-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

PL

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

pl_PL

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biochemistry
Uniwersalny uchwyt na próbki do makromolekularnej krystalografii rentgenowskiej z minimalnym rozp...
Uniwersalny uchwyt na próbki do makromolekularnej krystalografii rentgenowskiej z minimalnym rozp...
JoVE Journal
Biochemistry
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochemistry
An All-in-one Sample Holder for Macromolecular X-ray Crystallography with Minimal Background Scattering

Uniwersalny uchwyt na próbki do makromolekularnej krystalografii rentgenowskiej z minimalnym rozpraszaniem tła

Full Text
13,881 Views
07:55 min
July 6, 2019

DOI: 10.3791/59722-v

Christian G. Feiler1, Dirk Wallacher2, Manfred S. Weiss1

1Macromolecular Crystallography (HZB-MX),Helmholtz-Zentrum Berlin, 2Department Sample Environment,Helmholtz-Zentrum Berlin

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Przedstawiono nowatorski uchwyt na próbki do makromolekularnej krystalografii rentgenowskiej wraz z odpowiednim protokołem postępowania. System umożliwia wzrost kryształów, wygrzewanie kryształów i gromadzenie danych dyfrakcyjnych in situ zarówno w temperaturze otoczenia, jak i kriogenicznej, bez konieczności jakiejkolwiek manipulacji kryształami lub montażu.

Ten uchwyt na próbki może być używany do hodowli kryształów i zbierania danych dyfrakcji rentgenowskiej. Ten uchwyt na próbki został stworzony do użytku na płytkach 24-dołkowych, które są szeroko stosowane w społeczności MX. Bardzo ważnym aspektem jest to, że nie jest potrzebna żadna manipulacja.

Uchwyt na próbkę z opisanymi tutaj aspektami wcześniej nie istniał. Zobaczenie czegoś jest zawsze o wiele lepsze niż tylko czytanie o tym. Oglądając film, potencjalny użytkownik może natychmiast zrozumieć funkcje i zawiłości nowego uchwytu na próbki.

Na początek stwórz czystą i wolną od kurzu powierzchnię za pomocą wilgotnej, niestrzępiącej się szmatki. Wyjmij jeden uchwyt na próbkę z pudełka i delikatnie umieść go żółtą folią skierowaną do góry na czystej powierzchni, aby uniknąć uszkodzenia lub niepożądanego przebicia tylnej folii COC. Umieść krople krystalizacji na żółtej folii, tak jak robiłoby się to na powszechnie używanych szkiełkach ochronnych.

Krople należy rozmieszczać delikatnie, aby uniknąć pęknięcia lub przebicia folii za pomocą pipety. W przypadku uchwytów na próbki typu 2 i typu 3 zalecane są dwie krople. Na uchwycie na próbkę typu 1 można umieścić do trzech kropli.

Odwróć uchwyt próbki i umieść go na wstępnie nasmarowanej wnęce 24-dołkowej płytki typu Linbro. Użyj pomocy pozycjonujących uchwytu na próbkę, aby poprowadzić go do optymalnej pozycji. Upewnij się, że uchwyt na próbkę znajduje się w prawidłowym położeniu, aby uniknąć niepożądanego parowania.

Umieszczając płytkę krystalizacyjną pod mikroskopem światła transmisyjnego, bez polaryzatorów lub bez, monitoruj wzrost kryształów bez żadnych zakłóceń eksperymentu. Wykonaj krioochronę pod mikroskopem światła transmisyjnego. Delikatnie przekłuj zewnętrzną folię COC za pomocą drobnej kaniuli.

Upewnij się, że wewnętrzna żółta folia pozostaje nietknięta. Nakłucie powinno znajdować się tuż obok kropli, która ma być manipulowana. Włóż cienki papierowy do wybitego otworu.

Ostrożnie popchnij do przodu, aż dotknie żółtej folii poliimidowej. Utrzymuj w kontakcie z perforowaną folią. odessie cały nadmiar roztworu.

Czas potrzebny do całkowitego usunięcia cieczy zależy od lepkości roztworów i składu ługu macierzystego. Po odessaniu całego płynu delikatnie cofnij papierowy. Należy pamiętać o położeniu kropli, ponieważ może ona nie być widoczna po usunięciu ługu macierzystego.

Weź standardową pipetę, aby nałożyć niewielką objętość roztworu krioochronnego, używając wytłaczanej końcówki przez ten sam otwór. Aby ponownie uszczelnić samonaprawiającą się folię COC, delikatnie przyłóż chroniony palec do otworu na około jedną sekundę i przesuń go po nakłuciu. Niewielki nacisk w połączeniu z podwyższoną temperaturą sprzyja ponownemu uszczelnianiu nakłuć, które nie są zbyt duże.

Rozpuścić ligand w ługu macierzystym w pożądanym stężeniu w probówce reakcyjnej. Wirować roztwór przez 10 minut z prędkością 12 000 g w celu usunięcia nierozpuszczalnych cząstek. W razie potrzeby użyj wirówki o kontrolowanej temperaturze.

Delikatnie umieścić maksymalnie trzy mikrolitry roztworu zawierającego ligand w szczelinie między folią COC a folią poliimidową za pomocą długiej, wytłaczanej końcówki pipety; Schowaj końcówkę. Aby ponownie uszczelnić samonaprawiającą się folię COC, delikatnie przyłóż chroniony palec do otworu na około jedną sekundę i przesuń go po nakłuciu. Inkubuj eksperyment przez jakiś czas, aby umożliwić dyfuzję przez błonę.

Czas namaczania w dużym stopniu zależy od lepkości roztworu dyfuzyjnego i jego składników. Powtórz etapy namaczania ligandów wiele razy, aby następnie namoczyć różne ligandy. Aby zminimalizować rozproszenie rozpuszczalnika, przed zebraniem danych należy usunąć nadmiar roztworu.

Zapewnij stabilne środowisko linii badawczej o kontrolowanej wilgotności z wcześniej ustalonymi warunkami. Aby przeprowadzić zbieranie danych dyfrakcyjnych in situ w temperaturze otoczenia, delikatnie podnieś przezroczystą folię COC w wyznaczonym miejscu za pomocą kleszczy i odklej ją. Teraz delikatnie wyjmij uchwyt próbki z wnęki i natychmiast włóż go do wstępnie przygotowanej magnetycznej podstawy uchwytu na próbkę.

Na tym etapie nie jest potrzebny klej. Zastosuj delikatny nacisk, aby zapewnić prawidłowe ustawienie uchwytu próbki w podstawie. W przypadku uchwytów na próbki ze zdejmowanym pierścieniem zewnętrznym należy delikatnie docisnąć, przytrzymując pierścień zewnętrzny, a następnie odłamać go w wyznaczonych punktach przerwania.

Próbka jest teraz gotowa do centrowania i zbierania danych dyfrakcyjnych. Zamontuj uchwyt próbki na goniometrze linii badawczej i upewnij się, że uchwyt jest prawidłowo ustawiony. W zależności od geometrii goniometru, uchwyt próbki można obrócić nawet o 160 stopni bez powodowania zacienienia podczas eksperymentu dyfrakcyjnego.

Użyj papierowego i delikatnie dotknij żółtej folii poliimidowej od tyłu, aby usunąć nadmiar ługu macierzystego. Próbka jest teraz gotowa do centrowania i zbierania danych dyfrakcyjnych. Przygotuj się do zbierania danych dyfrakcyjnych in situ w temperaturze kriogenicznej, tak jak w przypadku temperatury otoczenia, a następnie zanurz próbkę w ciekłym azocie i przenieś ją do fiolki kompatybilnej ze SPINE.

Geometria uchwytów na próbki typu 2 i 3 umożliwia ich przeniesienie do standardowych fiolek na próbki SPINE, które mogą być używane do montażu próbki wspomaganego przez robota. Uchwyt na próbkę typu 1 i typu 2 został zaprojektowany tak, aby pasował do studzienki 24-dołkowej płytki typu Linbro. Każdy pojedynczy uchwyt na próbkę zawiera pomoce pozycjonujące po obu stronach zewnętrznej krawędzi w celu zapewnienia optymalnego ustawienia na krawędzi studzienki.

Użyto 24-dołkowej płytki w stylu Linbro z uchwytem na próbkę typu 1, aby zrównoważyć spadek o temperaturze 293 kelwinów z 500 mikrolitrami ługu macierzystego. Kryształy o wielkości od 40 do 50 mikronów obserwowano po pięciu godzinach przy użyciu mikroskopu światła transmisyjnego z polaryzatorem lub bez. Uchwyt na próbkę z kryształami lizozymu z białka jaja kurzego umieszczono w strumieniu powietrza o kontrolowanej wilgotności na linii badawczej HZB-MX 14.3.

Pokazany jest tutaj typowy obraz dyfrakcyjny. Nie można wykryć zwiększonego rozproszenia tła na obrazie dyfrakcyjnym. Bardzo ważne jest, aby unikać zanieczyszczeń folii poliimidowej.

Ponadto ważne jest, aby uchwyt na próbkę był dokładnie ustawiony, a manipulacja kryształami przeprowadzona ostrożnie. Uchwyt na próbkę umożliwia manipulowanie bardzo delikatnymi kryształami, co jest jednym z najważniejszych etapów krystalografii mikromolekularnej. Jego użycie znacznie zmniejsza szansę na zniszczenie próbki.

Explore More Videos

Uchwyt próbki makromolekularna krystalografia rentgenowska rozpraszanie tła dane dyfrakcji rentgenowskiej płytki 24-dołkowe krople krystalizacji pomoce pozycjonujące zapobieganie parowaniu mikroskop światła transmisyjnego krioprotekcja usuwanie cieczy skład ługu macierzystego

Related Videos

Mikrokrystalografia kryształów białek i dyfrakcji celulolo

09:35

Mikrokrystalografia kryształów białek i dyfrakcji celulolo

Related Videos

9.6K Views

Charakterystyka biochemiczna i strukturalna białka wiążącego substrat transportu węglowodanów SP0092

08:53

Charakterystyka biochemiczna i strukturalna białka wiążącego substrat transportu węglowodanów SP0092

Related Videos

31.6K Views

Połączenie krystalografii rentgenowskiej z rozpraszaniem promieniowania rentgenowskiego pod małym kątem w celu modelowania nieustrukturyzowanych obszarów Nsa1 z S. cerevisiae

09:15

Połączenie krystalografii rentgenowskiej z rozpraszaniem promieniowania rentgenowskiego pod małym kątem w celu modelowania nieustrukturyzowanych obszarów Nsa1 z S. cerevisiae

Related Videos

10.4K Views

Chipy mikroprzepływowe do dyfrakcji rentgenowskiej kryształów in situ i dynamicznego rozpraszania światła in situ do krystalografii szeregowej

11:48

Chipy mikroprzepływowe do dyfrakcji rentgenowskiej kryształów in situ i dynamicznego rozpraszania światła in situ do krystalografii szeregowej

Related Videos

15.3K Views

Synchrotronowe obrazowanie mikrodyfrakcji rentgenowskiej i fluorescencji próbek minerałów i skał

10:12

Synchrotronowe obrazowanie mikrodyfrakcji rentgenowskiej i fluorescencji próbek minerałów i skał

Related Videos

9.6K Views

Roztwór strukturalny białka fluorescencyjnego Cerulean za pomocą MeshAndCollect

06:42

Roztwór strukturalny białka fluorescencyjnego Cerulean za pomocą MeshAndCollect

Related Videos

6.2K Views

W pełni autonomiczna charakterystyka i zbieranie danych z kryształów makrocząsteczek biologicznych

07:11

W pełni autonomiczna charakterystyka i zbieranie danych z kryształów makrocząsteczek biologicznych

Related Videos

7.3K Views

Krystalizacja białek na chipie za pomocą mikrodializy do badań dyfrakcji rentgenowskiej in situ

12:38

Krystalizacja białek na chipie za pomocą mikrodializy do badań dyfrakcji rentgenowskiej in situ

Related Videos

7K Views

Rurociąg przygotowania próbek mikrokryształów na linii badawczej VMXm

09:00

Rurociąg przygotowania próbek mikrokryształów na linii badawczej VMXm

Related Videos

3.5K Views

Protokół przygotowania i transferu próbki do krystalografii długofalowej w próżni na linii badawczej I23 przy diamentowym źródle światła

10:32

Protokół przygotowania i transferu próbki do krystalografii długofalowej w próżni na linii badawczej I23 przy diamentowym źródle światła

Related Videos

3.2K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code