Ocena funkcjonalna wariantów BRCA1 za pomocą edytorów bazowych za pośrednictwem CRISPR

Dzięki skutecznej indukcji mutacji punktowych za pomocą edytora zasad cytozynowych za pośrednictwem CRISPR, można zidentyfikować funkcjonalność wariantów BRCA1, która jest ważna w zapobieganiu chorobom i diagnozowaniu. Zaletą tej techniki jest to, że bezpośrednio mutuje endogenną ekspresję BRCA1, co pozwala przezwyciężyć ograniczenia oceny funkcjonalnej przy użyciu egzogennej ekspresji BRCA1. Identyfikacja mutacji powodujących utratę funkcji BRCA1 może być wykorzystana do przewidywania prawdopodobieństwa wystąpienia nowotworów związanych z mutacjami BRCA1, takich jak rak piersi, jajnika, prostaty i trzustki.

Może być również używany do znajdowania potencjalnych celów leków poprzez poszukiwanie niezbędnych genów, których żywotność jest zmniejszona przez wyczerpanie funkcjonalne. Na początek uzyskaj sekwencję genomu BRCA1 z GenBank w NCBI i przeszukaj 20 miejsc docelowych par zasad za pomocą sekwencji motywu sąsiadującego z protospacerem, NGGNCCN, wokół interesującej mutacji. Mutacja, która jest przedmiotem zainteresowania, powinna być zlokalizowana w obrębie czterech do ośmiu nukleotydów w PAM-dystalnym końcu docelowych sekwencji przewodnika RNA.