-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

PL

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

pl_PL

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
Ultraszybkie sekwencjonowanie nowej generacji oparte na amplikonie w niepłaskonabłonkowym niedrob...
Ultraszybkie sekwencjonowanie nowej generacji oparte na amplikonie w niepłaskonabłonkowym niedrob...
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Ultra-Fast Amplicon-Based Next-Generation Sequencing in Non-Squamous Non-Small Cell Lung Cancer

Ultraszybkie sekwencjonowanie nowej generacji oparte na amplikonie w niepłaskonabłonkowym niedrobnokomórkowym raku płuca

Full Text
1,761 Views
07:59 min
September 8, 2023

DOI: 10.3791/65190-v

Christophe Bontoux1,2,3,4,5, Virginie Lespinet-Fabre1,2,3,4, Olivier Bordone1,2,3,4, Virginie Tanga1,2,3,4, Maryline Allegra1,2,3,4, Myriam Salah1,2,3,4, Salomé Lalvée1,2,3,4, Samantha Goffinet1,2,3,4, Jonathan Benzaquen3,4,5,6, Charles-Hugo Marquette3,4,5,6, Marius Ilié1,2,3,4,5, Véronique Hofman1,2,3,4,5, Paul Hofman1,2,3,4,5

1Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Centre Hospitalier Universitaire de Nice,Université Côte d’Azur, CHU de Nice, 2Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025),Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, 3Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA,Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, 4FHU OncoAge,Université Côte d'Azur, 5Team 4, Institute of Research on Cancer and Aging (IRCAN), CNRS INSERM, Centre Antoine-Lacassagne,Université Côte d'Azur, 6Department of Pulmonary Medicine and Thoracic Oncology, Centre Hospitalier Universitaire de Nice,Université Côte d'Azur

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study addresses the urgent need for rapid detection of genomic alterations in non-squamous non-small cell lung cancer (NS-NSCLC) to inform targeted therapies. An ultra-fast next-generation sequencing (NGS) workflow is presented as a solution for efficient analysis of small biopsy samples.

Key Study Components

Research Area

  • Oncology
  • Molecular diagnostics
  • Next-generation sequencing

Background

  • Targeted therapies for NS-NSCLC depend on timely detection of genomic alterations.
  • Traditional biopsy methods often yield small samples, complicating analysis.
  • A comprehensive approach for rapid testing is needed to enhance patient care.

Methods Used

  • Ultra-fast next-generation sequencing (NGS)
  • Analysis of formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples
  • Automated purification and sequencing processes

Main Results

  • The workflow identifies key genetic mutations and fusions in a time-efficient manner.
  • High sensitivity for detecting various genomic alterations was achieved.
  • Comprehensive molecular profiling was performed on 259 NS-NSCLC patients.

Conclusions

  • This study demonstrates a new standard for rapid genomic profiling in NS-NSCLC.
  • It provides critical insights for personalized treatment strategies in oncology.

Frequently Asked Questions

What are the advantages of the ultra-fast NGS workflow?
The ultra-fast NGS workflow allows for rapid detection of genetic mutations in small biopsy samples, minimizing the time to diagnosis and treatment.
How many patients were analyzed in this study?
A total of 259 patients with non-squamous non-small cell lung cancer were included in the analysis.
What sample types were used for this analysis?
The study utilized various biopsy types and surgical specimens, including formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues.
What are the implications of this research for lung cancer treatment?
The findings support the development of rapid genomic profiling methods that can inform targeted therapy decisions, improving patient outcomes.
What methodologies are compared in this study?
The study compares traditional molecular testing methods, such as RT-PCR and fluorescence in situ hybridization, with the proposed NGS approach.
What is the primary goal of the proposed NGS workflow?
The primary goal is to enable timely and comprehensive genomic profiling for optimal therapy selection in NS-NSCLC patients.

Wzrost liczby biomarkerów molekularnych do testowania w leczeniu leczenia niepłaskonabłonkowym niedrobnokomórkowym rakiem płuca (NS-NSCLC) skłonił do opracowania szybkich i niezawodnych metod wykrywania molekularnego. Opisujemy przebieg pracy do oceny zmian genomowych u pacjentów z NS-NSCLC przy użyciu podejścia ultraszybkiego sekwencjonowania nowej generacji (NGS).

Obecnie terapie celowane niedrobnokomórkowego raka płuca wymagają szybkiego wykrywania wielu zmian genomowych, dlatego ma to kluczowe znaczenie dla optymalnej opieki, ponieważ biopsja klatki piersiowej jest często mała i zawiera niewiele komórek nowotworowych. W związku z tym przedstawiamy ultraszybki proces sekwencjonowania nowej generacji, który jest wdrażany do rutynowej diagnostyki niedrobnokomórkowego raka płuca w laboratorium patomorfologii. Obecnie ukierunkowany NGS przy użyciu różnych rozmiarów paneli oraz testowanie sekwencjonowania jednego genu za pomocą RT-PCR, digital PCR, fluorescencyjna hybrydyzacja in situ i immunohistochemia to różne metody stosowane do wykrywania zmian molekularnych.

Jednak większość z tych metod może być czasochłonna i pochłaniać materiał tkankowy, co prowadzi do opóźnionej diagnozy i ryzyka wysiłku tkankowego. Wyzwanie polega na skutecznym wykrywaniu wielu zmian molekularnych przy jednoczesnej oszczędności materiałów i zapewnieniu szybkiej diagnozy. Przepływ pracy zapewnia onkologowi klatki piersiowej kompleksowe informacje o guzie, w tym diagnozę histologiczną, status PD-L1 i możliwe do ukierunkowania aberracje genomowe.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Sekwencjonowanie nowej generacji niedrobnokomórkowy rak płuca terapie celowane zmiany molekularne biopsja klatki piersiowej profilowanie genomowe status PD-L1 zautomatyzowany system szybka diagnostyka próbki tkanek próbki osocza podejmowanie decyzji dotyczących leczenia charakterystyka molekularna pacjenci z NS-NSCLC mechanizmy oporności

Related Videos

Sekwencjonowanie nowej generacji do wykrywania mutacji, które można podjąć w celu działania, w guzach litych i płynnych

11:15

Sekwencjonowanie nowej generacji do wykrywania mutacji, które można podjąć w celu działania, w guzach litych i płynnych

Related Videos

25.1K Views

Integracja procesów na mokrym i suchym stanowisku laboratoryjnym optymalizuje ukierunkowane sekwencjonowanie nowej generacji biopsji nowotworów o niskiej jakości i małej ilości

13:24

Integracja procesów na mokrym i suchym stanowisku laboratoryjnym optymalizuje ukierunkowane sekwencjonowanie nowej generacji biopsji nowotworów o niskiej jakości i małej ilości

Related Videos

12.3K Views

Wykrywanie rzadkich mutacji w ctDNA za pomocą sekwencjonowania nowej generacji

11:11

Wykrywanie rzadkich mutacji w ctDNA za pomocą sekwencjonowania nowej generacji

Related Videos

17.4K Views

Prosta i szybka metoda uzyskiwania wysokiej jakości DNA guza z próbek kliniczno-patologicznych za pomocą cytologii odcisku dotykowego

11:20

Prosta i szybka metoda uzyskiwania wysokiej jakości DNA guza z próbek kliniczno-patologicznych za pomocą cytologii odcisku dotykowego

Related Videos

11.4K Views

Wykrywanie celowalnych zmian w niedrobnokomórkowym raku płuc za pomocą sekwencjonowania nowej generacji

05:17

Wykrywanie celowalnych zmian w niedrobnokomórkowym raku płuc za pomocą sekwencjonowania nowej generacji

Related Videos

430 Views

Całościowa analiza immunohistochemiczna naczyń naczyniowych skóry kończyn embrionalnych: modelowy system do badania morfogenezy rozgałęzień naczyniowych w zarodku

09:53

Całościowa analiza immunohistochemiczna naczyń naczyniowych skóry kończyn embrionalnych: modelowy system do badania morfogenezy rozgałęzień naczyniowych w zarodku

Related Videos

18.1K Views

Izolacja i charakterystyka mezenchymalnych komórek macierzystych płuc myszy oniskim poziomie CD45 Hoechst

16:55

Izolacja i charakterystyka mezenchymalnych komórek macierzystych płuc myszy oniskim poziomie CD45 Hoechst

Related Videos

20.9K Views

Badania przesiewowe za pomocą mikroskopii fluorescencyjnej i sekwencjonowanie nowej generacji: przydatne narzędzia do identyfikacji genów zaangażowanych w integralność organelli

12:42

Badania przesiewowe za pomocą mikroskopii fluorescencyjnej i sekwencjonowanie nowej generacji: przydatne narzędzia do identyfikacji genów zaangażowanych w integralność organelli

Related Videos

12.8K Views

Ilościowy pomiar proteolizy macierzy zewnątrzkomórkowej za pośrednictwem inwadopodiów w kontekstach jedno- i wielokomórkowych

14:23

Ilościowy pomiar proteolizy macierzy zewnątrzkomórkowej za pośrednictwem inwadopodiów w kontekstach jedno- i wielokomórkowych

Related Videos

20K Views

Wykrywanie somatycznych zmian genetycznych w próbkach nowotworowych poprzez wychwytywanie eksonów i masowo równoległe sekwencjonowanie

11:02

Wykrywanie somatycznych zmian genetycznych w próbkach nowotworowych poprzez wychwytywanie eksonów i masowo równoległe sekwencjonowanie

Related Videos

20K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code