Name: Preimplantacyjne badania genetyczne w kierunku aneuploidii na półprzewodnikowej platformie sekwencjonowania nowej generacji (Wideo) | JoVE Journal
Uploaded: 2022-08-17T12:50:00.000+00:00
Duration: 9 min 30 s
Description: Poznaj procedurę PGT-A od amplifikacji pojedynczych komórek do raportowania wyników przy użyciu sekwencjonowania nowej generacji na półprzewodnikowej platformie. Ten protokół umożliwia replikację techniki w laboratoriach diagnostycznych.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Chcielibyśmy podziękować Dr. Zhangyong Mingowi i Panu Rongji Hou za ich rady dotyczące rozszerzonej aplikacji LIMS. Badanie to jest wspierane przez Specjalne Projekty Badawcze PLA na rzecz Planowania Rodziny (17JS008, 20JSZ08), Fundusz Kluczowego Laboratorium Badań nad Chorobami Metabolicznymi Guangxi (nr 20-065-76) oraz Projekt Badawczy Nauki i Technologii Zdrowia Obywatelskiego w Kantonie (201803010034).

<ol><li>Driscoll, D. A., Gross, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clinical+practice.+Prenatal+screening+for+aneuploidy%5BTitle%5D)+AND+%22The+New+England+Journal+of+Medicine%22%5BJournal%5D)">Clinical practice. Prenatal screening for aneuploidy.</a> The New England Journal of Medicine. 360 (24), 2556-2562 (2009).</li>
<li>Hassold, T., Hunt, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((To+err+%28meiotically%29+is+human%3A+the+genesis+of+human+aneuploidy%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Reviews+Genetics%22%5BJournal%5D)">To err (meiotically) is human: the genesis of human aneuploidy.</a> Nature Reviews Genetics. 2 (4), 280-291 (2001).</li>
<li>Hong, K. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Embryonic+aneuploidy+rates+are+equivalent+in+natural+cycles+and+gonadotropin-stimulated+cycles%5BTitle%5D)+AND+%22Fertility+and+Sterility%22%5BJournal%5D)">Embryonic aneuploidy rates are equivalent in natural cycles and gonadotropin-stimulated cycles.</a> Fertility and Sterility. 112 (4), 670-676 (2019).</li>
<li>Adams, D. R., Eng, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Next-generation+sequencing+to+diagnose+suspected+genetic+disorders%5BTitle%5D)+AND+%22The+New+England+Journal+of+Medicine%22%5BJournal%5D)">Next-generation sequencing to diagnose suspected genetic disorders.</a> The New England Journal of Medicine. 379 (14), 1353-1362 (2018).</li>
<li>Merriman, B., Team, I. T., Rothberg, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Progress+in+ion+torrent+semiconductor+chip+based+sequencing%5BTitle%5D)+AND+%22Electrophoresis%22%5BJournal%5D)">Progress in ion torrent semiconductor chip based sequencing.</a> Electrophoresis. 33 (23), 3397-3417 (2012).</li>
<li>Quail, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+tale+of+three+next+generation+sequencing+platforms%3A+comparison+of+Ion+Torrent%2C+Pacific+Biosciences+and+Illumina+MiSeq+sequencers%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">A tale of three next generation sequencing platforms: comparison of Ion Torrent, Pacific Biosciences and Illumina MiSeq sequencers.</a> BMC Genomics. 13 (1), 341(2012).</li>
<li>Kane, S. C., Willats, E., Bezerra Maia, E. H. M. S., Hyett, J., da Silva Costa, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pre-implantation+genetic+screening+techniques%3A+Implications+for+clinical+prenatal+diagnosis%5BTitle%5D)+AND+%22Fetal+Diagnosis+and+Therapy%22%5BJournal%5D)">Pre-implantation genetic screening techniques: Implications for clinical prenatal diagnosis.</a> Fetal Diagnosis and Therapy. 40 (4), 241-254 (2016).</li>
<li>Dilliott, A. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Targeted+next-generation+sequencing+and+bioinformatics+pipeline+to+evaluate+genetic+determinants+of+constitutional+disease%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%3A+JoVE%22%5BJournal%5D)">Targeted next-generation sequencing and bioinformatics pipeline to evaluate genetic determinants of constitutional disease.</a> Journal of Visualized Experiments: JoVE. (134), e57266(2018).</li>
<li>Ion ReproSeq™ PGS View Kits User Guide. Thermo Fisher Scientific. , Available from: 
 <a target="_blank" href="https://tools.thermofisher.com/contents/sfs/manuals/MAN0016158_IonReproSeqPGSView_UG.pdf">https://tools.thermofisher.com/contents/sfs/manuals/MAN0016158_IonReproSeqPGSView_UG.pdf</a> (2017).</li>
<li>PicoPLEX® Single Cell WGA Kit User Manual. Takara Bio USA. , Available from: 
 <a target="_blank" href="https://www.takarabio.com/documents/User%20Manual/PicoPLEX%20Single%20Cell%20WGA%20Kit%20User%20Manual/PicoPLEX%20Single%20Cell%20WGA%20Kit%20User%20Manual_112219.pdf">https://www.takarabio.com/documents/User%20Manual/PicoPLEX%20Single%20Cell%20WGA%20Kit%20User%20Manual/PicoPLEX%20Single%20Cell%20WGA%20Kit%20User%20Manual_112219.pdf</a> (2019).</li>
<li>Qubit® 3.0 Fluorometer User Guide, Invitrogen by Life Technologies. , Available from: 
 <a target="_blank" href="https://tools.thermofisher.com/contents/sfs/manuals/qubit_3_fluorometer_man.pdf">https://tools.thermofisher.com/contents/sfs/manuals/qubit_3_fluorometer_man.pdf</a> (2014).</li>
<li>Ion AmpliSeq™ DNA and RNA Library Preparation User Guide. Thermo Fisher Scientific. , Available from: 
 <a target="_blank" href="https://tools.thermofisher.com/contents/sfs/manuals/MAN0006735_AmpliSeq_DNA_RNA_LibPrep_UG.pdf">https://tools.thermofisher.com/contents/sfs/manuals/MAN0006735_AmpliSeq_DNA_RNA_LibPrep_UG.pdf</a> (2019).</li>
<li>Ion OneTouch 2 System User Guide. Thermo Fisher Scientific. , Available from: 
 <a target="_blank" href="https://tools.thermofisher.com/contents/sfs/manuals/MAN0014388_IonOneTouch2Sys_UG.pdf">https://tools.thermofisher.com/contents/sfs/manuals/MAN0014388_IonOneTouch2Sys_UG.pdf</a> (2015).</li>
<li>Ion Pl Hi-Q OT2 200 Kit User Guide. Thermo Fisher Scientific. , Available from: 
 <a target="_blank" href="https://assets.thermofisher.com/TFS-Assets/LSG/manuals/MAN0010857_Ion_Pl_HiQ_OT2_200_Kit_UG.pdf">https://assets.thermofisher.com/TFS-Assets/LSG/manuals/MAN0010857_Ion_Pl_HiQ_OT2_200_Kit_UG.pdf</a> (2017).</li>
<li>Ion Pl Hi-Q Sequencing 200 Kit User Guide. Thermo Fisher Scientific. , Available from: 
 <a target="_blank" href="https://tools.thermofisher.com/content/sfs/manuals/MAN0010947_Ion_Pl_HiQ_Seq_200_Kit_UG.pdf">https://tools.thermofisher.com/content/sfs/manuals/MAN0010947_Ion_Pl_HiQ_Seq_200_Kit_UG.pdf</a> (2017).</li>
<li>Torrent Suite Software 5.6. Help Guide. Thermo Fisher Scientific. , Available from: 
 <a target="_blank" href="https://www.thermofisher.com/in/en/home/life-science/sequencing/next-generation-sequencing/ion-torrent-next-generation-sequencing-workflow/ion-torrent-next-generation-sequencing-data-analysis-workflow/ion-torrent-suite-software.html">https://www.thermofisher.com/in/en/home/life-science/sequencing/next-generation-sequencing/ion-torrent-next-generation-sequencing-workflow/ion-torrent-next-generation-sequencing-data-analysis-workflow/ion-torrent-suite-software.html</a> (2017).</li>
<li>Wiedenhoeft, J., Brugel, E., Schliep, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fast+Bayesian+inference+of+copy+number+variants+using+Hidden+Markov+models+with+wavelet+compression%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Computational+Biology%22%5BJournal%5D)">Fast Bayesian inference of copy number variants using Hidden Markov models with wavelet compression.</a> PLoS Computational Biology. 12 (5), 1004871(2016).</li>
<li>Rubio, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pre-implantation+genetic+screening+using+fluorescence+in+situ+hybridization+in+patients+with+repetitive+implantation+failure+and+advanced+maternal+age%3A+two+randomized+trials%5BTitle%5D)+AND+%22Fertility+and+Sterility%22%5BJournal%5D)">Pre-implantation genetic screening using fluorescence in situ hybridization in patients with repetitive implantation failure and advanced maternal age: two randomized trials.</a> Fertility and Sterility. 99 (5), 1400-1407 (2013).</li>
<li>Gleicher, N., Kushnir, V. A., Barad, D. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Preimplantation+genetic+screening+%28PGS%29+still+in+search+of+a+clinical+application%3A+a+systematic+review%5BTitle%5D)+AND+%22Reproductive+Biology+and+Endocrinology%22%5BJournal%5D)">Preimplantation genetic screening (PGS) still in search of a clinical application: a systematic review.</a> Reproductive Biology and Endocrinology. 12, 22(2014).</li>
<li>Bono, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Validation+of+a+semiconductor+next-generation+sequencing-based+protocol+for+pre-implantation+genetic+diagnosis+of+reciprocal+translocations%5BTitle%5D)+AND+%22Prenatal+Diagnosis%22%5BJournal%5D)">Validation of a semiconductor next-generation sequencing-based protocol for pre-implantation genetic diagnosis of reciprocal translocations.</a> Prenatal Diagnosis. 35 (10), 938-944 (2015).</li>
<li>Handyside, A. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((24-chromosome+copy+number+analysis%3A+a+comparison+of+available+technologies%5BTitle%5D)+AND+%22Fertility+and+Sterility%22%5BJournal%5D)">24-chromosome copy number analysis: a comparison of available technologies.</a> Fertility and Sterility. 100 (3), 595-602 (2013).</li>
<li>Wells, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clinical+utilisation+of+a+rapid+low-pass+whole+genome+sequencing+technique+for+the+diagnosis+of+aneuploidy+in+human+embryos+prior+to+implantation%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Medical+Genetics%22%5BJournal%5D)">Clinical utilisation of a rapid low-pass whole genome sequencing technique for the diagnosis of aneuploidy in human embryos prior to implantation.</a> Journal of Medical Genetics. 51 (8), 553-562 (2014).</li>
<li>El-Metwally, S., Hamza, T., Zakaria, M., Helmy, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Next-generation+sequence+assembly%3A+Four+stages+of+data+processing+and+computational+challenges%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Computational+Biology%22%5BJournal%5D)">Next-generation sequence assembly: Four stages of data processing and computational challenges.</a> PLoS Computational Biology. 9 (12), 1003345(2013).</li>
<li>Jennings, L. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Guidelines+for+validation+of+next-generation+sequencing-based+oncology+panels%3A+A+joint+consensus+recommendation+of+the+Association+for+Molecular+Pathology+and+College+of+American+Pathologists%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Molecular+Diagnostics%3A+JMD%22%5BJournal%5D)">Guidelines for validation of next-generation sequencing-based oncology panels: A joint consensus recommendation of the Association for Molecular Pathology and College of American Pathologists.</a> The Journal of Molecular Diagnostics: JMD. 19 (3), 341-365 (2017).</li>
<li>de Bourcy, C. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+quantitative+comparison+of+single-cell+whole+genome+amplification+methods%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">A quantitative comparison of single-cell whole genome amplification methods.</a> PLoS One. 9 (8), 105585(2014).</li>
<li>Fiorentino, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+next-generation+sequencing+technology+for+comprehensive+aneuploidy+screening+of+blastocysts+in+clinical+pre-implantation+genetic+screening+cycles%5BTitle%5D)+AND+%22Human+Reproduction%22%5BJournal%5D)">Application of next-generation sequencing technology for comprehensive aneuploidy screening of blastocysts in clinical pre-implantation genetic screening cycles.</a> Human Reproduction. 29 (12), 2802-2813 (2014).</li>
<li>Damerla, R. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ion+Torrent+sequencing+for+conducting+genome-wide+scans+for+mutation+mapping+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Mammalian+Genome%22%5BJournal%5D)">Ion Torrent sequencing for conducting genome-wide scans for mutation mapping analysis.</a> Mammalian Genome. 25 (3-4), 120-128 (2014).</li>
<li>Brezina, P. R., Anchan, R., Kearns, W. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Preimplantation+genetic+testing+for+aneuploidy%3A+what+technology+should+you+use+and+what+are+the+differences%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Assisted+Reproduction+and+Genetics%22%5BJournal%5D)">Preimplantation genetic testing for aneuploidy: what technology should you use and what are the differences.</a> Journal of Assisted Reproduction and Genetics. 33 (7), 823-832 (2016).</li>
<li>Landrum, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ClinVar%3A+improving+access+to+variant+interpretations+and+supporting+evidence%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Research%22%5BJournal%5D)">ClinVar: improving access to variant interpretations and supporting evidence.</a> Nucleic Acids Research. 46, 1062-1067 (2018).</li>
<li>Genomes Project, C, et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+global+reference+for+human+genetic+variation%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">A global reference for human genetic variation.</a> Nature. 526 (7571), 68-74 (2015).</li>
<li>McKusick, V. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mendelian+inheritance+in+man+and+its+online+version%2C+OMIM%5BTitle%5D)+AND+%22American+Journal+of+Human+Genetics%22%5BJournal%5D)">Mendelian inheritance in man and its online version, OMIM.</a> American Journal of Human Genetics. 80 (4), 588-604 (2007).</li>
<li>Wang, K., Li, M., Hakonarson, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ANNOVAR%3A+functional+annotation+of+genetic+variants+from+high-throughput+sequencing+data%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Research%22%5BJournal%5D)">ANNOVAR: functional annotation of genetic variants from high-throughput sequencing data.</a> Nucleic Acids Research. 38 (16), 164(2010).</li>
<li>Zhao, M., Zhao, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CNVannotator%3A+A+comprehensive+annotation+server+for+copy+number+variation+in+the+human+genome%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">CNVannotator: A comprehensive annotation server for copy number variation in the human genome.</a> PLoS One. 8 (11), 80170(2013).</li>
<li>Darui laboratory information management system. Darui Reproduction Technology Co. , Available from: 
 <a target="_blank" href="http://www.daruiart.com/newsitem/278327399">http://www.daruiart.com/newsitem/278327399</a> (2018).</li>
<li>Zhang, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clinical+application+of+next-generation+sequencing+in+pre-implantation+genetic+diagnosis+cycles+for+Robertsonian+and+reciprocal+translocations%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Assisted+Reproduction+and+Genetics%22%5BJournal%5D)">Clinical application of next-generation sequencing in pre-implantation genetic diagnosis cycles for Robertsonian and reciprocal translocations.</a> Journal of Assisted Reproduction and Genetics. 33 (7), 899-906 (2016).</li>
<li>Xu, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mapping+allele+with+resolved+carrier+status+of+Robertsonian+and+reciprocal+translocation+in+human+pre-implantation+embryos%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">Mapping allele with resolved carrier status of Robertsonian and reciprocal translocation in human pre-implantation embryos.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 114 (41), 8695-8702 (2017).</li>
</ol>

Autorzy nie mają nic do ujawnienia.

Aneuploidia chromosomalna zarodków jest przyczyną dużej części utraty ciąży, zarówno poczętej naturalnie, jak i w wyniku zapłodnienia in vitro (IVF). W praktyce klinicznej zapłodnienia in vitro proponuje się, że badanie przesiewowe aneuploidii zarodka i przeniesienie zarodka euploidii może poprawić wyniki zapłodnienia in vitro. Fluorescencyjna hybrydyzacja in situ jest najwcześniejszą techniką przyjętą do selekcji płci i PGT-A; Technika ta wymaga jednak większej wiedzy technicznej od personelu laborator...

Aneuploidia to nieprawidłowość w liczbie chromosomów spowodowana obecnością jednego lub więcej dodatkowych chromosomów lub brakiem jednego lub więcej chromosomów. Zarodki, które są nosicielami pewnego rodzaju aneuploidii, takiej jak utrata jednego chromosomu X (zespół Turnera), dodatkowe kopie autosomów, takie jak trisomie autosomu 21 (zespół Downa), 13 (zespół Patau) i 18 (zespół Edwardsa) lub dodatkowe chromosomy płciowe, takie jak 47, XXY (zespół Klinefeltera) i 47, XXX (zespół potrójnego chromosomu X), mogą przetrwać do końca z wadami wrodzonymi1. Aneuploidia jest główną przyczyną poronień w pierwszym trymestrze ciąży i nieudanych prób zapłodnienia in vitro (IVF)2. Poinformowano, że wskaźnik aneuploidii może wahać się od 25,4% do 84,5% w różnych warstwach wiekowych naturalnego cyklu i grupy kontrolnej z lekiem w praktyce IVF3.
Technologia sekwencjonowania nowej generacji staje się coraz bardziej popularna w klinicznym określaniu informacji genetycznej; zapewnia praktyczny dostęp do sekwencji genomu z wydajnością i wysoką przepustowością. W szczególności sekwencjonowanie nowej generacji zrewolucjonizowało również diagnostykę zaburzeń za pomocą czynników genetycznych i testów na nieprawidłowości w klasie genome<sup='xref'>4. Wykorzystując technologię sekwencjonowania półprzewodników do bezpośredniego przesyłania sygnałów chemicznych w sekwencjonowaniu bioreakcji do danych cyfrowych, system sekwencyjny oparty na półprzewodnikach zapewnia bezpośrednią detekcję w czasie rzeczywistym w celu sekwencjonowania danych w 3-7 h5,6.
W procedurze in vitro, preimplantacyjne testy genetyczne (PGT) badają profil genetyczny zarodka przed przeniesieniem do macicy, aby poprawić wynik IVF i zmniejszyć ryzyko zaburzeń genetycznych u noworodków1,7. W PGT w połączeniu z technikami NGS materiał genetyczny wyekstrahowany z mniej niż 10 komórek jest amplifikowany za pomocą zestawów do amplifikacji całego genomu lub niezależnie opracowanego odczynnika do amplifikacji całego genomu. Wymaga to tylko jednego kroku w fazie amplifikacji i nie wymaga wstępnej amplifikacji, aby uzyskać produkty amplifikacji całego genomu. Startery lub panele do sekwencjonowania wariantów liczby kopii i specjalnych loci genów są projektowane i stosowane w skonstruowanej bibliotece.
Typowy przepływ pracy preimplantacyjnych testów genetycznych - aneuploidia (PGT-A) w NGS obejmuje procedury seryjne i wymaga intensywnego obciążenia personelu laboratoryjnego8. Niektóre błędy w działaniu spowodowane wycofaniem procedury mogą prowadzić do niepożądanej straty zarówno czasu, jak i zasobów laboratorium. Pomocne jest zwięzłe i przejrzyste standardowe procedury operacyjne (SOP) dla przepływu pracy PGS-NGS; Jednak protokoły w formacie Word nie mogą przedstawiać bardziej szczegółowych informacji na temat przetwarzania próbek, manipulacji urządzeniem i ustawień instrumentów, które można zobrazować w protokole wideo. W tym artykule zweryfikowany przepływ pracy w połączeniu z wizualizowaną demonstracją szczegółów operacyjnych może zaoferować bardziej bezpośrednie i intuicyjne protokoły referencyjne w praktyce PGT na platformie sekwencjonowania półprzewodników.
Protokół tutaj opisuje metodę, która umożliwia grupowanie do 16 biopsji zarodków równolegle. W przypadku większych partii zaleca się stosowanie komercyjnego protokołu opartego na zestawie do sekwencjonowania półprzewodników, takiego jak Reproes-PGS.

<table><tbody><tr><td>0,45 &mu; m Filtr strzykawkowy</td><td>Merkmillipore</td><td>Millex-HV</td><td></td></tr><tr><td>1,5 ml Probówki DNA LoBind</td><td>Eppendorf</td><td>30108051</td><td></td></tr><tr><td>15 ml Probówki</td><td>Greiner Bio-One</td><td>188261</td><td></td></tr><tr><td>2,0 mLDNA LoBind Probówki</td><td>Eppendorf</td><td>30108078</td><td></td></tr><tr><td>50 ml</td><td>Greiner Bio-One</td><td>227261</td><td></td></tr><tr><td>5x Anstart Taq Buffer (Mg2+ Plus)</td><td>FAPON&</td><td></td><td></td></tr><tr><td>nbsp; Odczynnik Anstart Tap DNA Polymerase</td><td>FAPON</td><td></td><td></td></tr><tr><td>AMPure XP (kulki magnetyczne do wiązania DNA)</td><td>Beckman</td><td>A63881</td><td>https://www.beckman.com/reagents/genomic/cleanup-and-size-selection/pcr/a63881</td></tr><tr><td>Bufor do lizy komórek</td><td>Południowy Uniwersytet</td><td></td><td>Medyczny Bufor do lizy komórek zawierający 40 mM Tris (pH 8), 100 mM NaCl, 2 mM EDTA, 1 mM glikol etylenowy kwas tetraoctowy (EGTA), 1% (v/v) Triton X-100, 5 mM sodu pirofosforan, 2 mM &beta;-glicerofosforan, 0,1% SDS</td></tr><tr><td>ClinVar</td><td>NCBI</td><td></td><td>Bufor</td></tr> <tr><td>elucyjny https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/ DNA</td><td>NEB</td><td>T1016L</td><td></td></tr><tr><td>dNTP</td><td>Vazyme</td><td>P031-AA</td><td></td></tr><tr><td>DynaMag-2 Magnet</td><td>Life Technologies</td><td>12321D</td><td></td></tr><tr><td>Alkohol etylowy</td><td>Guangzhou Fabryka odczynników chemicznych Thermo Fisher Naukowe</td><td></td><td>http://www.chemicalreagent.com/</td></tr> <tr><td>Niezależnie opracowane odczynniki do amplifikacji całego genomu</td><td>Południowy Uniwersytet</td><td></td> Medyczny <td>Odczynniki składają się z następujących składników: 1. Liza komórek 2. Amplifikacja Wstępnie zmieszany roztwór &nbsp; &nbsp; &nbsp; 1) Podkład WGA-P2 (10 &mu; M) &nbsp; &nbsp; &nbsp; 2) dNTP (10 mM) &nbsp; &nbsp; &nbsp; 3) 5x Anstart Taq Buffer (Mg2 + Plus) 3. Enzym wzmacniający &nbsp; &nbsp; &nbsp; 1) Polimeraza DNA Anstart Tap (5 U/&mu; L)</td></tr> <tr><td>Zestaw Ion PI Hi-Q OT2 200</td><td>Zestaw Thermo Fisher Scientific</td><td>A26434</td><td>Zestaw wspomniany w kroku 4.2.8</td></tr><tr><td>Zestaw sekwencjonowania Ion PI Hi-Q 200&nbsp; &nbsp;</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>A26433</td><td></td></tr><tr><td>Technologie żywotności</td><td>systemu jonów protonowych</td><td>4476610</td><td></td></tr><tr><td>Technologie żywotności</td><td>systemu serwerów Ion Reporter</td><td>4487118</td><td></td></tr><tr><td>Fabryka</td><td></td><td>odczynników chemicznych izopropanolu w Kantonie</td><td>http://www.chemicalreagent.com/</td></tr> <tr><td>zestaw do przygotowania biblioteki</td><td>Daan Gene Co., Ltd</td><td>114</td><td>https://www.daangene.com/pt/certificate.html</td></tr><tr><td>NaOH</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S5881-1KG</td><td></td></tr><tr><td>Technologie życia wodnego bez nukleaz</td><td></td><td>AM9932</td><td></td></tr><tr><td>Oligo WGA-P2</td><td>Sangon Biotech</td><td></td><td>5'-ATGGTAGTCCGACTCGAGNN NNNNATGTGG-3'OneTouch</td></tr> <tr><td>2 Technologie</td><td>żywotności</td> systemu <td>4474779</td><td>&nbsp; System amplifikacji i wzbogacania szablonów</td></tr><tr><td>Probówki PCR</td><td>Axygen</td><td>PCR-02D-C</td><td></td></tr><tr><td>Zestaw PicoPLEX WGA</td><td>Takara Bio USA</td><td>R300671</td><td></td></tr><tr><td>Końcówki do pipet</td><td>Wysokiej jakości produkty</td><td></td> naukowe <td>https://www.qsptips.com/products/standard_pipette_tips.aspx</td></tr><tr><td>Przenośna mini wirówka LX-300</td><td>Qilinbeier</td><td>E0122</td><td></td></tr><tr><td>Qubit 3.0 Fluorometer</td><td>Life Technologies</td><td>Q33216</td><td>Fluorometr</td></tr><tr><td>Probówki do oznaczania kubitów</td><td>Life Technologies</td><td>Q32856</td><td></td></tr><tr><td>Zestaw do oznaczania kubitów dsDNA HS Life</td><td>Technologies</td><td>Q32851</td><td></td></tr><tr><td>System serwera sekwencera</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td></td><td>Torrent Suite</td></tr><tr><td>Oprogramowanie Reakcje sekwencjonowania Uniwersalny zestaw</td><td>Daan Gene Co., Ltd</td><td>113</td><td>https://www.daangene.com/pt/certificate.html Ten zestaw zawiera następujące elementy: 1. Zestaw do przygotowania szablonów 1.1 Zestaw do przygotowania szablonów: Bufor emulsyjny do PCR Emulsyjna mieszanka enzymów PCR Roztwór nośnika szablonu 1.2 Roztwory do przygotowania szablonów: Przygotowanie szablonu Olej reakcyjny I roztwór do rozbijania emulgatora II Przygotowanie szablonu Olej reakcyjny II Woda wolna od nukleaz Animacja roztwór Roztwór deemulgujący I Roztwór do mycia szablonów Roztwór do mycia kulek C1 Roztwór do ponownego zawieszania kulek C1 Roztwór do ponownego zawieszania szablonów 1.3 Materiały do przygotowania szablonu: Rurka odczynnika I złącze Probówka zbiorcza Pipeta z probówką z odczynnikiem I Płytka wzmacniająca 8 dołków strip Dedykowane końcówki Adapter do mycia przygotowania szablonu Filtr do przygotowania szablonu 2. Zestaw do sekwencjonowania 2.1 Zestaw do sekwencjonowania: dGTP dCTP dATP dTTP Roztwór enzymu do sekwencjonowania Startery do sekwencjonowania Szablony kontroli jakości 2.2&nbsp; Rozwiązania do sekwencjonowania: Roztwór do sekwencjonowania II Roztwór do sekwencjonowania IIII Bufor do wyżarzania Bufor ładujący Środek spieniający Tabletki chloru Koralik C1 2.3 Materiały do sekwencjonowania: Probówka z odczynnikiem II Nasadka probówki z odczynnikiem Łyk probówki z odczynnikiem&nbsp; II Łyk do butelek z odczynnikami Butelki z odczynnikami 3. Chip</td></tr><tr><td>Roztwór wodorotlenku sodu</td><td>Sigma</td><td>72068-100ML</td><td></td></tr><tr><td>Thermal Cycler</td><td>Life Technologies</td><td>4375786</td><td></td></tr></tbody></table>

preimplantacyjne badania genetyczne w kierunku aneuploidii na półprzewodnikowej platformie sekwencjonowania nowej generacji

Pre-Implantation Genetic Testing for Aneuploidy on a Semiconductor Based Next-Generation Sequencing Platform

Sekwencjonowanie nowej generacji nabiera coraz większego znaczenia w zastosowaniach klinicznych do określania wariantów genetycznych. W preimplantacyjnym teście genetycznym technika ta ma swoje unikalne zalety w zakresie skalowalności, przepustowości i kosztów. W przypadku preimplantacyjnego testu genetycznego do analizy aneuploidii, przedstawiony tutaj system sekwencjonowania nowej generacji (NGS) oparty na półprzewodnikach zapewnia kompleksowe podejście do określania strukturalnych wariantów genetycznych w rozdzielczości co najmniej 8 Mb. Od pobrania próbki do raportu końcowego, proces pracy wymaga wielu etapów przy ścisłym przestrzeganiu protokołów. Ponieważ różne krytyczne kroki mogą decydować o wyniku amplifikacji, jakości biblioteki, pokryciu odczytów i danych wyjściowych, informacje opisowe z wizualną demonstracją inną niż słowa mogą dostarczyć więcej szczegółów na temat operacji i manipulacji, co może mieć duży wpływ na wyniki wszystkich krytycznych kroków. Przedstawione w niniejszym dokumencie metody przedstawią procedury związane z amplifikacją całego genomu (WGA) komórek trophectodermy (TE) poddanych biopsji, budową biblioteki genomicznej, zarządzaniem sekwenatorem i wreszcie generowaniem raportów wariantów liczby kopii.

Po zakończeniu planu sekwencjonowania i procesu uruchomionego w urządzeniu, system serwera sekwencjonowania raportuje podsumowanie zawierające informacje opisowe o wygenerowanych danych, stanie chipa, stopniu załadowania ISP oraz jakości biblioteki, jak pokazano na Rysunku 2. W tej demonstracji wyników uzyskano łącznie 17,6 G danych w całkowitej liczbie zasad, a ogólny stopień załadowania ISP wynosił 88% w całkowitej liczbie studzienek chipa; mapa ciepła wykazała, że próbka została równomier...

Protokół przedstawia ogólne procedury laboratoryjne wymagane w preimplantacyjnych testach genetycznych na aneuploidię na platformie sekwencjonowania nowej generacji opartej na półprzewodnikach. W tym miejscu przedstawiamy szczegółowe etapy amplifikacji całego genomu, selekcji fragmentów DNA, budowy biblioteki, przygotowania szablonów i przepływu roboczego sekwencjonowania z reprezentatywnymi wynikami.

Preimplantacyjne badania genetyczne w kierunku aneuploidii na półprzewodnikowej platformie sekwencjonowania nowej generacji

Next-generation sequencing has gained increasing importance in the clinical application in the determination of genetic variants. In the pre-implantation ...

Protokół ten przedstawia procedurę od amplifikacji pojedynczej komórki do końcowych danych sprawozdawczych w preimplantacyjnych testach genetycznych pod kątem aneuploidii na platformie sekwencjonowania nowej generacji opartej na półprzewodnikach. Ta procedura może pomóc widzom w dobrym zrozumieniu eksperymentalnego przepływu pracy sekwencjonowania PGT-A i odtworzeniu tej techniki w laboratorium diagnostycznym z platformą NGS opartą na półprzewodnikach. Zacznij od odpipetowania 25 mikrolitrów produktów amplifikacji całego genomu i przeniesienia ich do 1,5-mililitrowej probówki wirówkowej wstępnie załadowanej 25 mikrolitrami wody wolnej od nukleaz.Odwiruj i wymieszaj kulki oczyszczające DNA. Porcję 50 mikrolitrów tego roztworu do każdej probówki z próbką. Wirować i odwirowywać krótko przez pięć sekund.Ustaw probówkę na pięć minut w temperaturze pokojowej w celu przeprowadzenia procesu wiązania DNA. Włóż 1.5-mililitrową probówkę wirówkową do stojaka magnetycznego. Następnie poczekaj, aż wszystkie kulki magnetyczne zostaną przyciągnięte do bocznej ścianki rurki.Ostrożnie przenieś supernatant do nowej 1,5-mililitrowej probówki wirówkowej. Unikaj pipetowania kulek. Zgodnie z pierwotną objętością próbki.Odpipetować 30 mikrolitrów kulek magnetycznych, wirować i krótko wirować przez pięć sekund. Ustaw probówkę na pięć minut w temperaturze pokojowej w celu przeprowadzenia procesu wiązania DNA. Włóż 1.5-milimetrowe probówki wirówkowe do stojaka magnetycznego.Następnie poczekaj, aż wszystkie koraliki magnetyczne zostaną przyciągnięte do bocznej ścianki rurki. Ostrożnie usunąć i wyrzucić supernatant. Unikaj pipetowania kulek.Odpipetuj 300 mikrolitrów 70% etanolu do 1,5 mililitrowej probówki wirówkowej. Następnie delikatnie obróć rurkę dwukrotnie pod kątem 180 stopni i przesuń koraliki wzdłuż ścianki rurki, aby dokładnie umyć. Odpipetować i odrzucić supernatant.Unikaj pipetowania kulek. Powtórz procedurę prania raz. Umieść nową płytkę wzmacniającą w systemie po zakończeniu programu czyszczenia.Włóż probówki zbiorcze, z których każda jest wstępnie napełniona roztworem łamającym 150 mikrolitrów dwa do wirnika, a następnie umieść mostek na probówkach zbiorczych. Dodaj olej reakcyjny do połowy probówki, a roztwór do rozbijania emulgatora do jednej trzeciej probówki. Umieścić nowy filtr do przygotowania szablonu na stojaku na probówki z portalem na próbki skierowanym do góry.Wirować roztwór przez pięć sekund i krótko odwirowywać przez pięć sekund. Następnie przenieść roztwór do portalu próbki filtra po trzykrotnym odpipetowaniu 800 mikrolitrów. Odwirować probówkę, aby zmniejszyć ilość pęcherzyków przed ostatnim wstrzyknięciem.Unikaj wstrzykiwania powietrza do filtra. Wstrzyknąć 200 mikrolitrów oleju reakcyjnego dwa, po zmieszaniu roztworu. Obrócić sample portal filtra w dół i wymienić przyrząd myjący na filtr.Włóż igłę do próbki do środkowego otworu pokrywy wirnika, a następnie dociśnij igłę do dna. Kliknij przycisk Uruchom na ekranie i wybierz program zgodnie z odpowiednim zestawem. Następnie wybierz opcję Wspomagane, aby sprawdzić wszystkie kroki.Klikaj przycisk Dalej, aż rozpocznie się uruchamianie. Bieg potrwa około 4,5 godziny. Wybierz pozycję Dalej po zakończeniu programu.System rozpocznie 10-minutowy proces wirowania. Po odwirowaniu kliknij przycisk Otwórz pokrywę i przenieś probówki zbiorcze na stojaki. Jeśli procedura nie przejdzie do następnego kroku w ciągu 15 minut, naciśnij ostatnie wirowanie, aby ponownie odwirować.Usunąć sklarowany osad z probówki zbiorczej, pozostawiając w niej 100 mikrolitrów roztworu. Wymieszaj pozostałą próbkę przez pipetowanie i przenieś próbkę do nowej probówki wirówkowej o pojemności 1,5 mililitra oznaczonej OT. Podczas pipetowania supernatantu należy unikać dotykania dna probówki wzdłuż boków. Odpipetować 100 mikrolitrów wody wolnej od nukleaz do każdej probówki zbiorczej i przenieść roztwór do probówki OT przemytej przez wielokrotne pipetowanie.Dodaj 600 mikrolitrów wody wolnej od nukleaz do probówki OT, aby uzyskać całkowitą objętość jednego mililitra. Wirować przez 30 sekund w wirówce przy 15 500 razy G przez osiem minut. Delikatnie usunąć supernatant, pozostawiając 100 mikrolitrów roztworu w probówce OT.Użyj końcówki, aby całkowicie wyrzucić warstwę oleju. Dodaj 900 mikrolitrów wody wolnej od nukleaz, wiruj przez 30 sekund i wiruj przy 15 500 razy G przez osiem minut. Usunąć supernatant do momentu, aż pozostanie 20 mikrolitrów roztworu i dodać roztwór do ponownego zaparcia matrycy, aby uzyskać objętość 100 mikrolitrów.Następnie wirować przez 30 sekund i krótko wirować przez dwie sekundy. Przejdź do następnego kroku w ciągu 12 godzin od przetworzenia próbki Załaduj 100 mikrolitrów rozcieńczonej biblioteki, 130 mikrolitrów kulek C1, 300 mikrolitrów trzech x roztworu do mycia matryc i 300 mikrolitrów roztworu do stopienia do ośmiu pasków studzienki. Zainstaluj osiem pasków dołka na module wzbogacającym, załaduj końcówkę pipetującą i ustaw probówkę wirówkową o pojemności 200 mikrolitrów w pozycji do pobierania.Kliknij Start, aby uruchomić program. Pobrać pipetę z 55 mikrolitrów roztworu próbki i wstrzyknąć ją do otworu na próbkę w chipie. Ustaw chip na wirówce.Trzymaj wycięcie skierowane na zewnątrz, a sample portal wewnątrz. Następnie zrównoważ go innym zużytym chipem i wiruj przez 10 minut. Przygotuj roztwór ładujący zgodnie z opisem w manuskrypcie tekstowym.Wdmuchnij 100 mikrolitrów powietrza do spieniającego się roztworu. Kilkakrotnie pipetować roztwór, aż bąbelki znajdą się w gęstym, pieniącym się stanie i utrzymać objętość piany na poziomie około 250 mikrolitrów. Umieść wiór na stole po odwirowaniu.Wstrzyknąć 100 mikrolitrów piany do otworu na próbkę i usunąć wytłaczany roztwór do portalu wyjściowego. Następnie krótko odwiruj chip przez 30 sekund. Powtórz ten proces raz.Wstrzyknąć dwukrotnie 100 mikrolitrów w 50% buforze myjącym i usunąć wytłaczany roztwór w portalu zewnętrznym po każdym wstrzyknięciu. Następnie trzykrotnie wstrzyknąć 100 mikrolitrów w 50% buforze do wyżarzania i usunąć wytłaczany roztwór w portalu wyjściowym po każdym wstrzyknięciu. Wstrzyknąć 65 mikrolitrów w 50% buforze reakcji enzymatycznej, unikając pęcherzyków i usunąć wytłaczany roztwór w portalu wyjściowym.Ustabilizuj załadowany chip w temperaturze pokojowej przez pięć minut i zainstaluj chip na portalu chipowym sekwencera. Wybierz Planowany program, sprawdź informacje i rozpocznij uruchamianie. Reprezentatywna seria uzyskała łącznie 17,6 gigabajta danych, a całkowita szybkość ładowania cząstki kuli jonowej wyniosła 88% w całkowitych studniach chipa.Mapa cieplna potwierdziła równomierne obciążenie próbki na całkowitej powierzchni chipa. 77% wszystkich odczytów było użytecznych. Wszystkie studnie załadowane przez ISP wykazały 100% wzbogacenie szablonów, z czego 78% było klonalnych.Spośród wszystkich szablonów klonalnych 97% zostało zakwalifikowanych jako biblioteka ostateczna. Średnia długość odczytu wynosiła 177 par zasad, podczas gdy mediana i tryb wynosiły odpowiednio 176 i 174 pary zasad. Szczytowa liczba tyminy, cytozyny i adeniny w matrycach wynosiła około 76 powyżej kwalifikowanej linii odcięcia wynoszącej 50.We wszystkich adresowalnych studniach z żywymi dostawcami internetowymi 99,5% zakwalifikowano jako bibliotekę zbudowaną, a 20% bibliotek poliklonalnych i niskiej jakości zostało odfiltrowanych, podczas gdy 76,6% dostawców usług internetowych zostało zakwalifikowanych do dalszej analizy. Wynik wariancji liczby kopii z pojedynczej próbki przedstawiał trisomię mozaiki 182,16 par megazasad P 16,3 do Q 35,2 na chromosomie czwartym i 33-punktowy segment monosomii par megazasad 13 Q 11,1 do Q 13,33 na chromosomie 22. Podczas przeprowadzania selekcji fragmentów odstępy czasu między etapami powinny być modyfikowane w zależności od wielkości próbek w tej samej partii, aby zapobiec nadmiernej ekspozycji i jej brakowi w przypadku próbek z przodu i z tyłu.

pre-implantation-genetic-testing-for-aneuploidy-on-semiconductor

Research

JoVE Journal

Genetics

Genetyka

Niniejszy artykuł opisuje dobór odpowiednich sond do techniki single-cell FISH, metody preparowania jąder blastomerów, a także hybrydyzację in situ i ocenę sygnałów w kontekście diagnostyki przedimplantacyjnej (PGD) stosowanej w warunkach klinicznych.

FISH w diagnostyce preimplantacyjnej

Okołokomorowa heterotopia guzkowa (PNH) jest najczęstszą formą wady rozwojowej kory mózgowej (MCD) w wieku dorosłym, ale jej podłoże genetyczne pozostaje nieznane w większości sporadycznych przypadków. Niedawno opracowaliśmy strategię identyfikacji nowych genów kandydujących do MCD i bezpośredniego potwierdzenia ich przyczynowej roli in vivo.

Nowatorska strategia łącząca macierz CGH, sekwencjonowanie całego eksomu i elektroporację in utero u gryzoni w celu identyfikacji genów odpowiedzialnych za wady rozwojowe mózgu

Opisany jest zintegrowany system do ukierunkowanego sekwencjonowania nowej generacji próbek onkologicznych. Ten wieloplatformowy system jest zoptymalizowany pod kątem biopsji guza o niskiej jakości i małej ilości, obsługuje niskie dane wejściowe DNA, zawiera dobrze scharakteryzowane wielowariantowe kontrole i zawiera nowatorski wariant wywołujący, który jest informowany o ilościowych przedanalitycznych środkach kontroli jakości.

Integracja procesów na mokrym i suchym stanowisku laboratoryjnym optymalizuje ukierunkowane sekwencjonowanie nowej generacji biopsji nowotworów o niskiej jakości i małej ilości

Tutaj wprowadzamy metodę sekwencjonowania półprzewodników do preimplantacyjnych testów genetycznych na aneuploidię (PGT-A) z zaletami krótkiego czasu realizacji, niskich kosztów i wysokiej przepustowości.

Sekwencjonowanie półprzewodników do preimplantacyjnych badań genetycznych w kierunku aneuploidii

Ten protokół proponuje całościowe procedury laboratoryjne wymagane do wykrywania polimorfizmów pojedynczego nukleotydu w próbkach raka żołądka w oparciu o platformę sekwencjonowania półprzewodników jonowych. Szczegółowo opisano również sekwencje docelowe, adaptery ligaturujące, wzmacnianie i oczyszczanie biblioteki oraz kryteria kontroli jakości.

Wykrywanie wielogenowego polimorfizmu pojedynczego nukleotydu w raku żołądka w oparciu o platformę sekwencjonowania półprzewodników jonowych

Tutaj prezentujemy protokół śledzenia zanieczyszczenia genomowym DNA (gDNA) w próbkach RNA. W prezentowanej metodzie wykorzystuje się startery specyficzne dla wewnętrznego transkrybowanego regionu dystansowego (ITS) genów rybosomalnego DNA (rDNA). Metoda ta nadaje się do niezawodnego i czułego wykrywania zanieczyszczenia DNA u większości eukariontów i prokariontów.

Ocena zanieczyszczenia DNA w próbkach RNA na podstawie rybosomalnego DNA

Przedstawiono porównanie i optymalizację dwóch metod wzbogacania DNA organelek roślinnych: tradycyjne wirowanie różnicowe i frakcjonowanie całkowitego gDNA w oparciu o status metylacji. Oceniamy otrzymaną ilość i jakość DNA, wykazujemy wydajność w sekwencjonowaniu nowej generacji z krótkim odczytem i omawiamy potencjał zastosowania w sekwencjonowaniu pojedynczych cząsteczek z długim odczytem.

Optymalizacja i analiza porównawcza metod wzbogacania organelek DNA roślin odpowiednich do sekwencjonowania nowej generacji

Ukierunkowane sekwencjonowanie nowej generacji to efektywne czasowo i kosztowo podejście, które staje się coraz bardziej popularne zarówno w badaniach nad chorobami, jak i w diagnostyce klinicznej. Opisany tutaj protokół przedstawia złożony przepływ pracy wymagany do sekwencjonowania i procesu bioinformatycznego wykorzystywanego do identyfikacji wariantów genetycznych, które przyczyniają się do choroby.

Ukierunkowane sekwencjonowanie nowej generacji i bioinformatyka w celu oceny genetycznych uwarunkowań chorób konstytucjonalistycznych

Indywidualne sekwencjonowanie prowirusowe o pełnej długości (FLIPS) zapewnia efektywną i wysokoprzepustową metodę amplifikacji i sekwencjonowania pojedynczych, prawie pełnej długości (nienaruszonych i wadliwych) prowirusów HIV-1 i pozwala na określenie ich potencjalnej zdolności replikacyjnej. Projekt FLIPS pozwala przezwyciężyć ograniczenia poprzednich testów zaprojektowanych do sekwencjonowania utajonego rezerwuaru HIV-1.

Amplifikacja prowirusów HIV-1 o niemal pełnej długości do sekwencjonowania nowej generacji

Identyfikacja fizycznych interakcji między genami a elementami regulatorowymi jest trudna, ale została ułatwiona dzięki metodom wychwytywania konformacji chromosomów. Ta modyfikacja protokołu 4C-seq łagodzi stronniczość PCR, minimalizując nadmierną amplifikację matryc PCR i maksymalizując mapowalność odczytów poprzez włączenie etapu trawienia enzymu ograniczającego dodawanie.

Wysokoprzepustowa identyfikacja sekwencji regulatorowych genów przy użyciu sekwencjonowania nowej generacji wychwytywania konformacji chromosomów kołowych (4C-seq)

Poznaj procedurę PGT-A od amplifikacji pojedynczych komórek do raportowania wyników przy użyciu sekwencjonowania nowej generacji na półprzewodnikowej platformie. Ten protokół umożliwia replikację techniki w laboratoriach diagnostycznych.

Preimplantacyjne badania genetyczne w kierunku aneuploidii na półprzewodnikowej platformie sekwencjonowania nowej generacji

Przeglądaj więcej filmów