June 26th, 2018
Celem tego protokołu jest dostarczenie systemu opartego na komórkach, który replikuje tworzenie agregatów alfa-synukleiny in vivo. Wewnątrzkomórkowe inkluzje alfa-synukleiny są wysiewane w pierwotnych neuronach przez internalizację i propagację egzogennych, podawanych natywnych agregatów alfa-synukleiny związanych z mikrosomami wyizolowanych z chorych myszy transgenicznych alfa-synukleiny.
Metoda ta może pomóc odpowiedzieć na kluczowe pytania w dziedzinie alfa-synukleiny, takie jak wyjaśnienie mechanizmu rozprzestrzeniania się agregacji i toksyczności alfa-synukleiny in vivo. Główną zaletą tej techniki jest to, że nie wymaga ona czasochłonnego oczyszczania fibryli wstępnie uformowanych alfa-synukleiny. Procedurę zademonstruje Lucia Rota, doktorantka z COLA Lab.
Aby rozpocząć procedurę, należy przygotować bufor homogenizacyjny i przechowywać go na lodzie. Następnie homogenizuj świeżą lub zamrożoną tkankę w objętości od 1 do 10 lodowatego buforu homogenizacyjnego za pomocą homogenizatora teflonowego z tłuczkiem o 10 do 15 pociągnięciach. Następnie przenieś cały początkowy homogenat do probówki mikrowirówkowej i odwiruj w temperaturze 1000 razy G przez 10 minut w temperaturze czterech stopni Celsjusza w celu usunięcia jąder i nieuszkodzonych komórek z powstałego osadu.
Następnie wyrzuć wynikowy osad. Następnie przenieś supernatant do czystej probówki do mikrowirówki i odwiruj go w temperaturze 10 000 razy G przez 20 minut w temperaturze czterech stopni Celsjusza za pomocą wirówki z chłodzeniem w celu uzyskania drugiego supernatantu i osadu. Następnie przenieś ten supernatant do butelki z poliwęglanu i odwiruj go w temperaturze 100 000 razy G przez jedną godzinę w temperaturze czterech stopni Celsjusza za pomocą ultrawirówki i wirnika o stałym kącie nachylenia.
Zawiesić surowy granulat P100 z 500 mikrolitrami buforu homogenizacyjnego. Przenieś surowy osad P100 do czystej probówki do mikrowirówki i odwiruj przy 10 000 razy G przez 20 minut w temperaturze czterech stopni Celsjusza w wirówce z chłodzeniem. Po 20 minutach wyrzucić supernatant i ponownie zawiesić P100 ze 100 mikrolitrami buforu homogenizacyjnego.
Następnie poddaj próbkę sonikacji przez dwie sekundy na lodzie i przechowuj ją w temperaturze minus 80 stopni Celsjusza. Aby wykonać Western Blot, należy odlać gradientowy żel poliakrylamidowy o stężeniu od czterech do 20% tris-glicyny na pionowym aparacie do elektroforezy. Rozpuść jeden mikrogram frakcji alfa-synukleiny związanych z mikrosomami w denaturującym buforze próbki i załaduj go na żel.
Do innego dołka załaduj pięć mikrolitrów markera wzorcowego białka. Uruchom żel pod napięciem 100 V w buforze działającym tris-glicyny SDS, aż marker białkowy dotrze do końca żelu. Następnie przenieś białka do membrany nitrocelulozowej za pomocą zasadowego buforu węglanowego.
Próbkę należy przechowywać przez noc w chłodni ze stałą mocą ustawioną na 200 miliamperów. Następnego dnia zablokuj membranę PBS-T z 5% beztłuszczowym mlekiem w proszku na wytrząsarce orbitalnej przez 30 minut w temperaturze pokojowej. Następnie krótko przepłucz membranę PBS-T.
Inkubować błonę z przeciwciałem SIN-1 w temperaturze od jednego do 5 000 lub przeciwciałem alfa-synukleiny P-Ser129 w temperaturze od jednego do 5 000 w 2,5% beztłuszczowym mleku w proszku w PBS-T przez noc w chłodni lub lodówce w temperaturze czterech stopni Celsjusza na wytrząsarce orbitalnej. Następnego dnia myj membranę przez 10 minut w temperaturze pokojowej za pomocą PBS-T na wytrząsarce orbitalnej. Inkubować błonę z przeciwciałem drugorzędowym sprzężonym z HRP przeciwko myszom lub królikom w ilości od jednego do 3 000 w 2,5% beztłuszczowym mleku w proszku w PBS-T przez jedną godzinę w temperaturze pokojowej na wytrząsarce orbitalnej.
Następnie myj membranę przez 10 minut w temperaturze pokojowej za pomocą PBS-T na wytrząsarce orbitalnej trzy razy. Uzyskaj sygnał za pomocą zwykłego zestawu chemiluminescencyjnego. Aby leczyć neurony, należy wyciągnąć związane z mikrosomami agregaty alfa-synukleiny uzyskane z rdzenia kręgowego trzech różnych chorych myszy transgenicznych, aby uzyskać roztwór o stężeniu jednego mikrograma na mikrolitr rozcieńczony oryginalnym buforem homogenizacyjnym.
Następnie usuń jedną trzecią pożywki i delikatnie zastąp ją świeżą pożywką neuronową. Dodaj jeden mikrogram połączonych agregatów alfa-s związanych z mikrosomami do pożywki komórkowej. Zwróć neurony w inkubatorze w temperaturze 37 stopni Celsjusza.
Dodać jedną trzecią świeżej pożywki do próbki, nie wymieniając pożywki raz na trzy dni przez jeden tydzień. Po tygodniu leczenia należy usunąć jedną trzecią pożywki i delikatnie zastąpić ją świeżą pożywką zawierającą 2% witaminy B27, gentamycynę 10 mikrogramów na mililitr i dwumilimolową glutaminę. Powtarzaj co trzy dni przez tydzień przed utrwaleniem komórek.
Aby przeprowadzić immunofluorescencję, w chemicznym okapie oparowym utrwalić neurony za pomocą 2% paraformaldehydu i PBS w 5% roztworze sacharozy przez 15 minut w temperaturze pokojowej bez wstrząsania. Po 15 minutach usuń roztwór utrwalający i krótko przemyj neurony trzykrotnie PBS. Następnie przepuszczaj neurony za pomocą 0,3% niejonowej surfaktyny w PBS przez pięć minut w temperaturze pokojowej.
Następnie krótko umyj neurony trzykrotnie PBS. Inkubuj neurony z 3% FBS i PBS przez 30 minut w temperaturze pokojowej na wytrząsarce orbitalnej, aby zablokować niespecyficzne miejsca wiązania. Następnie inkubuj neurony z odpowiednim przeciwciałem pierwszorzędowym rozpuszczonym w 3% FBS i PBS przez noc w chłodni lub lodówce przez noc w temperaturze czterech stopni Celsjusza na wytrząsarce orbitalnej.
Następnego dnia usuń roztwór przeciwciała i krótko przemyj komórki trzykrotnie PBS. Następnie inkubuj neurony z odpowiednim fluorescencyjnym przeciwciałem wtórnym rozpuszczonym w 3% FBS i PBS przez godzinę w temperaturze pokojowej w ciemności na wytrząsarce orbitalnej. Usunąć roztwór przeciwciał i krótko przemyć PBS trzy razy.
Następnie barwić neurony roztworem DAPI przez 15 minut w temperaturze pokojowej w ciemności na wytrząsarce orbitalnej. Po 15 minutach usunąć roztwór przeciwciała i krótko przemyć PBS trzy razy. Zamontuj szkiełka nakrywkowe na szkiełku za pomocą środka montażowego zapobiegającego blaknięciu.
W tym badaniu podanie jednego mikrograma połączonych agregatów alfa-synukleiny związanych z mikrosomami od chorych myszy transgenicznych A53T do pożywki hodowlanej neuronów korowych lub hipokampowych indukuje zależne od czasu tworzenie inkluzji alfa-synukleiny, dodatnich dla specyficznych dla agregatu przeciwciał alfa-synukleinowych. Po dwóch dniach leczenia agregaty te pojawiają się jako małe, rozproszone punkty, które staną się bardziej obfite w późniejszych punktach czasowych. Po dwóch tygodniach inkluzje alfa-synukleiny przypominają długie i dojrzałe struktury przypominające koraliki, silnie rozsiane po kulturach neuronalnych zgodnie ze wzorcem neurytów i częściowo kolokalizujące się z markerami presynaptycznymi i neurytowymi.
Podejmując tę procedurę, należy pamiętać o dostosowaniu stosunku mikrogramów agregatów alfa-synukleiny związanych z mikrosomami do gęstości posianych neuronów oraz o wyizolowaniu agregatów alfa-synukleiny związanych z mikrosomami z tkanki bogatej w inkluzje alfa-synukleiny. Po obejrzeniu tego filmu powinieneś dobrze zrozumieć, jak oczyszczać agregaty alfa-synukleiny związane z mikrosomami od chorych myszy transgenicznych, które mają być stosowane jako leczenie pierwotnych neuronów w celu wywołania tworzenia inkluzji alfa-synukleiny.
To badanie prezentuje model oparty na komórkach do badania in vivo tworzenia skupień alfa-synucleiny, wykorzystując pierwotne neurony. Poprzez zastosowanie egzogennych skupień alfa-synucleiny z chorych myszy transgenicznych, badania mają na celu wyjaśnienie mechanizmów leżących u podstaw rozprzestrzeniania się skupień i toksyczności.
This method provides a physiologically relevant cell model for studying pathogenic alpha-synuclein aggregation directly from diseased tissue, bypassing recombinant fibril production. It enables mechanistic de-risking of alpha-synuclein-targeted therapeutics by using authentic seeding species that mimic in vivo inclusions. The approach supports target validation and phenotypic screening in Parkinson's disease research with improved predictive confidence.
The method fits within the early discovery continuum, supporting target validation through phenotypic screening of aggregation modulators in a disease-relevant neuronal system.