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Mudanças dinâmicas na concentração de cálcio intracelular em resposta a vários estímulos regula muitos processos celulares como a proliferação, diferenciação e apoptose 1. Durante a apoptose acúmulo de cálcio, na mitocôndria promove a liberação de fatores pró-apoptóticos da mitocôndria para o citosol 2. É, portanto, de interesse para medir diretamente cálcio mitocondrial em células vivas in situ durante a apoptose. Alta resolução de imagem fluorescente de células carregadas de excitação dupla raciométrica e não raciométrica corantes indicador sintético de cálcio tem sido provado ser uma ferramenta confiável e versátil para estudar vários aspectos da sinalização do cálcio intracelular. Medir os fluxos de cálcio citosólico utilizando estas técnicas é relativamente simples. No entanto, medindo os níveis de cálcio nas células intactas intramitocondrial utilizando indicadores de cálcio sintéticos como Rhod-2 e Rhod-FF é mais desafiador. Indicadores sintéticos direcionados para as mitocôndrias têm embotado respostas repetitivas a um aumento no cálcio mitocondrial, e interromper a morfologia mitocondrial 3. Além disso, indicadores sintéticos tendem a vazar para fora da mitocôndria durante várias horas o que os torna inadequados para experimentos de longa duração. Assim, os indicadores de cálcio geneticamente codificado com base em proteína fluorescente verde (GFP) 4 ou 5 aequorin direcionados para as mitocôndrias têm muito facilitada medição da dinâmica do cálcio mitocondrial. Aqui, descrevemos um método simples para medição em tempo real dos fluxos de cálcio mitocondrial em resposta a estímulos diferentes. O método é baseado em microscopia de fluorescência de 'raciométrica-pericam ", que é seletivamente direcionados para as mitocôndrias. Pericam raciométrica é um indicador de cálcio baseado em uma fusão de circularmente permutados proteína fluorescente amarela e calmodulina 4. A ligação do cálcio para pericam raciométrica provoca uma mudança de seu pico de excitação de 415 nm a 494 nm, enquanto que o espectro de emissão, que picos em torno de 515 nm, permanece inalterado. Raciométrica pericam liga um íon de cálcio com uma única constante de dissociação in vitro de ~ 1,7 mM 4. Estas propriedades do pericam raciométrica permitem a quantificação de mudanças rápidas e de longo prazo na concentração de cálcio mitocondrial. Além disso, descrevemos a adaptação desta metodologia a um padrão de imagem do microscópio de campo amplo de cálcio com comumente disponíveis conjuntos de filtros. Usando dois agonistas distintos, o agonista purinérgico ATP e indução de apoptose estaurosporina de drogas, demonstram que este método é apropriado para monitorar mudanças na concentração de cálcio mitocondrial com uma resolução temporal de segundos a horas. Além disso, também demonstram que pericam raciométrica também é útil para medir a fissão mitocondrial / fragmentação durante a apoptose. Assim, pericam raciométrica é particularmente adequado para a medição contínua de longo prazo da dinâmica do cálcio mitocondrial durante a apoptose.