Test do ilościowego określania wiązania białka-RNA u bakterii

Charakterystyka wiązania białek z RNA in vivo pozostaje dużym wyzwaniem ze względu na złożony charakter RNA i wiele czynników wpływających na jego interakcję z białkami. Białko wiążące RNA lub powinowactwo RBP-RNA mierzy się w żywych komórkach bakteryjnych. Ponieważ środowisko komórkowe wpływa zarówno na strukturę RNA, jak i wynikowe wiązanie RBP-RNA, pomiar powinowactwa in vivo ma kluczowe znaczenie dla zrozumienia takich interakcji w systemach naturalnych.

Sekret sukcesu tkwi w konstrukcji plazmidów. W projekcie należy wykorzystać kilka fal delta i unikać wstawiania kodonów stop i mutacji przesunięcia ramki odczytu. Rozpocznij ten protokół od zaprojektowania kasety miejsca wiązania.