plant J. 61 (6), 909-921 (2010).</li>
<li>Serrano, M., Kombrink, E., Meesters, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Considerations+for+designing+chemical+screening+strategies+in+plant+biology%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">Considerations for designing chemical screening strategies in plant biology.</a> Front Plant Sci. 6, 131(2015).</li>
<li>Yoshitani, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+structure-based+strategy+for+discovery+of+small+ligands+binding+to+functionally+unknown+proteins%3A+Combination+of+in+silico+screening+and+surface+plasmon+resonance+measurements%5BTitle%5D)+AND+%22Proteomics%22%5BJournal%5D)">A structure-based strategy for discovery of small ligands binding to functionally unknown proteins: Combination of in silico screening and surface plasmon resonance measurements.</a> Proteomics. 5 (6), 1472-1480 (2005).</li>
<li>Macarron, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Impact+of+high-throughput+screening+in+biomedical+research%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Drug+Discov%22%5BJournal%5D)">Impact of high-throughput screening in biomedical research.</a> Nat Rev Drug Discov. 10 (3), 188-195 (2011).</li>
<li>DeBolt, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Morlin%2C+an+inhibitor+of+cortical+microtubule+dynamics+and+cellulose+synthase+movement%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Morlin, an inhibitor of cortical microtubule dynamics and cellulose synthase movement.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 104 (14), 5854-5859 (2007).</li>
<li>Christian, M., Hannah, W. B., Luthen, H., Jones, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+auxins+by+a+chemical+genomics+approach%5BTitle%5D)+AND+%22J+Exp+Bot%22%5BJournal%5D)">Identification of auxins by a chemical genomics approach.</a> J Exp Bot. 59 (10), 2757-2767 (2008).</li>
<li>Drakakaki, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clusters+of+bioactive+compounds+target+dynamic+endomembrane+networks+in+vivo%5BTitle%5D)+AND+%22PNAS%22%5BJournal%5D)">Clusters of bioactive compounds target dynamic endomembrane networks in vivo.</a> PNAS. 108 (43), 17850-17855 (2011).</li>
<li>Armstrong, J. I., Yuan, S., Dale, J. M., Tanner, V. N., Theologis, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+inhibitors+of+auxin+transcriptional+activation+by+means+of+chemical+genetics+in+Arabidopsis%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Identification of inhibitors of auxin transcriptional activation by means of chemical genetics in Arabidopsis.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 101 (41), 14978-14983 (2004).</li>
<li>Brown, L. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+small+molecule+with+differential+effects+on+the+PTS1+and+PTS2+peroxisome+matrix+import+pathways%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+J%22%5BJournal%5D)">A small molecule with differential effects on the PTS1 and PTS2 peroxisome matrix import pathways.</a> Plant J. 65 (6), 980-990 (2011).</li>
<li>De Rybel, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chemical+inhibition+of+a+subset+of+Arabidopsis+thaliana+GSK3-like+kinases+activates+brassinosteroid+signaling%5BTitle%5D)+AND+%22Chem+Biol%22%5BJournal%5D)">Chemical inhibition of a subset of Arabidopsis thaliana GSK3-like kinases activates brassinosteroid signaling.</a> Chem Biol. 16 (6), 594-604 (2009).</li>
<li>Arkin, M. R., Tang, Y., Wells, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Small-molecule+inhibitors+of+protein-protein+interactions%3A+progressing+toward+the+reality%5BTitle%5D)+AND+%22Chem+Biol%22%5BJournal%5D)">Small-molecule inhibitors of protein-protein interactions: progressing toward the reality.</a> Chem Biol. 21 (9), 1102-1114 (2014).</li>
<li>St Onge, R., Schlecht, U., Scharfe, C., Evangelista, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Forward+chemical+genetics+in+yeast+for+discovery+of+chemical+probes+targeting+metabolism%5BTitle%5D)+AND+%22Molecules%22%5BJournal%5D)">Forward chemical genetics in yeast for discovery of chemical probes targeting metabolism.</a> Molecules. 17 (11), 13098-13115 (2012).</li>
<li>Vassilev, L. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vivo+activation+of+the+p53+pathway+by+small-molecule+antagonists+of+MDM2%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">In vivo activation of the p53 pathway by small-molecule antagonists of MDM2.</a> Science. 303 (5659), 844-848 (2004).</li>
<li>Zhao, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chemical+genetic+interrogation+of+natural+variation+uncovers+a+molecule+that+is+glycoactivated%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Chem+Biol%22%5BJournal%5D)">Chemical genetic interrogation of natural variation uncovers a molecule that is glycoactivated.</a> Nat Chem Biol. 3 (11), 716-721 (2007).</li>
<li>Walsh, T. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+emerging+field+of+chemical+genetics%3A+Potential+applications+for+pesticide+discovery%5BTitle%5D)+AND+%22Pest+Manag+Sci%22%5BJournal%5D)">The emerging field of chemical genetics: Potential applications for pesticide discovery.</a> Pest Manag Sci. 63 (12), 1165-1171 (2007).</li>
<li>Center, A. B. R. Seed Handling. , The Ohio State University. Available from:
 <a target="_blank" href="https://abrc.osu.edu/seed-handling">https://abrc.osu.edu/seed-handling</a> (2013).</li>
<li>Knoth, C., Salus, M. S., Girke, T., Eulgem, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+synthetic+elicitor+3%2C5-dichloroanthranilic+acid+induces+NPR1-dependent+and+NPR1-independent+mechanisms+of+disease+resistance+in+Arabidopsis%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiol%22%5BJournal%5D)">The synthetic elicitor 3,5-dichloroanthranilic acid induces NPR1-dependent and NPR1-independent mechanisms of disease resistance in Arabidopsis.</a> Plant Physiol. 150 (1), 333-347 (2009).</li>
<li>Conway, M. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Scalable+96-well+Plate+based+iPSC+culture+and+production+using+a+robotic+liquid+handling+system%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Scalable 96-well Plate based iPSC culture and production using a robotic liquid handling system.</a> J Vis Exp. , (2015).</li>
<li>Daniszewski, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Automated+cell+culture+systems+and+their+applications+to+human+pluripotent+stem+cell+studies%5BTitle%5D)+AND+%22SLAS+Technol%22%5BJournal%5D)">Automated cell culture systems and their applications to human pluripotent stem cell studies.</a> SLAS Technol. , (2017).</li>
<li>Popa-Burke, I., Russell, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Compound+precipitation+in+high-concentration+DMSO+solutions%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biomol+Screen%22%5BJournal%5D)">Compound precipitation in high-concentration DMSO solutions.</a> J Biomol Screen. 19 (9), 1302-1308 (2014).</li>
<li>Partridge, F. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+automated+high-throughput+system+for+phenotypic+screening+of+chemical+libraries+on+C.+elegans+and+parasitic+nematodes%5BTitle%5D)+AND+%22Cold+Spring+Harb+Protoc%22%5BJournal%5D)">An automated high-throughput system for phenotypic screening of chemical libraries on C. elegans and parasitic nematodes.</a> Cold Spring Harb Protoc. , (2017).</li>
</ol>

Autorzy oświadczają, że nie mają konkurencyjnych interesów finansowych.

Protokół ten ma na celu pomóc naukowcom w przeprowadzeniu badań przesiewowych genetyki chemicznej nad rzodkiewnikiem. Przedstawiamy reprezentatywne wyniki z badania przesiewowego 50 000 związków (Figura 2 i Rycina 3), jednego z największych badań przesiewowych genetyki chemicznej przeprowadzonych do tej pory na Arabidopsis 9,13,23. Zastosowanie robota do obsługi cieczy ...

W ciągu ostatnich 20 lat badacze z dziedziny biologii roślin poczynili ogromne postępy, stosując podejścia genetyki chemicznej, zarówno w kierunku prostym (forward), jak i odwrotnym (reverse), co poprawiło nasze zrozumienie biosyntezy ściany komórkowej, cytoszkieletu, biosyntezy i sygnalizacji hormonalnej, gravitropizmu, patogenezy, biosyntezy puryn oraz transportu endomembranowego1,2,3,4,5. Wykorzystanie technik genetyki chemicznej w kierunku prostym umożliwia identyfikację interesujących fenotypów i pozwala badaczom zrozumieć genotypowe podstawy określonych procesów. Z kolei genetyka chemiczna w kierunku odwrotnym służy do poszukiwania związków chemicznych, które oddziałują z uprzednio określonym białkiem docelowym6. Arabidopsis stał się kluczowym organizmem w tych odkryciach z zakresu biologii roślin, ponieważ jego genom jest mały, zmapowany i adnotowany. Charakteryzuje się krótkim czasem generacji, a dostępnych jest wiele linii mutantów/reporterów, co ułatwia identyfikację zaburzeń w obrębie maszynerii subkomórkowej7.
Istnieją dwa główne wąskie gardła spowalniające postępy w bezpośrednich przesiewach chemiczno-genetycznych: wstępny proces przesiewania oraz określanie celu działania badanego związku8. Istotnym wsparciem w zwiększaniu szybkości selekcji małych cząsteczek jest zastosowanie automatyzacji i urządzeń zautomatyzowanych9. Roboty do obsługi cieczy stanowią doskonałe narzędzie do zarządzania obszernymi bibliotekami małych cząsteczek i odegrały kluczową rolę w rozwoju nauk biologicznych10. Przedstawiony tutaj protokół został opracowany w celu wyeliminowania wąskiego gardła związanego z procesem przesiewania, co umożliwia szybką identyfikację bioaktywnych małych cząsteczek. Technika ta zmniejsza nakład pracy i czasu operatora, a jednocześnie obniża koszty ekonomiczne ponoszone przez głównego badacza.
Do tej pory większość analizowanych bibliotek chemicznych zawierała od 10 0 do 20 00 związków, przy czym niektóre obejmowały nawet 150 0, a inne zaledwie 709,1,12,13,14,15,16. Przedstawiony w niniejszej pracy protokół został wdrożony dla biblioteki małych cząsteczek składającej się z 50 0 związków (patrz Tabela Materiałów), co stanowi jeden z największych do tej pory badań przesiewowych typu forward chemical genetics przeprowadzonych na Arabidopsis. Protokół ten wpisuje się w obecny trend zwiększania wydajności i szybkości w zakresie genetyki chemicznej typu forward, szczególnie w odniesieniu do poszukiwania nowych herbicydów, insektycydów, fungicydów, leków oraz w biologii nowotworów17,18,19,20,21. Choć protokół ten został tutaj zastosowany w przypadku Arabidopsis, można go łatwo zaadaptować do kultur komórkowych, zarodników, a potencjalnie nawet owadów w medium płynnym w płytkach 96-, 384- lub 1536-dołkowych. Ze względu na niewielki rozmiar Arabidopsis nadaje się do badań przesiewowych w płytkach 96-dołkowych. Wyzwaniem jest jednak równomierne rozdzielenie nasion pomiędzy dołki. Wysiew ręczny jest dokładny, ale pracochłonny, a mimo istnienia urządzeń zaprojektowanych do dozowania nasion do płytek 96-dołkowych, są one kosztowne w zakupie. W niniejszej pracy pokazujemy, jak można ominąć ten etap przy niewielkiej utracie dokładności.
Ogólnym celem tej metody było ułatwienie przesiewania dużej biblioteki chemicznej przeciwko Arabidopsis, bez utraty dokładności, poprzez zastosowanie robota do obsługi cieczy. Zastosowanie tej metody zwiększa efektywność pracy badacza poprzez skrócenie czasu potrzebnego na przeprowadzenie wstępnego zarządzania seriami rozcieńczeń i późniejszych przesiewów fenotypowych, co pozwala na szybką wizualizację próbek pod mikroskopem stereoskopowym oraz szybką identyfikację nowych bioaktywnych małych cząsteczek. Rycina 1 przedstawia kluczowe etapy tego protokołu w 4 krokach.
<img alt="Schemat przepływu pracy podczas przesiewu chemicznego: rozcieńczanie biblioteki, przygotowanie płytek, inkubacja, wizualizacja." class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57393/57393fig1.jpg" data-altupdatedat="1788250015000" data-alt="Rycina 1"> 
Rysunek 1: Ogólny schemat badania przesiewowego metodą bezpośredniej genetyki chemicznej. Przegląd protokołu z opisem szczegółowym dla każdego z 4 kluczowych etapów. 1: Odbiór biblioteki związków chemicznych, 2: Przygotowanie biblioteki rozcieńczeń, 3: Przygotowanie płytek screeningowych oraz 4: Inkubacja i wizualizacja płytek screeningowych. <a href="/files/ftp_upload/57393/57393fig1large.jpg" target="_blank">Proszę kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej figury.</a>

<table><tbody><tr><td>Klawiatura</td><td>Dostawca lokalny</td><td>Nie dotyczy</td><td>Używany do projektowania i obsługi protokołu Mysz Biomek FX</td></tr><tr><td></td><td>Lokalny dostawca</td><td>Nie dotyczy</td><td>Używany do projektowania i obsługi protokołu Biomek</td></tr><tr><td>FX Ekran komputera</td><td>Lokalny dostawca</td><td>Nie dotyczy</td><td>Używany do projektowania i obsługi protokołu Biomek FX</td></tr><tr><td>Komputer</td><td>Lokalny dostawca</td><td>Nie</td> dotyczy <td>Używany do projektowania i obsługi protokołu Biomek FX</td></tr><tr><td>DIVERSet Różnorodna biblioteka przesiewowa</td><td>ChemBridge</td><td>N/A Biblioteka</td><td>chemiczna</td></tr><tr><td>Oprogramowanie Biomek</td><td>Beckman Coulter</td><td>N/A</td><td>Uruchamia i projektuje sterownik urządzeń Biomek</td></tr><tr><td></td><td>FX Beckman Coulter</td><td>719366</td><td>Obsługuje pompę wodną/stację mycia końcówek</td></tr><tr><td>Wózek widłowy Karuzela wisząca</td><td>Beckman Coulter</td><td>148240</td><td>Ręczna obsługa Biomek Wózek widłowy</td></tr><tr><td>Karuzela Biomek Karuzela Karuzela</td><td>Beckman Coulter</td><td>148520</td><td>Jednostka obrotowa, która mieści wszystkie układarki FX Stacker 10</td></tr><tr><td>FX Stacker 10</td><td>Beckman Coulter</td><td>148522</td><td>Jednostka elewatora, w której znajdują się komponenty do ekranu</td></tr><tr><td>FX Stacker 10</td><td>Beckman Coulter</td><td>148522</td><td>Jednostka elewatora, w której znajdują się komponenty do ekranu</td></tr><tr><td>FX Stacker 10</td><td>Beckman Coulter</td><td>148522</td><td>Jednostka elewatora, w której znajdują się komponenty do ekranu</td></tr><tr><td>FX Stacker 10</td><td>Beckman Coulter</td><td>148522</td><td>Jednostka elewatora, w której znajdują się komponenty do ekranu</td></tr><tr><td>Biomek FX</td><td>Beckman Coulter</td><td>https://www.beckman.com/liquid-handlers</td><td>Robot, który wykonuje żądane operacje</td></tr><tr><td>Accuframe</td><td>Artisan Technology Group</td><td>76853-4</td><td>Ramię ramy do prawidłowego umieszczania komponentów</td></tr><tr><td>Oprawa ramowa</td><td>Beckman Coulter</td><td>719415</td><td>Centruje ramię w</td></tr><tr><td>wielokanałowym myciu końcówek</td> Accuframe ALP <td>Beckman Coulter</td><td>719662</td><td>Myje końcówki po kąpieli etanolowej</td></tr><tr><td>Ładowarka końcówek ALP</td><td>Beckman Coulter</td><td>719356</td><td>Pneumatycznie ładuje końcówki na ramię</td></tr><tr><td>Sprężarka powietrza</td><td>Lokalny dostawca</td><td>Nie dotyczy</td><td>Dostarcza powietrze do pneumatycznego załadunku końcówek</td></tr><tr><td>Napęd konsolowy MasterFlex</td><td>Cole-Parmer</td><td>77200-65</td><td>Pompa służąca do cyrkulacji wody przez wielokanałowy wąż powietrzny do myjki końcówek</td></tr><tr><td></td><td>Lokalny dostawca</td><td>Nie dotyczy</td><td>Dostarcza powietrze ze sprężarki powietrza do węża wodnego ładowarki końcówek</td></tr><tr><td></td><td>Lokalny dostawca</td><td>Nie dotyczy</td><td>Dostarcza wodę od 5 galonów rezerwy do myjki końcówki</td></tr><tr>Statyczna <td>redlica Beckman</td><td>firmy ALP</td><td>W zestawie z Biomek FX</td><td>Obsługuje sprzęt do ekranu</td></tr><tr><td>5 galonów Rezerwator</td><td>Lokalny dostawca</td><td>Nie dotyczy</td><td>Recyrkuluje brudną wodę z czyszczenia końcówek</td></tr><tr><td>Chwytaki</td><td>Beckman Coulter</td><td>W zestawie z Biomek FX</td><td>Chwyta i przenosi sprzęt we właściwe miejsca</td></tr><tr><td>96-kanałowy 200 i mikro; L Head</td><td>Beckman Coulter</td><td>W zestawie Biomek FX</td><td>Zawiera 96 końcówek używanych na ekranie</td></tr><tr><td>AP96 P200 Końcówki do pipet</td><td>Beckman Coulter</td><td>717251</td><td>Służy do tworzenia biblioteki przesiewowej</td></tr><tr><td>96 Well Flat Bottom Plate</td><td>Costar</td><td>9018</td><td>Pomaga w wizualizacji ekranu</td></tr><tr><td>96 Well V-Bottom Plate</td><td>Costar</td><td>3897</td><td>Pomaga w przechowywaniu biblioteki rozcieńczeń</td></tr><tr><td>AlumaSeal 96 Folia uszczelniająca</td><td>MedSci</td><td>F-96-100</td><td>Uszczelki do przechowywania zarówno biblioteki chemicznej, jak i biblioteki rozcieńczeń</td></tr><tr><td>Plastikowe torebki na kanapki z zamkiem błyskawicznym</td><td>Lokalny dostawca</td><td>Nie dotyczy</td><td>Służy do zapewnienia wilgotnego środowiska dla ekranu</td></tr><tr><td>AP96 P20 Końcówki do pipet</td><td>Beckman Coulter</td><td>717254</td><td>Używany w tworzeniu biblioteki rozcieńczeń</td></tr><tr><td>Komora wzrostu</td><td>Percival</td><td>AR36L3</td><td>Kiełkuje nasiona do fenotypu wizulizacja</td></tr><tr><td>Szpatułka</td><td>Lokalny dostawca</td><td>Nie dotyczy</td><td>Przechowuje nasiona do dodania do studzienek, w których wysiew płynny nie powiódł się odpowiednio</td></tr><tr><td>Nasiona Wykałaczka</td><td>Lokalny dostawca</td><td>Nie dotyczy</td><td>Wypycha nasiona ze szpatułki do studni</td></tr><tr><td>Murashige i Skoog Mieszanina soli bazalnej</td><td>Laboratoria fitotechnologiczne</td><td>M524</td><td>Dodaj do mieszaniny pożywki</td></tr><tr><td>MS MES Wolny monohydrat kwasu</td><td>Fisher Scientific</td><td>ICN19483580</td><td>Dodawany do pożywki MS w celu obniżenia pH</td></tr><tr><td>Agar w proszku</td><td>Alfa Aesar</td><td>9002-18-0</td><td>Zwiększa grubość podłoża w celu podparcia zawiesiny nasion</td></tr><tr><td>5M KOH</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>484016</td><td>Podnosi pH do odpowiedniego poziomu</td></tr><tr><td>Butelka do przechowywania pożywek</td><td>1L Corning</td><td>1395-1L</td><td>Mieści wystarczającą ilość podłoża na ekran</td></tr><tr><td>Probówki wirówkowe z polipropylenu</td><td>Corning</td><td>431470</td><td>Sterylizuje nasiona przed wernilizacją</td></tr><tr><td>Sonda pH</td><td>Davis Instruments</td><td>YX-58825-26</td><td>Służy do wytwarzania mediów</td></tr><tr><td>ALP (Automated Labware Positioners) Instrukcja obsługi</td><td>Beckman Coulter</td><td>PN 987836</td><td>Pomaga w ustawianiu sprzętu towarzyszącego dla Biomek FX</td></tr> Instrukcja <tr><td>obsługi karuzeli układarki Biomek 2000</td><td>Beckman Coulter</td><td>609862-AA</td><td>Pomoce w konfiguracji karuzeli</td></tr> <tr><td>układarkiBiomek FX i FXP Instrukcja obsługi stacji roboczych do automatyzacji laboratoriów</td><td>Beckman Coulter</td><td>PN 987834</td><td>Służy do oprawiania wielokanałowej stacji</td></tr><tr><td>roboczej automatyzacji laboratorium Pod Biomek FXP Przewodnik uruchomienia</td> klienta <td>Beckman Coulter</td><td>PN B32335AB</td><td>Służy do pomocy w konfiguracji oprogramowania Biomek FX</td></tr> Instrukcja <tr><td>obsługi oprogramowania Biomek</td><td>Beckman Coulter</td><td>PN 987835</td><td>Służy do konfiguracji i zrozumienia Oprogramowanie</td></tr></tbody></table>

optymalizacja wykorzystania robota do obsługi cieczy w celu przeprowadzenia wysokoprzepustowego badania przesiewowego genetyki chemicznej arabidopsis thaliana

Optimizing the Use of a Liquid Handling Robot to Conduct a High Throughput Forward Chemical Genetics Screen of Arabidopsis thaliana

Genetyka chemiczna jest coraz częściej wykorzystywana do dekodowania cech roślin, które mogą być oporne na tradycyjną genetykę z powodu redundancji genów lub śmiertelności. Jednak prawdopodobieństwo, że syntetyczna mała cząsteczka jest bioaktywna, jest niskie; Dlatego należy przetestować tysiące molekuł, aby znaleźć te, które Cię interesują. Systemy robotyki do obsługi cieczy są zaprojektowane do obsługi dużej liczby próbek, co zwiększa szybkość, z jaką biblioteka chemiczna może być przesiewana, a także minimalizuje/standaryzuje błędy. Aby uzyskać wysokowydajne badanie przesiewowe genetyki chemicznej w bibliotece 50 000 małych cząsteczek na Arabidopsis thaliana (Arabidopsis), opracowano protokoły wykorzystujące stacjonarnego wielokanałowego robota do obsługi cieczy, które wymagają minimalnego zaangażowania techników. Dzięki tym protokołom odkryto 3271 małych cząsteczek, które spowodowały widoczne zmiany fenotypowe. 1,563 związki indukowały krótkie korzenie, 1,148 związków zmieniało zabarwienie, 383 związki powodowały włośniki i inne, nieskategoryzowane zmiany, a 177 związków hamowało kiełkowanie.

Celem końcowym tej metody forwardowej genetyki chemicznej na Arabidopsis jest możliwość dokładnej i wydajnej charakterystyki fenotypów po dodaniu małych cząsteczek w stężeniach przesiewowych pod mikroskopem stereowym.. Fenotypy zaobserwowane po przesiewie wszystkich 50 00 związków były zróżnicowane i można je było podzielić na kilka wyraźnych klas (Rycina 2). Rysunek 3A-F przedstawia przykłady fenotypów ...

Przeprowadzono wysokoprzepustowe badanie przesiewowe syntetycznych małych cząsteczek na modelowym gatunku rośliny, Arabidopsis thaliana. Protokół ten, opracowany dla robota do obsługi cieczy, zwiększa szybkość badań przesiewowych genetyki chemicznej, przyspieszając odkrywanie nowych małych cząsteczek wpływających na fizjologię roślin.

Optymalizacja wykorzystania robota do obsługi cieczy w celu przeprowadzenia wysokoprzepustowego badania przesiewowego genetyki chemicznej Arabidopsis thaliana

Chemical genetics is increasingly being employed to decode traits in plants that may be recalcitrant to traditional genetics due to gene redundancy or ...

Ogólnym celem tego protokołu jest przeprowadzenie wysokoprzepustowego badania genetycznego genetyki chemicznej na siewkach rzodkiewnika. Dzięki tej metodzie możemy sprawnie i skutecznie odkrywać nowe małe cząsteczki, które wpływają na fizjologię roślin. Odkrycia te będą stanowić podstawę do dalszych badań nad procesami fizjologicznymi, takimi jak synteza ściany komórkowej.Główną zaletą tej techniki jest to, że w krótkim czasie można przesiać dziesiątki tysięcy małych cząsteczek. Chociaż protokół ten jest przeznaczony dla modelowego gatunku rośliny Arabidopsis, można go łatwo dostosować do innych organizmów, takich jak owady, mikroorganizmy lub hodowle komórkowe. Po raz pierwszy wpadliśmy na pomysł tego protokołu, gdy dowiedzieliśmy się, że uniwersyteckie centrum genomiczne musi znaleźć dom dla robota obsługującego nadwyżki płynów.Natychmiast zgłosiliśmy się na ochotnika, aby zdjąć go z ich rąk. Przygotuj bibliotekę rozcieńczeń i wielokanałowy automatyczny pozycjoner naczyń laboratoryjnych do mycia końcówek lub ALP zgodnie z opisem w protokole tekstowym. Ręcznie załaduj wózek Stacker 10s podłączony do karuzeli układarki.W hotelach od A do D najpierw załaduj jedno pudełko końcówek do

optimizing-use-liquid-handling-robot-to-conduct-high-throughput

Research

JoVE Journal

Bioengineering

Bioinżynieria

Opisujemy metodę wprowadzania, śledzenia i ilościowej analizy ekspresji GFP w komórkach roślinnych. Metoda ta wykorzystuje specjalnie zaprojektowany system robotyczny do półciągłego zbierania obrazów z dużej liczby próbek w czasie. Demonstrujemy również zastosowanie programów ImageJ i ImageReady do analizy serii obrazów.

Robotyka i dynamiczna analiza obrazu w badaniach ekspresji genów w tkankach roślinnych

Opisano procedurę hodowli w środowisku ciekłym oraz rozdziału szczepów C. elegans wykazujących ekspresję fluorescencyjnych białek reporterowych, która nie wymaga użycia kosztownego sprzętu do sortowania. Podejście to można zastosować w przypadku licznych indukowalnych genów C. elegans w celu odkrywania leków lub biosensingu zanieczyszczeń.

Przesiewanie wysokoprzepustowe i biosensing z wykorzystaniem fluorescencyjnych szczepów C. elegans

Protokół ilościowego, wysokoprzepustowego badania ekspresji i analitycznego oczyszczania białek fuzyjnych z małych kultur Escherichia coli jest opisany i zastosowany do ekspresji bogatych w dwusiarczki białek jadu zwierzęcego.

Wysokoprzepustowe ilościowe badania przesiewowe i oczyszczanie stosowane do rekombinowanych, bogatych w dwusiarczki białek jadowych wytwarzanych w E. coli

Tutaj opisujemy komórkowy test genu reporterowego jako cenne narzędzie do badania bibliotek chemicznych pod kątem związków modulujących mechanizmy kontroli potranskrypcyjnej wywieranej przez 3' UTR.

Wysokoprzepustowe badania przesiewowe pod kątem chemicznych modulatorów genów regulowanych potranskrypcyjnie

Opisana jest wysokoprzepustowa, zautomatyzowana metodologia produkcji i przetwarzania protoplastów tytoniu. Zrobotyzowany system umożliwia masowo równoległą ekspresję i odkrywanie genów w modelowym systemie BY-2, które powinno być możliwe do przełożenia na uprawy niemodelowe.

Zrobotyzowana platforma do wysokowydajnej izolacji i transformacji protoplastów

Tutaj prezentowany jest zautomatyzowany przepływ pracy do wykonywania modułowego montażu "urządzenia" DNA przy użyciu modułowej metody klonowania DNA na robotach obsługujących ciecze. Protokół wykorzystuje intuicyjne narzędzie programowe do generowania list wyboru osób zajmujących się cieczami do kombinatorycznego generowania biblioteki urządzeń DNA, które demonstrujemy za pomocą dwóch platform do obsługi cieczy.

Zautomatyzowany zrobotyzowany montaż modułowych urządzeń DNA do obsługi cieczy

Tutaj opisujemy prosty protokół szybkiego wytwarzania setek pożywek hodowlanych dla nicieni, 96-dołkowych płytek hodowlanych ze stałą liczbą Caenorhhabditis elegans na studzienkę. Kultury te są przydatne do fenotypowych badań przesiewowych całych organizmów. Skupiamy się tutaj na wykorzystaniu tych kultur do badań przesiewowych substancji chemicznych pod kątem efektów sprzyjających długowieczności.

Prosta metoda wysokoprzepustowych badań przesiewowych w kierunku Caenorhabditis elegans

Dostępny jest protokół o wysokiej przepustowości do powierzchniowej sterylizacji nasion Arabidopsisthaliana (Arabidopsis), optymalizujący etapy obsługi cieczy za pomocą prostego urządzenia ssącego zbudowanego z pompą próżniową. Setki próbek nasion można wysterylizować powierzchniowo w ciągu jednego dnia.

Wysokowydajna, wytrzymała i bardzo elastyczna w czasie metoda powierzchniowej sterylizacji nasion rzodkiewnika

Protokół ten zapewnia metodę systematycznej globalnej optymalizacji genetycznie kodowanych bioczujników poprzez wspomagane automatyzacją generowanie i ocenę bibliotek genetycznych. Jest to połączone z metodologiami projektowania eksperymentów w celu usprawnienia eksperymentów i umożliwienia selekcji komponentów genetycznych w celu dostrojenia bioczujników do określonych wyników projektu.

Efektywne pobieranie próbek z genetycznie zakodowanej przestrzeni projektowej biosensorów możliwe dzięki projektowaniu eksperymentów i automatyzacji przepływu pracy

Ten protokół przedstawia standardowy przepływ wysokowydajnego przesiewania dla mikroorganizmów przemysłowych. Obejmuje ono konstruowanie biblioteki mutantów poprzez mutagenezę ARTP, przeprowadzanie pozytywnego przesiewania kropel za pomocą zautomatyzowanych mikrofluidów i następnie weryfikację wyników. Niezawodność przepływu została zweryfikowana poprzez przesiewanie wysokowydajnych szczepów B. coagulans.

Przesiewowe badanie wysokowydajne mutantów Bacillus coagulans hiperprodukujących kwas L-mlekowy za pomocą zautomatyzowanej platformy mikrofluidycznej kroplowej

Poznaj metodę wysokoprzepustowego badania przesiewowego genetyki chemicznej Arabidopsis thaliana z wykorzystaniem robota do obsługi cieczy. Ta technika umożliwia szybkie odkrywanie nowych małych cząsteczek wpływających na fizjologię roślin.

Optymalizacja wykorzystania robota do obsługi cieczy w celu przeprowadzenia wysokoprzepustowego badania przesiewowego genetyki chemicznej Arabidopsis thaliana (Wideo) | JoVE Journal

Optymalizacja wykorzystania robota do obsługi cieczy w celu przeprowadzenia wysokoprzepustowego badania przesiewowego genetyki chemicznej Arabidopsis thaliana

Przeglądaj więcej filmów