Retrotransposons LTR

A maioria dos genomas eucarióticos contém um grupo único de elementos transponíveis chamado retrotransposões ou Transposões Classe I.diferentemente de transposões de apenas DNA ou transposões Classe II, os retrotransposões empregam um mecanismo de copiar e colar, o que significa que uma cópia do transposão 00:00:22.530 00:00:26.030 se move para o novo genoma. Há dois tipos de retrotransposões o de terminal de repetição longa, ou retrotransposões de LTR;e retrotransposões não-LTR, ambos 00:00:37.610-00:00:41.470 usam mecanismos diferentes de transposição. Os retrotransposões de LTR consistem em uma região, com 5 a 7kb de comprimento, de codificação de proteína ladeada em ambas as extremidades por repetições terminais longos, tipicamente com 250 a 600 pares base em comprimento.

Estes LTRs contêm o promotor e as sequências do promotor para a transcrição. A região codificadora é muito semelhante à do genoma do retroviral, que consiste em genes estreitamente relacionados com a gag e a pol de retrovírus. Então os retrotransposões de LTR são também Conhecidos como retrotransposões do retroviral.

No entanto, ao contrário dos retrovírus, os retrotransposões LTR não codificam O gene env e, portanto, não podem formar um envelope viral. Enquanto o gene pol codifica enzimas, tais como protéase, transcriptase reversa, integrasse, e RNase H, o gene gag codifica proteínas estruturais que 00:01:39.070 00:01:41.530 podem formar um vírus tipo partículas. O mecanismo de transposição dos elementos do LTR também se assemelha à replicação do retroviral nas células hospedeiras.

Primeiramente, a célula RNA do hospedeiro, polimerase II, liga-se ao LTR cinco prime e começa transcrevendo os retrotransposões em uma cadeia única de RNA. O RNA intermediário é então processado pelas enzimas da célula hospedeira para adicionar um tampão prime 5 e uma cauda poli-a de 3 prime. O RNA maduro é então transportado para o citoplasma e traduzido em proteínas.

O mRNA e os produtos da proteína então se montam para formar uma partícula tipo vírus. É dentro desta partícula tipo vírus que o RNA é reverso transcrito em uma única cadeia de DNA encalhado. Isto é seguido pela degradação da faixa de RNA pela RNase H e síntese de um DNA complementar, levando a um DNA bicatenário.

Este DNA bicatenário linear é ligado pela integrasse em ambos os fins para formar um complexo estável chamado um intasomo que pode ser transportado de volta ao núcleo 00:02:52.370 00:02:57.460 e inserido em um novo local no genoma do hospedeiro. Os retrotransposões de LTR podem fazer diversas cópias de si mesmos na mesma célula usando este mecanismo de replicação.