Methods to Assess Microbial Communities

Uma comunidade microbiana é um consórcio de bactérias, arqueias e eucariotas microbianos que coexistem e interagem dentro de um habitat compartilhado.

A estrutura da comunidade microbiana é frequentemente descrita usando riqueza, abundância relativa e uniformidade.

Em uma amostra, riqueza é o número de táxons detectados, enquanto abundância relativa quantifica a proporção de cada táxon. Uniforme descreve como os indivíduos estão distribuídos uniformemente entre os táxons.

Atualmente, abordagens moleculares independentes da cultura são usadas para perfilar comunidades microbianas.

A metagenômica estuda DNA de amostras ambientais, como o solo, e é amplamente utilizada para perfilar a composição das comunidades microbianas.

A metatranscriptômica permite a avaliação da expressão de mRNA, fornecendo um retrato das funções microbianas ativas, como a produção de enzimas ou a degradação do óleo.

Metaproteômica e metabolômica identificam proteínas e metabólitos no ambiente, revelando como microrganismos contribuem para processos como a quebra de nutrientes e o ciclo biogeoquímico.