1. Isolamento exossomo
- Cultivar células em meio com exossomo livre de soro. Assim, qualquer soro adicionado ao meio de cultura celular deve ser esgotado de exossomos por ultracentrifugação a 120 000 xg durante a noite a 4 ° C antes do uso.
- Transferir a suspensão celular para tubos cônicos.
- Centrifugar a 300 xg por 10 minutos a 4 ° C para sedimentar as células.
- Transfira o sobrenadante para tubos de ultracentrifugação e, se não completamente cheio adicionar PBS.
- Centrifugar a amostra a 16 500 xg por 20 minutos a 4 ° C para continuar a remover as células e restos celulares.
- Filtrar o sobrenadante através de um 0,2 m de filtro para remover partículas maiores que 200 nm.
- Transferir o sobrenadante filtrado para tubos de ultracentrífuga novo e fechar os tubos antes de ultracentrífuga a 120 000 xg por 70 minutos a 4 ° C para agregar as exossomos.
- Desprezar o sobrenadante.
- Para recuperação exossomo máxima, ressuspender o exossomo enriquecered pellet repetidamente em um pequeno volume (~ 3 x mL 50) de um tampão apropriado. Esse buffer depende das experiências jusante planejada após o isolamento exossomo. Por exemplo, tampão de lise é usado para a proteína e isolamento de RNA, PBS é usado para microscopia eletrônica e citometria de fluxo e por meio de estudos funcionais podem ser preferidos.
Nota; exossomos também pode ser isolado de fluidos corporais diferentes, tais como plasma, usando o mesmo procedimento que para meios de cultura de células. Para fluidos viscosos, pode ser necessário para diluir a amostra com PBS antes da centrifugação e filtração. Em relação à velocidade de centrifugação para o ponto 5 acima, pode ser aumentada para 29 500 xg, ea ultracentrifugação no ponto 7 pode ser estendido para 90 minutos 18.
Se a amostra precisa ser mais purificada do pellet exossomo pode ser lançada em um gradiente de sacarose e os exossomos serão principalmente encontrados na fração represeNTING uma densidade de 1,13-1,19 g / ml 2.
2. Identificação exossomo por microscopia eletrônica
- Para continuar a reduzir proteínas contaminantes, ressuspender o pellet exossomo enriquecido em PBS e ultracentrífuga a 120 000 xg por 70 minutos a 4 ° C para a re-pellet exossomos.
- Dê uma pequena alíquota da amostra para isolamento de proteínas e de medição de proteína total. Certifique-se que apenas uma pequena parte da amostra é lisados e utilizado para a medição de proteína e manter o exossomos intacta, resolvido em PBS, em separado sobre o gelo ou a -80 ° C para novas experiências.
- Colocar uma gota, cerca de 10 mg de proteína exosomal do exossomos intacta ressuspenso em PBS, em uma Parafilm. Então, com uma pinça, com cuidado a posição de uma grade de carbono formvar níquel revestido em cima de cada gota de 30-60 minutos. Garantir que a grade está posicionado com o lado voltado para a queda de revestimento contendo exossomos.
- Coloque três gotas, cada mL 30, da PBS em tele Parafilm e lave a grade sequencialmente, o posicionamento da grade em cima das gotas de PBS, e usar um papel absorvente entre elas. Use o papel absorvendo suavemente apenas mantendo-lo de perto ao lado da grade, sem fazer contato com a área revestida.
- Fixar a amostra por depositar uma gota de paraformaldeído 2% sobre o Parafilm e colocar a grade em cima da queda de 10 minutos.
- Repita a etapa de lavagem no ponto 4, antes de imunomarcação com um anticorpo apropriado. Os anticorpos usados são anti-CD63 e anti-MHC classe II. Microscopia eletrônica também pode ser realizada sem imunomarcação como exossomos podem ser identificados apenas com base no tamanho e morfologia. No entanto, recomendamos para avaliar o tamanho, morfologia e da presença de uma proteína de membrana para uma validação mais conclusivos.
- Transferência da grelha para uma queda de 30 mL do anticorpo primário de escolha e incubar por 40 minutos. Lavar, repetindo o ponto 4, mas o uso de 0,1% de soro albumina bovina na PBS em vez de PBS sozinho.
- Repita o ponto 7, mas com a 10 nm de ouro-anticorpo marcado secundário e lavar com PBS sozinho.
- Pós-fix da amostra pela adição de uma gota de glutaraldeído 2,5% para o Parafilm e incubar a grade em cima da queda de 10 minutos. Repita a lavagem no ponto 4, mas use cinco gotas de água deionizada em vez de três gotas de PBS.
- Contraste da amostra, adicionando uma gota de acetato de uranila 2% para o Parafilm e incubar a grade em cima da queda de 15 minutos.
- Incorporar a amostra pela adição de uma gota de metil-celulose 0,13% e acetato de uranila 0,4% para o Parafilm e incubar a grade em cima da queda de 10 minutos.
- Retire o excesso de líquido com cuidado usando um papel absorvente, antes de posicionar a grade em um papel com o lado revestido para cima e deixe secar por 5 minutos.
- Examine os preparativos com um microscópio eletrônico ou armazenar as redes em uma caixa de grade para trabalhos futuros.
3.Caracterização exossomo por citometria de fluxo
Como exossomos são muito pequenos para serem detectados pelo equipamento atual citometria de fluxo, é necessário primeiro não amarrar o exossomos para contas revestidas de anticorpo (Figura 1). Estas contas podem ser comprados como um produto pronto feito ou feito em laboratório com o anticorpo de escolha. Dependendo da origem exosomal celular, diferentes anticorpos pode ser acoplado a grânulos que podem ser tanto de caráter magnético ou látex. Atualmente usamos anti-MHC classe II ou anti-CD63 grânulos revestidos para esta análise.
- Para o uso de "caseiro" contas revestidas de anticorpo, usamos quatro esferas de látex M revestido com anticorpos anti-CD63. Lavar 25 mL 4 contas de látex M (30 x 10 6 esferas) duas vezes em 100 l MES buffer, 3 000 xg por 15-20 minutos e dissolver o sedimento em 100 mL de buffer MES. Prepare a mistura de anticorpos contendo um volume igual de 12,5 mg de anticorpos com o mesmo volume de tampão MES. Adicione ocontas à mistura anticorpo e incubar sob agitação durante a noite em temperatura ambiente. Lave as contas revestidas de anticorpo três vezes com PBS (3 000 xg por 20 minutos) e dissolver o sedimento em 100 l de tampão de armazenamento (com uma concentração final de 300 000 contas / mL).
- Para cada amostra (cada anticorpo), continue com um volume igual a um mínimo de 30 mg de proteína exosomal (do exossomos intacta resolvido em PBS) por ~ 100 000 contas revestidas de anticorpo.
- Incubar exossomos e contas, em um volume total de 300 mL PBS, durante a noite a 4 ° C em movimentos suaves.
- Bloco, adicionando 300 ml de 200 mM de glicina e incubar por 30 minutos.
- Lavar os complexos exossomo-bead duas vezes em tampão de lavagem (soro 1-3% em PBS), a 600 xg por 10 minutos.
- Incubar os complexos exossomo-talão com 50 mL de anticorpos IgG a 4 ° C. Lavar os complexos exossomo-bead duas vezes em tampão de lavagem, tal como descrito na etapa 5.
- Adicionar 90 mL tampão de lavagem e 10 mlanticorpo de escolha (de preferência anti-CD9, anti-CD63 ou anti-CD81) para os complexos exossomo-talão e incubar por 40 minutos sob movimento suave. Lavar os complexos exossomo-bead duas vezes em tampão de lavagem, tal como descrito na etapa 5.
- Adicionar 300 mL de tampão de lavagem e aquisição de dados usando citometria de fluxo.
Como discutido acima, contas diferentes podem ser usados, tais como esferas de látex como descrito no protocolo ou esferas magnéticas. Se esferas magnéticas são usadas em vez, por favor, note que o protocolo é um pouco diferente. A etapa de bloqueio (ponto 4) não é necessária ea lavagem é realizada com a colocação do tubo em um suporte magnético em vez de uma centrifugação.
O buffer de armazenamento utilizado para a "homemade" contas revestidas de anticorpo, contém 0,1% de glicina e de sódio a 0,1% Azid em PBS, com um pH de 7,2.
Importante, certifique-se usar o soro exossomo esgotados para o tampão de lavagem de citometria de fluxo (1-3% de soro em PBS), para evitar qualquerexossomos soro contaminar a análise.
Nota; ao realizar caracterização exossomo usando anticorpos contas junto é importante reconhecer que é apenas uma subpopulação específica, específica para o anticorpo utilizado, que é isolada e caracterizada.
4. Exossomo detecção por Western blot
Western blot é um método bem estabelecido e não vamos entrar em detalhes sobre o método em si, mas o foco sobre a importância de um isolamento de proteínas adequada antes do Western blot e os diferentes anticorpos utilizados.
- Dissolver o sedimento exossomo no tampão de lise de proteínas de escolha e de pipetagem completamente, seguido de vortex-mistura. Para mais lisar as exossomos, sonicate a amostra em banho-maria 3 x 5 minutos com vortex de mistura entre eles. Finalmente centrifugar a amostra, 13 000 xg por 5 minutos em temperatura ambiente, e transferir o sobrenadante para um tubo eppendorf novo.
- Measure a proteína total por um método de escolha e de carga 20-50 mg de proteína por poço.
- Separar e transferir as proteínas por eletroforese em gel e eletroforese.
- Bloco e lave a membrana antes de realizar imunocoloração contra proteínas enriquecido em exossomos.
- Detectar a proteína específica por quimioluminescência sistema de imagem, digital e software de análise.
Como não há marcadores específicos exossomo, proteínas que são enriquecidos em exossomos, de todas as origens diferentes celulares, são comumente usados para a detecção exossomo. Estes são proteínas, como tetraspanins (por exemplo, CD9, CD63 e CD81), proteína do citoesqueleto associados (por exemplo Ezrin) e proteínas envolvidas na biogênese multivesiculares (por exemplo, Tsg101 e alix). Outras proteínas que também são comumente detectados em exossomos são Flotillin, Hsc70 e proteínas rab diferentes etc, no entanto, também existem células proteínas específicas encontradas em exossomos como A33 (células do epitélio intestinal), CD3(Células T) e MHC classe II (células apresentadoras de antígenos). Assim, dependendo do que tipo de célula do exossomos são liberados a partir dos marcadores para a detecção pode variar.
Como outros compartimentos da célula também pode produzir vesículas, é mais recomendada para determinar a presença de proteínas a partir desses compartimentos, como o retículo endoplasmático (por exemplo, calnexin e Grp78) eo aparelho de Golgi (por exemplo, GM130). Assim, a falta dessas proteínas indica pouca ou nenhuma contaminação de outros compartimentos de vesículas na amostra estudada.
5. Isolamento do RNA e análise exosomal RNA
- Dissolver o sedimento exossomo no tampão de lise RNA de escolha e executar extração de RNA. Kits de isolamento diferentes RNA pode ser usado de acordo com experimentos a jusante, mas os métodos de coluna com base fornece amostras com um espectro mais amplo de RNA. Atualmente estamos usando miRCURY Kit Isolamento RNA por Exiqon, mas outros kits pode ser adequado, dependendo do scquestão ientific na mão.
- Ao realizar o isolamento do RNA é importante trabalhar em um ambiente livre de RNase. Portanto, use de ácido nucléico e dicas nuclease livre pipeta e limpe juízes e equipamentos livres de contaminantes e RNases.
- Para o isolamento do RNA, usando miRCURY Kit Isolamento RNA, dissolver o sedimento exossomo em 350 ml de solução de lise e executar vórtice de mistura por 15 segundos.
- Adicionar 200 mL de etanol a 95% e vortex de mistura por 10 segundos.
- Coloque uma coluna em um tubo de coleta e transferir os exossomos lisadas para a coluna e centrifugar 1 minuto a 14 000 x g.
- Lavar três vezes adicionando 400 mL de solução de lavagem para a coluna que contém o RNA exosomal e centrifugar por 1 minuto a 14 000 x g.
- Centrifugar por 2 minutos a 14 000 xg para se certificar de que a coluna é seco e colocar a coluna seca em um tubo eppendorf RNase-free.
- Adicionar 50 mL tampão de eluição para a coluna e centrifugar por 2 minutos a 200 xg, seguido de 1 minuto a 14 000 x g.
- Continue com o RNA isolado ou armazená-lo em -80 ° C.
Para detecção e análise do RNA total extraído exosomal, use um Agilent 2100 Bioanalyzer com o RNA 6000 Nano ou Kit Pico RNA 6000. A análise mostra o rendimento RNA exosomal e distribuição de tamanho.
6. Resultados representante
Exossomos são pequenos demais para ser detectado pelos métodos de citometria de fluxo disponíveis, e são, portanto, ligado ao anticorpo revestido contas antes de serem analisados (Figura 1). Como exossomo-bead complexos pode agregar o fluxo gráfico de dispersão citometria pode conter diferentes populações de solteiro, duplo e triplo grânulos (Figura 2A). A seta indica as contas individuais que são analisados. A CD63 positivo população de esferas-exossomo único em relação ao seu controle isotipo é mostrado na Figura 2B.
e_content "> Devido ao tamanho pequeno de exossomos, eles só podem ser visualizados diretamente com microscopia eletrônica, e não por microscopia de luz. típicas características morfológicas de exossomos são arredondados e 3-10 nm vesículas da membrana de tamanho.
Na Figura 3, microscopia eletrônica fotografias mostram exossomos imunocoradas
(A) com o ouro marcado com anticorpos para CD63 (indicado pela seta) e não-histoquímica exossomos
(B). Para determinar que o vesículas isoladas são, na verdade exossomos e de melhor caracterizar as proteínas exosomal, Western Blot é comumente usado. Figura 4 mostra a ausência de calnexin, um marcador de retículo endoplasmático. Isto indica a contaminação pouco de vesículas do retículo endoplasmático. Além disso, a Figura 4 mostra as presenças de CD81 em exossomos, que é um tetraspanin comumente enriquecido em exossomos.
RNA celular contêm principalmentes RNA ribossomal (rRNA), vistos como os dois picos proeminentes para o 18S rRNA 28S e subunidades em uma análise Bioanalyzer (Figura 5A). No entanto, RNA exosomal diferem em seu perfil como exossomos falta os dois picos rRNA (18S e 28S) e são ricos em RNA curto, como mRNA e miRNA (Figura 5B).

Figura 1. Devido ao tamanho pequeno de exossomos (3-10 nm), eles não podem ser distinguir do ruído de fundo e, quando analisados por citometria de fluxo. Portanto, é necessário anexá-los a contas revestidas de anticorpo antes da exossomos são analisados, que depois podem ser visualizadas pelo laser.

Figura 2. As contas exossomo complexo pode agregar entre si e formam grânulos duplos e triplos (A). A seta está demonstrando o único grânulo-exo alguns população, que é fechado e usado para análise posterior. Essa população será diretamente comparado com um controle isotipo (cheio de cinza de pico) para determinar a presença de moléculas de membrana da exossomos. CD63 exossomos positiva (pico preto aberto) são mostrados na figura B.

Figura 3. Microscopia eletrônica de exossomos com a morfologia típica e tamanho (40-80 nm) (A e B). A seta na figura A indica a partícula de ouro do anticorpo secundário, verificando-se que este exossomo têm CD63 em sua superfície da membrana.

Figura 4. Resultados Western Blot mostrando a ausência do calnexin retículo endoplasmático proteína, mas a presença da proteína comumente enriquecido em exossomos, tetraspanin CD81.
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Figura 5. Resultados Bioanalyzer mostrando presença de RNA em células (A) e exossomos (B). Setas indica a 18S e subunidades 28S rRNA presente em células. Como exosomal RNA viril contêm RNA pequenos rRNA pouco ou nenhum é identificado em exossomos.