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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Neste artigo, apresentamos um método baseado em microfluídicos para o confinamento de partículas com base no fluxo hidrodinâmico. Demonstramos prendendo partículas estáveis em um ponto de estagnação de fluidos utilizando um mecanismo de controle feedback, permitindo assim confinamento e micromanipulação de partículas arbitrário em um microdispositivo integrado.
A capacidade de limitar e manipular partículas individuais em solução livre é uma tecnologia capacitadora essencial para a ciência fundamental e aplicada. Métodos para a captura de partículas baseado em técnicas ópticas, magnéticas eletrocinética, e acústico têm levado a grandes avanços na física e na biologia molecular que vão desde o de nível celular. Neste artigo, apresentamos uma técnica nova baseada microfluídicos para a captura e manipulação de partículas com base exclusivamente no fluxo de fluido hidrodinâmico. Usando este método, nós demonstramos aprisionamento de partículas micro e nano-escala em soluções aquosas para escalas de tempo. A armadilha hidrodinâmicas consiste de um dispositivo integrado microfluídicos com uma geometria do canal cruz-slot onde duas correntes opostas laminar convergir, gerando um fluxo extensional planar com um ponto de estagnação do fluido (velocidade zero pontos). Neste dispositivo, as partículas estão confinadas no centro armadilha por controle ativo do campo de fluxo para manter a posição da partícula no ponto de estagnação do fluido. Desta forma, as partículas são efetivamente presos em solução livre usando um algoritmo de controle de feedback implementado com um código LabVIEW custom-built. O algoritmo de controle consiste de aquisição de imagem para uma partícula no dispositivo micro, seguido pelo rastreamento de partículas, a determinação da posição da partícula centróide e ajuste ativo de fluxo de fluido através da regulação da pressão aplicada a uma válvula pneumática on-chip usando um regulador de pressão. Desta forma, o on-chip funções da válvula de medição dinâmica para regular as taxas de fluxo relativa nos canais de saída, permitindo fina escala de controle de posição estagnação ponto e captura de partículas. A armadilha hidrodinâmico microfluídicos baseados apresenta várias vantagens como um método para a captura de partículas. Trapping hidrodinâmica é possível para qualquer partícula arbitrária sem requisitos específicos sobre as propriedades físicas ou químicas do objeto preso. Além disso, prendendo hidrodinâmica permite o confinamento de um objeto alvo "single" de partículas em suspensões concentradas ou lotado, o que é difícil usar a força métodos alternativos baseada em campo com armadilhas. A armadilha hidrodinâmico é user-friendly, fácil de implementar e pode ser adicionado ao existente dispositivos microfluídicos para facilitar a análise de captura e de longa data de partículas. No geral, a armadilha hidrodinâmica é uma nova plataforma para o confinamento, micromanipulação, e observação de partículas, sem a imobilização de superfície e elimina a necessidade de potencialmente perturbativos campos ópticas, magnéticas e elétricas no aprisionamento solução livre de partículas pequenas.
A armadilha consiste em uma hidrodinâmica de duas camadas híbridas dispositivo (PDMS (polidimetilsiloxano) / vidro) microfluídicos para confinamento de partículas. Os passos 1-2 descrevem a fabricação de dispositivos microfluídicos e Passos projeto de dispositivos 3-4 discutir e operação.
1. SU-8 Fabricação Mold (não mostrado no vídeo)
2. Fabricação de dispositivos microfluídicos
Descrever os passos 3-4 implementação da armadilha hidrodinâmico usando o dispositivo micro descrito acima.
3. Setup Armadilha hidrodinâmico Experimental
4. Procedimento Trapping hidrodinâmica
Código LabVIEW: Nota de Utilização de Controlador de comentários
Captura de partículas automatizado é obtida utilizando um algoritmo de controle de feedback linear implementado usando um código LabVIEW personalizado. O código de LabVIEW capta imagens de uma câmera CCD e transmite um potencial elétrico (tensão) a um regulador de pressão, que modula a posição ativa (estado parcialmente aberto / fechado) de uma válvula pneumática on-chip dinâmico. Como a válvula muda de posição, a taxa de fluxo hidrodinâmico em uma linha de saída is ajustado, assim, re-posicionar o ponto de estagnação e permitindo captura hidrodinâmico. As etapas do ciclo de feedback são seqüencialmente e iterativamente executado a uma taxa de captura de imagens (10-60 Hz). O código de LabVIEW executa os seguintes passos durante cada ciclo de retroalimentação:
O código de LabVIEW registra os seguintes dados para cada imagem capturada durante a captura de partículas: 1) o tempo decorrido, 2) centróide (x, y de posição) da partícula presa, 3) posição do centro armadilha, 4) a distância da partícula do pressão armadilha centro, 5) aplicada à válvula on-chip. Além disso, o código também grava um filme da partícula preso em formato de arquivo AVI.
5. Resultados representante
Nós preso esferas de poliestireno fluorescentes de vários tamanhos (100, 540, 830 nm, diâmetro e 2,2 mm) usando uma armadilha hidrodinâmico. Figura 1 (a) mostra uma imagem de uma partícula presa na junção cruzada slot-in um dispositivo micro. A trajetória de uma partícula presa pode ser determinada diretamente a partir dos dados gravados por posição centróide o código LabVIEW durante um evento de captura ou através do rastreamento e localização de uma partícula presa a partir do arquivo de filme gravado. Figura 1 (b) mostra a trajetória de uma partícula presa (2,2 mM fluorescentes poliestireno talão) ao longo da direção do canal de saída. O talão é inicialmente preso (quadrados) por 3 min e depois é liberado da armadilha e foge junto a um dos canais de saída (círculos). Trajetórias de partículas ao longo do eixo de compressão de fluxo (direção do canal de entrada; dados não mostrados) são semelhantes às trajetórias de partículas ao longo do eixo do fluxo extensional (direção de saída), como mostrado na Figura 1 (b). Um histograma de deslocamento de partículas do centro da armadilha para um cordão preso (2,2 de diâmetro mm) ao longo das direções do canal de saída é mostrado na Figura 1 (c). Usando o algoritmo de controle de feedback descrito neste trabalho, as partículas presas estão confinados dentro de ± 1 mícron do centro da armadilha ao longo do canal de entrada e saída de direções.
Um esquema do dispositivo micro usado para capturar hidrodinâmico é mostrado na Figura 2. O dispositivo integrado microfluídicos consiste de uma camada fluídica e uma camada de controle e é fabricada utilizando litografia de multicamadas padrão suave como descrito neste artigo. A camada fluídica contém os canais tampão e amostra, bem como a geometria do canal cruz-slot para facilitar a captura hidrodinâmico. A camada de controle consiste em uma válvula pneumática posicionados acima de um dos canais de saída na camada fluídica, eo controle e camadas de fluidos são separados por uma membrana elastomérica fina. Durante a operação do dispositivo, a válvula na camada de controle é pressurizado com gás nitrogênio, o que obriga a fina membrana na camada fluídica, induzindo uma constrição no canal de saída. A válvula pneumática dinâmica contrai o canal de saída por quantidades variáveis, alterando a pressão aplicada na camada de controle, que ajusta as taxas de fluxo relativo na tomada de canais e permite fina escala o controle do ponto de estagnação.

Figura 1: Trapping de partículas. (A) Imagem de um talão única confinada na armadilha hidrodinâmico. Além do talão no centro armadilha, várias contas untrapped são mostradas na região de captura. (B) Trajetória de uma partícula presa ao longo dos canais de saída (quadrados). Quando a partícula é liberada da armadilha (seta), que escapa ao longo de um dos canais de saída (círculos). (C) Histograma dos deslocamentos de um talão presos (2,2 de diâmetro mm) do centro da armadilha ao longo dos canais de saída.

Figura 2:. Esquemática do dispositivo micro para capturar hidrodinâmica hidrodinâmico A armadilha é construído utilizando um dispositivo de duas camadas microfluídicos. A camada de fluidos consiste de uma entrada da amostra, fnossas enseadas buffer, e duas saídas de resíduos. A camada de controle consiste de uma válvula pneumática de membrana situada no topo de um dos canais de saída na camada fluídica. A constrição no canal de saída opostas fornece uma pressão de deslocamento para a válvula pneumática. Dimensões canal típicos variam entre 100-500 mM. Na região (A), é o fluxo de entrada da amostra focada por duas entradas de buffer. Na região (B), fluxos de entrada de oposição convergem na junção cruzada slot-trapping onde ocorre. A válvula pneumática (C) é posicionado no topo de um dos canais de saída. A posição do ponto de estagnação é modulado pela regulação da pressão a esta válvula.
Neste artigo, apresentamos um método baseado em microfluídicos para o confinamento de partículas com base no fluxo hidrodinâmico. Demonstramos prendendo partículas estáveis em um ponto de estagnação de fluidos utilizando um mecanismo de controle feedback, permitindo assim confinamento e micromanipulação de partículas arbitrário em um microdispositivo integrado.
Agradecemos ao grupo Kenis na Universidade de Illinois em Urbana-Champaign para discussões úteis e generosamente proporcionar a utilização de instalações de salas limpas.
Este trabalho foi financiado por um Pathway NIH para Independence Award PI, sob Grant No. 4R00HG004183-03 (Charles M. Schroeder e Melikhan Tanyeri).
Este trabalho foi financiado pela National Science Foundation através de uma Bolsa de Investigação Pós-Graduação para Eric M. Johnson-Chavarria.
| Agulha romba de 21 gauge | Zephyrtronics | ZT-5-021-1-L | Para perfurar furos de porta em |
| seringa de plástico PDMS 3 ml | BD Biosciences | 309585 | Para encher válvula com óleo |
| Si wafers | University Wafer | 3” P (100) lado único polido 380 μ m grau de teste | |
| Vidro | de cobertura VWR international | 48404-428 | 24 x 40 mm #1.5 |
| Cartão DAQ | National Instruments | PCI 6229 | |
| Contas fluorescentes | Spherotech, Inc. | FP-2056-2 | 2.2 μ m Fluorinerte vermelho do Nilo |
| 3M | FC 40 | Microscópio invertido de óleo de suporte fluorado | |
| Olympus Corporation | IX-71 | ||
| LabVIEW | National Instruments | Versão 9.0f3 (32 bits) | |
| Microscópio estéreo | Leica Microsystems | MZ6 | Para alinhar a camada de controle PDMS à camada fluídica. |
| Forno de Convecção Mecânico | VWR international | 1300U | Para dispositivos de cozedura para criar placas PDMS monolíticas com duas camadas. |
| Tubos e conectores microfluídicos | Upchurch Scientific | Tubulação 1/16 x .020 PFA e conexões super flangeless | |
| PDMS | GE Healthcare | RTV 615 A& Câmara | de Plasma B|
| Harrick Scientific Products, Inc. | PDC-001 | ||
| Transdutor de Pressão | Proporção Ar | DQPV1 | |
| Spin Coater | Sistemas de Revestimento Especial | G3P-8 Spin Coat | |
| Fotorresistente | MicroChem Corp. | SU 8 2050 | |
| Bomba de seringa | Harvard Apparatus | PHD 2000 | Bloco de terminais programável|
| National Instruments | BNC 2110 | Para saída analógica para regulador de pressão e leitura. | |
| Fonte de luz colimada UV e sistema de exposição | OAI | Modelo 30 Fonte | de luz aprimorada |