Wykorzystanie testu rozszczepienia pod tarczami i znakowania (CUT&Tag) w badaniach mioblastów myszy

Badania naszej grupy koncentrują się na tym, w jaki sposób struktura genomu i transkrypcja w komórkach macierzystych dorosłych mięśni szkieletowych są regulowane i utrzymywane, szczególnie podczas zmian faz komórkowych, takich jak zaangażowanie komórek macierzystych, różnicowanie i starzenie się. Dorosłe komórki macierzyste mięśni szkieletowych, zawierające zaledwie 1% komórek jednojądrowych w tkance mięśniowej, stanowią wyzwanie dla badań cech chromatyny przy użyciu Hi-C, ChIP i ATAC-seq ze względu na ich niedobór w zawiesinach pojedynczych komórek uzyskanych z trawienia mięśni. Immunoprecypitacja chromatyny (ChIP) jest kluczowym narzędziem do profilowania cech genomu.

Prostsza, bardziej wydajna technika kontaktowa opracowana przez dr Stevena Henikoffa często przewyższa ChIP, zwłaszcza w badaniu epigenetyki w rzadkich populacjach komórek. Jego łatwość użycia zwiększa jego dostępność dla badaczy, w tym ekspertów niebędących ekspertami w dziedzinie epigenetyki. Na początek dodaj 30 mikrolitrów kulek Concanavalin A do 1,5 mililitrowej probówki wirówkowej.