17 maja 2022
Ten protokół ma na celu dostarczenie szczegółowych procedur zbierania, utrwalania i utrzymywania próbek roślin mykoheterotroficznych, stosując różne techniki mikroskopowe, takie jak skaningowa i transmisyjna mikroskopia elektronowa, mikroskopia świetlna, konfokalna i fluorescencyjna do badania kolonizacji grzybów w tkankach roślinnych i nasionach kiełkujących z grzybami mikoryzowymi.
Protokół przedstawia różnorodne techniki mikroskopowe stosowane w celu zrozumienia kolonizacji grzybów w roślinach mykoheterotroficznych, od pobierania po szczegółowe przygotowanie próbek i obejmuje niezbędne kroki. Takie techniki można zastosować do różnych roślin mykoheterotroficznych, a nawet do materiałów roślinnych innych niż mykoheterotroficzne. Metoda ta jest głównie związana z botaniką strukturalną i może również dostarczyć informacji na temat interakcji mikoryzowych, fizjologii, biologii rozrodu, ewolucji i ekologii roślin mykoheterotroficznych.
Na początek zbierz rośliny mykoheterotroficzne, badając glebę wokół podstawy rośliny, uważając, aby nie uszkodzić podziemnych organów. Unikaj również wyciągania roślin z ziemi, aby zapobiec odłączeniu organów powietrznych od podziemnych. Ostrożnie kop wokół konstrukcji powietrznych za pomocą kielni ogrodniczej, badając podziemne organy, takie jak korzenie, łodygi, kłącza i organy spichrzowe, nie uszkadzając tych struktur.
Usuń cząstki gleby, aby zachować delikatne struktury i delikatnie umyj te narządy wodą z kranu, aby spłukać pozostałe cząstki gleby przed utrwaleniem próbek. Rośliny mykoheterotroficzne związane ze ściółką z liści wymagają szczególnej uwagi. Dlatego ostrożnie zbieraj delikatne narządy połączone z rozkładającym się materiałem przez ich strzępki, nie wyciągając ich z połączonych struktur.
Zachowaj struktury z takimi połączeniami i zbierz śmieci do analizy. W przypadku analizy transmisyjnej mikroskopii elektronowej należy podzielić próbki o grubości od 3 do 4 milimetrów w kropli buforu kakodylanu aldehydu glutarowego na mniejsze odcinki o grubości od 1 do 2 milimetrów. Wyrzuć przycięte krawędzie poza spadek.
Zapewnić przeprowadzenie procesu utrwalania w miejscu zbioru bezpośrednio po zebraniu roślin. Natychmiast przenieść skrawki do probówki zbiorczej o objętości utrwalacza ponad 10 razy większej niż objętość próbek, ponieważ jest to utrwalacz z dodatkiem. Do analizy powierzchniowej powierzchownych strzępek w narządach, zwłaszcza w podziemnych i mających kontakt ze ściółką z liści.
Obserwuj świeży lub utrwalony materiał pod mikroskopem preparacyjnym w powiększeniu 7.5x lub większym. Szukaj obszarów zainteresowania, kierując się powierzchownymi strzępkami i ryzomorfami. Wybierz próbki zawierające obszary powierzchownych ryzomorfów, ponieważ można je podzielić na sekcje, aby uwidocznić pelotony i cewki strzępek w komórkach korowych w korzeniach i łodygach.
Przygotować 0,2 miligrama na mililitr sprzężonego fluorochromu aglutyniny z kiełków pszenicy i 1% białych roztworów kalkofluoru w 0,1-molowym buforze fosforanowym zgodnie z opisem w manuskrypcie. Teraz inkubuj skrawki na szkiełkach szkiełkowych, odpowiednio przykrywając je roztworem sprzężonym fluorochromu aglutyniny z kiełków pszenicy przez 30 minut. Po inkubacji przemyć skrawki 0,1 molowym buforem fosforanowym i inkubować je w roztworze kalkofluoru jako pożywkę montażową.
Następnie umieść szkiełka nakrywkowe na szkiełkach i obserwuj je pod mikroskopem konfokalnym lub fluorescencyjnym przy użyciu wskazanych filtrów. Po utrwaleniu próbek, wykonaniu odwodnienia i przechowywaniu ich w 70% etanolu, należy odsłonić dowolną powierzchnię do analizy za pomocą skaningowej mikroskopii elektronowej za pomocą ostrej i nowej żyletki do wykonywania cięć ruchem jednokierunkowym. W razie potrzeby użyj mikroskopu stereoskopowego, aby wybrać próbki i weź pod uwagę obszar metalowych króćców podczas określania wielkości próbek.
Następnie odwodnić próbki w serii etanolowej. Małe i delikatne próbki należy przechowywać przez 30 minut w każdym stężeniu, a większe i gęstsze próbki przez 1 godzinę. Następnie złóż małe koperty za pomocą bibuły, aby uporządkować próbki do kolejnych kroków.
Większe próbki można obsługiwać bez koperty. Oznacz koperty ołówkiem i prowadź dziennik próbek. Ostrożnie umieść próbki w kopertach za pomocą pędzla.
Teraz przechowuj te próbki w absolutnym etanolu. Natychmiast przystąp do suszenia w punkcie krytycznym, uruchamiając osuszacz punktu krytycznego zgodnie ze standardowymi procedurami operacyjnymi. W tym celu należy umieścić próbki w etanolu absolutnym w uchwycie na próbkę i umieścić je w komorze ciśnieniowej suszarki punktu krytycznego.
Płyn pośredni rozpuszcza się w płynie przejściowym w krytycznym punkcie dwutlenku węgla, wysuszając w ten sposób próbki. Ponieważ reabsorpcja wilgoci atmosferycznej może zniszczyć próbki, należy je przechowywać w pojemniku do wysuszania natychmiast po wysuszeniu w punkcie krytycznym. Przed zamontowaniem próbek na metalowych króćcach załóż rękawice, aby manipulować króćcami.
Zanurz je w acetonie na 5 minut, aby usunąć tłuszcz i pozwól im wyschnąć. Pod mikroskopem stereoskopowym przymocuj próbki do króćca za pomocą przewodzącej dwustronnej taśmy klejącej z włókna węglowego i umieść je. Miejsce z góry jest jedyną możliwą perspektywą na obrazach ze skaningowej mikroskopii elektronowej.
Aby manipulować próbkami, użyj pęsety z cienkim czubkiem. Część próbki, której dotyka pęseta, jest zwykle uszkodzona. Bądź więc ostrożny i staraj się dotykać części znajdujących się z dala od obszarów zainteresowania.
Utrzymać kikuty z próbkami na szczelnie zamkniętej szalce Petriego z żelem krzemionkowym. Następnie należy przystąpić do napylania w celu osadzenia warstwy złota lub platyny na powierzchni próbek w atmosferze gazu obojętnego pod niskim ciśnieniem, postępując zgodnie ze standardowymi procedurami operacyjnymi. Grubość powłoki zależy od topografii próbki i zwykle wynosi od 15 do 40 nanometrów.
Na koniec utrzymuj pokryte kikuty na szczelnie zamkniętej szalce Petriego z żelem krzemionkowym zatrzymującym wilgoć. Próbki mogą być przechowywane w ten sposób przez wiele tygodni. Użyj skaningowego mikroskopu elektronowego, aby przeanalizować te próbki.
Wiązka elektronów uderza w próbkę in vacuo podczas skaningowej mikroskopii elektronowej, a emisja sygnału z takiej interakcji jest interpretowana jako obrazy. Upewnij się, że roztwory i materiały używane w symbiotycznym kiełkowaniu nasion są sterylne. aby uniknąć zanieczyszczenia.
Zacznij od autoklawowania ich przez 20 minut w temperaturze 121 stopni Celsjusza. W okapie z laminarnym przepływem powietrza należy powierzchownie zdezynfekować owoce i nasiona, zanurzając je w roztworze podchlorynu sodu zawierającym 2% aktywnego chloru. Smukłe i kruche nasiona można zanurzyć w rozcieńczonym w 1:1 roztworze podchlorynu sodu.
Po dezynfekcji zregeneruj nasiona, filtrując je za pomocą tkaniny kserograficznej. Umyj owoce i nasiona trzykrotnie w autoklalawowanej wodzie destylowanej, aby usunąć roztwór podchlorynu przed przystąpieniem do testów kiełkowania. W razie potrzeby przechowywać je w kopertach z bibuły filtracyjnej wewnątrz szklanych kolb z żelem krzemionkowym w temperaturze 4 stopni Celsjusza i hermetycznie zamknąć kolby i uszczelnić folią spożywczą, a następnie ocenić skuteczność procesu mycia, przenosząc kilka kropli wody z ostatniego prania na agar z dekstrozą ziemniaczaną.
W celu symbiotycznego kiełkowania nasion orchidei należy inkubować nasiona na 1 do 2-centymetrowych autoklawowanych krążkach z bibuły filtracyjnej umieszczonych na szalkach Petriego zawierających pożywkę do hodowli agaru z płatków owsianych. Teraz zaszczepij środek szalki Petriego fragmentem pożywki hodowlanej zawierającej grzybnię z wybranego izolowanego grzyba. Uszczelnij szalki Petriego folią spożywczą i inkubuj je w ciemności w temperaturze około 25 stopni Celsjusza lub temperaturze pokojowej, w zależności od wzrostu grzybów.
Przygotuj kilka potraw z nasionami i bez inokulacji grzybów jako kontrolę negatywną dla testu kiełkowania. Analizuj wyniki kiełkowania co tydzień, zbierając dane ilościowe i jakościowe oraz fotografując protobulmy i sadzonki. Ryzomorfy można łatwo rozpoznać zwykle jako ciemne, przypominające sznurowadła struktury.
Odręczne lub inne metody uzyskiwania odcinków grubszych niż 10 mikrometrów mogą lepiej uwidocznić peletony i dostarczyć bardziej reprezentatywnych obrazów wzorców kolonizacji grzybów. Sekcje odręczne mogą być również odpowiednie do analizy strzępek w wyższym wzmocnieniu. Chociaż szczegóły lepiej uzyskuje się w cieńszych sekcjach.
Wtórne ściany komórkowe w pierwiastkach ksylemu można łatwo zidentyfikować po jasnym kolorze, jaki uzyskuje toluidyna. Tymczasem elementy łyka składające się tylko z pierwotnych ścian komórkowych są identyfikowane na podstawie ich cieńszych i ciemniejszych ścian komórkowych. Artefakty autofluorescencji można zobaczyć w przekrojach żywicy glikolowo-metakrylanowej.
Artefakty te są zwykle związane ze stężeniem fluorochromu i można ich uniknąć, przemłukując próbki większą liczbę razy buforem. Odręczna część korzenia pokazuje strzępki wewnętrzne i zewnętrzne. Ten sam narząd można zobaczyć za pomocą skaningowej mikroskopii elektronowej z dużą ilością ryzomorfów i pojedynczych strzępek na jego powierzchni.
Większość gatunków storczyków kiełkuje w ciągu kilku tygodni po zakażeniu zaszczepionym grzybem lub do prawie ponad miesiąca. Światło w skaningowej mikroskopii elektronowej można zastosować do kwiatów, owoców i nasion w celu zbadania biologii reprodukcyjnej lub roślin mykoheterotroficznych. Symbiotyczne kiełkowanie nasion można również przetestować w storczykach autotroficznych.
Wyświetl pełny transkrypt i uzyskaj dostęp do tysięcy filmów naukowych
Ten protokół opisuje szczegółowe procedury zbierania i przygotowywania próbek roślin mykoheterotroficznych. Stosuje różne techniki mikroskopiczne do badania kolonizacji grzybów w tkankach roślin i nasionach związanych z grzybami mikoryzowymi.
Microscopy-based structural analysis of fungal colonization in mycoheterotrophic plant tissues enables precise mapping of plant-fungal interfaces critical for nutrient exchange. These imaging workflows support early-stage target validation and mechanistic de-risking in plant-microbe interaction studies, informing translational research and assay development for symbiotic systems. The protocols facilitate reproducible, quantitative evaluation of symbiotic germination and colonization patterns, directly impacting pipeline decisions in agricultural and biotechnological R&D.
These microscopy protocols integrate from early discovery through assay development and translational research, supporting hypothesis testing and mechanistic validation in plant-microbe pipelines.