February 11th, 2020
Ta praca opisuje protokół ilościowego oznaczania poziomu etanolu w zarodku danio pręgowanego za pomocą chromatografii gazowej w przestrzeni głowy, od właściwych metod ekspozycji do przetwarzania zarodków i analizy etanolu.
Protokół ten jest istotny, ponieważ pomaga w zrozumieniu farmakokinetyki etanolu w rozwoju zarodków danio pręgowanego, a to pomoże ustandaryzować reżimy ekspozycji na etanol w badaniach nad danio pręgowanym. Główną zaletą naszej techniki jest to, że pozwala ona naukowcom na szybki i powtarzalny pomiar poziomu etanolu podczas rozwoju embrionalnego, szczególnie w przypadku zarodków, w których nie ma dostępu do krwi. Metodę tę można łatwo zastosować do innych systemów modelowych, a także innych czynników środowiskowych, zakładając odpowiednią technikę i konfigurację sprzętu.
Spodziewałbym się, że osoby wykonujące ten protokół po raz pierwszy będą zmagać się z szybkością niezbędną do zapobieżenia parowaniu etanolu podczas przetwarzania zarodków. Zacznij od przeniesienia 10 zarodków z dodatkowym płynem embrionalnym do 1,5 mililitrowych probówek wirówkowych oznaczonych linią o objętości 250 mikrolitrów. Dodaj wodę do linii napełniania.
Przygotować dodatkowe probówki do mikrowirówek do próbek odkoryzowanych. Aby usunąć kosmówkę, inkubuj zarodki na 100-milimetrowej szalce Petriego z dwoma miligramami na mililitr koktajlu proteazy w pożywce zarodkowej przez 10 minut. Delikatnie obracaj naczynie co kilka minut, aby przełamać kosmówkę.
Gdy wszystkie zarodki są wolne od kosmówki, usuń je z koktajlu proteazy i umyj je dwukrotnie świeżą pożywką. Następnie przenieś zarodki do świeżej 100-milimetrowej naczynia. Gdy wszystkie próbki są gotowe do pomiaru objętości, użyj mikropipety P200 z najmniejszą możliwą końcówką, aby ostrożnie usunąć cały płyn z okolic zarodków.
Zważ wodę wagą z dokładnością mniejszą niż 0,1 miligrama, a następnie określ objętość 10 zarodków, odejmując wagę usuniętej wody od 250 mikrolitrów. Aby określić objętość pojedynczego zarodka, podziel różnicę przez 10. Zbierz zarodki ze zbiorników kryjących i umieść je na standardowej 100-milimetrowej szalce Petriego, a następnie inkubuj szalkę w temperaturze 28,5 stopnia Celsjusza.
Po sześciu godzinach od zapłodnienia przenieś do 100 zarodków do nowej pożywki z pożywką dla zarodków i 1% etanolem lub samą pożywką. Przykryj, ale tak, aby nie zamykać szalek Petriego i umieść je w inkubatorze o temperaturze 28,5 stopnia Celsjusza na 18 godzin lub do momentu, gdy osiągną 24 godziny po zapłodnieniu. Użyj dwóch mikropipet P200 ustawionych na 50 mikrolitrów i odessaj roztwór koktajlu proteazy do jednej, a wody do drugiej.
Następnie szybko umieść 10 zarodków w 1,5-mililitrowej probówce mikrowirówkowej za pomocą szklanej pipety i zamknij nakrętkę. Powtórzyć ten proces dla wszystkich próbek, które mają być badane, próbek kontrolnych i zarodków poddanych działaniu etanolu. Pracując z jedną próbką na raz, szybko otwórz nakrętkę i odessaj wszystkie resztki pożywki zarodkowej za pomocą mikropipety P200 ustawionej na 200 mikrolitrów.
Szybko, ale delikatnie dodaj i usuń 50 mikrolitrów wody, a następnie dodaj 50 mikrolitrów koktajlu proteazy i zamknij nakrętkę tubki. Pozostaw próbkę na 10 minut w temperaturze pokojowej, a następnie szybko dodaj 450 mikrolitrów pięciomolowego chlorku sodu i zamknij nakrętkę probówki. Homogenizować próbkę przez wirowanie przez 10 minut i przenieść dwa mikrolitry supernatantu do fiolki do chromatografii gazowej.
Uszczelnić fiolkę kapslem z politetrafluoroetylenu. Po zakończeniu metody uruchamiania załaduj 436 prądowy etanol SPME od dwóch do pięciu minut RG. metamfetaminy z menu metod w oprogramowaniu do analizy dla każdej próbki z listy próbek.
Wypełnij listę próbek, zaczynając od powietrza, wody i pięciu ślepych półfabrykatów koktajlu z proteazą molowo-chlorkowo-sodową. Następnie wprowadź wzorce etanolu w kolejności od 0,3125 do 40 milimolów. Postępuj zgodnie ze standardami z drugą rundą półfabrykatów.
Wprowadzić wszystkie homogenizowane próbki supernatantu zarodka do badania od najniższego do najwyższego przewidywanego stężenia etanolu i zakończyć wprowadzaniem trzeciej rundy ślepych prób. Dodać fiolki do chromatografii gazowej do automatycznego podajnika próbek w kolejności, w jakiej próbki zostały wprowadzone, i pozostawić je do ogrzania przez 10 do 15 minut. Następnie rozpocznij przykładowe przebiegi za pomocą oprogramowania.
Po zakończeniu wszystkich przebiegów aktywuj metodę zamykania, dodając końcową próbkę do listy przykładów i uruchamiając polecenie standby.meth. Utwórz kopię zapasową wszystkich danych uzyskanych podczas przykładowego przebiegu. Po zakończeniu metody wyłączania kliknij otwórz chromatogram i otwórz folder z wynikami.
Próbki są automatycznie integrowane z tym programem. W wynikach upewnij się, że zostały zintegrowane właściwe szczyty. Po potwierdzeniu wszystkich próbek wydrukuj lub wyeksportuj wyniki.
Wykreśl wysokość piku wzorców etanolu na wykresie, a następnie oblicz nachylenie, punkt przecięcia z osią y i wartości r kwadrat. Wartość alkoholu etylowego dla każdej próbki należy uzyskać, odejmując wysokość piku próbki od punktu przecięcia z osią y wzorców i dzieląc tę wartość przez nachylenie wzorców. Aby obliczyć stężenie etanolu w zarodkach, należy obliczyć współczynnik rozcieńczenia dla każdej próbki i pomnożyć wartość próbki alkoholu etylowego przez ten współczynnik rozcieńczenia.
Na koniec należy obliczyć próbki referencyjne podłoża, mnożąc wartość alkoholu etylowego w pożywce przez współczynnik rozcieńczenia równy 10. Aby prawidłowo obliczyć embrionalne stężenia etanolu, zmierzono objętość zarodków zarówno w ich kosmówce, jak i usuniętych z kosmówki. W tej analizie zarodek stanowił 56% całkowitej objętości wewnątrz kosmówki.
Na podstawie wcześniej opublikowanych prac, 73,6% wykorzystano jako zawartość wody w zarodku we wszystkich prezentowanych analizach. W ten sposób powstała woda składająca się z 0,82 mikrolitra z 1,1 mikrolitra objętości embrionalnej. Z całkowitej objętości wody 49% znajduje się w zarodku, a 51% w płynie pozazarodkowym.
Do analizy metodą chromatografii gazowej analizowano dwie grupy po 15 próbek oraz pożywki, którymi je traktowano, mierzone pięć razy na grupę. Poziomy etanolu w pożywce wynosiły 143,6 milimola dla grupy pierwszej i 133,6 milimola dla grupy drugiej. Stężenia etanolu w zarodkach wynosiły średnio 63,5 milimola i 53,1 milimola odpowiednio dla grupy pierwszej i drugiej.
Obliczono stosunek stężenia etanolu w zarodku do poziomów etanolu w pożywkach dla każdej próbki. Grupa pierwsza miała 44% poziomów etanolu w pożywce, podczas gdy grupa miała 40% poziomów etanolu w pożywce. Nieleczone zarodki kontrolne mierzono przy zerowym stężeniu etanolu w pożywce milimolowej.
Najważniejszą rzeczą, o której należy pamiętać podczas wykonywania tej procedury, jest to, że prawidłowe przetwarzanie zarodków do analizy GC ma kluczowe znaczenie, ponieważ etanol jest lotny i szybko odparowuje. Opisano najlepszy sposób wykonania tego kroku, ale należy go ćwiczyć, aby rozwinąć prawidłową pamięć mięśniową. Procedura ta pomoże ustandaryzować schematy leczenia etanolem u danio pręgowanego i umożliwi przyszłe prace mające na celu analizę genetycznych i komórkowych mechanizmów teratogenności etanalnej.
View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos
To dzieło opisuje protokół do ilościowego oznaczania poziomów etanolu w zarodkach danio rzecznego za pomocą gazowej chromatografii w przestrzeni głowowej. Metoda pomaga w zrozumieniu farmakokinetyki etanolu w trakcie rozwoju embrionalnego.
Standardizing ethanol exposure quantification addresses variability in zebrafish models of fetal alcohol spectrum disorders, improving reproducibility in mechanistic toxicology studies. Reliable measurement of embryonic ethanol levels enables predictive de-risking of teratogenicity assays and supports cross-laboratory data alignment. This capability strengthens target validation workflows by providing pharmacokinetic context for ethanol-induced developmental phenotypes.
The method fits within early discovery to preclinical workflows by providing internal dose quantification that informs hazard assessment and lead identification in developmental toxicology programs.