Name: Regioselektywna O-glikozylacja nukleozydów poprzez tymczasową ochronę 2,3-diolem przez ester boronowy do syntezy nukleozydów disacharydowych (Wideo) | JoVE Journal
Uploaded: 2018-07-26T13:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 46 s
Description: Poznaj metodę regioselektywnej O-glikozylacji nukleozydów z wykorzystaniem tymczasowej ochrony boronowym estry 2',3'-diolu. Technika ta umożliwia syntezę disacharydowych nukleozydów bez konieczności stosowania chroniących grup.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

To badanie zostało sfinansowane z grantów Ministerstwa Edukacji, Kultury, Sportu, Nauki i Technologii (MEXT) Japonii (nr 15K00408, 24659011, 24640156, 245900425 i 22390005 dla Shin Aoki), z grantu z Tokyo Biochemical Research Foundation, Tokio, Japonia, oraz z funduszu TUS (Tokyo University of Science) na strategiczne obszary badań. Chcielibyśmy podziękować Noriko Sawabe (Wydział Nauk Farmaceutycznych, Uniwersytet Naukowy w Tokio) za pomiary widm NMR, Fukiko Hasegawa (Wydział Nauk Farmaceutycznych, Uniwersytet Naukowy w Tokio) za pomiary widm masowych oraz Tomoko Matsuo (Instytut Badawczy Nauki i Technologii, Uniwersytet Naukowy w Tokio) za pomiary analiz elementarnych.

Autorzy nie mają nic do ujawnienia.

Celem tego manuskryptu jest pokazanie wygodnej metody syntezy nukleozydów disacharydowych przy użyciu niezabezpieczonych rybonukleozydów bez żmudnych manipulacji grupami ochronnymi. W niniejszym artykule informujemy o regioselektywnych O-glikozylacjach nukleozydów poprzez tymczasową ochronę 2',3'-diolu przez cykliczny ester boronowy (ryc. 1B)51.
Przygotowanie cyklicznego półproduktu estru boronowego jest j...

Nukleozydy disacharydowe, które są koniugatami nukleozydu i ugrupowania węglowodanowego połączonych wiązaniem O-glikozydowym, stanowią cenną klasę naturalnie występujących pochodnych węglowodanów 1,2,3,4,5,6,7. Na przykład, są one włączone do makrocząsteczek biologicznych, takich jak tRNA (kwas rybonukleinowy transferowy) i poli(ADP-ryboza) (ADP = difosforan adenozyny), a także do niektórych środków przeciwbakteryjnych i innych substancji biologicznie czynnych (np. adenophostyny, amicetyny, ezomycyna)5,6,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19. W związku z tym oczekuje się, że nukleozydy disacharydowe i ich pochodne będą związkami wiodącymi do badań nad odkrywaniem leków. Metodologie syntezy nukleozydów disacharydowych dzielą się na trzy kategorie; enzymatyczna O-glikozylacja <sup class="xref">20,21, chemiczna N-glikozylacja 5,9,16,22,23,24, oraz chemiczne O-glikozylacja7,9, 14,16,18,19,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37. W szczególności chemiczna O-glikozylacja byłaby skuteczną metodą stereoselektywnej syntezy i syntezy nukleozydów disacharydowych na dużą skalę. Poprzednie badania wykazały, że O-glikozylacja 2'-dezoksyrybonukleozydu 2 z donorem tioglikozylu 1, przy użyciu kombinacji chlorku p-toluenosulfenylu i triflatu srebra, zapewnia pożądany nukleozyd disacharydu 3 (<klasa silna = "xfig">Rysunek 1A; Ar = aryl i PG = grupa ochronna)38.
Po tych wynikach, zdecydowaliśmy się opracować O-glikozylację rybonukleozydów przy użyciu systemu promotora chlorku p-toluenosulfenylu i triflatu srebra. Wykazano kilka przykładów O-glikozylacji częściowo chronionych rybonukleozydów7,9,14,16,18,19,24,32,33,34,35,36,37, użycie niezabezpieczonych lub tymczasowo chronionych rybonukleozydów jako akceptora glikozylu dla O-glikozylacji zostało znikomo zgłoszone. W związku z tym opracowanie regioselektywnej O-glikozylacji rybonukleozydów niechronionych lub tymczasowo chronionych zapewniłoby bardziej korzystną metodę syntezy bez ochrony grupowych manipulacji rybonukleozydami. Aby osiągnąć regioselektywną O-glikozylację rybonukleozydów, skupiliśmy się na związkach boru, ponieważ opisano kilka przykładów regio- i/lub stereoselektywnej acylacji, alkilacji, sililacji i glikozylacji pochodnych węglowodanów wspomaganych kwasem boronowym lub borowym39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50. W artykule przedstawiono procedurę syntezy nukleozydów disacharydowych z wykorzystaniem regioselektywnej O-glikozylacji w grupie 5'-hydroksylowej rybonukleozydów za pośrednictwem pośredniego estru boronowego. W przedstawionej tutaj strategii, półprodukt estru boronowego 6 byłby zapewniony przez estryfikację rybonukleozydu 4 kwasem borowym 5, co umożliwia regioselektywną O-glikozylację w grupie 5'-hydroksylowej z donorem tioglikozylu 7, aby uzyskać nukleozyd disacharydowy 8 (<klasa silna = "xfig">Rysunek 1 B)<klasa sup = "xref">51. Badaliśmy również oddziaływanie rybonukleozydu i kwasu borowego za pomocą spektroskopii magnetycznego rezonansu jądrowego (NMR), aby zaobserwować powstawanie estru boronowego. Estryfikacja w celu wytworzenia estru boronowego i reakcja glikozylacji wymagają warunków bezwodnych, aby zapobiec hydrolizie estru boronowego i donora glikozylu. W tym artykule przedstawiono typowe procedury uzyskiwania bezwodnych warunków dla udanych reakcji glikozylacji dla naukowców i studentów nie tylko w chemii, ale także w innych dziedzinach badawczych.

<table><tbody><tr><td>Srebro trifluorometanosulfonian</td><td>Nacalai Tesque</td><td>34945-61</td><td></td></tr><tr><td>Kwas fenyloboronowy (zawiera różne ilości bezwodnika)</td><td>Tokyo Chemical Industry</td><td>B0857</td><td></td></tr><tr><td>p-Metoksyfenyloboronowy kwas</td><td>Wako Pure Chemical Industries</td><td>321-69201</td><td></td></tr><tr><td>Kwas 4-(trifluorometylo)fenyloboronowy (zawiera różne ilości bezwodnika)</td><td>Tokyo Chemical Industry</td><td>T1788</td><td></td></tr><tr><td>Kwas 2,4-difluorofenyloboronowy (zawiera różne ilości bezwodnika)</td><td>Tokyo Chemical Industry</td><td>D3391</td><td></td></tr><tr><td>Kwas cyklopentyloboronowy (zawiera różne ilości bezwodnika)</td><td>Tokyo Chemical Industry</td><td>C2442</td><td></td></tr><tr><td>Kwas 4-nitrofenyloboronowy (zawiera różne ilości bezwodnika)</td><td>Tokyo Chemical Industry</td><td>N0812</td><td></td></tr><tr><td>Kwas 4-heksylofenyloboronowy (zawiera różne ilości bezwodnika)</td><td>Tokyo Chemical Industry</td><td>H1489</td><td></td></tr><tr><td>Adenozyna</td><td>Merck KGaA</td><td>862.</td><td></td></tr><tr><td>Guanozyna</td><td>Acros Organics</td><td>411130050</td><td></td></tr><tr><td>Cytydyna</td><td>Tokio Przemysł chemiczny</td><td>C0522</td><td></td></tr><tr><td>Urydyna</td><td>Tokio Przemysł chemiczny</td><td>U0020</td><td></td></tr><tr><td>5-Fluorourydyna</td><td>Tokio Przemysł chemiczny</td><td>F0636</td><td></td></tr><tr><td>5-metylurydyna</td><td>Sigma</td><td>M-9885</td><td></td></tr><tr><td>Metyloamina (40% w metanolu,&nbsp; ok. 9,8 mol / L)</td> <td>Tokyo Chemical Industry</td><td>M1016</td><td></td></tr><tr><td>N,N-dimetylo-4-aminopirydyna</td><td>Wako Pure Chemical Industries</td><td>044-19211</td><td></td></tr><tr><td>Bezwodnik octowy</td><td>Nacalai Tesque</td><td>00226-15</td><td></td></tr><tr><td>Pirydyna, odwodniona</td><td>Wako Pure Chemical Industries</td><td>161-18453</td><td></td></tr><tr><td>Acetonitryl</td><td>Kanto Chemical</td><td>01031-96</td><td></td></tr><tr><td>1,4-dioksan</td><td>Nacalai Tesque</td><td>13622-73</td><td></td></tr><tr><td>Dichlorometan</td><td>Wako Pure Chemical Industries</td><td>130-02457</td><td></td></tr><tr><td>Propionitryl</td><td>Wako Pure Chemical Industries</td><td>164-04756</td><td></td></tr><tr><td>Sita molekularne 4A w proszku</td><td>Nacalai Tesque</td><td>04168-65</td><td></td></tr><tr><td>Sita molekularne 3A w proszku</td><td>Nacalai Tesque</td><td>04176-55</td><td></td></tr><tr><td>Celite 545RVS</td><td>Nacalai Tesque</td><td>08034-85</td><td></td></tr><tr><td>Acetonitryl-D3 (D,99.8%)</td><td>Cambridge Isotope Laboratories</td><td>DLM-21-10</td><td></td></tr><tr><td>Kwas trifluorooctowy</td><td>Nacalai Tesque</td><td>34831-25</td><td></td></tr><tr><td>TLC Żel krzemionkowy 60 F254</td><td>Merck KGaA</td><td>1.05715.0001</td><td></td></tr><tr><td>Chromatorex</td><td>Fuji Silysia Chemical</td><td>FL100D</td><td></td></tr><tr><td>Wodorowęglan sodu</td><td>Wako Pure Chemical Industries</td><td>191-01305</td><td></td></tr><tr><td>Kwas solny</td><td>Wako Pure Chemical Industries</td><td>080-01061</td><td></td></tr><tr><td>Siarczan sodu</td><td>Nacalai Tesque</td><td>31915-96</td><td></td></tr><tr><td>Chloroform</td><td>Kanto Chemical</td><td>07278-81</td><td></td></tr><tr><td>Chlorek sodu</td><td>Wako Pure Chemical Industries</td><td>194-01677</td><td></td></tr><tr><td>Metanol</td><td>Nacalai Tesque</td><td>21914-74</td><td></td></tr><tr><td>JEOL Zawsze 300</td><td>JEOL</td><td></td><td>Pomiar NMR</td></tr><tr><td>Lamda 400</td><td>JEOL</td><td></td><td>Pomiar NMR</td></tr><tr><td>PerkinElmer Spectrum 100 Spektrometr FT-IR</td><td>Perkin Elmer</td><td></td><td>Pomiar IR</td></tr><tr><td>JEOL JMS-700</td><td>JEOL</td><td></td><td>Pomiar MS</td></tr><tr><td>PerkinElmer Analizator CHN 2400</td><td>Perkin Elmer</td><td></td><td>Pomiar analizy elementarnej</td></tr><tr><td>Polarymetr cyfrowy JASCO P-1030</td><td>JASCO</td><td></td><td>Pomiar skręcalności optycznej</td></tr><tr><td>JASCO PU-2089 Plus inteligentna pompa HPLC</td><td>JASCO</td><td></td><td>Do HPLC</td></tr><tr><td>Jasco UV-2075 Plus Inteligentny detektor UV/Vis</td><td>JASCO</td><td></td><td>Do HPLC</td></tr><tr><td>Rheodyne Model 7125 Wtryskiwacz</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>58826</td><td>Do</td></tr><tr><td>chromatopacu HPLC C-R8A</td><td>Shimadzu</td><td></td><td>do HPLC</td></tr><tr><td>Senshu Pak Pegasil ODS</td><td>Senshu Scientific</td><td></td><td>do HPLC</td></tr><<tr><td>em>p-Toluenosulfenyl&nbsp; </td><td></td><td></td><td>Chlorek Przygotowany&nbsp; Nr ref. 38</td></tr><tr><td>Fenyl 6-O-acetylo-2,3,4-tri-O-benzylo-1-tio-a-D-mannopiranozyd (a-<silny>9</silny>)</td><td></td><td></td><td>Przygotowany&nbsp; Nr ref. 52</td></tr><tr><td>4-metylofenyl 2,3,4,6-tetra-O-benzoilo-1-tio-b-D-galaktopyranozyd (b-<silny>21</silny>)</td><td></td><td></td><td>Przygotowany&nbsp; Ref. 53</td></tr><tr><td>2,3,4,6-tetra-metylofenyl O-benzoilo-1-tio-b-D-glukopiranozyd (b-<silny>31)</td><td></td><td></td><td>Przygotowany&nbsp; Ref. 57</td></tr><tr><td>4-metylofenyl 2,3,4,6-tetra-O-benzoilo-1-tio-a-D-mannopiranozyd (a-<silny>32</silny>)</td><td></td><td></td><td>Przygotowany&nbsp; Nr ref. 67</td></tr><tr><td>6-N-Benzoiladenozyna (<silny>14</silny>)</td><td></td><td></td><td>Przygotowany&nbsp; Nr ref. 54</td></tr><tr><td>2-N-Isobutyrylguanosine (16)</td><td></td><td></td><td>Przygotowany&nbsp; Nr ref. 55</td></tr><tr><td>4-N-Benzoilcytydyna (20)</td><td></td><td></td><td>Przygotowany&nbsp; Ref. 56</td></tr></tbody></table>

regioselektywna o-glikozylacja nukleozydów poprzez tymczasową ochronę 2',3'-diolem przez ester boronowy do syntezy nukleozydów disacharydowych

Regioselective O-Glycosylation of Nucleosides via the Temporary 2',3'-Diol Protection by a Boronic Ester for the Synthesis of Disaccharide Nucleosides

Nukleozydy disacharydowe, które składają się z ugrupowań disacharydowych i nukleotydowych, są znane jako cenna grupa naturalnych produktów o różnorodnej bioaktywności. Chociaż chemiczna O-glikozylacja jest powszechnie korzystną strategią syntezy nukleozydów disacharydowych, przygotowanie substratów, takich jak donory i akceptory glikozylu, wymaga żmudnych manipulacji grupami ochronnymi i oczyszczania na każdym etapie syntezy. Tymczasem kilka grup badawczych poinformowało, że estry boronowe i borynowe służą jako ochronna lub aktywująca grupa pochodnych węglowodanów w celu osiągnięcia regio- i/lub stereoselektywnej acylacji, alkilacji, sililacji i glikozylacji. W tym artykule przedstawiono procedurę regioselektywnej O-glikozylacji niezabezpieczonych rybonukleozydów z wykorzystaniem kwasu boronowego. Estryfikacja 2',3'-diolu rybonukleozydów kwasem borowym powoduje tymczasową ochronę diolu, a po O-glikozylacji donorem glikozylu w obecności chlorku p-toluenosulfenylu i triflatu srebra pozwala na regioselektywną reakcję grupy 5'-hydroksylowej w celu uzyskania nukleozydów disacharydowych. Metodę tę można zastosować do różnych nukleozydów, takich jak guanozyna, adenozyna, cytydyna, urydyna, 5-metylurydyna i 5-fluorourydyna. Ten artykuł i towarzyszący mu film stanowią przydatne (wizualne) informacje na temat O-glikozylacji niezabezpieczonych nukleozydów i ich analogów do syntezy nie tylko nukleozydów disacharydowych, ale także różnych biologicznie istotnych pochodnych.

Wyniki O-glikozylacji uridyny 10 z tiomannozydą α-9 przedstawiono w Tabeli 160,61. W pozycji 1 O-glikozylacja związku 10 z α-9 w braku pochodnych kwasu boronowego doprowadziła do powstania skomplikowanej mieszaniny. W pozycji 2 związek 10 i kwas fenylboronowy 11a wymieszano, współodparowano z pir...

Tutaj prezentujemy protokoły syntezy nukleozydów disacharydowych metodą regioselektywnej O-glikozylacji rybonukleozydów poprzez tymczasową ochronę ich ugrupowań 2',3'-diolu za pomocą cyklicznego estru boronowego. Metoda ta ma zastosowanie do kilku niezabezpieczonych nukleozydów, takich jak adenozyna, guanozyna, cytydyna, urydyna, 5-metylurydyna i 5-fluorourydyna, aby uzyskać odpowiednie nukleozydy disacharydowe.

Regioselektywna O-glikozylacja nukleozydów poprzez tymczasową ochronę 2',3'-diolem przez ester boronowy do syntezy nukleozydów disacharydowych

Disaccharide nucleosides, which consist of disaccharide and nucleobase moieties, have been known as a valuable group of natural products having ...

Można się spodziewać, że metoda ta pomoże w badaniach nad odkrywaniem leków ze względu na krótki proces potrzebny do przygotowania biologicznie aktywnych nukleozydów disacharydowych w porównaniu z tradycyjnymi istniejącymi metodami. Główną zaletą tej techniki jest to, że niezabezpieczone nukleozydy mogą być stosowane do glikozylacji bez żmudnej manipulacji grupą ochronną w celu syntezy nukleozydów disacharydowych. Wizualna demonstracja tej metody dostarczy użytecznych informacji na temat skutecznej glikozylacji niezabezpieczonych nukleozydów dla naukowców i studentów, nie tylko w dziedzinie chemii, ale także w innych dziedzinach badań.Na początek zoptymalizuj warunki reakcji syntezy związku Alfa i Beta-12 zgodnie z opisem w protokole tekstowym. Następnie zastosuj zoptymalizowane warunki reakcji do syntezy Beta-22 do Beta-30, a także dla Beta-33, stosując podobną procedurę. W tym filmie pokazano syntezę związku Beta-22.Rozpocznij od tymczasowej ochrony dwóch pierwszych, trzech prime-diolu rybonukleozydu poprzez rozpuszczenie 20,4 miligrama adenozyny-13 w 0,76 mililitra bezwodnej pirydyny w 10-mililitrowej kolbie w kształcie gruszki. Następnie dodaj 80,4 miligrama dawcy galaktozylu Beta-21. Teraz dodaj 21,7 miligrama kwasu cztero-trifluorometylofenyloboronowego 11C.Ta alternatywa dla kwasu borowego jest stosowana, ponieważ dała Alfa i Beta-12 w najwyższej wydajności chemicznej podczas optymalizacji. Odparować mieszaninę rozpuszczoną w 0,76 mililitra bezwodnej pirydyny za pomocą wyparki obrotowej. Następnie należy dwukrotnie odparować powstałą mieszaninę reakcyjną z 0,76 mililitra bezwodnej pirydyny, a następnie 0,76 mililitra bezwodnego jednego czterodioksanu trzy razy w temperaturze pokojowej do około 40 stopni Celsjusza, aby usunąć wodę.Rozpuść pozostałość w 0,76 mililitra bezwodnego jednego czterodioksanowego i mieszaj mieszaninę reakcyjną w temperaturze refluksu przez jedną godzinę, aby utworzyć ester boronowy jako tymczasową ochronę. Usunąć rozpuszczalnik za pomocą wyparki obrotowej, a następnie pompy próżniowej. Tymczasem w 10-mililitrowej kolbie okrągłodennej z dwiema szyjkami z dołączoną przegrodą dodaj 150 miligramów proszku z sitami molekularnymi o średnicy czterech angstremów.Podgrzej sita molekularne w kuchence mikrofalowej pod ciśnieniem atmosferycznym. Następnie schładzaj je pod zmniejszonym ciśnieniem, trzykrotnie opróżniane przez pompę próżniową. Po schłodzeniu osuszyć sita opalarką pod zmniejszonym ciśnieniem, kilkakrotnie zastępując powietrze argonem.Aby przeprowadzić glikozylację, należy rozpuścić pozostałość powstałą w wyniku dekompresji próżniowej w 1,50 mililitra bezwodnego propionitrylu i przenieść ten roztwór do kolby zawierającej sita molekularne. Mieszaninę reakcyjną mieszać w temperaturze pokojowej przez 0,5 godziny, a następnie schłodzić do minus 40 stopni Celsjusza. Teraz dodaj 117,6 miligramów triflatu srebra, a następnie 30,3 mikrolitrów chlorku paratoluenesulfonylu do mieszaniny reakcyjnej w tej samej temperaturze.Mieszaj mieszaninę reakcyjną w temperaturze minus 40 stopni Celsjusza przez 1,5 godziny. Następnie sprawdzić reakcję za pomocą chromatografii cienkowarstwowej z dwoma do jednego octanu dietylu heksanu w celu sprawdzenia donorów glikozylu i z 10 do jednego chloroformu do metanolu w celu sprawdzenia akceptorów i produktów glikozylu. Zgasić mieszaninę reakcyjną 2,0 mililitrami nasyconego wodnego wodorowęglanu sodu.Następnie rozcieńczyć reakcję 3,0 mililitrami chloroformu. Teraz usuń nierozpuszczalne materiały przez kelit i ostrożnie umyj go 30 mililitrami chloroformu. Za pomocą 100-mililitrowego lejka separatora przemyć filtrat trzykrotnie 30 mililitrami nasyconego wodnego wodorowęglanu sodu.Następnie przemyć filtrat 30 mililitrami solanki. Wysuszyć powstałą warstwę organiczną siarczanem sodu. Po przefiltrowaniu materiałów nierozpuszczalnych należy zagęścić filtrat za pomocą wyparki obrotowej.Oczyścić pozostałą pozostałość za pomocą chromatografii kolumnowej z żelem krzemionkowym z gradientem metanolu chloroformowego w zakresie od stosunku jeden do zera do stosunku 30 do jednego, aby uzyskać Beta-22. Kontynuuj syntezę innych związków zgodnie z opisem w protokole tekstowym. W 10-mililitrowej kolbie w kształcie gruszki rozpuść 34,3 miligrama Urydyny 10 w jednym mililitrze bezwodnej pirydyny.Dodać 40,0 miligramów czterech kwasów trifluorometylofenyloboronowych 11C. Mieszaninę reakcyjną należy trzykrotnie odparować z jednym mililitrem bezwodnej pirydyny, a następnie trzykrotnie jeden mililitr bezwodnego jednego czterodioksanu w temperaturze pokojowej do około 40 stopni Celsjusza w celu usunięcia wody. Pozostałość rozpuścić w bezwodnych 1,40 mililitra jednego czterodioksanu.Następnie mieszaj mieszaninę reakcyjną w temperaturze refluksu przez godzinę, aby utworzyć ester boronowy jako tymczasową ochronę. Teraz dozuj 0,14 mililitra mieszaniny reakcyjnej do pięciomililitrowej fiolki. Usunąć rozpuszczalnik z pięciomililitrowej fiolki za pomocą wyparki obrotowej, a następnie pompy próżniowej.Powstałą pozostałość rozpuścić w 0,64 mililitra acetonitrylu tridutero. Na koniec zmierz widmo NMR protonu, boru 11 i fluoru 19 za pomocą kwarcowej rurki NMR w temperaturze 25 stopni Celsjusza. Zoptymalizowano warunki reakcji glikozylacji urydyny 10 z donorem glikozylu Alfa-nine.Warunek, jak pokazano w pozycji 12, dał nukleozydowi disacharydowemu alfa i beta-12 najwyższą wydajność chemiczną. Pokazano tutaj wyniki glikozylacji różnych nukleozydów 10 i 13 do 20 z donorem glikozylu Beta-21, które przy zastosowaniu w zoptymalizowanych warunkach reakcji zapewniają odpowiednie nukleozydy disacharydowe od Beta-22 do Beta-30 z najwyższą wydajnością. Podczas próby tej procedury bardzo ważne jest, aby uzyskać warunki bezwodne przy użyciu wystarczającej ilości wysuszonej kolby, sit molekularnych i rozpuszczalników, aby uniknąć hydrolizy estru borowego na donorze glikozylu.Zastosowanie czasowej ochrony grup hydroksylowych przez ester boronowy będzie przydatne do syntezy różnorodnych związków naturalnych i sztucznych, a także nukleozydów disacharydowych.

regioselective-o-glycosylation-nucleosides-via-temporary-2-3-diol

Research

JoVE Journal

Chemistry

Chemia

W niniejszym artykule przedstawiono wysokoprzepustową metodę syntezy oligosacharydów oraz ich przyłączania do powierzchni nanocząsteczek polianhydrydu w celu ich dalszego wykorzystania w celowaniu w specyficzne receptory na komórkach prezentujących antygen.

Wysokoprzepustowa synteza węglowodanów i funkcjonalizacja nanocząstek polianhydrydu

Protokół opisany tutaj ma na celu wyjaśnienie i skrócenie licznych przeszkód na drodze skomplikowanej drogi prowadzącej do zmodyfikowanych trifosforanów nukleozydów. W związku z tym protokół ten ułatwia zarówno syntezę tych aktywowanych elementów budulcowych, jak i ich dostępność do praktycznych zastosowań.

Trifosforany nukleozydów - od syntezy do charakterystyki biochemicznej

Glikozydy indoksylowe są dobrze znanymi i szeroko stosowanymi narzędziami do badań przesiewowych enzymów i monitorowania aktywności enzymów. Zwłaszcza w przypadku struktur typu glukozy poprzednie syntezy okazały się trudne i mało wydajne. Nasze nowatorskie podejście wykorzystuje estry kwasów indoksylowych jako cenne produkty pośrednie, aby uzyskać znaczną liczbę glikozydów indoksylowych z dobrą wydajnością.

Synteza indoksylglikozydów do wykrywania aktywności glikozydazy

Modułowe podejście do syntezy N-glikanów do dołączania do szkiełka pokrytego tlenkiem glinu (ACG) jako mikromatrycy glikanowej zostało opracowane i zademonstrowano jego zastosowanie do profilowania przeciwciała neutralizującego wirusa HIV.

Chemoenzymatyczna synteza N-glikanów do tworzenia macierzy i profilowania przeciwciał HIV

Ten artykuł zawiera szczegółową procedurę syntezy, oczyszczania i charakterystyki dodekamerów RNA modyfikowanych w pozycji C2'-O. Analizy fotometryczne UV-vis i dichroizmu kołowego służą do ilościowego określania i charakteryzowania aspektów strukturalnych, tj. jednoniciowych lub dwuniciowych.

Protokół syntezy w fazie stałej oligomerów RNA zawierających modyfikację 2'-O-tiofenylometylu i charakterystykę za pomocą dichroizmu kołowego

Analizy biochemiczne i strukturalne glikozylowanych białek wymagają stosunkowo dużej ilości jednorodnych próbek. W tym miejscu przedstawiamy skuteczną metodę chemiczną specyficznej dla miejsca glikozylacji rekombinowanych białek oczyszczonych z bakterii poprzez celowanie w reaktywne tiole Cys.

Ukierunkowanie tioli cysteinowych na glikozylację białek rekombinowanych in vitro specyficzną dla miejsca

Ester 2-azydo-1-azotanu może zostać przekształcony w odpowiadający mu 2-azydo-1-trichloroacetimidian w procedurze jednoetapowej. Celem pracy jest wykazanie przydatności reaktora mikrofalowego w syntezie węglowodanów.

Jednodomowa konwersja anomerycznych estrów azotanów do trichloroacetimidianów w jednym garnku wspomagana mikrofalami

Ten protokół pokazuje, jak używać oprogramowania Auto-CHO do hierarchicznej i programowalnej jednogarnkowej syntezy oligosacharydów. Opisano w nim również ogólną procedurę eksperymentów z oznaczaniem RRV i jednogarnkową glikozylacją SSEA-4.

Hierarchiczna i programowalna jednoetapowa synteza oligosacharydów

Tutaj proponujemy prosty protokół łączący metaboliczną inżynierię oligosacharydów, chemię kliknięć i mikroskopię ekspansji, który umożliwia bioobrazowanie wewnątrzkomórkowych sjalowanych N-glikoprotein z lepszą rozdzielczością przy użyciu rutynowego sprzętu mikroskopowego.

Wizualizacja sialilacji wewnątrzkomórkowej za pomocą chemii kliknięć i mikroskopii ekspansyjnej

Opisano metodę syntezy wrażliwych na powietrze tytanowych i wanadowych środków przeciwnowotworowych, wraz z oceną ich aktywności cytotoksycznej w stosunku do ludzkiej linii komórek rakowych za pomocą testu MTT.

Przeciwnowotworowe kompleksy metalowe: synteza i ocena cytotoksyczności za pomocą testu MTT

Poznaj metodę regioselektywnej O-glikozylacji nukleozydów z wykorzystaniem tymczasowej ochrony boronowym estry 2',3'-diolu. Technika ta umożliwia syntezę disacharydowych nukleozydów bez konieczności stosowania chroniących grup.

Regioselektywna O-glikozylacja nukleozydów poprzez tymczasową ochronę 2,3-diolem przez ester boronowy do syntezy nukleozydów disacharydowych (Wideo) | JoVE Journal

Regioselektywna O-glikozylacja nukleozydów poprzez tymczasową ochronę 2',3'-diolem przez ester boronowy do syntezy nukleozydów disacharydowych

Przeglądaj więcej filmów