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1. Imunofluorescência
O protocolo seguinte é realizada em crio-secções cerebrais coronais, obtidos a partir de ratinhos transcardially perfundidos (20 ml de PBS, 0,1 mol / litro, pH 7,4, seguido por 50 ml de paraformaldeído 4% gelada em PBS). Após a perfusão, os cérebros foram cuidadosamente removidos e transferidos para 30% de sacarose em PBS a 4 ° C durante a noite para crioprotecção. Os cérebros são então rapidamente congelados por imersão em isopentano a - 45 ° C durante 3 minutos antes de ser selado em frascos e armazenada a -70 ° C até à sua utilização. Criocortes cerebrais coronais (20 um) são cortados em série e submetido a protocolos de imunofluorescência 11, 6.
Todos os reagentes e amostras à temperatura ambiente antes do uso. Por favor note que as diluições de trabalho apresentados de anticorpos e soro resultou de estudos realizados, a fim de obter o melhor desempenho. Quando diferentes anticorpos e soro são utilizados, o protocolo deve ser validado.
Note que, porque os anticorpos primários, tanto anti-CD11b e anti-CD68 são feitos em ratos, para evitar sinal de cruz por anti-rato Alexa 546, foi utilizado um alta diluição de anti-CD11b seguido de amplificação do sinal fluorescente com kit TSA (Cy5 tiramida). Criámos a diluição de trabalho ideal para anti-CD11b realizando o protocolo descrito, exceto para a etapa 1.17 e usando pelo menos sete diluições diferentes de anti-CD11b como relatado na tabela 1. Como resultado, 1:30.000 foi escolhido ser o único diluição realização: 1) sinal visível com Cy5 no comprimento de onda de excitação 646 nm, 2) nenhum sinal com Alexa 546 no comprimento de onda de excitação de 532 nm. Desta forma, Alexa 546 sinal fluorescente está associada selectivamente com CD68.
As diluições óptimas de anti-CD11b e anti-CD68 podem variar dependendo do tipo de tecido e deve ser definida antes do início do protocolo de co-marcação.
- Lavar criocortes cerebrais duas vezes com PBS.
- Emcriocortes Cubate por 5 min em PBS contendo 1% de H 2 O 2 (etapa necessária uma vez que a amplificação de fluorescência precisa de incubação com peroxidase de rábano, com estreptavidina-HRP, ver passo 1.12).
- Criocortes Lavar 2x com PBS.
- Incubar durante 60 min criocortes em PBS contendo 10% NGS e 0,3% de Triton.
- Incubar criocortes a 4 ° C durante a noite em PBS contendo rato primária Ab anti-CD11b [1:30.000], 10% NGS e 0,3% de Triton.
- Lavar 2x criocortes (5 min) com PBS.
- Incubar durante 60 min criocortes em PBS contendo secundário biotinilado anti-rato Ab [1:200] e 1% de NGS.
- Criocortes Lavar 2x com PBS.
- Lavar criocortes com TNT (Tris-HCl, NaCl, Tween: TRIS 0,1 M-HCl, pH 7,4, 0,15 M de NaCl, 0,05% de Tween 20).
- Incubar criocortes durante 1,5 horas em TNB (tampão Tris-HCl-NaCl-Blocking: TRIS 0,1 M-HCl, pH 7,4, 0,15 M NaCl, 0,5% de reagente de bloqueio a partir de kit adequado (ver tabela de reagentes)).
- Wash crioseções 3x vezes com TNT.
- Incubar criocortes em TNB contendo estreptavidina-HRP [1:100].
- Criosecções Lavar 3x com TNT.
- Incubar criosecções por 8 minutos em Amplificação diluente contendo Cyanine 5 tiramida [1:300].
- Criocortes Lavar 3x com PBS.
- Incubar durante 60 min criocortes em PBS contendo 10% NGS e 0,1% de Triton.
- Incubar criocortes a 4 ° C durante a noite em PBS contendo primário Rato Ab anti-CD68 [1:200], 3% de NGS e 0,3% de Triton.
- Criocortes Lavar 3x com PBS.
- Incubar criocortes durante 60 min em PBS contendo fluorconjugated secundário Ab Alexa 546 anti-rato [1:500] e 1% de NGS.
- Criocortes Lavar 3x com PBS.
- Incubar criocortes durante 10 min em PBS contendo Hoechst 1 ug / ml.
- Criocortes Lavar 3x com PBS.
- Monte criosecções em Prolong Gold.
2. Aquisição de imagens tridimensionais por microscopia confocal
O microscópio utilizado foi um microscópio IX81 equipado com uma unidade de digitalização FV500 confocal com 3 linhas de laser: Ar-Kr (488nm), He-Ne vermelho (646nm), e verde He-Ne (532nm) e um diodo de UV.
- Selecione os lasers de excitação, dependendo dos comprimentos de onda dos corantes fluorescentes a ser animado (He-Ne vermelho para Cy5, CD11b, He-Ne verde para Alexa546, CD68 eo diodo UV para a Hoechst, núcleos).
- Escolha a melhor combinação espelho dicróico para a coleta de sinal luminoso.
- Configure a resolução da imagem em um mínimo de 800 x 600 pixels.
- Identificar uma área de interesse, utilizando epi-fluorescência e aumentar progressivamente a ampliação para a objetiva de 40X.
- Mudar para Laser Scanning Microscopy (LSM) modalidade.
- Execute varreduras repetitivas para ajustar o fotomultiplicador (PMT) eo ganho para cada canal. Lasers podem ser ativados individualmente para facilitar a configuração. Manter ganho tão baixa quanto possível, para evitar sinais não específicos indesejados.
- Com repetitive verificação em execução, mover o foco de controlo para definir extremos superior e inferior do eixo z (comprimento total do eixo z = 10 mm).
- Pare de varredura repetitivo.
- Definir tamanho do passo. Ele deve ser o mais próximo possível ao tamanho do pixel (0,225 mm) para se obter uma proporção de 1:1 de tamanho padrão ao longo do eixo z.
- Activar filtro de Kalman, pelo menos, duas vezes.
- Ative o modo de varredura seqüencial para evitar efeitos sangram-through.
- Vá a meio caminho ao longo do eixo z e executar uma varredura seqüencial xy. Confira o set-up da PMT e ganho (boa relação sinal / ruído). Se não for satisfatória, repita o passo 2.6.
- Execute aquisição xyz.
- Exportar dados como arquivo multitiff. Cada arquivo multitiff normalmente contém 3 canais de cores (azul, verde e vermelho) e 44 planos focais.
3. Ver tridimensional de Aquisições confocal e Rendering tridimensional
Fazer upload de arquivos para o software multitiff Imaris e processá-los da seguinte forma:
- Software Open.
- Selecione a vista superar.
- Faça o upload do arquivo multitiff.
- Selecione a cor desejada para cada canal.
- Remover o ruído de fundo, aumentando o valor mínimo no painel de exibição de ajuste. Ajuste cada canal individualmente.
- Vá para a vista de seção. Mover ao longo do eixo z procurando co-localização (pixels amarelos).
- Clique sobre uma área de amarelo para ver se a co-localização está presente ao longo do eixo z (ou seja, pertencem a um objecto sólido). Projecções do eixo Z são visíveis na parte direita e na parte inferior da figura.
- Tome um instantâneo.
- Volte para superar vista.
- Colheita 3D para isolar uma célula ou um grupo de células.
- Selecione um canal no painel de ajuste de exibição.
- Selecione o superam / superfícies algoritmo construtor. Etapas algoritmo:
- Selecione canal.
- Definir limite (use o mesmo valor mínimo em tele exibir o painel de ajuste).
- Definir redimensionamento.
- Definir suavização (melhor = 0,200).
- Definir aparência de cor.
- Fim algoritmo.
- Repita o passo 3,12 para cada canal.
- Desmarque canais de fluorescência no painel de ajuste de exibição e selecione todas as três superfícies.
- Mova o volume para encontrar a melhor vista.
- Tome um instantâneo.