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Artigo de método

Hibridização de sonda e amplificação de sinal em hibridização in situ de RNA: uma técnica para detectar sequências específicas de RNA em seções de tecido

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30 de abril de 2023

Neste artigo

Resumo

Fonte: Outh-Gauer, S. et al. Hibridização In Situ Cromogênica como Ferramenta para o Diagnóstico de Câncer de Cabeça e Pescoço Relacionado ao HPV. J. Vis. Exp. (2019)

Este vídeo descreve uma estratégia de hibridização sequencial que envolve a hibridização de sondas de mRNA para mRNA alvo específico. Após a hibridização da sonda, a amplificação do sinal é realizada para melhorar a resolução por meio da redução da relação sinal-ruído durante o RNA-CISH de amostras histológicas.

Protocolo

Todos os procedimentos envolvendo participantes humanos foram realizados em conformidade com as diretrizes institucionais, nacionais e internacionais para o bem-estar humano e foram revisados pelo conselho de revisão institucional local.

1. Executando o ensaio

NOTA: Não deixe as seções secarem entre as etapas de incubação.

  1. Hibridização da sonda HPV
    NOTA: Certifique-se de que as sondas estejam pré-aquecidas para dissolver qualquer precipitação antes do uso. Para esta etapa, em vez da sonda do HPV, a peptidil-prolil isomerase B (PPIB) para controle positivo ou a di-hidrodipicolinato redutase (DAPB) para controle negativo (consulte a Tabela de Materiais) também podem ser usadas.
    1. Toque e/ou mova os slides para remover qualquer excesso de líquido e coloque-os no rack de slides. Adicione ~ 4 gotas de sonda de HPV para cobrir inteiramente cada seção.
    2. Cubra a bandeja com uma tampa e coloque-a no forno por 2 h a 40 °C.
      NOTA: Para evitar a evaporação, certifique-se de que o botão giratório esteja completamente girado para a posição travada.
    3. Retire a bandeja do forno e remova a grade deslizante.
    4. Uma lâmina de cada vez, remova rapidamente qualquer excesso de líquido e coloque a lâmina em um suporte de lâminas submerso em um prato de coloração cheio de 1x tampão de lavagem.
    5. Lave as lâminas em 1x tampão de lavagem por 2 min em temperatura ambiente com agitação constante. Repita isso com um tampão de lavagem 1x fresco.
  2. Hibridização de AMP1, AMP2, AMP3 e AMP4
    NOTA: Essas etapas incluem hibridização no forno de hibridização e AMP1–AMP4 do kit adquirido (consulte a Tabela de Materiais).
    1. Toque e/ou mova para remover qualquer excesso de líquido das lâminas e coloque-as no suporte de lâminas. Adicione ~ 4 gotas de AMP1 para cobrir inteiramente cada seção.
    2. Cubra a bandeja com uma tampa e coloque-a no forno por 30 min a 40 °C.
    3. Retire a bandeja do forno e remova a grade deslizante.
    4. Uma lâmina de cada vez, remova rapidamente qualquer excesso de líquido e coloque a lâmina em um suporte de lâminas submerso em um prato de coloração cheio de 1x tampão de lavagem.
    5. Lave as lâminas em 1x tampão de lavagem por 2 min em temperatura ambiente com agitação constante. Repita isso com um tampão de lavagem 1x fresco.
    6. Repita as etapas 1.2.1–1.2.5, mas use ~ 4 gotas de AMP2 em vez de AMP1 e incube por 15 min a 40 ° C. Lave as lâminas 2x por 2 min, ambas as vezes em tampão de lavagem fresco.
    7. Repita as etapas 1.2.1–1.2.5, mas use ~ 4 gotas de AMP3 em vez de AMP1 e incube por 30 min a 40 ° C. Lave as lâminas 2x por 2 min, ambas as vezes em tampão de lavagem fresco.
    8. Repita as etapas 1.2.1–1.2.5, mas use ~ 4 gotas de AMP4 em vez de AMP1 e incube por 15 min a 40 ° C. Lave as lâminas 2x por 2 min, ambas as vezes em tampão de lavagem fresco.
  3. Hibridização de AMP5 e AMP6
    NOTA: Essas etapas não incluem hibridização no forno, mas hibridização em temperatura ambiente. AMP5 e AMP6 vêm do kit adquirido (consulte a Tabela de Materiais).
    1. Toque e/ou mova os slides para remover qualquer excesso de líquido e coloque-os no rack de slides. Adicione ~ 4 gotas de AMP5 para cobrir inteiramente cada seção.
    2. Cubra a bandeja com uma tampa e incube por 30 min em temperatura ambiente.
    3. Uma lâmina de cada vez, remova rapidamente qualquer excesso de líquido e coloque-o em um rack de lâminas submerso em um prato de coloração cheio de 1x tampão de lavagem.
    4. Lave as lâminas em 1x tampão de lavagem por 2 min em temperatura ambiente com agitação constante. Repita isso com um tampão de lavagem 1x fresco.
    5. Repita as etapas 1.3.1–1.3.4, mas use ~ 4 gotas de AMP6 em vez de AMP5 e incube por 15 min em temperatura ambiente. Lave as lâminas 2x por 2 min, ambas as vezes em tampão de lavagem recente.

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Divulgações

Não há conflitos de interesse declarados.

Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Forno HybEZ (110v) Diagnóstico Celular Avançado Inc. Rolamento 321710
Rack de slides HybEZ Diagnóstico Celular Avançado Inc. 300104
Reagentes de detecção RNAscope 2.5 HD-BROWNDiagnóstico Celular Avançado Inc.Rolamento 322310Este kit inclui os reagentes de amplificação AMP1, AMP2, AMP3, AMP4, AMP5 e AMP6, e os reagentes de detecção DAB-A e DAB-B
Sonda de controle negativo RNAscope 3-Plex Diagnóstico Celular Avançado Inc.320871DAPB
Sonda de controle positivo RNAscope 3-Plex Diagnóstico Celular Avançado Inc.320861PPIB
Sonda RNAscope - HPV16/18 Diagnóstico Celular Avançado Inc.311121
Reagentes tampão de lavagem RNAscopeDiagnóstico Celular Avançado Inc.310091Tampão de lavagem 50X x4

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