Name: Obrazowanie kolców dendrytycznych u Caenorhabditis elegans (Wideo) | JoVE Journal
Uploaded: 2021-09-27T13:30:00.000+00:00
Duration: 9 min 14 s
Description: Poznaj techniki obrazowania kolców dendrytycznych w neuronach GABAergicznych Caenorhabditis elegans. Metoda obejmuje mikroskopię konfokalną i obrazowanie wapnia GCaMP, umożliwiając analizę morfologii i aktywności neuronalnej.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Obrazowanie i analiza na Imaris zostały przeprowadzone w Vanderbilt Cell Imaging Shared Resource (CIRS) wspieranym przez NIH (CA68485, DK20593, DK58404, DK59637, i EY08126). LSM 880 jest wspierany przez grant 1S10OD201630. Obrazowanie na obracającym się dysku firmy Nikon zostało wykonane w Centrum Doskonałości firmy Nikon. Dziękujemy Jenny Schafer, dyrektorce CISR, Bryanowi Millisowi za szkolenie i wnikliwe dyskusje, a także członkom laboratorium Burnette: Dylanowi Burnette'owi, Aidanowi Fenixowi i Nilayowi Taneji za rady. Praca ta była wspierana przez granty National Institutes of Health dla DMM (R01NS081259 i R01NS106951) oraz grant American Heart Association dla ACC (18PRE33960581).

1. Określenie struktury kolców dendrytycznych DD
<ol>
	<li>Twórz transgeniczne robaki, aby oznaczyć kolce DD
	<ol>
		<li>Użyj promotora flp-13, aby zbudować wektor ekspresji dla interesującej Cię etykiety (np. cytoplazmatyczne mCherry, MYR::mRuby, LifeAct::GFP, GFP::utrophina) (<silna klasa="xfig">Rysunek 1). Zobacz pełną listę plazmidów w pliku uzupełniającym 1.</li>
		<li>Użyj sprawdzonych metod, aby wygenerować linię transgeniczną oznaczającą kolce DD kolce8,9.</li>
	</ol>
	</li>
	<li>Przygotuj szczeliwo
	<ol>
		<li>Przygotuj mieszaninę 1:1 podłoża do zatapiania na bazie parafiny10 (patrz Tabela Materiałów).</li>
		<li>Podgrzać pożywkę w temperaturze 60 °C aż do stopienia, a następnie rozdzielić porcję w 1,5 ml zaślepionych probówkach wirówkowych i utrzymywać blok grzewczy w temperaturze 60-70 °C. 
		UWAGA: Szczeliwo może wytrzymać 4 tygodnie w bloku grzewczym.</li>
	</ol>
	</li>
	<li>Przygotuj środek znieczulający.
	<ol>
		<li>Sporządzać roztwory podstawowe w destylowanymH2Oz 1% trikainy i 1 M lewamizolu (patrz tabela materiałów). Przechowywać w temperaturze -20 °C.</li>
		<li>Przygotuj roztwór roboczy składający się z 0,05% trikainy i 15 mM środka znieczulającego lewamizolem, zgodnie z opisem w krokach 1.3.3-1.3.511.</li>
		<li>Wymieszaj 75 μl 1% wywaru trikainowego i 22,5 μl 1 M lewamizolu.</li>
		<li>Dodać bufor M9 do końcowej objętości 1,5 ml.</li>
		<li>Podwielokrotność 10 μl 0,05% trikainy, 15 mM lewamizolu do probówek mikrowirówek o pojemności 0,5 ml i przechowywać w temperaturze -20 °C. 
		UWAGA: Mieszanina znieczulająca jest wrażliwa na temperaturę, a poszczególne porcje roztworu roboczego nie powinny być ponownie zamrażane po rozmrożeniu dla każdego eksperymentu. Zobacz Plik uzupełniający 2, aby zapoznać się z przepisem na bufor M9.</li>
	</ol>
	</li>
	<li>Uzyskiwanie obrazów w wysokiej rozdzielczości
	<ol>
		<li>Przygotować 10% agarozy i przechowywać w łaźni wodnej o temperaturze 60 °C. 
		UWAGA: Zobacz raport Moniki Driscoll w WormBook12.</li>
		<li>Zamontuj 15-20 młodych dorosłych na 10% płatkach agarozowych i dodaj 3 μl środka znieczulającego (patrz krok 3).</li>
		<li>Nałożyć szkiełko nakrywkowe (robaki unieruchamiają się w ciągu 5 minut).</li>
		<li>Uszczelnić krawędzie szkiełka nakrywkowego stopioną mieszaniną kleju i uszczelniacza (patrz Tabela materiałów).</li>
		<li>Uzyskiwanie obrazów
		<ol>
			<li>Akwizycja w super rozdzielczości
			<ol>
				<li>Użyj laserowego skaningowego mikroskopu konfokalnego wyposażonego w mikroskopię superrozdzielczą z soczewką obiektywową olejową Plan-Apochromat 63x/1,40, aby uzyskać mały rozmiar piksela (np. < 50 nm). Kup stosy Z, używając rozmiaru kroku zalecanego przez oprogramowanie producenta (patrz Tabela materiałów).</li>
				<li>Zbierz serię przekrojów optycznych, które obejmują całkowitą objętość wyrostka brzusznego DD (np. 15-20 warstw o rozmiarze kroku 0,19 μm lub grubości 2-3 μm). Prześlij stosy Z do przetwarzania obrazu za pomocą oprogramowania producenta i przeanalizuj obrazy z wynikiem wyższym niż 7 (<silna klasa="xfig">Rysunek 1B, <silna klasa="xfig">Rysunek 2 i <silna klasa="xfig">Rysunek 3).</li>
			</ol>
			</li>
			<li>Przejęcie firmy Nyquist
			<ol>
				<li>Użyj laserowego skaningowego mikroskopu konfokalnego, aby wybrać optymalny rozmiar piksela dla długości fali światła i apertury numerycznej używanej soczewki obiektywu (np. obiektyw 40x/1.4 Plan Fluor oil). 
				UWAGA: Mniejszy rozmiar piksela ujawni delikatną strukturę kolców DD.</li>
				<li>Prześlij stos do dekonwolucji 3D za pomocą algorytmu automatycznego (patrz Tabela materiałów) (<silna klasa="xfig">Rysunek 3).</li>
			</ol>
			</li>
			<li>Użyj najmniejszego możliwego kroku Z (np. określonego przez stolik piezoelektryczny), ponieważ nadpróbkowanie w Z może dać ostrzejsze obrazy po dekonwolucji 3D13.</li>
		</ol>
		</li>
	</ol>
	</li>
	<li>Analiza obrazu
	<ol>
		<li>Użyj odpowiedniego oprogramowania do przetwarzania obrazu (patrz Tabela materiałów), aby utworzyć projekcje maksymalnej intensywności dla Z-stacks14.</li>
		<li>Ręcznie policz występy na dendrycie DD. 
		UWAGA: Wystające elementy są prostopadłymi przedłużeniami wału głównego (<silna klasa="xfig">Rysunek 1B, groty strzałek).</li>
		<li>Określ długość naciętego dendrytu DD, aby obliczyć gęstość kolców na 10 μm dendrytu DD (<silna klasa="xfig">Rysunek 1C).</li>
		<li>Klasyfikuj kolce jako cienkie/grzybowe, filopodialne, przysadziste lub rozgałęzione (<silna klasa="xfig">Rysunek 2A). 
		UWAGA: Cienkie/grzybkowe kolce mają wąską podstawę (szyjkę) i szerszą końcówkę (głowę). Kolce strzałkowo-podzieniowe nie mają zwężonej podstawy (bez szyi), ale mają stałą szerokość. Przysadziste kolce mają szeroką podstawę i końcówkę. Rozgałęzione kolce to wypukłości z więcej niż jedną końcówką.</li>
	</ol>
	</li>
</ol>
2. Ocena aktywacji kolców dendrytycznych DD przez presynaptyczną sygnalizację cholinergiczną
<ol>
	<li>Twórz transgeniczne robaki przy użyciu konwencjonalnych technik (np. mikroiniekcji)8,9
	<ol>
		<li>Użyj promotora flp-13 do sterowania ekspresją czujnika Ca + +, GCaMP6s, w neuronach DD i promotora unc-4 do sterowania ekspresją Chrimson, przesuniętej ku czerwieni rodopsyny kanałowej, w presynaptycznych neuronach VA (<silna klasa = "xfig">Figura 4A). Patrz lista plazmidów w pliku uzupełniającym 1.</li>
	</ol>
	</li>
	<li>Przygotuj płytki All-trans Retinal (ATR) i kontrolne. 
	UWAGA: ATR jest kofaktorem wymaganym, aby Chrimson działał jako optogenetycznie aktywowany kanał jonowy.
	<ol>
		<li>Przygotować 100 mM roztwór podstawowy ATR w etanolu (100%). Przechowywać w temperaturze -20 °C w 1 ml porcji.</li>
		<li>Pod okapem z przepływem laminarnym dodaj 300 μl nocnej kultury bakteryjnej OP50 i 0,25 μl ATR do każdej płytki agarowej o średnicy 60 mm NGM (Nematode Growth Medium) i rozprowadź sterylną szklaną pałeczką.</li>
		<li>W przypadku kontroli dodaj 300 μl bakterii OP50 i 0,25 μl etanolu (100%) do oddzielnej grupy płytek NGM.</li>
		<li>Pozostaw talerze w okapie w temperaturze pokojowej na 24 godziny (chronione przed światłem otoczenia), aby umożliwić rozwój bakterii. 
		UWAGA: Płytki mogą być używane po początkowej 24 godzinnej inkubacji lub utrzymywane w temperaturze 4 °C do użycia w ciągu 5 dni.</li>
	</ol>
	</li>
	<li>Przygotowanie eksperymentu
	<ol>
		<li>Umieść pięć larw w stadium L4 NC3569 na płytkach ATR lub kontrolnych z nasionami OP50, które nie mają ATR i rosną w ciemności w temperaturze 23°C.</li>
		<li>Trzy dni później użyj stereoskopowego mikroskopu preparacyjnego, aby potwierdzić rozwój sromu, aby pobrać potomstwo w stadium L4 z ATR i płytek kontrolnych do obrazowania, jak opisano w krokach 2.4.1-2.4.3.</li>
		<li>Na szkiełku mikroskopowym umieść 2 μl wielokulek 0,05 μm (2,5% ciał stałych w/v) (patrz Tabela materiałów).</li>
		<li>Użyj platynowego drutu ("szpikulca ślimakowego"), aby dodać małą kuleczkę super kleju do roztworu i delikatnie zamieszaj, aby wytworzyć nitkowate "pasma" kleju. Następnie dodaj 3 μl buforu M9 (<silna klasa="xfig">Rysunek 4B).</li>
		<li>Umieścić około dziesięciu larw L4 w roztworze i nałożyć szkiełko nakrywkowe. 
		UWAGA: Włókna kleju będą losowo stykać się z robakami i unieruchamiać je po nałożeniu szkiełka nakrywkowego. Robaki, które są osadzone w dużych kulełkach kleju, wyglądają na wysuszone i nie powinny być obrazowane.</li>
		<li>Uszczelnić krawędzie szkiełka nakrywkowego, jak wspomniano w kroku 1.4.4.</li>
	</ol>
	</li>
	<li>Rejestracja wywołanych stanów przejściowych Ca++ w kolcach dendrytycznych.
	<ol>
		<li>Użyj mikroskopu konfokalnego z wirującym dyskiem wyposażonego w czułą kamerę CCD, soczewkę obiektywu olejowego TIRF 100x oraz linie laserowe 488 nm i 561 nm (patrz tabela materiałów).</li>
		<li>Dostosuj stolik mikroskopu, aby ustawić kolce DD w płaszczyźnie ogniskowej.</li>
		<li>Konfiguracja akwizycji poklatkowej w celu oświetlenia próbki linią laserową 488 nm co klatkę (w celu wykrycia fluorescencji GCaMP6s) i linią laserową 561 nm w odstępach czasu (w celu wzbudzenia Chrimsona). 
		UWAGA: Na przykład, użyj światła 488 nm, aby uchwycić kolejne migawki (200 ms) sygnału GCaMP6s sprzężonego z impulsem 200 ms światła 561 nm co 5 klatkę (<silna klasa="xfig">Rysunek 4C-E). Dzięki tej konfiguracji poziomy GCaMP przed i po każdym impulsie 561 nm są wykrywane w odstępie ~1 s (200 ms lasera 488 nm do wykrywania GCaMP przed aktywacją VA, 200 ms impulsu 561 nm do aktywacji VA i ~600 ms do przełączania między liniami laserowymi a filtrami emisyjnymi. Dzięki takiemu ustawieniu neurony VA są aktywowane co 2,5 s.</li>
	</ol>
	</li>
	<li>Analiza obrazowania Ca++ in vivo
	<ol>
		<li>Użyj dekonwolucji 2D i wyrównania obrazu, aby skorygować drobne odchylenia wynikające z ruchu robaka podczas akwizycji (patrz Tabela materiałów).</li>
		<li>Zdefiniuj grzbiet dendrytyczny DD jako obszar zainteresowania (ROI w <silna klasa="xfig">Rysunki 4C-D).</li>
		<li>Zduplikuj ROI i przenieś się do sąsiedniego regionu wewnątrz robaka, aby zebrać sygnał tła (tj. szum).</li>
		<li>Użyj odpowiedniego oprogramowania (patrz tabela materiałów), aby wyeksportować intensywności GCaMP6s do Excela dla każdego punktu czasowego. Odejmij fluorescencję tła od fluorescencji ROI kręgosłupa.</li>
		<li>Określ zmianę fluorescencji, odejmując fluorescencję GCaMP6s w ramce bezpośrednio przed wzbudzeniem 561 nm (F0) od każdego punktu czasowego po wzbudzeniu (ΔF), a następnie dzieląc przez F0, aby określić ΔF/F0 (<silna klasa = "xfig">Rysunek 4E).</li>
		<li>Proszę narysować na wykresie znormalizowane ścieżki (patrz tabela materiałów).</li>
		<li>Wykonaj sparowany test statystyczny dla każdego pomiaru fluorescencji GCaMP6s przed i po każdym impulsie światła o długości fali 561 nm. 
		UWAGA: Takie podejście skutecznie wyklucza losowe fluktuacje fluorescencji GCaMP6s, które w przeciwnym razie zmniejszają moc statystyczną porównywania średniego sygnału GCaMP6s ze wszystkich pomiarów przed i po wzbudzeniu 561 nm (<silna klasa = "xfig" >Rysunek 4F).</li>
		<li>W przypadku pomiarów, które pokazują rozkład normalny lub gaussowski, należy użyć sparowanego parametrycznego testu ANOVA i skorygować dla wielokrotnych porównań dla każdej z dwóch grup (ATR przed i po, brak ATR przed i po). Alternatywnie, w przypadku danych, które nie mają rozkładu normalnego, należy użyć nieparametrycznej ANOVA z poprawką posthoc dla wielu testów. 
		UWAGA: Robaki hodowane na płytkach, które nie mają ATR ("brak ATR") są niezbędne do kontroli i nie powinny wykazywać stanów nieustalonych Ca++ aktywowanych przez 561 nm, ponieważ ATR jest wymagany do funkcji Chrimson.</li>
	</ol>
	</li>
</ol>

<ol><li>Sala, C., Segal, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dendritic+Spines%3A+The+Locus+of+Structural+and+Functional+Plasticity%5BTitle%5D)+AND+%22Physiological+Reviews%22%5BJournal%5D)">Dendritic Spines: The Locus of Structural and Functional Plasticity.</a> Physiological Reviews. 94 (1), 141-188 (2014).</li>
<li>Cuentas-Condori, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((C.+elegans+neurons+have+functional+dendritic+spines%5BTitle%5D)+AND+%22Elife%22%5BJournal%5D)">C. elegans neurons have functional dendritic spines.</a> Elife. 8, 47918(2019).</li>
<li>Philbrook, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Neurexin+directs+partner-specific+synaptic+connectivity+in+C.+Elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Elife%22%5BJournal%5D)">Neurexin directs partner-specific synaptic connectivity in C. Elegans.</a> Elife. 7, 35692(2018).</li>
<li>Oliver, D., Alexander, K., Francis, M. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+Mechanisms+Directing+Spine+Outgrowth+and+Synaptic+Partner+Selection+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Experimental+Neuroscience%22%5BJournal%5D)">Molecular Mechanisms Directing Spine Outgrowth and Synaptic Partner Selection in Caenorhabditis elegans.</a> Journal of Experimental Neuroscience. 12, 10-13 (2018).</li>
<li>Riedl, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lifeact%3A+a+versatile+marker+to+visualize+F-actin%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">Lifeact: a versatile marker to visualize F-actin.</a> Nature Methods. 5, 605-607 (2008).</li>
<li>Ladt, K., Ganguly, A., Roy, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Axonal+actin+in+action%3A+Imaging+actin+dynamics+in+neurons%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+of+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Axonal actin in action: Imaging actin dynamics in neurons.</a> Methods of Cell Biology. 131, 91-106 (2016).</li>
<li>Schild, L. C., Glauser, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dual+color+neural+activation+and+behavior+control+with+chrimson+and+CoChR+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Dual color neural activation and behavior control with chrimson and CoChR in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 200 (4), 1029-1034 (2015).</li>
<li>Mello, C., Kramer, J., Stinchcomb, D., Ambros, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Efficient+gene+transfer+in+C.+elegans%3A+extrahcormosomal+maintenance+and+integration+of+transforming+sequences%5BTitle%5D)+AND+%22The+EMBO+Journal%22%5BJournal%5D)">Efficient gene transfer in C. elegans: extrahcormosomal maintenance and integration of transforming sequences.</a> The EMBO Journal. 10 (12), 3959-3970 (1991).</li>
<li>Berkowitz, L. A., Knight, A. L., Caldwell, G. A., Caldwell, K. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Generation+of+Stable+Transgenic+C+.+elegans+Using+Microinjection%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Generation of Stable Transgenic C . elegans Using Microinjection.</a> Journal of Visualized Experiments. (18), e833(2008).</li>
<li>Smith, C. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Time-lapse+imaging+and+cell-specific+expression+profiling+reveal+dynamic+branching+and+molecular+determinants+of+a+multi-dendritic+nociceptor+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Developemntal+Biology%22%5BJournal%5D)">Time-lapse imaging and cell-specific expression profiling reveal dynamic branching and molecular determinants of a multi-dendritic nociceptor in C. elegans.</a> Developemntal Biology. 345 (1), 18-33 (2010).</li>
<li>Mccarter, J., Bartlett, B., Dang, T., Schedl, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Soma+-+Germ+Cell+Interactions+in+Caenorhabditis+elegans+%3A+Multiple+Events+of+Hermaphrodite+Germline+Development+Require+the+Somatic+Sheath+and+Spermathecal+Lineages%5BTitle%5D)+AND+%22Developemntal+Biology%22%5BJournal%5D)">Soma - Germ Cell Interactions in Caenorhabditis elegans : Multiple Events of Hermaphrodite Germline Development Require the Somatic Sheath and Spermathecal Lineages.</a> Developemntal Biology. 181 (2), 121-143 (1997).</li>
<li>Driscoll, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mounting+animals+for+observation+with+Nomarski+DIC+optics%5BTitle%5D)+AND+%22WormBook%22%5BJournal%5D)">Mounting animals for observation with Nomarski DIC optics.</a> WormBook. , (2008).</li>
<li>North, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Seeing+is+believing%3F+A+beginners%27+guide+to+practical+pitfalls+in+image+acquisition%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Seeing is believing? A beginners' guide to practical pitfalls in image acquisition.</a> Journal of Cell Biology. 172 (1), 9-18 (2006).</li>
<li>Schindelin, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fiji%3A+An+open-source+platform+for+biological-image+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">Fiji: An open-source platform for biological-image analysis.</a> Nature Methods. 9, 676-682 (2012).</li>
<li>Hotulainen, P., Hoogenraad, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Actin+in+dendritic+spines+connecting+dynamics+to+function%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Actin in dendritic spines connecting dynamics to function.</a> Journal of Cell Biology. 189 (4), 619-629 (2010).</li>
<li>Berry, K. P., Nedivi, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spine+Dynamics%3A+Are+They+All+the+Same%5BTitle%5D)+AND+%22Neuron%22%5BJournal%5D)">Spine Dynamics: Are They All the Same.</a> Neuron. 96 (1), 43-55 (2017).</li>
<li>Miller, D. M., Niemeyer, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Expression+of+the+unc-4+homeoprotein+in+Caenorhabditis+elegans+motor+neurons+specifies+presynaptic+input%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">Expression of the unc-4 homeoprotein in Caenorhabditis elegans motor neurons specifies presynaptic input.</a> Development. 121 (9), 2877-2886 (1995).</li>
<li>White, J. G., Southgate, E., Thomson, J. N., Brenner, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Structure+of+the+Ventral+Nerve+Cord+of+Caenorhadbitis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Philosophical+Transactions+of+the+Royal+Society%22%5BJournal%5D)">The Structure of the Ventral Nerve Cord of Caenorhadbitis elegans.</a> Philosophical Transactions of the Royal Society. 275 (938), 327-348 (1976).</li>
<li>Huff, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Airyscan+detector+from+ZEISS+confocal+imaging+with+improved+signal-to-noise+ratio+and+super-resolution%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">The Airyscan detector from ZEISS confocal imaging with improved signal-to-noise ratio and super-resolution.</a> Nature Methods. 12, (2015).</li>
<li>Huff, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Fast+mode+for+ZEISS+LSM+880+with+Airyscan+high-speed+confocal+imaging+with+super-resolution+and+improved+signal-to-noise+ratio%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">The Fast mode for ZEISS LSM 880 with Airyscan high-speed confocal imaging with super-resolution and improved signal-to-noise ratio.</a> Nature Methods. 13, (2016).</li>
<li>Jacquemet, G., Carisey, A. F., Hamidi, H., Henriques, R., Leterrier, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+cell+biologist%27s+guide+to+super-resolution+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Cell+Science%22%5BJournal%5D)">The cell biologist's guide to super-resolution microscopy.</a> Journal of Cell Science. 133 (11), 240713(2020).</li>
</ol>

Oświadczamy, że nie występujemy w przypadku konfliktu interesów.

Detektor Airyscan został wybrany do wykonywania zdjęć kolców DD, ponieważ zapewnia wyższy stosunek sygnału do szumu i lepszą rozdzielczość niż konwencjonalne mikroskopy konfokalne19,20. Obrazowanie AiryScan pozwala również na wykorzystanie konwencjonalnych białek fluorescencyjnych (np. GFP, mCherry itp.), które są obecnie powszechnie dostępne dla C. elegans. Chociaż obrazy o wyższej rozdzielczości można uzyskać za pomocą innych metod superrozdzielczych (np. STORM, STED, PALM), metody te wymagają fotoaktywowanych lub fotoprzełączalnych białek fluorescencyjnych21. Jako alternatywę dla Airyscan polecane są konwencjonalne mikroskopy konfokalne. Na przykład obrazowanie z akwizycją Nyquista (ryc. 3) pozwala osiągnąć rozmiar piksela przy użyciu obiektywu 40x/1,3 nm 123,9 nm, co jest wystarczające do rozróżnienia typów morfologicznych kręgosłupa (ryc. 2).
Do określenia gęstości kręgosłupa zaleca się użycie cytozolowego białka fluorescencyjnego, takiego jak (1) mCherry lub GFP, (2) LifeAct do znakowania cytoszkieletu aktynowego lub (3) mirystoylowanego białka fluorescencyjnego (np. MYR::mRuby) do znakowania błony plazmatycznej (Figura 1B). Dla porównania, białko wiążące F-aktynę Utrophin zmniejsza gęstość kręgosłupa (Figura 1C), co wskazuje na negatywny wpływ na morfogenezę kręgosłupa, gdy utropina jest nadmiernie eksprymowana.
Obecne metody obrazowania powinny pomóc w identyfikacji wariantów genetycznych, które regulują morfologię kręgosłupa 1,16. Morfologia kręgosłupa DD (tj. cienki/grzybowaty, filopodialny, przysadzisty, rozgałęziony, patrz ryc. 2) można ocenić na podstawie pojedynczych projekcji 2D bocznych obrazów brzusznego rdzenia nerwowego, ponieważ większość kolców DD przyjmuje charakterystyczną orientację skierowaną brzusznie. W tych porównaniach ważne jest, aby użyć tego samego markera fluorescencyjnego dla każdego schorzenia, ponieważ pozorne typy morfologiczne kręgosłupa wydają się być pod wpływem metody znakowania (np. MYR::mRuby vs. LifeAct::GFP). Ponadto zauważono, że kształty kręgosłupa są dynamiczne i prawdopodobnie zmieniają kształt w odpowiedzi na sygnały zewnętrzne 2,16. W związku z tym niezbędne jest również porównanie kształtów kręgosłupa między genotypami na podobnych etapach rozwoju i w podobnych warunkach.
Orientacja rdzenia brzusznego C. elegans ma kluczowe znaczenie dla dokładnego uzyskania obrazu. Zarówno sznur brzuszny, jak i grzbietowy po przeciwnych stronach zwierzęcia powinny być widoczne w tej samej płaszczyźnie Z, co wskazuje, że robak jest zorientowany na boku (ryc. 1B). Najlepiej nie zbierać obrazów robaków poruszających się lub mających kontakt z innymi robakami lub pęcherzykami w pobliżu rdzenia brzusznego, ponieważ może to zdegradować obrazy kolców.
W przypadku obrazowania wapnia in vivo świeże preparaty należy przygotować bezpośrednio przed każdym pobraniem. Najlepiej jest obrazować robaki w kontakcie tylko z cienkimi włóknami kleju vs. "kulki" kleju, które mają tendencję do wysuszania robaków i degradacji obrazu (ryc. 4B). W eksperymencie pokazanym na rysunku 4 impuls światła o długości fali 561 nm aktywuje całe pole widzenia. W celu zwiększenia rozdzielczości czasowej i przestrzennej w celu wykrycia lokalnych stanów nieustalonych Ca++ , na przykład w obrębie pojedynczych kolców DD, można użyć miniskanera galvo skonfigurowanego dla linii laserowej 561 nm do stymulacji mniejszego obszaru zainteresowania17.

Kolce dendrytyczne to wyspecjalizowane struktury komórkowe, które otrzymują dane wejściowe od sąsiednich neuronów do transmisji synaptycznej. Aktywacja receptorów neuroprzekaźników podnosi wewnątrzkomórkowy wapń i dalsze szlaki sygnałowe w tych charakterystycznych wypukłościach neuronalnych1. Ze względu na fundamentalne znaczenie kolców dendrytycznych dla neuroprzekaźnictwa i ich nieprawidłowej regulacji w chorobach neurorozwojowych1, odkrycie czynników modulujących morfogenezę i funkcję kolców dendrytycznych jest bardzo interesujące dla dziedziny neuronauki.
Ostatnio, kolce dendrytyczne zostały zidentyfikowane w układzie nerwowym C. elegans na podstawie kluczowych cech wspólnych dla kolców ssaków2. Ustalenie to ma kluczowe znaczenie, ponieważ otwiera możliwość wykorzystania zalet C. elegans do badania biologii kręgosłupa. Kolce dendrytyczne na grzbietowych neuronach ruchowych D (DD) otrzymują dane wejściowe od neuronów cholinergicznych (VA i VB) w brzusznym rdzeniu nerwowym (<silna klasa="xfig">Rysunek 1A)2,3,4. W tym miejscu przedstawiono metody obrazowania w celu zbadania struktury kolców dendrytycznych DD i ich funkcji in vivo w nienaruszonym układzie nerwowym, który jest łatwo dostępny do obrazowania na żywo i analizy genetycznej. Do monitorowania kształtu kolców dendrytycznych, (1) cytozolowe białka fluorescencyjne, które wypełniają proces dendrytyczny i kolce; (2) białka fluorescencyjne związane z błoną, które zdobią granicę kolców dendrytycznych i dendrytów; lub (3) używane są markery aktynowe, LifeAct5 lub Utrophin6, które są wzbogacone w kolce dendrytyczne, ujawniając w ten sposób ich kształt. Aby monitorować funkcjonalność kolców DD, fluorescencja GCaMP jest używana do wykrywania stanów przejściowych Ca++ wywołanych przez aktywację przesuniętej ku czerwieni opsyny, Chrimson, w presynaptycznych neuronach cholinergicznych7. Oczekuje się, że obie strategie ułatwią badanie kolców dendrytycznych DD u zwierząt typu dzikiego i zmutowanego.

<table><tbody><tr><td>All-trans retinal (ATR)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>R2500-100MG</td><td>Niezbędny kofaktor do pobudzenia neuronów za pomocą Chrimson</td></tr><tr><td>diH2O</td><td>MilliQ</td><td></td><td>Aby przygotować bufor M9</td></tr><tr><td>Etanol 100%</td><td>Sigma</td><td>64-17-5</td><td>Aby rozcieńczyć ATR i wykonać płytki kontrolne do wzbudzenia neuronów</td></tr><tr><td>Sól metanosulfonianu 3-aminobenzoesanu etylu (trikaina)</td><td></td><td></td><td>Do unieruchamiania zwierząt do obrazowania kolców dendrytycznych</td></tr><tr><td>ImageJ</td><td>NIH(</td><td>Schindelin J i wsp., 2012)</td><td>Oprogramowanie do przetwarzania obrazów o otwartym kodzie źródłowym</td></tr><tr><td>KH2PO4</td><td>Fisher Bioreagents</td><td>7758-11-4</td><td>Aby przygotować bufor M9</td></tr><tr><td>Chlorowodorek lewamizolu</td><td>Sigma</td><td>16595-80-5</td><td>Do unieruchamiania zwierząt do obrazowania kolców</td></tr> <tr><td>dendrytycznychMgSO4</td><td>Fisher Chemical</td><td>M63-500</td><td>Do przygotowania buforu M9</td></tr><tr><td>Szkło pokrywy mikroskopu</td><td>Fisherbrand</td><td>12542B</td><td>Do montażu zwierząt do akwizycji mikroskopowej</td></tr><tr><td>Na2HPO4</td><td>Fisher Scientific</td><td>S369-500</td><td>Aby przygotować bufor M9</td></tr><tr><td>NaCl</td><td>Fisher Chemical</td><td>S671-3</td><td>Aby przygotować bufor M9</td></tr><tr><td>NIS Elements wersja 05.21</td><td>Nikon</td><td></td><td>Do analizy obrazów i filmów (np. Dekonwolucja, wyrównanie obrazu)</td></tr><tr><td>Polybeads karboksylan 0,05um mikrosfery</td><td>Polysciences, Inc</td><td>15913-10</td><td>Do unieruchamiania zwierząt do obrazowania stanów nieustalonych Ca++</td></tr><tr><td>Pryzmat</td><td></td><td></td><td>Do analizy statystycznej i tworzenia wykresów znormalizowanych stanów nieustalonych Ca++</td></tr><tr><td>SeaKen ME agaroza</td><td>Lonza</td><td>50014</td><td>Do produkcji podkładek agarozowych do mocowania zwierząt do obrazowania</td></tr><tr><td>Super Glue</td><td>Firma</td><td></td><td>goryli Do unieruchamiania zwierząt do obrazowania stanów nieustalonych Ca++</td></tr><tr><td>Szkiełka mikroskopowe Superfrost</td><td>Fisherbrand</td><td>22-034-980</td><td>Do montażu zwierząt do mikroskopii Akwizycja</td></tr><tr><td>wazeliny</td><td>Covidien</td><td>8884430300</td><td>Do uszczelniania próbki do zdjęć konfokalnych</td></tr><tr><td>Wosk</td><td>Fisherbrand</td><td>23-021-399</td><td>Paraplast do zatapiania tkanek medium</td></tr><tr><td>mikroskop do obrazowania superrozdzielczego</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>LSM880</td><td>Detektor Zeiss</td> AiryScan Zeiss <td></td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Plan Apochromat (olej) 63x/ 1,40 NA, WD = 0,19 mm</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Linie</td><td></td><td></td><td></td>laserowe</tr><tr><td>Kontroler stopnia</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Mikroskop do akwizycji obrazów Nyquist</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>A1R Konfokalny</td><td>Nikon</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Plan Fluor (olej) 40x/1.3 NA, WD 0.24 mm</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>488 nm, 16mW</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>561 nm, 17mW</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Mikroskop do monitorowania wywołanych stanów nieustalonych Ca++ w kolcach dendrytycznych</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Spinning Disk Konfokalny</td><td>aparat Nikon</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Andor DU-897 EMCCD</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Głowica z wirującym dyskiem CSU-X1</td><td>Yokogawa</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Apo TIRF (olej) 100x/1.49 NA, WD 0.12 mm</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>488 nm, 65mW</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>561 nm, 86 mW</td><td></td><td></td><td></td>,</tr><tr><td>525 nm (+/- 18 nm)</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>605 nm (+/- 35 nm)</td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

obrazowanie kolców dendrytycznych u caenorhabditis elegans

Imaging Dendritic Spines in Caenorhabditis elegans

Kolce dendrytyczne są wyspecjalizowanymi miejscami unerwienia synaptycznego, modulowanymi przez aktywność i służą jako substraty do uczenia się i pamięci. Ostatnio kolce dendrytyczne zostały opisane dla neuronów DD GABA-ergic jako miejsca wejściowe z presynaptycznych neuronów cholinergicznych w obwodzie motorycznym Caenorhabditis elegans. Ten obwód synaptyczny może teraz służyć jako nowy, potężny model morfogenezy i funkcji kręgosłupa in vivo, który wykorzystuje łatwą genetykę i łatwą dostępność C. elegans do obrazowania żywych komórek. 
Ten protokół opisuje eksperymentalne strategie oceny struktury i funkcji kręgosłupa DD. W tym podejściu strategia obrazowania w superrozdzielczości jest wykorzystywana do wizualizacji skomplikowanych kształtów bogatych w aktynę kolców dendrytycznych. Aby ocenić funkcję kręgosłupa DD, aktywowana światłem opsynana, Chrimson, stymuluje presynaptyczne neurony cholinergiczne, a wskaźnik wapnia, GCaMP, informuje o wywołanych stanach przejściowych wapnia w postsynaptycznych kolcach DD. Razem metody te stanowią potężne podejścia do identyfikacji genetycznych determinantów kolców dendrytycznych u C. elegans, które mogą również kierować morfogenezą i funkcją kręgosłupa w mózgu.

Pomiary z użyciem trzech niezależnych markerów (cytosolowy mCherry, LifeAct::GFP, MYR::mRuby) wykazały średnią gęstość wynoszącą 3,4 ± 1,03 kolców dendrytycznych DD na 10 µm dendrytu DD u młodych osobników typu dzikiego (Rycina 1B,C). Do niniejszej analizy wykluczono pomiary uzyskane z użyciem markera GFP::Utrophin, które wykazały istotnie niższą gęstość kolców dendrytycznych (2,4 ± 0,74, Rycina 1) ze względu na oddziaływania utrofin z cytoszkieletem aktynowym6 co potencjalnie napędza morfogenezę kolców dendrytycznych15Pomiary gęstości kolców w mikroskopie świetlnym są porównywalne z wartością 4,2 kolca/10 µm dendryt uzyskany z rekonstrukcji 12 kolców z mikrografii elektronowych neuronu DD12Metoda obrazowania żywych komórek potwierdziła, że w organizmie dorosłym przeważa cienka lub grzybowata morfologia kolców DD. kontra alternatywne kształty kolców (np. filopodialne, krótkie, rozgałęzione) (Rysunek 2B), co jest również typowe dla kolców w dojrzałym układzie nerwowym ssaków16.
Zastosowano strategię optogenetyczną, aby sprawdzić, czy domniemane kolce dendrytyczne wykryte za pomocą wysokorozdzielczej mikroskopii świetlnej (Rycina 1 i Rysunek 2) reagują na uwalnianie neuroprzekaźników z miejsc presynaptycznych, co jest charakterystyczną cechą kolców dendrytycznych w neuronach ssaków. Światło zielone (561 nm) wykorzystano do aktywacji wariantu channelrhodopsyny, Chrimson, w presynaptycznych neuronach cholinergicznych, a światło niebieskie (488 nm) do detekcji Ca++zależna fluorescencja emitowana przez cytoplazmatyczną sondę GCaMP w postsynaptycznych kolcach dendrytycznych neuronów DD. W eksperymencie tym wykryto przejściowe impulsy sygnału GCaMP w kolcach neuronów DD bezpośrednio po optogenicznej aktywacji białka Chrimson w presynaptycznych neuronach VA (Rycina 3). Sukces tego eksperymentu zależy od wiarygodnej ekspresji Chrimson we wszystkich presynaptycznych neuronach VA. W tym przypadku integrant chromosomalny17 z Punc-4Marker Chrimson został wykorzystany w celu zapewnienia spójnej ekspresji VA. Eksperyment ten można przeprowadzić również z wykorzystaniem macierzy pozachromosomalnej. Ekspresję Chrimson w konkretnym neuronie VA można potwierdzić niezależnie, na przykład poprzez połączenie transgenu Chrimson z sekwencją liderową SL2 trans-spliced oraz zlokalizowanym w jądrze białkiem GFP jako markerem koekspresji.2Niezbędne jest przeprowadzenie eksperymentu kontrolnego w warunkach braku ATR, aby potwierdzić, że mierzony sygnał GCaMP zależy od optogenetycznej aktywacji białka Chrimson, która jest ściśle zależna od ATR (Rycina 4D). W końcu, ponieważ wywołany Ca++ Sygnały są przejściowe, dlatego kluczowe jest zastosowanie protokołu obrazowania umożliwiającego szybkie przełączanie (&lt;1 s) pomiędzy wzbudzeniem 561 nm a akwizycją sygnału GCaMP za pomocą lasera 488 nm (Rycina 4).
<img alt="Schemat nicieni, mikroskopia fluorescencyjna, lokalizacja białek, wykres skrzypcowy gęstości kolców, analiza porównawcza." class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/62676/62676fig1v2.jpg" data-altupdatedat="1788282455000" data-alt="Rycina 1"> 
Rycina 1: Znakowanie kolców dendrytycznych neuronów DD. (A) (Góra) Sześć neuronów grzbietowych D (DD1-DD6) w brzusznych sznurach nerwowych C. elegans. (Dół) U osobników dorosłych, skierowane brzusznie kolce DD (grot strzałki) kontaktują się z terminalami presynaptycznymi brzusznych neuronów ruchowych A (VA) i B (VB) (magenta), a komisury DD rozciągają się do grzbietowego sznura nerwowego, zapewniając wyjście GABAergiczne do mięśni ciała (strzałka)18. Rycina została zmodyfikowana na podstawie Źródła2. (B) Mikrografie fluorescencyjne (Airyscan) kolców DD znakowanych cytozolowym mCherry, mirystylowanym mRuby (MYR::mRuby), LifeAct::GFP oraz GFP::Utrophin u młodych dorosłych nicieni. Szare groty strzałek wskazują kolce. Pasek skali = 2 µm. (C) Gęstość (kolce/10 µm) kolców dendrytycznych neuronów DD znakowanych cytozolowym mCherry (3,77 ± 0,9), MYR::mRuby (3,09 ± 0,8), LifeAct::GFP (3,44 ± 1,1) lub GFP::Utrophin (2,41 ± 0,8). Wszystkie próbki mają rozkład normalny. Jednoczynnikowa analiza wariancji (One-Way ANOVA) wykazuje, że gęstość kolców dla cytozolowego mCherry, MYR::mRuby i LifeAct::GFP nie różni się istotnie (NS), podczas gdy gęstość kolców jest zredukowana dla GFP::Utrophin vs. cytozolowo znakowanego mCherry (p = 0,0016) i LifeAct::GFP (p = 0,0082). Czerwona przerywana linia reprezentuje gęstość kolców neuronów DD ocenioną na podstawie rekonstrukcji EM 3D (4,2 kolce/10 µm). Rycina została zmodyfikowana na podstawie Źródła2. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62676/62676fig1v2large.jpg" target="_blank">Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.</a>
<img alt="Schemat klasyfikacji morfologii kolców dendrytycznych i wykres częstotliwości; grupy LifeAct::GFP vs MYR::mRuby." class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/62676/62676fig02.jpg" data-altupdatedat="1788282455000" data-alt="Rycina 2"> 
Rycina 2: Obrazowanie kolców dendrytycznych DD. (A) (Góra) Schemat kształtów kolców. (Dół) Obrazy Airyscan każdego typu kolca (Pasek skali = 500 nm) znakowanych LifeAct::GFP (zielony) oraz rekonstrukcje 3D wykonane za pomocą seryjnych mikrografii elektronowych po mrożeniu pod wysokim ciśnieniem u osobników dorosłych (niebieski). (B) Częstotliwość występowania kolców w zależności od typu, wizualizowana za pomocą LifeAct::GFP: cienkie/grzybkowate (55.5 ± 14.5%), filopodialne (10.3 ± 8.70%), krępe (18.8 ± 10.7%), rozgałęzione (15.42 ± 6.01%). Częstotliwość występowania kolców w zależności od typu, wizualizowana za pomocą MYR::mRuby: cienkie/grzybkowate (52.2 ± 16.5%), filopodialne (5.68 ± 7.0%), krępe (33.1 ± 14.8%), rozgałęzione (9.02 ± 9.6%). Nieparzysty test t, kolce filopodialne (p = 0.0339), krępe (p = 0.0009) i rozgałęzione (p = 0.011) znakowane markerem MYR::mRuby różnią się istotnie od kolców znakowanych LifeAct::GFP. Rycina została zmodyfikowana na podstawie źródła2. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62676/62676fig02large.jpg" target="_blank">Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tej ryciny.</a>
<img alt="Porównanie mikroskopii Airyscan i Nyquista; ilustracja rozdzielczości obrazowania, wielkości piksela, fluorescencji." class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/62676/62676fig03.jpg" data-altupdatedat="1788282455000" data-alt="Rysunek 3"> 
Rysunek 3: Strategie pozyskiwania obrazów wysokiej rozdzielczości kolców DD. (A-B) (Góra) Obrazy fluorescencyjne dendrytów DD1 znakowanych markerem cytozolowym (mCherry) za pomocą (A) detektora Airyscan oraz (B) akwizycji Nyquista. (Dół) Dendryt DD (czerwony) przedstawiony za pomocą oprogramowania do analizy obrazu (opcja auto-path programu filament tracer), a kolce DD (niebieskie) zilustrowane graficznie przy użyciu półautomatycznego modułu detekcji kolców. Strzałka wskazuje rozgałęziony kolec powiększony na zdjęciach C i D. Groty strzałek oznaczają sąsiadujące kolce cienkie/grzybiaszkowate powiększone na zdjęciach C i D. Pasek skali = 2 µm. (C-D) Powiększone przykłady (góra) kolca rozgałęzionego (strzałka) oraz (dół) dwóch sąsiadujących kolców cienkich/grzybiaszkowatych (groty strzałek) uzyskane za pomocą (C) detektora Airyscan lub (D) akwizycji Nyquista. Pasek skali = 500 nm. Dane powtórzone z2. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62676/62676fig03large.jpg" target="_blank">Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.</a>
<img alt="Eksperyment optogenetyczny; schemat, wyniki obrazowania fluorescencyjnego, analiza odpowiedzi neuronów sensorycznych." class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/62676/62676fig04.jpg" data-altupdatedat="1788282455000" data-alt="Rycina 4"> 
Rycina 4: Ocena funkcji kolców DD. (A) Motoneurony DD wykazują ekspresję wskaźnika Ca++ GCaMP6s (zielony), a motoneurony VA wykazują ekspresję wariantu channelrhodopsyny, Chrimson (magenta)7. (B) Schemat przedstawiający metodę montażu nicieni do pomiarów Ca++. (1) Na czystym szkiełku przedmiotowym (2) nanieść 2 µL kulek polistyrenowych o rozmiarze 0,05 µm, (3) za pomocą drutu platynowego („wykałaczki do nicieni”) dodać małą kroplę superglue i (4) zamieszać w roztworze, aby utworzyć nitkowate pasma kleju. (5) Dodać 3 µL buforu M9. (6) Umieścić około dziesięciu larw w stadium L4 w roztworze, (7) nałożyć szkiełko nakrywkowe i uszczelnić krawędzie wazeliną lub woskiem. (C-D) Aktywacja neuronów VA koreluje z przejściowymi wzrostami poziomu Ca++ w kolcach DD1. Obrazowanie fluorescencji GCaMP6s (w odstępach 0,5 s) z okresową aktywacją Chrimson światłem (w odstępach 2,5 s) wywołuje przejściowe wzrosty Ca++ w grupie (C) +ATR (n = 12), ale nie w grupie (D) kontrolnej (-ATR, n = 12). Panele stanowią migawki w czasie (s), przed i po impulsie światła o długości 561 nm (pionowa różowa linia). Paski skali = 2 µm. Sygnał GCaMP6s jest pobierany z ROI (Region of Interest – obszaru zainteresowania) na końcówce każdego kolca. (E) Wykres fluorescencji GCaMP6s podczas 10 s okresu rejestracji dla grupy +ATR (zielony) vs -ATR (kontrola, szary) (n = 12 filmów). Pionowe różowe paski oznaczają naświetlanie 561 nm (np. aktywacja Chrimson). Każde zwierzę stymulowano 4 razy światłem 561 nm. Pomiary zbierano przed i po każdym impulsie światła 561 nm. (F) Wykres fluorescencji GCaMP6s przed i po każdym impulsie światła 561 nm. Fluorescencję GCaMP6s mierzono 1 s po każdym impulsie światła 561 nm. Ze względu na brak rozkładu normalnego próbek zastosowano sparowany nieparametryczny test Friedmana, aby skorygować wielokrotne porównania fluorescencji GCaMP6s przed vs po stymulacji światłem 561 nm dla nicieni hodowanych z dodatkiem ATR (+ATR, zielony) (*** p = 0,0004, n = 48 pomiarów) lub bez ATR (-ATR, szary) (NS, brak istotności, p = 0,0962, n = 48 pomiarów). Rycina ta została zmodyfikowana na podstawie źródła2. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62676/62676fig04large.jpg" target="_blank">Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.</a>
Plik uzupełniający 1: Lista plazmidów wykorzystanych w badaniu. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62676/Supplementary%20File%201.docx" target="_blank">Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.</a>
Plik uzupełniający 2: Skład i przygotowanie buforu M9. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62676/Supplementary%20File%202.docx" target="_blank">Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.</a>

Kolce dendrytyczne są ważnymi cechami komórkowymi układu nerwowego. W tym miejscu opisano metody obrazowania na żywo służące do oceny struktury i funkcji kolców dendrytycznych u C. elegans. Podejścia te wspierają rozwój zmutowanych badań przesiewowych dla genów, które definiują kształt lub funkcję kolców dendrytycznych.

Obrazowanie kolców dendrytycznych u Caenorhabditis elegans

Dendritic spines are specialized sites of synaptic innervation modulated by activity and serve as substrates for learning and memory. Recently, dendritic ...

Protokół ten opisuje metody wizualizacji morfologii kolców dendrytycznych i stanów przejściowych wapnia w neuronach C.elegans. Nasze podejście powinno ułatwić podejście genetyczne do odkrywania determinantów morfogenezy i funkcji kręgosłupa. Nasz protokół obejmuje kolce dendrytyczne w neuronach GABA-ergicznych.Kolce w innych klasach neuronów C.elegans mogą być również badane za pomocą tych metod. Nasz protokół opisuje metody unieruchamiania żywych C.elegans. Szczególnie ważne jest, aby zapobiec ruchom zwierząt podczas akwizycji obrazu i wybrać odpowiednie konfiguracje lasera do pobudzania i rejestrowania aktywności neuronalnej.Aby uzyskać obrazy o wysokiej rozdzielczości, dodaj trzy mikrolitry roztworu znieczulającego i nałóż od 15 do 20 młodych dorosłych robaków na 10% płatki agarozowe. Następnie nałóż szkiełko nakrywkowe, aby unieruchomić ślimaki i uszczelnij krawędzie szkiełka nakrywkowego stopioną mieszanką kleju uszczelniającego. Aby uzyskać akwizycję w super rozdzielczości, użyj laserowego skaningowego mikroskopu konfokalnego wyposażonego w mikroskopię superrozdzielczą.Zdobądź stosy Z, używając rozmiaru kroku zalecanego przez oprogramowanie producenta. Zbierz serię odcinków optycznych, które obejmują całkowitą objętość grzbietowego wyrostka brzusznego D lub DD. Prześlij stosy Z do przetworzenia obrazu za pomocą oprogramowania producenta i przeanalizuj obrazy z wynikiem wyższym niż siedem.Do akwizycji Nyquista użyj laserowego skaningowego mikroskopu konfokalnego i wybierz optymalny rozmiar piksela dla długości fali światła i apertury numerycznej soczewki obiektywu. Następnie prześlij stos do dekonwolucji 3D za pomocą automatycznego algorytmu. Do analizy obrazu użyj odpowiedniego oprogramowania do przetwarzania obrazu, aby utworzyć projekcje maksymalnej intensywności stosów Z.I ręcznie policz wypukłości na dendrycie DD. Następnie określ długość naciętego dendrytu DD, aby obliczyć gęstość kolców na 10 mikrometrów dendrytu DD. Następnie sklasyfikuj kolce jako cienkie lub grzybowe, filopodialne, przysadziste lub rozgałęzione.Korzystając z konwencjonalnych technik, takich jak mikroiniekcja, stwórz transgeniczne robaki wyrażające czujnik wapnia GCaMP w neuronach DD i Chrimson, przesuniętą ku czerwieni rodopsynę kanałową w presynaptycznych neuronach VA. Następnie, pod kapturem laminarnym, przygotuj wszystkie płytki trans-siatkówkowe lub ATR, dodając 300 mikrolitrów wyhodowanej przez noc kultury bakteryjnej OP50 i 0,25 mikrolitra ATR do każdej 60-milimetrowej płytki agarowej z podłożem odżywczym dla nicieni. Następnie rozprowadź kulturę za pomocą sterylnego szklanego pręta.W przypadku płytek kontrolnych dodaj 300 mikrolitrów bakterii OP50 i 0,25 mikrolitrów etanolu. Aby umożliwić rozwój bakterii, inkubuj płytki w temperaturze pokojowej przez 24 godziny, chroniąc je przed światłem otoczenia. Aby przygotować eksperyment, umieść pięć larw w stadium L4 na płytkach ATR lub kontrolnych z nasionami OP50 i inkubuj płytki w ciemności w temperaturze 23 stopni Celsjusza.Po trzech dniach użyj stereoskopowego mikroskopu preparacyjnego, aby potwierdzić rozwój sromu i wybierz potomstwo w stadium L4 z płytek ATR i kontrolnych do obrazowania. Następnie umieść dwa mikrolitry polikulek o grubości 0,05 mikrometra na szkiełku mikroskopowym. I umieść około 10 larw L4 w roztworze.Za pomocą drutu platynowego dodaj do roztworu małą kuleczkę super kleju. Delikatnie zamieszaj roztwór, aby wytworzyć nitkowate pasma kleju. Następnie dodaj trzy mikrolitry buforu M9.Następnie nałóż szkiełko nakrywkowe i uszczelnij jego krawędzie, jak pokazano wcześniej. Aby zarejestrować wywołane stany przejściowe wapnia w kolcach dendrytycznych, użyj mikroskopu konfokalnego z wirującym dyskiem i dostosuj stolik mikroskopu, aby ustawić kolce DD w płaszczyźnie ogniskowej. Następnie skonfiguruj akwizycję poklatkową, aby oświetlić próbkę linią laserową o długości 488 nanometrów w każdej klatce w celu wykrycia fluorescencji GCaMP oraz linią laserową o długości 561 nanometrów w okresowych odstępach czasu w celu wzbudzenia Chrimsona.W przypadku obrazowania wapnia in vivo należy użyć dekonwolucji 2D i wyrównania obrazu, aby skorygować niewielkie odchylenia od ruchu robaka podczas akwizycji. Następnie zdefiniuj grzbiet dendrytyczny DD jako obszar zainteresowania lub ROI. Zduplikuj zwrot z inwestycji i przenieś się do sąsiedniego regionu wewnątrz robaka, aby zebrać sygnał w tle.Następnie, za pomocą odpowiedniego oprogramowania, wyeksportuj intensywności GFP do Excela dla każdego punktu czasowego i odejmij fluorescencję tła od fluorescencji ROI kręgosłupa. Określ zmianę fluorescencji, odejmując fluorescencję GFP w układzie bezpośrednio przed wzbudzeniem 561 nanometrów lub w punkcie zerowym od każdego punktu czasowego po wzbudzeniu lub Delta F. Następnie podziel przez F zero, aby wyznaczyć Delta F przez F zero. I narysuj na wykresie znormalizowane ślady.Najpierw określ, czy dane są normalnie rozłożone, używając testu Shapiro-Wilka. W przypadku danych, które nie mają rozkładu normalnego, należy użyć nieparametrycznej analizy ANOVA z korektą post-hoc dla wielu testów. Alternatywnie, w przypadku pomiarów pokazujących rozkład normalny lub gaussowski, należy wykonać sparowany parametryczny test ANOVA dla każdego pomiaru fluorescencji GCaMP przed i po każdym impulsie 561 nanometrów.I popraw dla wielokrotnych porównań w każdej z dwóch grup. Znakowanie kolców dendrytycznych DD za pomocą trzech niezależnych markerów, cytozolowego mCherry, MYR:mRuby i LifeAct:GFP dało średnią gęstość 3,4 kolców dendrytycznych DD na 10 mikronów dendrytu DD u młodych dorosłych typu dzikiego. Marker GFP:Utrophin został wykluczony z tej analizy, ponieważ dawał znacznie niższą gęstość kręgosłupa, potencjalnie z powodu interakcji utrofiny z cytoszkieletem aktyny, który napędza morfogenezę kręgosłupa.Podejście do obrazowania żywych komórek potwierdziło, że cienka morfologia kolców DD w kształcie grzyba dominuje u dorosłego osobnika w porównaniu z alternatywnymi kształtami kręgosłupów, takimi jak filopodialny, przysadzisty i rozgałęziony. Aktywację kolców dendrytycznych DD oceniano za pomocą presynaptycznej sygnalizacji cholinergicznej u transgenicznych robaków eksprymujących GCaMP w neuronach DD i Chrimson w presynaptycznych neuronach VA. Przejściowe impulsy sygnału GCaMP wykryto w kolcach DD natychmiast po optogenetycznej aktywacji Chrimson w presynaptycznych neuronach VA.Eksperyment kontrolny przy braku ATR potwierdził, że pomiar sygnału GCaMP zależy od optogenetycznej aktywacji Chrimson, która jest ściśle zależna od ATR. Aby uwidocznić kolce DD, najlepiej jest wyobrazić sobie zwierzęta leżące na boku, takie jak wystające kolce są pod kątem prostym do ścieżki światła. Dzięki tej metodzie naukowcy mogą również wykorzystać manipulacje farmakologiczne, aby zrozumieć mechanizmy, które napędzają stany przejściowe wapnia w kolcach DD.

imaging-dendritic-spines-in-caenorhabditis-elegans

Research

JoVE Journal

Neuroscience

Neuronauka

Liczne niedawne badania zidentyfikowały mutacje w białkach synaptycznych powiązanych z patologiami mózgu. Pierwotne hodowle neuronów korowych zapewniają dużą elastyczność w badaniu wpływu tych białek związanych z chorobami na morfologię i ruchliwość kolców dendrytycznych.

Analiza morfologii kolców dendrytycznych w hodowlanych neuronach OUN

Źródło: Pekarek, B. T., et. al., Obrazowanie i kwantyfikacja nienaruszonych dendrytów neuronalnych za pomocą oczyszczania tkanek CLARITY. J. Vis. Exp. (2021)W tym filmie pokazujemy przygotowanie, obrazowanie i analizę oczyszczonego mózgu myszy w celu zbadania dendrytycznych altan dendrytycznych, morfologii kręgosłupa i rozmieszczenia neuronów przy użyciu mikroskopii konfokalnej i technik rekonstrukcji 3D.

Obrazowanie mikroskopem konfokalnym nienaruszonych altan dendrytycznych i morfologii kręgosłupa w oczyszczonym mózgu myszy

Źródło: Doser, R., et al. Subkomórkowe obrazowanie neuronalnej obsługi wapnia in vivo. J. Vis. Exp. (2023)Ten film pokazuje obrazowanie in vivo subkomórkowego strumienia wapnia w neuronach brzusznego rdzenia nerwowego transgenicznych szczepów Caenorhabditis elegans. Stosowane są dwa różne wskaźniki wapnia: wskaźnik cytoplazmatyczny w jednym szczepie i wskaźnik mitochondrialny w innym. Neurony obserwuje się pod mikroskopem fluorescencyjnym w celu monitorowania zmian intensywności fluorescencji w...

Obrazowanie subkomórkowej dynamiki wapnia w neuronach Caenorhabditis elegans

Dzięki małemu, przezroczystemu ciału, dobrze udokumentowanej neuroanatomii i mnóstwu podatnych technik genetycznych i odczynników, C. elegans stanowi idealny organizm modelowy do obrazowania neuronów in vivo przy użyciu stosunkowo prostych, tanich technik. Tutaj opisujemy obrazowanie pojedynczego neuronu u nienaruszonych dorosłych zwierząt przy użyciu genetycznie kodowanych fluorescencyjnych wskaźników wapnia.

In vivo (in vivo) Obrazowanie wapnia neuronów u C. elegans

Ten artykuł opisuje działający protokół obrazowania kolców dendrytycznych z neuronów hipokampa in vitro za pomocą Mikroskopii Iluminacji Strukturalnej (SIM). Mikroskopia superrozdzielcza wykorzystująca SIM zapewnia rozdzielczość obrazu znacznie wykraczającą poza granicę dyfrakcji światła we wszystkich trzech wymiarach przestrzennych, umożliwiając obrazowanie pojedynczych kolców dendrytycznych z większą szczegółowością.

Obrazowanie kolców dendrytycznych pierwotnych neuronów hipokampa szczura za pomocą mikroskopii oświetlenia strukturalnego

Opisujemy dwie metody wizualizacji i kwantyfikacji arboryzacji dendrytycznej w hipokampie modeli mysich: obrazowanie w czasie rzeczywistym i rozszerzoną głębię ostrości. Podczas gdy pierwsza metoda pozwala na zaawansowane śledzenie topograficzne i ilościowe określenie zakresu rozgałęzień, druga pozwala na szybką wizualizację drzewa dendrytycznego.

Ocena arboryzacji dendrytycznej w zakręcie zębatym okolicy hipokampa u myszy

Użycie dostosowanego "chipa węchowego" do efektywnego obrazowania wapnia u samców C. elegans jest opisane tutaj. Pokazano również badania dotyczące narażenia mężczyzn na glicerol i feromon.

Wykorzystanie dostosowanego mikroprzepływowego chipa węchowego do obrazowania aktywności neuronalnej w odpowiedzi na feromony w męskich neuronach głowy C. elegans

Ten protokół opisuje użycie genetycznie kodowanych reporterów Ca2+ do rejestrowania zmian w aktywności neuronalnej u zachowujących się robaków Caenorhabditis elegans.

Ratiometryczne obrazowanie wapnia poszczególnych neuronów w zachowaniu Caenorhabditis elegans

Tutaj prezentujemy podejście kombinatoryczne wykorzystujące mikroskopię o wysokiej rozdzielczości, narzędzia obliczeniowe i znakowanie pojedynczych komórek w żywych zarodkach C. elegans, aby zrozumieć dynamikę pojedynczej komórki podczas rozwoju neurologicznego.

Izotropowa mikroskopia świetlna i zautomatyzowane analizy linii komórkowych w celu skatalogowania embriogenezy Caenorhabditis elegans z rozdzielczością subkomórkową

Seryjna skaningowa mikroskopia elektronowa (SBEM) jest stosowana do obrazowania i analizy kolców dendrytycznych w mysim hipokampie.

Seryjna skaningowa mikroskopia elektronowa typu block-face (SBEM) do badania kolców dendrytycznych

Protokół opisuje modyfikację szybkiej metody Golgiego, która może być dostosowana do dowolnej części układu nerwowego, do barwienia neuronów w hipokampie i przyśrodkowej korze przedczołowej szczura.

Szybkie barwienie Golgiego do wizualizacji dendrytycznego kręgosłupa w hipokampie i korze przedczołowej

Poznaj techniki obrazowania kolców dendrytycznych w neuronach GABAergicznych Caenorhabditis elegans. Metoda obejmuje mikroskopię konfokalną i obrazowanie wapnia GCaMP, umożliwiając analizę morfologii i aktywności neuronalnej.

Obrazowanie kolców dendrytycznych u Caenorhabditis elegans

Przeglądaj więcej filmów