Name: Zautomatyzowane cięcie wibratomiczne tkanki płucnej zatopionej w agarozie do multipleksowego obrazowania fluorescencyjnego (Wideo) | JoVE Journal
Uploaded: 2023-10-06T12:50:00.000+00:00
Duration: 7 min 17 s
Description: Poznaj zautomatyzowaną technikę cięcia wibratomicznego tkanki płucnej zatopionej w agarozie do multipleksowego obrazowania fluorescencyjnego. Ta metoda umożliwia badanie przestrzennej ekspresji białek w modelu transplantacji płuc u świń bez konieczności odzyskiwania antygenów.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Autorzy dziękują za fundusze otrzymane od Fundacji Medycyny Molekularnej Wallenberga i Centrum Komórek Macierzystych Uniwersytetu w Lund oraz dziękują Centrum Bioobrazowania Uniwersytetu w Lund (LBIC) za dostęp do aparatu Nikon A1RHD.

Mysie płuca zostały podarowane przez badaczy korzystających z innych układów narządów w celu utrzymania zasady 3R. Wszystkie procedury na świniach zostały przeprowadzone zgodnie z dyrektywą europejską 2010/63/UE i zostały zatwierdzone przez Komitet Etyczny ds. Badań na Zwierzętach w Malmö-Lund (Dnr 5.8.18-05527/2019) i przeprowadzone zgodnie z wytycznymi CODEX Szwedzkiej Rady ds. Badań Naukowych. Zgoda na wykorzystanie próbek pobranych od ludzi została wydana przez Szwedzką Krajową Komisję Etyczną (Dnr 2020-07115 i Dnr 2020-01864). Szczegółowe informacje na temat wszystkich materiałów i instrumentów użytych w tym protokole można znaleźć w Tabeli Materiałów.
1. Przygotowanie roztworów i materiałów
<ol>
	<li>Utrwal tkankę płucną w 4% paraformaldehydzie w temperaturze pokojowej przez 48 godzin. Następnie przenieś tkankę płucną do stożkowej rurki o pojemności 50 ml wypełnionej solą fizjologiczną buforowaną fosforanami (PBS) zawierającą 0,01% azydku sodu.</li>
	<li>Przygotować 3% (w/v) roztwór agarozy, rozpuszczając 1,5 g agarozy o niskiej temperaturze topnienia w 50 ml sterylnego PBS. Przygotuj plastikowy kubek, cienkie kleszczyki i sterylne nożyczki.</li>
	<li>Podgrzej agarozę w kuchence mikrofalowej, aż się zagotuje, a następnie schłodzić ją do 42 °C w łaźni wodnej. Przechowuj agarozę w postaci płynnej, przechowując ją w łaźni wodnej do momentu użycia do momentu, gdy będzie gotowa do użycia. 
	UWAGA: Podczas podgrzewania agarozy obserwuj kuchenkę mikrofalową, aż zacznie wrzeć, aby się nie przelała. Zwykle zajmuje to około 1,5 minuty.</li>
</ol>
2. Tkanka płucna zanurzona w agarozie
<ol>
	<li>Pobrać biopsję płuca z azydku PBS i ostrożnie wypreparować płaty płuc za pomocą cienkich kleszczy i sterylnych nożyczek. Pokrój płat płuca na mniejsze bloki. 
	UWAGA: Chociaż możliwe jest cięcie z opłucną, jej grube wiązki elastyny mogą utrudniać cięcie ostrzem wibratomowym. Dlatego zalecamy jego usunięcie, jeśli nie jest to konieczne.</li>
	<li>Przetnij plastikowy kubek przez środek i dodaj niewielką ilość agarozy na jego dno. Umieścić pokrywkę ze stożkowej probówki o pojemności 50 ml (bez brzegu) na powierzchni agarozy i przechowywać filiżankę w temperaturze 4 °C przez 5 minut, aby agaroza zastygła do późniejszego użycia.</li>
	<li>Wyjmij plastikowy kubek z lodówki o temperaturze 4 °C, dodaj około 1 ml płynnej agarozy na pokrywkę, a następnie delikatnie umieść blok tkanki płucnej na pokrywce. Pozostaw agarozę na 2-3 minuty do częściowego zestalenia się w temperaturze pokojowej. Następnie powoli wlej płynną agarozę na tkankę płucną, aż zostanie całkowicie zanurzona.</li>
	<li>Wstaw do lodówki w temperaturze 4 °C na około 15 minut, aż agaroza zastygnie. Następnie ostrożnie użyj ostrego ostrza, aby usunąć dodatkową agarozę otaczającą tkankę płucną, pozostawiając jednolitą warstwę o grubości około 5 mm wokół tkanki (<silna klasa = "xfig">Rysunek 1).</li>
</ol>
3. Wycinanie skrawków tkanki płucnej
<ol>
	<li>Aby przygotować tkankę płucną do cięcia, przymocuj każdy blok tkanki do dysku próbki wibratomu za pomocą super kleju. Następnie napełnij tackę buforową wibratomu PBS i umieść lód w otaczającej łaźni lodowej. Na koniec ostrożnie zainstaluj dysk z próbką w tacy buforowej.</li>
	<li>Pokrój tkankę płucną za pomocą wibratomu z następującymi ustawieniami: grubość: 200 μm, częstotliwość: 100 Hz, amplituda ostrza: 1,3 mm i prędkość posudnia ostrza 0,02-0,03 mm/s, która zależy od sztywności tkanki. 
	UWAGA: Cięcie jest możliwe do grubości 70 μm, jeśli prędkość ostrza zostanie zmniejszona do 0,01 mm/s. Niektóre wibratory (np. Leica V1200s) umożliwiają automatyzację cięcia poprzez ustawienie okna cięcia.</li>
	<li>Aby zebrać skrawki, delikatnie przenieś plasterek tkanki, nabierając go szczoteczką z tacki wibratomu do 24-dołkowej płytki wypełnionej 0,01% azydkiem w PBS. Na koniec zakonserwuj plastry płuc w temperaturze 4 °C.</li>
</ol>
4. Barwienie immunologiczne elastyny, CD31, HTII-280 i SMA
<ol>
	<li>Przepuszczalność i zablokowanie (1% albuminy surowicy bydlęcej + 0,5% Tritonu + 5% normalnej surowicy koziej) tkanki w temperaturze 4 °C pod delikatnym wstrząsem przez 45 min.</li>
	<li>Rozcieńczyć przeciwciała pierwszorzędowe (SMA 1:500; elastyna 1:250; CD31 1:250; HTII-280 1:250) w PBS, dodać 300 μl do każdego dołka i inkubować przez noc w temperaturze 4 °C pod delikatnym wstrząsaniem.</li>
	<li>Nie dotykając plastra i nie usuwając przeciwciał pierwotnych końcówką pipety, przemyć 3 x 20 min (400 μl) PBS.</li>
	<li>Rozcieńczyć przeciwciała drugorzędowe (1:1000) w PBS, dodać 300 μl do każdego dołka i inkubować w temperaturze 4 °C pod delikatnym wstrząsem przez 90 minut.</li>
	<li>Usunąć przeciwciała drugorzędowe za pomocą końcówki pipety, dodać 4',6-diamidino-2-fenyloindol (DAPI) (1:1000) i lektynę-488 pomidora (1:500) przez 30 minut inkubacji i myć przez 3 x 10 minut PBS.</li>
	<li>Umieść trzy krople podłoża montażowego na szkiełku, zamontuj szkiełko nakrywkowe i przystąp do obrazowania.</li>
</ol>

Innovative Lung Imaging Using Agarose-Embedded Vibratome Sections

<ol><li>Morin, J. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Precision+cut+lung+slices+as+an+efficient+tool+for+in+vitro+lung+physio-pharmacotoxicology+studies%5BTitle%5D)+AND+%22Xenobiotica%22%5BJournal%5D)">Precision cut lung slices as an efficient tool for in vitro lung physio-pharmacotoxicology studies.</a> Xenobiotica. 43 (1), 63-72 (2013).</li>
<li>Kawasaki, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+NanoSuit+method%3A+a+novel+histological+approach+for+examining+paraffin+sections+in+a+nondestructive+manner+by+correlative+light+and+electron+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Laboratory+Investigation%22%5BJournal%5D)">The NanoSuit method: a novel histological approach for examining paraffin sections in a nondestructive manner by correlative light and electron microscopy.</a> Laboratory Investigation. 100 (1), 161-173 (2020).</li>
<li>Silva, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Semi-quantitative+scoring+system+for+green+histopathological+evaluation+of+large+animal+models+of+acute+lung+injury%5BTitle%5D)+AND+%22BIO-PROTOCOL%22%5BJournal%5D)">A Semi-quantitative scoring system for green histopathological evaluation of large animal models of acute lung injury.</a> BIO-PROTOCOL. 12 (16), e4493(2022).</li>
<li>Kim, J. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimizing+tissue-clearing+conditions+based+on+analysis+of+the+critical+factors+affecting+tissue-clearing+procedures%5BTitle%5D)+AND+%22Scientific+Reports%22%5BJournal%5D)">Optimizing tissue-clearing conditions based on analysis of the critical factors affecting tissue-clearing procedures.</a> Scientific Reports. 8 (1), 12815(2018).</li>
<li>Jain, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Immunocytochemistry+for+predictive+biomarker+testing+in+lung+cancer+cytology%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Cytopathology%22%5BJournal%5D)">Immunocytochemistry for predictive biomarker testing in lung cancer cytology.</a> Cancer Cytopathology. 127 (5), 325-339 (2019).</li>
<li>Alturkistani, H. A., Tashkandi, F. M., Mohammedsaleh, Z. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Histological+stains%3A+a+literature+review+and+case+study%5BTitle%5D)+AND+%22Global+Journal+of+Health+Science%22%5BJournal%5D)">Histological stains: a literature review and case study.</a> Global Journal of Health Science. 8 (3), 72-79 (2015).</li>
<li>Morrison, L. E., Lefever, M. R., Lewis, H. N., Kapadia, M. J., Bauer, D. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Conventional+histological+and+cytological+staining+with+simultaneous+immunohistochemistry+enabled+by+invisible+chromogens%5BTitle%5D)+AND+%22Laboratory+Investigation%22%5BJournal%5D)">Conventional histological and cytological staining with simultaneous immunohistochemistry enabled by invisible chromogens.</a> Laboratory Investigation. 102 (5), 545-553 (2022).</li>
<li>Dineshshankar, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Kerosene+as+an+alternative+to+xylene+in+histopathological+tissue+processing+and+staining%3A+An+experimental+study%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Pharmacy+and+Bioallied+Sciences%22%5BJournal%5D)">Kerosene as an alternative to xylene in histopathological tissue processing and staining: An experimental study.</a> Journal of Pharmacy and Bioallied Sciences. 11 (6), 376(2019).</li>
<li>Abdelaal, H. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+of+vibratome+and+compresstome+sectioning+of+fresh+primate+lymphoid+and+genital+tissues+for+in+situ+MHC-tetramer+and+immunofluorescence+staining%5BTitle%5D)+AND+%22Biological+Procedures+Online%22%5BJournal%5D)">Comparison of vibratome and compresstome sectioning of fresh primate lymphoid and genital tissues for in situ MHC-tetramer and immunofluorescence staining.</a> Biological Procedures Online. 17 (1), 2(2015).</li>
<li>Siwczak, F., Hiller, C., Pfannkuche, H., Schneider, M. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Culture+of+vibrating+microtome+tissue+slices+as+a+3D+model+in+biomedical+research%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Biological+Engineering%22%5BJournal%5D)">Culture of vibrating microtome tissue slices as a 3D model in biomedical research.</a> Journal of Biological Engineering. 17 (1), 36(2023).</li>
<li>Bèchet, N. B., Shanbhag, N. C., Lundgaard, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glymphatic+pathways+in+the+gyrencephalic+brain%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Cerebral+Blood+Flow+%26+Metabolism%22%5BJournal%5D)">Glymphatic pathways in the gyrencephalic brain.</a> Journal of Cerebral Blood Flow & Metabolism. 41 (9), 2264-2279 (2021).</li>
<li>Bèchet, N. B., Kylkilahti, T. M., Mattsson, B., Petrasova, M., Shanbhag, N. C., Lundgaard, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Light+sheet+fluorescence+microscopy+of+optically+cleared+brains+for+studying+the+glymphatic+system%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Cerebral+Blood+Flow+and+Metabolism%22%5BJournal%5D)">Light sheet fluorescence microscopy of optically cleared brains for studying the glymphatic system.</a> Journal of Cerebral Blood Flow and Metabolism. 40 (10), 1975-1986 (2020).</li>
<li>Bai, Y., Ai, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Utilizing+the+precision-cut+lung+slice+to+study+the+contractile+regulation+of+airway+and+intrapulmonary+arterial+smooth+muscle%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Utilizing the precision-cut lung slice to study the contractile regulation of airway and intrapulmonary arterial smooth muscle.</a> Journal of Visualized Experiments. (183), (2022).</li>
<li>Gerckens, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Generation+of+human+3D+lung+tissue+cultures+%283D-LTCs%29+for+disease+modeling%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Generation of human 3D lung tissue cultures (3D-LTCs) for disease modeling.</a> Journal of Visualized Experiments. (144), (2019).</li>
<li>Sanderson, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Exploring+lung+physiology+in+health+and+disease+with+lung+slices%5BTitle%5D)+AND+%22Pulmonary+Pharmacology+%26+Therapeutics%22%5BJournal%5D)">Exploring lung physiology in health and disease with lung slices.</a> Pulmonary Pharmacology & Therapeutics. 24 (5), 452-465 (2011).</li>
<li>Lam, M., Lamanna, E., Organ, L., Donovan, C., Bourke, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Perspectives+on+precision+cut+lung+slices%E2%80%94powerful+tools+for+investigation+of+mechanisms+and+therapeutic+targets+in+lung+diseases%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Pharmacology%22%5BJournal%5D)">Perspectives on precision cut lung slices—powerful tools for investigation of mechanisms and therapeutic targets in lung diseases.</a> Frontiers in Pharmacology. 14, 1162889(2023).</li>
<li>Liu, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+precision+cut+lung+slices+as+a+translational+model+for+the+study+of+lung+biology%5BTitle%5D)+AND+%22Respiratory+Research%22%5BJournal%5D)">Use of precision cut lung slices as a translational model for the study of lung biology.</a> Respiratory Research. 20 (1), 162(2019).</li>
<li>Cooper, P. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Formoterol+and+salmeterol+induce+a+similar+degree+of+%CE%B2+2-+adrenoceptor+tolerance+in+human+small+airways+but+via+different+mechanisms%5BTitle%5D)+AND+%22British+Journal+of+Pharmacology%22%5BJournal%5D)">Formoterol and salmeterol induce a similar degree of β 2- adrenoceptor tolerance in human small airways but via different mechanisms.</a> British Journal of Pharmacology. 163 (3), 521-532 (2011).</li>
<li>Ochoa, L. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+of+murine+whole+lung+fibrosis+by+large+scale+3D+microscopy+aided+by+tissue+optical+clearing%5BTitle%5D)+AND+%22Scientific+Reports%22%5BJournal%5D)">Imaging of murine whole lung fibrosis by large scale 3D microscopy aided by tissue optical clearing.</a> Scientific Reports. 8 (1), 13348(2018).</li>
<li>Tehrani, K. F., Park, J., Chaney, E. J., Tu, H., Boppart, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nonlinear+imaging+histopathology%3A+a+pipeline+to+correlate+gold-standard+hematoxylin+and+eosin+staining+with+modern+nonlinear+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22IEEE+Journal+of+Selected+Topics+in+Quantum+Electronics%22%5BJournal%5D)">Nonlinear imaging histopathology: a pipeline to correlate gold-standard hematoxylin and eosin staining with modern nonlinear microscopy.</a> IEEE Journal of Selected Topics in Quantum Electronics. 29 (4), (2023).</li>
<li>Branchfield, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+three-dimensional+study+of+alveologenesis+in+mouse+lung%5BTitle%5D)+AND+%22Developmental+Biology%22%5BJournal%5D)">A three-dimensional study of alveologenesis in mouse lung.</a> Developmental Biology. 409 (2), 429-441 (2016).</li>
<li>Li, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Precision+vibratome+for+high-speed+ultrathin+biotissue+cutting+and+organ-wide+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22iScience%22%5BJournal%5D)">Precision vibratome for high-speed ultrathin biotissue cutting and organ-wide imaging.</a> iScience. 24 (9), 103016(2021).</li>
<li>Qian, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DOCK2+promotes+pleural+fibrosis+by+modulating+mesothelial+to+mesenchymal+transition%5BTitle%5D)+AND+%22American+Journal+of+Respiratory+Cell+and+Molecular+Biology%22%5BJournal%5D)">DOCK2 promotes pleural fibrosis by modulating mesothelial to mesenchymal transition.</a> American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 66 (2), 171-182 (2022).</li>
<li>Cagle, P. T., Allen, T. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pathology+of+the+pleura%3A+What+the+pulmonologists+need+to+know%5BTitle%5D)+AND+%22Respirology%22%5BJournal%5D)">Pathology of the pleura: What the pulmonologists need to know.</a> Respirology. 16 (3), 430-438 (2011).</li>
<li>Jantz, M. A., Antony, V. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pleural+fibrosis%5BTitle%5D)+AND+%22Clinics+in+Chest+Medicine%22%5BJournal%5D)">Pleural fibrosis.</a> Clinics in Chest Medicine. 27 (2), 181-191 (2006).</li>
<li>Viana, F., O’Kane, C. M., Schroeder, G. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Precision-cut+lung+slices%3A+A+powerful+ex+vivo+model+to+investigate+respiratory+infectious+diseases%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+Microbiology%22%5BJournal%5D)">Precision-cut lung slices: A powerful ex vivo model to investigate respiratory infectious diseases.</a> Molecular Microbiology. 117 (3), 578-588 (2022).</li>
<li>Paddenberg, R., Mermer, P., Goldenberg, A., Kummer, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Videomorphometric+analysis+of+hypoxic+pulmonary+vasoconstriction+of+intra-pulmonary+arteries+using+murine+precision+cut+lung+slices%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Videomorphometric analysis of hypoxic pulmonary vasoconstriction of intra-pulmonary arteries using murine precision cut lung slices.</a> Journal of Visualized Experiments. (83), e50970(2014).</li>
<li>Lyons-Cohen, M. R., Thomas, S. Y., Cook, D. N., Nakano, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Precision-cut+mouse+lung+slices+to+visualize+live+pulmonary+dendritic+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Precision-cut mouse lung slices to visualize live pulmonary dendritic cells.</a> Journal of Visualized Experiments. (122), e55465(2017).</li>
<li>Klouda, T., Kim, H., Kim, J., Visner, G., Yuan, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Precision+cut+lung+slices+as+an+efficient+tool+for+ex+vivo+pulmonary+vessel+structure+and+contractility+studies%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Precision cut lung slices as an efficient tool for ex vivo pulmonary vessel structure and contractility studies.</a> Journal of Visualized Experiments. (171), e62392(2021).</li>
<li>Ghaidan, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reduction+of+primary+graft+dysfunction+using+cytokine+adsorption+during+organ+preservation+and+after+lung+transplantation%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Communications%22%5BJournal%5D)">Reduction of primary graft dysfunction using cytokine adsorption during organ preservation and after lung transplantation.</a> Nature Communications. 13 (1), 1-15 (2022).</li>
<li>Guenthart, B. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regeneration+of+severely+damaged+lungs+using+an+interventional+cross-circulation+platform%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Communications%22%5BJournal%5D)">Regeneration of severely damaged lungs using an interventional cross-circulation platform.</a> Nature Communications. 10 (1), 1985(1985).</li>
<li>Ruaro, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+history+and+mystery+of+alveolar+epithelial+type+II+cells%3A+focus+on+their+physiologic+and+pathologic+role+in+lung%5BTitle%5D)+AND+%22International+Journal+of+Molecular+Sciences%22%5BJournal%5D)">The history and mystery of alveolar epithelial type II cells: focus on their physiologic and pathologic role in lung.</a> International Journal of Molecular Sciences. 22 (5), 2566(2021).</li>
<li>Crapo, J. D., Barry, B. E., Gehr, P., Bachofen, M., Weibel, E. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+number+and+cell+characteristics+of+the+normal+human+lung%5BTitle%5D)+AND+%22The+American+Review+of+Respiratory+Disease%22%5BJournal%5D)">Cell number and cell characteristics of the normal human lung.</a> The American Review of Respiratory Disease. 126 (2), 332-337 (1982).</li>
<li>Evans, K. V., Lee, J. -H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Alveolar+wars%3A+The+rise+of+in+vitro+models+to+understand+human+lung+alveolar+maintenance%2C+regeneration%2C+and+disease%5BTitle%5D)+AND+%22Stem+Cells+Translational+Medicine%22%5BJournal%5D)">Alveolar wars: The rise of in vitro models to understand human lung alveolar maintenance, regeneration, and disease.</a> Stem Cells Translational Medicine. 9 (8), 867-881 (2020).</li>
<li>Chen, J. -X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sirtuin+3+ameliorates+lung+senescence+and+improves+type+II+alveolar+epithelial+cell+function+by+enhancing+the+FoxO3a-dependent+antioxidant+defense+mechanism%5BTitle%5D)+AND+%22Stem+Cells+and+Development%22%5BJournal%5D)">Sirtuin 3 ameliorates lung senescence and improves type II alveolar epithelial cell function by enhancing the FoxO3a-dependent antioxidant defense mechanism.</a> Stem Cells and Development. 30 (17), 843-855 (2021).</li>
<li>Zacharias, W. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regeneration+of+the+lung+alveolus+by+an+evolutionarily+conserved+epithelial+progenitor%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Regeneration of the lung alveolus by an evolutionarily conserved epithelial progenitor.</a> Nature. 555 (7695), 251-255 (2018).</li>
<li>Gonzalez, R. F., Allen, L., Gonzales, L., Ballard, P. L., Dobbs, L. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((HTII-280%2C+a+biomarker+specific+to+the+apical+plasma+membrane+of+human+lung+alveolar+type+II+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Histochemistry+%26+Cytochemistry%22%5BJournal%5D)">HTII-280, a biomarker specific to the apical plasma membrane of human lung alveolar type II cells.</a> Journal of Histochemistry & Cytochemistry. 58 (10), 891-901 (2010).</li>
</ol>

Autorzy nie mają do ujawnienia żadnych konfliktów interesów.

W tym protokole przedstawiamy ulepszoną metodę generowania skrawków płuc opartą na wibratomie. W porównaniu z technikami przetwarzania opartymi na parafinie metoda ta jest bardziej opłacalna, efektywna czasowo i bardziej przyjazna dla środowiska22. Co więcej, metoda ta pomaga zachować integralność strukturalną wycinków tkanki płucnej i pozwala na zaawansowane obrazowanie immunofluorescencyjne bez konieczności pobierania antygenu. Jednak podczas naszych eksperymentów znaleźliśmy również pewne ograniczenia w tym przepływie pracy. Chore płuca mogą zakłócać proces cięcia z powodu zniszczenia tkanek spowodowanego zmianami patologicznymi. Podczas używania wibratomu do cięcia, niedrożność dróg oddechowych i ciężka zwłóknieniowa tkanka płucna mogą utrudniać działanie ostrza, co utrudnia proces krojenia tych tkanek. Można to jednak przezwyciężyć, zmniejszając prędkość ostrza i podpierając tkankę drobnym pędzlem. Podobne wyzwania wynikają z pogrubienia opłucnej, które jest częstym skutkiem zapalenia opłucnej, przewlekłej obturacyjnej choroby płuc (POChP) i idiopatycznego włóknienia płuc (IPF)23,24,25. Jeśli opłucna nie jest przedmiotem eksperymentu, zalecamy jej usunięcie przed sekcją lub przez odizolowanie objętości płuc od opłucnej. Jeśli opłucna jest konieczna, można ją pokroić za pomocą podobnej manipulacji jak powyżej, obejmującej wolniejsze prędkości ostrza i podparcie krojenia za pomocą cienkiej szczotki.
Podczas gdy precyzyjnie wycięte plastry płuc mogą zachować trójwymiarową architekturę i natywne środowisko płuc26, ważne jest, aby pamiętać, że generowanie PCLS jest złożonym i czasochłonnym procesem. Powodzenie generowania wycinków tkanki płucnej w dużej mierze zależy od skuteczności wypełnienia agarozą, na którą z kolei wpływa obecność nienaruszonej opłucnej i żywotnych miejsc iniekcji w uzyskanej tkance. Jest to łatwe do osiągnięcia u gryzoni, ponieważ agaroza może być łatwo wprowadzana przez tchawicę do nienaruszonych płuc 27,28,29. Jednak w badaniach na dużych zwierzętach biopsje pobierane w ramach eksperymentu są zazwyczaj z dystalnych segmentów płuc, które nie mają wystarczająco dużych dróg oddechowych, aby kaniulować30,31. Tak więc, zamiast wstrzykiwać agarozę do oskrzeli lub naczyń krwionośnych, stosujemy tę metodę, w której tkanka płucna, niezależnie od gatunku pochodzenia lub objętości próbki, jest osadzana w agarozie o niskiej temperaturze topnienia w celu wytworzenia wycinków tkanki płucnej. Takie podejście jest technicznie łatwiejsze i ma na celu zminimalizowanie uszkodzeń tkanek w jak największym stopniu. Opierając się na naszym doświadczeniu, metoda ta wykazała wyższą skuteczność i łatwość w generowaniu skrawków tkanki płucnej. Skutecznie zachowuje morfologię pęcherzyków płucnych i jest szczególnie odpowiedni do cięcia tkanki płucnej, umożliwiając generowanie powtarzalnego obrazowania fluorescencyjnego multipleksowego o wysokiej rozdzielczości.
W tym badaniu demonstrujemy ponadto dwie kwantyfikacje oparte na próbie dla wygenerowanych danych obrazowych. W pierwszym z nich wykorzystano śledzenie obrazu w celu oceny różnic w wielkości pęcherzyków płucnych w próbkach gatunków. Nic dziwnego, że pęcherzyki płucne myszy były najmniejsze, podczas gdy pęcherzyki płucne świń i ludzi były podobnej wielkości, co podkreśla, że świnie są interesującym modelem translacyjnym do badań nad płucami.
W drugiej kwantyfikacji porównaliśmy rozkład HTII między próbką płuc osoby dorosłej i niemowlęcia. Pneumocyty typu 2 odgrywają istotną rolę w budowie dystalnego nabłonka płuc. Ta unikalna zdolność TII przyczynia się do naprawy i regeneracji nabłonka wyrostka zębodołowego32. W płucach zdrowego dorosłego człowieka TII stanowią około 15% całej populacji komórek, podczas gdy ich pokrycie powierzchni pęcherzyków płucnych szacuje się na około 5%33. HTII-280 jest powszechnie uznanym markerem specyficznym dla płuc do badania rozwoju i odpowiedzi komórek nabłonka pęcherzyków płucnych na uraz i jest specyficznie zlokalizowany na wierzchołkowych błonach plazmatycznych TII. W eksperymencie dorosłą tkankę uzyskano od pacjenta dawcy, który zmarł z powodu krwotoku śródmózgowego i miał współistniejące uszkodzenie płuc, podczas gdy próbka niemowlęcia pochodziła ze śmiertelności związanej z uduszeniem. Nasze odkrycia wskazują, że ekspresja HTII-280 była znacznie niższa w próbce płuc osoby dorosłej niż w próbce niemowlęcej. Co ciekawe, podczas gdy HTII-280 ulega ekspresji w większości HTII, na jego ekspresję może mieć również wpływ jakość tkanek i jest ona znacznie zmniejszona w uszkodzonej tkance płucnej człowieka34. Starzejące się tkanki płuc wykazują znaczny spadek liczby i aktywności wydzielniczej TII w porównaniu z młodymi tkankami, a osoby starsze wykazują znacznie niższą proliferację, wydzielanie i aktywność antyapoptotyczną TII w porównaniu z tymi młodymi tkankami35. W związku z tym, identyfikacja i wykrycie białka na powierzchni komórki specyficznego dla ludzkich TII może pomóc w ocenie ciężkości uszkodzenia płuc i ocenie podejść terapeutycznych mających na celu poprawę naprawy płuc36,37. W związku z tym, korzystając z tego potoku, bardzo interesujące byłoby przeprowadzenie badań TII pęcherzyków płucnych w większych kohortach ludzi o zdrowiu i chorobie.
Podsumowując, protokół ten przedstawia szybsze i łatwiejsze podejście do cięcia tkanki płucnej. Metoda ta zawiera szczegółowe instrukcje dotyczące przygotowania, cięcia i barwienia tkanki płucnej, zapewniając zachowanie nienaruszonej struktury tkanki płucnej. Optymalizuje model do badania zarówno zdrowej, jak i chorej architektury płuc, co prowadzi do poprawy wydajności eksperymentalnej. Ogólnie rzecz biorąc, badanie to wprowadza obiecujące podejście do badania złożonej biologii przestrzennej w patofizjologii tkanki płucnej u różnych gatunków, co może pomóc w lepszym zrozumieniu mechanizmów molekularnych odgrywających rolę w chorobach i naprawach.

Plastry tkanki płucnej ex vivo są szeroko stosowane w badaniach nad chorobami płuc1. Obecne złote standardy, szczególnie w klinicznych i translacyjnych badaniach na dużych zwierzętach, wykorzystują barwienie hematoksyliną i eozyną w połączeniu z mikroskopią jasnego pola i oceną opartą na obserwatorach do oceny i oceny dysfunkcji płuc2,3. Chociaż nadal jest to cenna technika, wykazuje ograniczenia pod względem rozdzielczości przestrzennej i liczby znaczników, które można obrazować jednocześnie. Co więcej, tkanka płucna musi zostać poddana intensywnemu płukaniu na bazie rozpuszczalnika, co powoduje odwodnienie, skurczenie i ponowne uwodnienie tkanki przed jej ostatecznym obrazowaniem 4. Proces ten jest nie tylko czasochłonny, ale także nieprzyjazny dla środowiska, maskuje epitopy białek i może wywoływać zmiany strukturalne w tkance5,6,7,8. Jednak w przypadku tkanki płucnej zatapianie w parafinie przed sekcją było konieczne ze względu na kruchość strukturalną płuc. W przeciwieństwie do tego, narządy stałe, takie jak mózg, mogą być cięte za pomocą wibrującego mikrotomu (wibratomu), zarówno w tkankach stałych, jak i świeżych9,10,11,12.
Aby umożliwić sekcję wibratomu w tkance płucnej, ustanowiono metodę określaną jako precyzyjnie wycinane plastry płuc (PCLS), gdzie agaroza o niskiej temperaturze topnienia jest wstrzykiwana do świeżej tkanki płucnej przez drogi oddechowe lub naczynia krwionośne i pozostawiana do zestalenia13,14. Agaroza w drogach oddechowych zapewnia wystarczające wsparcie strukturalne, aby umożliwić sekcję wibratomową9,14. U gryzoni jest to łatwe do osiągnięcia, ponieważ agaroza może być wstrzykiwana przez tchawicę; Jednak w tkankach świńskich i ludzkich znalezienie odpowiedniej drogi oddechowej/naczynia w obrębie danej biopsji może być trudne15,16. Co więcej, nawet jeśli taka droga oddechowa/naczynie jest zlokalizowane, zwykle potrzebna jest znaczna siła do wstrzyknięcia agarozy, co może wpływać na późniejszą morfologię płuc17.
Aby sprostać wyzwaniom związanym z zatapianiem/sekcją/barwieniem parafiny oraz przepływem pracy PCLS, stworzyliśmy nowy potok przetwarzania dla utrwalonej tkanki płucnej. Ten przepływ pracy pozwala na użycie wibratomu do cięcia, może wytwarzać cieńsze plastry niż w PCLS i daje warstwy, które nie wymagają pobierania antygenu do multipleksowego obrazowania fluorescencyjnego. Metoda ta oferuje sposób "najmniejszego przetwarzania" w celu wygenerowania wycinków płuc, które można wykorzystać w zaawansowanej mikroskopii świetlnej. Co więcej, odczyty obrazowe mogą być wykorzystane do zademonstrowania relacji przestrzennych komórek i struktur anatomicznych w tkance płucnej poprzez uchwycenie objętościowej architektury tkanki18,19,20,21. W tym artykule opisano protokół generowania tych skrawków płuc i zademonstrowano barwienia multipleksowe zastosowane do każdej z tych tkanek oraz sposób, w jaki te zaawansowane dane obrazowania można wykorzystać do kwantyfikacji.

<table><tbody><tr><td>24-dołkowe wkładki do hodowli tkankowych</td><td>SARSTEDT</td><td>83.3932.300</td><td></td></tr><tr><td>4% paraformaldehyd</td><td>SOLVECO</td><td>6095714</td><td></td></tr><tr><td>4', 6-diamidino-2-fenyloindol (DAPI)</td><td>Thermo Fisher scientific</td><td>D1306</td><td></td></tr><tr><td>50 mL probówka Falcon</td><td>&nbsp; SARSTEDT</td><td>2045221</td><td></td></tr><tr><td>Klaster różnicowania 31 (CD31)</td><td>Abcam</td><td>ab28364</td><td></td></tr><tr><td>Mikroskop konfokalny&nbsp;</td><td>Nikon</td><td>A1R HD25</td><td></td></tr><tr><td>Elastyna</td><td>Abcam</td><td>ab23747</td><td></td></tr><tr><td>Szkiełko nakrywkowe Epredia X1000 Thermo</td><td>Fisher scientific</td><td>10318963</td><td></td></tr><tr><td>Szkiełka adhezyjne Epredia SuperFrost Plus Thermo</td><td>Fisher scientific</td><td>10149870</td><td></td></tr><tr><td>Kleszcze</td><td>AESCULAP</td><td>FB395R</td><td></td></tr><tr><td>Koza przeciw myszom 647&nbsp;</td><td>Invitrogen&nbsp;</td><td>A21235</td><td></td></tr><tr><td>Koza anty-królik 568</td><td>Invitrogen&nbsp;</td><td>A11011</td><td></td></tr><tr><td>Komórki ludzkie typu II</td><td>Terrace Biotech</td><td>TB-27AHT2-280&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>Invitrogen Fluoromount-G Medium montażowe</td><td>Thermo Fisher scientific</td><td>E41473</td><td></td></tr><tr><td>Niska temperatura żelowania Agaroza</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>1003467046</td><td></td></tr><tr><td>Lycopersicon Esculentum lektyna</td><td>Thermo Fisher scientific</td><td>2531965</td><td></td></tr><tr><td>Sól fizjologiczna buforowana fosforanami (PBS)</td><td>Thermo Fisher scientific</td><td>50-100-8798</td><td></td></tr><tr><td>Kubek plastikowy</td><td>kontorsgiganten</td><td>885221</td><td></td></tr><tr><td>Nożyczki</td><td>STILLE</td><td>101-8380-18</td><td></td></tr><tr><td>Aktyna mięśni gładkich</td><td>Abcam</td><td>ab5694</td><td></td></tr><tr><td>Azydek sodu</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>K54329188239</td><td></td></tr><tr><td>Super klej</td><td>LOCTITE</td><td>2721643</td><td></td></tr><tr><td>Wibracyjny mikrotom</td><td>Leica</td><td>VT1200S</td><td></td></tr></tbody></table>

zautomatyzowane cięcie wibratomiczne tkanki płucnej zatopionej w agarozie do multipleksowego obrazowania fluorescencyjnego

Automated Vibratome Sectioning of Agarose-Embedded Lung Tissue for Multiplex Fluorescence Imaging

Ze względu na swoją wrodzoną kruchość strukturalną, płuco jest uważane za jedną z trudniejszych tkanek do przetworzenia pod mikroskop. Aby dodać wsparcie strukturalne do cięcia, kawałki tkanki płucnej są zwykle zanurzane w parafinie lub związku OCT i cięte odpowiednio za pomocą mikrotomu lub kriostatu. Nowsza technika, znana jako precyzyjnie cięte plastry płuc, dodaje strukturalne wsparcie świeżej tkance płucnej poprzez infiltrację agarozy i zapewnia platformę do utrzymania pierwotnej tkanki płucnej w hodowli. Jednak ze względu na maskowanie epitopów i zniekształcenia tkanek, żadna z tych technik nie nadaje się odpowiednio do opracowania powtarzalnych zaawansowanych odczytów obrazowania świetlnego, które byłyby kompatybilne dla wielu przeciwciał i gatunków. 
W tym celu opracowaliśmy proces przetwarzania tkanek, który wykorzystuje osadzanie agarozy w stałej tkance płucnej, w połączeniu z automatycznym cięciem wibratomem. Ułatwiło to generowanie skrawków płuc o grubości od 200 μm do 70 μm w płucach myszy, świń i ludzi, które nie wymagają pobierania antygenu i stanowią najmniej "przetworzoną" wersję natywnej izolowanej tkanki. Korzystając z tych wycinków, ujawniamy odczyt obrazowania multipleksowego, który jest w stanie generować obrazy o wysokiej rozdzielczości, których przestrzenną ekspresję białek można wykorzystać do ilościowego określenia i lepszego zrozumienia mechanizmów leżących u podstaw uszkodzenia i regeneracji płuc.

Proces przygotowywania skrawków tkanki płuc obejmuje kilka kluczowych etapów, w tym przygotowanie, zatopienie w medium i sekcjonowanie. Roztwór agarozy (3% (w/v)) przygotowuje się poprzez rozpuszczenie 1,5 g agarozy niskotopliwej w 50 mL sterylnego PBS. Niezbędne materiały eksploatacyjne to plastikowy kubek, nakrętka od probówki stożkowej 50 mL (z usuniętym rantem), pinceta i nożyczki. Tkanka płucna jest ostrożnie wycinana w mniejsze bloki za pomocą precyzyjnej pincety i sterylnych nożyczek (Rycina 1A,B). Następnie, aby zatopić bloki tkanki płucnej, dno kubka wypełnia się niewielką ilością agarozy, na powierzchni agarozy kładzie się nakrętkę, a kubek przechowuje w temperaturze 4 °C przez 5 min (Rycina 1C). Na nakrętkę dodaje się około 1 mL płynnej agarozy, a następnie na nakrętce umieszcza się blok tkanki płucnej. Agarozę pozostawia się na 2-3 min w temperaturze pokojowej do częściowego zestalenia (Rycina 1D). Gdy blok płuca zostanie unieruchomiony przez częściowo zestaloną agarozę, do kubka wlewa się płynną agarozę, aż blok tkanki płucnej zostanie całkowicie zanurzony. całość przechowuje się w temperaturze 4 °C przez 15 min (Rycina 1E,F). Zatopienie w agarozie niskotopliwej zapewnia tkance płucnej niezbędne wsparcie i sztywność, co pomaga zachować jej pierwotną architekturę podczas procesu krojenia. Do usunięcia nadmiaru agarozy otaczającej tkankę płucną używa się ostrego ostrza. Wokół tkanki pozostawia się jednolitą warstwę o grubości około 5 mm (Rycina 1G). Wycięty blok tkanki płucnej jest następnie ostrożnie przyklejany do uchwytu na tkankę (Rycina 1H). Tackę z buforem w wibratomie wypełnia się PBS, w otaczającej kąpieli lodowej umieszcza się lód, a w tackach z buforem instaluje się dysk z preparatem (Rycina 1I). Parametry cięcia ustawione na panelu wibratomu wynosiły: grubość skrawka: 200 µm; częstotliwość: 100 Hz; amplituda ostrza: 1,3 mm; prędkość posuwu ostrza: 0,02-0,03 mm/s, zależnie od sztywności tkanki (Rycina 1J). Na koniec przeprowadza się barwienie wolno pływających skrawków (Rycina 1K-M). 
Barwienie immunofluorescencyjne przeprowadzono w 200 µm przekroje z każdego gatunku w celu wykazania aktyny mięśni gładkich (SMA, marker komórek mięśni gładkich i myofibroblastów), elastyny (białka macierzy zewnątrzkomórkowej) oraz lektyny z *Lycopersicon Esculentum* (LEA), która wiąże się z komórkami nabłonka oskrzelowo-pęcherzykowego. Płuco jest tkanką strukturalnie heterogenną, w związku z czym w strukturach takich jak przewody pęcherzykowe, naczynia krwionośne, oskrzeliki wewnątrzprzepłucne i pęcherzyki płucne u myszy, świń i ludzi obserwuje się zróżnicowany rozkład SMA i elastyny (Rysunek 2A-L). Renderowanie w wysokiej rozdzielczości 20 µm objętość oskrzeliki pokazuje, w jaki sposób można badać drobne struktury w płucach na poziomie półtrójwymiarowym (Film uzupełniający S1). Jako przykład ilościowy, wykorzystując obrysowywanie obrazów, pokazujemy, jak różni się wielkość pęcherzyków płucnych między próbkami (n = 20 pęcherzyków) (Rysunek 2L,M).
Aby wykazać, w jaki sposób można ilościowo wykorzystać te zaawansowane dane obrazowe, porównaliśmy rozkład pneumocytów typu II (TII) w tkance płuca człowieka dorosłego oraz niemowlęcia. Przeciwciało specyficzne dla ludzkich pęcherzykowych komórek typu 2, HTII-280, wykazuje silne powinowactwo do powierzchni ludzkich komórek typu 2 (Rycyna 3A-F). Komórki te można dodatkowo obserwować w przestrzeni trójwymiarowej pojedynczego pęcherzyka powietrznego, wykorzystując obrazowanie wolumetryczne (Film uzupełniający S2). Aby określić ilościowo liczbę komórek TII w próbkach od dorosłego i niemowlęcia, przeanalizowaliśmy liczbę komórek HTII-280 w 10 losowych polach widzenia (fov). W porównaniu tych próbek, w próbce od niemowlęcia odnotowano znacznie większą liczbę komórek TII (Rycina 3G). Jednak próbka od niemowlęcia wykazała również znacznie większy stopień pokrycia rusztowania niż próbka od osoby dorosłej, co mogłoby wyjaśniać wyższą liczbę komórek (Rycina 3H). Aby to uwzględnić, oceniliśmy liczbę komórek TII w oparciu o pokrycie rusztowania, jako liczbę komórek na mm2 tkanki, co nadal wykazało istotnie większą liczbę komórek TII w próbce od niemowlęcia (Rycina 3I). Zatem większa liczba komórek TII w próbce od niemowlęcia nie wynika ze zwiększonego pokrycia rusztowania, co podkreśla znaczenie oceny rozkładu komórek w płucach w oparciu o powierzchnię rusztowania, a nie o całkowite pole widzenia (fov).
<img alt="Schemat zatapiania i cięcia tkanek; przygotowanie agarozy, sprzęt do mikrotomii, przygotowanie skrawków." class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/65943/65943fig01.jpg" data-altupdatedat="1788304762000" data-alt="Rycina 1"> 
Rycina 1: Protokół wycinania skrawków tkanki płucnej. (A) Roztwory i materiały: 3% (w/v) roztwór agarozy otrzymany przez rozpuszczenie 1,5 g agarozy o niskiej temperaturze topnienia w 50 mL sterylnego roztworu soli fizjologicznej z buforem fosforanowym; plastikowy kubek; zakrętka od probówki stożkowej 50 mL; pęseta i nożyczki. (B) Tkanka płucna została wypreparowana przy użyciu precyzyjnej pęsety i sterylnych nożyczek. (C) Wypełnij dno kubka niewielką ilością agarozy i umieść zakrętkę na powierzchni agarozy, następnie przechowuj w temperaturze 4 °C przez 5 min. (D) Powoli dodaj 1-2 mL ciekłej agarozy do zakrętki, ostrożnie połóż fragment tkanki płucnej na zakrętce i przechowuj w temperaturze 4 °C przez 2 min. (E,F) Wlej ciekłą agarozę do kubka, aż fragment tkanki płucnej zostanie całkowicie zanurzony, przechowuj w temperaturze 4 °C przez 15 min, a następnie delikatnie rozbij plastikowy kubek. (G) Użyj ostrego ostrza, aby usunąć nadmiar agarozy otaczającej tkankę płucną, pozostawiając jednolitą warstwę o grubości około 5 mm wokół tkanki. (H) Wycięty blok tkanki płucnej zostaje następnie ostrożnie przyklejony do uchwytu tkanek. (I) Wypełnij tackę buforową wibratomu PBS, umieść lód w otaczającej kąpieli lodowej i zamontuj dysk z próbką w tacce buforowej. (J) Ustaw parametry cięcia na panelu wibratomu; grubość skrawka: 200 μm, częstotliwość: 100 Hz, amplituda noża: 1,3 mm oraz prędkość posuwu ostrza 0,02-0,04 mm/s. (K-M) Reprezentatywne obrazy wolno pływającego skrawka wciąż zatopionego w agarozie i gotowego do barwienia immunofluorescencyjnego. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/65943/65943fig01large.jpg" target="_blank">Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.</a>
<img alt="Mikroskopia tkanki płucnej: mysz, świnia, człowiek. Porównanie przewodu pęcherzykowego, naczynia, oskrzelika; analiza wielkości." class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/65943/65943fig02.jpg" data-altupdatedat="1788304762000" data-alt="Rysunek 2"> 
Rysunek 2: Obrazy immunofluorescencyjne struktury płuc u człowieka, świni i myszy. (A-L) Reprezentatywne obrazy przewodu pęcherzykowego, naczynia krwionośnego, oskrzelika i pęcherzyków płucnych w przekrojach tkanki płucnej odpowiednio myszy, świni i człowieka. SMA (zaznaczona na zielono) jest markerem komórek mięśni gładkich i występuje w ścianach naczyń oraz oskrzelików tkanki płucnej. Elastyna (zaznaczona na czerwono) stanowi element macierzy pozakomórkowej płuc. (M) Ilościowa ocena wielkości pęcherzyków płucnych poprzez wybór 20 losowych pozycji na każdym przekroju tkanki płucnej dla próbek pochodzących od człowieka, świni i myszy. Do przedstawienia rozkładu wielkości pęcherzyków w każdej grupie wykorzystano histogramy. Paski skali = 50 µm (A-F, H-L), 100 µm (G). Test Kruskalla-Wallisa. *p < 0.05, **p < 0.01, ***p < 0.001, ****p < 0.0001. Skróty: DAPI = 4′,6-diamidino-2-phenylindole; LEA = lektyna Lycopersicon Esculentum; SMA = aktyna mięśni gładkich; ms = mysz; hmn = człowiek. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/65943/65943fig02large.jpg" target="_blank">Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.</a>
<img alt="Analiza tkanki płucnej; mikroskopia immunofluorescencyjna wykazująca markery HT2-280; statystyczne porównanie wykresów osób dorosłych i niemowląt." class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/65943/65943fig03.jpg" data-altupdatedat="1788304762000" data-alt="Rysunek 3"> 
Rycina 3. Rozmieszczenie pneumocytów typu II w próbkach pobranych od dorosłych ludzi i niemowląt. (A,B) Reprezentatywne obrazy tkanki płuca dorosłego człowieka i niemowlęcia z barwieniem na HTII-280 (kolor czerwony), CD31 (kolor zielony) oraz LEA (kolor szary). (C,D) Reprezentatywne obrazy dorosłego i niemowlęcia, przedstawiające wyłącznie rozkład pneumocytów typu II. (E,F) Reprezentatywne obrazy w rozdzielczości pojedynczych komórek pojedynczego pneumocytu typu 2 z próbek płuc dorosłego i niemowlęcia. (G) Ilościowe oznaczenie liczby pneumocytów typu II w próbkach pobranych od osób dorosłych i niemowląt. (H) Ilościowe oznaczenie stopnia pokrycia powierzchni rusztowania tkanki płucnej (% względem powietrza) w próbkach dorosłych i niemowląt. (I) Ilościowe oznaczenie pneumocytów typu II na mm2 tkanki w próbkach dorosłych i niemowląt. Paski skali = 5 µm (E,F), 100 µm (A-D). n = 10 pól widzenia (fov) na próbkę. Próba niezależna t-test lub test Manna-Whitneya. *p &lt; 0,05, **p &lt; 0,01, ***p &lt; 0,001, ****p &lt; 0.0001. Skróty: DAPI = 4', 6-diamidino-2-fenyloindol; LEA = lektyna Lycopersicon Esculentum; HTII = ludzkie komórki typu II; CD31 = cząsteczka adhezyjna komórek śródbłonka płytek krwi-1/klaster różnicowania 31; fov = pole widzenia. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/65943/65943fig03large.jpg" target="_blank">Prosimy kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ilustracji.</a>
Wideo uzupełniające S1: Film przedstawiający objętość obrazowania 20 µm pojedynczej drogi oddechowej świni zabarwionej przy użyciu DAPI, LEA, SMA i elastyny, ukazujący wysokorozdzielczy widok struktury elementów ściany dróg oddechowych. Skróty: DAPI = 4′,6-diamidino-2-phenylindole; LEA = lektyna z Lycopersicon Esculentum; SMA = aktyna mięśni gładkich. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/65943/Sup_vid1.mp4" target="_blank">Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.</a>
Wideo uzupełniające S2: Film przedstawiający objętość obrazowania 30 µm pojedynczego pęcherzyka płucnego barwionego za pomocą DAPI, LEA i HTII-280, ukazujący rozkład pneumocytów typu 2 w obrębie struktury. Skróty: DAPI = 4′,6-diamidino-2-phenylindole; LEA = lektyna Lycopersicon Esculentum; SMA = aktyna mięśni gładkich. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/65943/Sup_vid2.mp4" target="_blank">Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.</a>

Opracowaliśmy technikę przetwarzania tkanek wykorzystującą wibratomę i tkankę płucną zatopioną agarozą do generowania skrawków płuc, co pozwala na uzyskanie obrazów architektury płuc w wysokiej rozdzielczości. Zastosowaliśmy barwienie immunofluorescencyjne, aby obserwować przestrzenną ekspresję białek przy użyciu specyficznych markerów strukturalnych płuc.

Zautomatyzowane cięcie wibratomiczne tkanki płucnej zatopionej w agarozie do multipleksowego obrazowania fluorescencyjnego

Due to its inherent structural fragility, the lung is regarded as one of the more difficult tissues to process for microscopic readouts. To add structural ...

Protokół ten jest szczególnie przydatny w dużych modelach zwierzęcych przeszczepu i regeneracji płuc, takich jak świnie, gdzie z czasem możemy pobierać próbki małych fragmentów. Technika ta może pomóc nam lepiej zrozumieć biologię przestrzenną występującą w tych modelach. Technika ta pozwala na uzyskanie minimalnie przetworzonych wycinków płuc nadających się do obrazowania immunofluorescencyjnego bez konieczności pobierania antygenu i okazała się skuteczna w przypadku wszystkich testowanych do tej pory przeciwciał.Procedura ta może być dostosowana do cięcia nieco grubszych odcinków, powiedzmy około jednego milimetra, które można następnie wykorzystać w mikroskopii fluorescencyjnej na arkuszach świetlnych w celu zbadania przestrzennej ekspresji białek w bardziej trójwymiarowej objętości. Nasze badania koncentrują się na czynnikach wpływających na odrzucenie przeszczepu płuc i opracowujemy terapie mające na celu zmniejszenie odrzucenia przeszczepu przy użyciu naszego modelu świni. Technika ta pomaga zrozumieć przestrzenne zmiany białek wpływające na wyniki przeszczepu po operacji.Obecnie używamy tej techniki do zbadania przestrzennego krajobrazu ekspresji białek w naszym modelu przeszczepu płuc świni. Mamy nadzieję, że pomoże nam to lepiej zrozumieć mechanizmy stojące za naszymi eksperymentalnymi terapiami. Kluczem do sukcesu jest obserwacja wibratomów, wysokie amplitudy ostrzy i niższe prędkości siły to kluczowe rzeczy, na które należy zwrócić uwagę, jeśli cięcie pójdzie źle.Na początek utrwal tkankę płucną świni w 4% paraformaldehydzie w temperaturze pokojowej przez 48 godzin. Następnie przenieś tkankę płucną do stożkowej rurki o pojemności 50 mililitrów zawierającej 30 mililitrów PBS z 0,01% azydkiem sodu. Miej w pogotowiu plastikowy kubek, cienkie kleszczyki i sterylne nożyczki.Podgrzej agarozę w kuchence mikrofalowej, aż osiągnie temperaturę wrzenia. Następnie schłodzić go do 42 stopni Celsjusza w łaźni wodnej. Przechowuj go w łaźni wodnej do momentu, gdy będzie gotowy do użycia.Usunąć biopsję płuc z roztworu azydku PBS. Użyj cienkich kleszczy i sterylnych nożyczek, aby ostrożnie rozciąć płaty płuc na mniejsze bloki. Następnie odetnij środek plastikowego kubka.Wlej niewielką ilość agarozy na dno filiżanki. Umieść pokrywkę stożkowej rurki o pojemności 50 mililitrów ze zdjętą krawędzią na powierzchni agarozy. Przechowuj ten zestaw w temperaturze czterech stopni Celsjusza przez pięć minut, aby agaroza zestaliła się.Gdy agaroza zastygnie, wyjmij plastikowy kubek z lodówki. Teraz wlej około jednego mililitra płynnej agarozy na pokrywkę. Następnie delikatnie umieść blok tkanki płucnej na pokrywie.Gdy agaroza częściowo zastygnie, powoli zanurz tkankę płucną w płynnej agarozie. Wstaw do lodówki w temperaturze czterech stopni Celsjusza przez około 15 minut, aż agaroza stanie się twarda. Użyj ostrego ostrza, aby ostrożnie usunąć nadmiar agarozy otaczającej tkankę płucną.Na początek osadź tkankę płucną w agarozie. Aby przygotować tkankę płucną do cięcia, najpierw przymocuj każdy blok tkanki do krążka próbki wibratomu za pomocą super kleju i dodaj lód do otaczającej kąpieli. Następnie ostrożnie włóż krążek z próbką do tacki buforowej i napełnij tacę PBS.Następnie ustaw parametry wibratomu, utrzymując grubość na poziomie 200 mikrometrów, częstotliwość na 100 herców, amplitudę ostrza na 1,3 milimetra, a prędkość naprzód ostrza między 0,02 a 0,03 milimetra na sekundę. Rozpocznij cięcie tkanki płucnej. Po utworzeniu wystarczającej liczby plasterków użyj pędzla, aby delikatnie podnieść plasterek chusteczki z tacki na wibratomy.Przenieś plastry na 24-dołkową płytkę z roztworem azydku PBS. Zachowaj plastry płuc w temperaturze czterech stopni Celsjusza. Zacznij od osadzenia tkanki płucnej i agarozy i podzielenia ich na sekcje za pomocą wibratomu.Do pokrojonych tkanek dodaj 300 mikrolitrów środka blokującego. Inkubować płytkę w temperaturze czterech stopni Celsjusza na wytrząsarce, delikatnie mieszając przez 45 minut. Następnie odpipetować 300 mikrolitrów rozcieńczonego PBS przeciwciała pierwszorzędowego do każdej studzienki.Inkubuj płytkę przez noc w temperaturze czterech stopni Celsjusza, delikatnie wstrząsając. Teraz delikatnie odpipetuj przeciwciała pierwszorzędowe, nie dotykając plasterka. Umyj plastry trzy razy 400 mikrolitrami PBS.Następnie odpipetować 300 mikrolitrów rozcieńczonych przeciwciał drugorzędowych do każdej studzienki. Usunąć roztwór przeciwciał po inkubacji w zimnie przez 90 minut. Następnie dodaj DAPI i lektynę pomidorową-488 do studzienek.Inkubować mieszaninę przez 30 minut. Po usunięciu DAPI i lektyny pomidorowej myj plastry w PBS przez trzy cykle po 10 minut. Za pomocą pędzla przenieś plasterki na szkiełko.Umieść trzy krople podłoża montażowego na szkiełku podstawowym i zamontuj na nim szkiełko nakrywkowe przed obrazowaniem. Wycinki płuc próbek pobranych od myszy, świń i ludzi wybarwiono immunofluorescencyjnie na obecność SMA, elastyny i LEA. Zaobserwowano, że SMA i elastyna są rozprowadzane w strukturach, takich jak przewody pęcherzykowe zębodołowe, naczynia krwionośne, oskrzela i pęcherzyki płucne.Porównano dystrybucję pneumocytów typu drugiego u dorosłych i niemowląt. Przeciwciało HT2-280 przeciwko komórkom pęcherzykowym typu drugiego miało silne powinowactwo do powierzchni komórek pneumocytu. Próbka dla niemowląt wykazała znacznie wyższą liczbę pneumocytów typu drugiego.Jednak próbka niemowlęca wykazywała również znacznie wyższe pokrycie rusztowania niż osoba dorosła. Liczba pneumocytów typu drugiego w oparciu o pokrycie rusztowaniem była również znacznie wyższa u niemowląt.

automated-vibratome-sectioning-agarose-embedded-lung-tissue-for

Research

JoVE Journal

Medicine

Medycyna

Sztywność macierzy zewnątrzkomórkowej silnie wpływa na wiele zachowań komórek adherentnych. Sztywność macierzy zmienia się przestrzennie w obrębie tkanki i ulega modyfikacjom w różnych stanach chorobowych. W niniejszej pracy opracowujemy metody charakteryzacji zmienności przestrzennej sztywności w normalnej i zwłókniałej tkance płuc myszy z wykorzystaniem mikroindentacji za pomocą mikroskopii sił atomowych.

Mikromechaniczna charakterystyka tkanki płucnej z wykorzystaniem skaningowej mikroskopii siłowej

Nowy protokół opisany w niniejszym badaniu umożliwia selekcyjne wykrywanie przerzutów do płuc z rozdzielczością pojedynczych komórek u myszy poprzez połączenie perfuzji i fiksacji płuc in-situ oraz barwienia X-Gal komórek nowotworowych znakowanych genem lacZ.

Ulepszona wizualizacja przerzutów do płuc w rozdzielczości pojedynczych komórek u myszy poprzez połączoną perfuzję in-situ tkanki płucnej i barwienie X-Gal komórek nowotworowych znakowanych lacZ

Ten film opisuje metodę przygotowania płuc do obrazowania na żywo ex vivo w celu zbadania interakcji między komórkami rakowymi a komórkami zrębu, przy użyciu agarozy do inflacji. W protokole próbki opisano procedurę inflacji agarozy przed obserwacją żywych interakcji komórkowych.

Napompowanie agarozy w całym płucu: metoda przygotowania płuc do obrazowania na żywo ex vivo

Opisujemy metodę generowania precyzyjnie wycinanych plastrów płuc (PCLS) i ich barwienia immunologicznego, aby zobrazować lokalizację różnych typów komórek odpornościowych w płucach. Nasz protokół można rozszerzyć w celu wizualizacji lokalizacji i funkcji wielu różnych typów komórek w różnych warunkach.

Precyzyjnie wycięte plastry płuc myszy do wizualizacji żywych komórek dendrytycznych płuc

Ten protokół opisuje metodę obrazowania rezydentnych komórek T CD8 infiltrujących nowotwór, oznaczonych fluorescencyjnie sprzężonymi przeciwciałami w wycinkach ludzkiego guza płuc. Technika ta umożliwia analizę migracji limfocytów T CD8 w czasie rzeczywistym przy użyciu mikroskopii konfokalnej.

Ex vivo Obrazowanie rezydentnych limfocytów T CD8 w wycinkach ludzkiego guza płuc za pomocą mikroskopii konfokalnej

Szczegółowy protokół dla sześciomarkerowego multipleksowego panelu immunofluorescencyjnego jest zoptymalizowany i wykonany, przy użyciu automatycznego barwnika dla bardziej spójnych wyników i krótszego czasu zabiegu. Podejście to może być bezpośrednio zaadaptowane przez dowolne laboratorium do badań immunoonkologicznych.

Zautomatyzowany multipleksowy panel immunofluorescencyjny do badań immunoonkologicznych na próbkach tkanek raka utrwalonego formaliną

Wprowadzony tutaj protokół pozwala na scharakteryzowanie zdolności naprowadzania płuc pierwotnych ludzkich limfocytów w warunkach zapalnych in vivo. Naciek płucny adoptywnie przeniesionych ludzkich komórek odpornościowych w mysim modelu alergicznego zapalenia można zobrazować i określić ilościowo za pomocą mikroskopii fluorescencyjnej arkusza świetlnego chemicznie oczyszczonej tkanki płucnej.

Zaawansowane obrazowanie ludzkich limfocytów naprowadzających płuca w eksperymentalnym modelu zapalenia alergicznego in vivo opartym na mikroskopii arkuszowej światła

Opisujemy metodę szybkiego barwienia do wykonywania obrazowania wielospektralnego na zamrożonych tkankach.

Szybka metoda wielospektralnego obrazowania fluorescencyjnego zamrożonych skrawków tkanek

Ten eksperymentalny protokół opisuje i optymalizuje metodę barwienia metodą immunohistochemii multipleksowej (IHC), głównie poprzez optymalizację warunków inkubacji przeciwciał jednokanałowych i dostosowanie ustawień przeciwciał i kanałów do rozwiązania problemów autofluorescencji i przesłuchu kanałowego w tkankach raka płuc pochodzenia klinicznego.

Multipleksowe barwienie immunohistochemiczne tkanki raka płuc zatopionej w parafinie

Tutaj opisujemy prosty i ekonomiczny protokół do przeprowadzenia bezstronnej kwantyfikacji gęstości mikrokrążenia płuc dla całej tkanki płucnej myszy za pomocą pojedynczego barwienia izolektyny B4.

Kwantyfikacja gęstości mikronaczyniowej płuc u myszy w poprzek zrazików

Prezentujemy metodę modelu patogenezy grzybów, która zachowuje naturalne położenie zarodników grzybów w drogach oddechowych płuc do analizy za pomocą mikroskopii fluorescencyjnej.

Skuteczna metoda obrazowania płuc myszy, która zachowuje dynamikę przestrzenną zarodników grzybów w drogach oddechowych

Poznaj zautomatyzowaną technikę cięcia wibratomicznego tkanki płucnej zatopionej w agarozie do multipleksowego obrazowania fluorescencyjnego. Ta metoda umożliwia badanie przestrzennej ekspresji białek w modelu transplantacji płuc u świń bez konieczności odzyskiwania antygenów.

Zautomatyzowane cięcie wibratomiczne tkanki płucnej zatopionej w agarozie do multipleksowego obrazowania fluorescencyjnego

Przeglądaj więcej filmów