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Os gânglios da raiz dorsal (DRG) são compostos de soma de neurônios aferentes que inervam várias partes do corpo, e insights importantes podem ser obtidos com o estudo de neurônios sensoriais com diferentes alvos de inervação1. Vários métodos indiretos ou invasivos são usados para isolar e identificar neurônios aferentes para, por exemplo, injetar o nervo com marcadores como fluoroouro1, injetar corante nos músculos pelo método cirúrgico2. Dos diferentes corantes que foram usados com sucesso para marcar neurônios e tratos neuronais, os corantes fluorescentes como o DiI são amplamente utilizados em traçados neuroanatômicos devido à sua rápida absorção pelos terminais dos neurônios, retenção de longo prazo nos neurônios e falta de transferência entre os neurônios3. Os neurônios aferentes marcados com DiI podem ser facilmente visualizados usando um microscópio fluorescente para um estudo detalhado. No entanto, uma limitação é que marcadores como DiI podem ser perdidos das células durante a permeabilização celular necessária para a imunocitoquímica com epítopos intracelulares4. Aqui descrevemos um método que usa DiI injetado no músculo esquelético para identificar neurônios aferentes musculares no DRG. Também descrevemos um método de permeabilização celular que retém DiI no neurônio enquanto permite o acesso de anticorpos a epítopos intracelulares. Demonstramos o uso da eletrofisiologia e da imunocitoquímica do patch clamp para estudar esses neurônios identificados, bem como descrevemos as vantagens distintas de cada técnica no estudo dos canais iônicos que controlam a excitabilidade neuronal. Finalmente, descrevemos problemas potenciais que podem dificultar a interpretação dos dados eletrofisiológicos. Usamos esses métodos para identificar neurônios aferentes musculares e cutâneos e determinar os canais de sódio dependentes de voltagem (NaV) expressos nesses neurônios identificados8. No entanto, esses métodos podem ser adaptados a uma variedade de preparações para estudar subconjuntos identificados de neurônios que inervam um determinado tecido-alvo ou núcleo cerebral.