Proteínas de ligação ao DNA de cadeia simples

Uma vez que a helicase desenrola o DNA, as moléculas de DNA separadas e de fita simples resultantes podem formar alças fechadas por emparelhamento intra-fita ou DNA de fita dupla por emparelhamento entre fitas.

Essas fitas também são vulneráveis ao ataque de nucleases que podem digerir o DNA.

Para evitar isso, as proteínas de ligação ao DNA de fita simples, ou SSB, se ligam ao DNA de fita simples de maneira sequencial, onde o SSB de entrada se liga adjacente ao SSB existente.

Essa ligação cooperativa das proteínas SSB endireita e protege a fita de DNA original, evitando a formação das alças de grampo de cabelo ou o rebobinamento do DNA de volta à sua estrutura de fita dupla.

As proteínas SSB se ligam firmemente à estrutura de açúcar-fosfato do DNA e deixam as bases nitrogenadas disponíveis para a ligação de nucleotídeos complementares, permitindo a formação da fita filha.