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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Os animais selvagens são comumente parasitados por uma ampla gama de helmintos. Os quatro principais tipos de helmintos são "lombrigas" (nematóides), "vermes de cabeça espinhosa" (acantocéfalos), "vermes" (trematódeos) e "tênias" (cestóides). Aqui descrevemos como os helmintos são coletados de um animal vertebrado e como eles são preservados e taxonomicamente identificados.
Animais selvagens são comumente parasitados por uma ampla gama de helmintos. Os quatro principais tipos de helmintos são "lombrigas" (nematóides), "vermes de cabeça espinhosa" (acantocéfalos), "vermes" (trematódeos) e "tênias" (cestóides). O método ideal para coletar helmintos é examinar um hospedeiro que está morto há menos de 4-6 horas, já que a maioria dos helmintos ainda estará viva. Uma necropsia completa deve ser realizada e todos os principais órgãos examinados. Os órgãos são lavados sobre uma peneira de 106 μm em água corrente e o conteúdo examinado em um microscópio estereoscópico. Todos os helmintos são contados e um número representativo é fixado (em etanol a 70%, formalina tamponada a 10% ou álcool-formalina-ácido acético). Para a identificação das espécies, os helmintos são eliminados em lactofenol (nematóides e pequenos acantocéfalos) ou corados (trematódeos, cestóides e grandes acantocéfalos) usando hematoxilina de Harris ou carmim de Semichon. Os helmintos são ligados às espécies examinando diferentes estruturas (por exemplo, espículas masculinas em nematóides ou o rostelo em cestóides). Os protocolos descritos aqui podem ser aplicados a qualquer animal vertebrado. Eles exigem alguma experiência no reconhecimento dos diferentes órgãos e na capacidade de diferenciar helmintos de outros detritos teciduais ou conteúdos intestinais. Coleta, preservação e coloração são técnicas simples que requerem equipamentos e reagentes mínimos. A identificação taxonômica, especialmente para espécies, pode ser muito demorada e pode exigir a submissão de espécimes a um especialista ou análise de DNA.
Os vertebrados são parasitados por quatro grupos principais de helmintos (vermes). Dois dos grupos, trematódeos, ou vermes, e cestóides, ou tênias, se enquadram no filo Platyhelminthes. Os outros dois grupos são os nematóides, ou lombrigas, (Nematoda) e os acantocéfalos, ou vermes de cabeça espinhosa (Acanthocephala). Muitos desses parasitas têm sido documentados como causas de morbidade e mortalidade em aves e mamíferos silvestres1,2.
A maioria dos helmintos tem ciclos de vida complexos envolvendo mais de um hospedeiro1,2 . Por exemplo, os trematódeos têm um ou dois hospedeiros intermediários (geralmente invertebrados) e um hospedeiro final. Todos os hospedeiros precisam estar disponíveis para que o ciclo seja concluído e, portanto, para que os helmintos adultos estejam presentes nos hospedeiros finais (que são o tópico deste manuscrito). Portanto, é importante ter em mente que podem ocorrer flutuações sazonais na prevalência e intensidade de algumas espécies de helmintos e o monitoramento de longo prazo é desejável para capturar o helmintos completos de auna de um hospedeiro específico.
O método ideal para coletar helmintos é examinar um hospedeiro que foi sacrificado. Isso permite a coleta de helmintos enquanto ainda estão vivos e seu relaxamento e fixação adequados. O material de hospedeiros que estão mortos há mais de 24 horas, ou que foram congelados e descongelados para exame, geralmente é inferior e difícil de identificar. Trematódeos e cestóides de hospedeiros congelados ou formalizados são frequentemente muito contraídos e perderam estruturas cruciais para a identificação, como espinhos orais em trematódeos ou ganchos no escólex de tênias. No entanto, a realidade é que a maior parte do material disponível de hospedeiros vertebrados hoje em dia é congelado ou preservado.
Bancos de dados contendo informações de sequência de DNA para helmintos estão crescendo rapidamente e, portanto, a identificação taxonômica já é possível para muitas espécies. Portanto, os helmintos devem ser preservados para possíveis análises de DNA, tanto quanto possível. No entanto, o DNA de boa qualidade não é possível se as amostras forem fixadas em formalina. Os métodos descritos aqui para coletar e matar helmintos produzirão material adequado para extração de DNA e análises genéticas.
Abaixo, descrevemos métodos detalhados sobre como necropsiar vertebrados (anfíbios, répteis, aves e mamíferos; trematódeos monogênicos de peixes não estão incluídos) para a coleta de helmintos, seguidos de procedimentos sobre como preservá-los e processá-los para identificação taxonômica.
Os animais usados nos experimentos a seguir foram encontrados mortos como atropelamentos.
1. Necropsia Animal e Triagem de Órgãos Principais para Coleta de Helmintos
2. Preservação de helmintos
3. Identificação taxonômica de helmintos
4. Depositário de Helmintos na Coleção Nacional de Parasitas dos EUA
Usando os métodos descritos acima, uma pesquisa dos helmintos do musaranho mascarado, Sorex cinereus, foi realizada no condado de Missoula, Montana, entre 2007-2011. Um total de 56 musaranhos foram coletados de armadilhas de queda e examinados dentro de 2 horas após a morte. A prevalência geral de infecção foi de 96%; apenas 2 musaranhos estavam livres de parasitas. Quinze espécies de helmintos foram identificadas, incluindo 9 espécies de cestóides e 6 espécies de nematóides. Uma espécie do gênero cestódeo Staphylocystoides não foi descrita anteriormente. Os órgãos encontrados infectados incluíram o intestino delgado (9 cestóides, 3 nematóides), estômago (1 nematóide), pulmões (1 nematóide) e bexiga urinária (1 nematóide). As intensidades totais de infecção variaram de 7 a 234 vermes por hospedeiro infectado. A riqueza de espécies (o número de espécies de helmintos por hospedeiro infectado) variou de 1 a 8, com média de 4,1 (Figura 2).

Figura 1. Desenhos e fotografias representativos de grupos de helmintos mostrando as principais características anatômicas de cada filo: A) Trematoda; b) Cestoda; C) Acanthocephala; e D) Nematóide. Para as fotografias, estão incluídas informações sobre o nome científico, órgão e hospedeiro. Trematódeos e cestóides são hermafroditas. Os desenhos não estão necessariamente na mesma escala. Clique aqui para ver a imagem ampliada.

Figura 2. Resumo dos dados preliminares de helmintos de musaranhos mascarados, Sorex cinereus coletados no condado de Missoula, Montana, entre 2007-2011.
Clique aqui para ver a imagem ampliada.
Não temos nada a divulgar
Os animais selvagens são comumente parasitados por uma ampla gama de helmintos. Os quatro principais tipos de helmintos são "lombrigas" (nematóides), "vermes de cabeça espinhosa" (acantocéfalos), "vermes" (trematódeos) e "tênias" (cestóides). Aqui descrevemos como os helmintos são coletados de um animal vertebrado e como eles são preservados e taxonomicamente identificados.
Os autores gostariam de agradecer ao Dr. Joe N. Caudell, biólogo de doenças do Programa de Serviços de Vida Selvagem APHIS do USDA de Indiana na Universidade de Purdue, por fornecer espécimes usados para a coleta de helmintos para a produção deste vídeo. Jennifer Serafin preparou todas as soluções químicas.
| Álcool-Formalina-Ácido Acético (AFA) | Fisher Scientific | A407-1 (etanol) F75F-1GAL (formaldeído) BP2401500 (ácido acético glacial) | Etanol 85% (85 ml) + formaldeído 37% (10 ml) + ácido acético glacial (5 ml) |
| Etanol para abate e preservação a longo prazo | Fisher Scientific | A407-1 | Etanol 100% (70 ml) + água destilada (30 ml) |
| Etanol para fixação e estudos de DNA | Fisher Scientific | AC61511-0010 | Etanol 80-90% (80-90 ml) + água destilada (20-10 ml), respectivamente |
| Tamponado com formalina | Fisher Scientific | SF100-4 | Formalina 10% (10 ml) + água destilada (90 ml) |
| Glicerina-álcool | Fisher Scientific | A407-1 (etanol) AC15365-1000 (glicerina) | Etanol 70% (95 ml) + glicerina (5 ml) |
| Etanol para desidratação durante a coloração | Fisher Scientific | A407-1 | Etanol 80%, 95%, 100% (80 ml, 95 ml, 100 ml) + água destilada (20 ml, 5 ml, 0 ml) |
| Lactofenol | Fisher Scientific | R400-27-Fenol | |
| Fisher Scientific | A931I-1 (fenol) A407-1 (etanol) | Fenol 100% (80 ml) + etanol 100% (20 ml) | |
| Harris' Hematoxilina | Fisher Scientific | S25347 (hematoxilina) A407-1 (etanol) A567-500 (sulfato de alumínio e amônio) S25553 (iodato de sódio) | Hematoxilina (5 g) + etanol 100% (50 ml) + sulfato de alumínio e amônio (100 g) + iodato de sódio (0,37 g) + água destilada (1.000 ml) |
| Semichon' s carmim acético | Fisher Scientific | BP2401500 (ácido acético glacial) S25236 (carmim) A407-1 (etanol) | Ácido acético glacial (100 ml) + carmim (1,5 g) + água destilada (100 ml). Aqueça em banho-maria fervente por 15 min e deixe esfriar. Filtre para fazer a solução estoque. Misture 1:2 com álcool 70% para colorir. |
| Xileno | Fisher Scientific | X4-4 | Use apenas sob um exaustor químico. |
| Salicilato de metila | Fisher Scientific | S25437-Etanol | |
| básico | Fisher Scientific | A407-1 (etanol) S25159A (hidróxido de amônio concentrado) | Etanol 70% (100 ml) + hidróxido de amônio (0,1 ml) |
| Ácido etanol | Fisher Scientific | A407-1 (etanol) SA9233-100 (ácido clorídrico) | Etanol 70% (99,5 ml) + ácido clorídrico (0,5 ml) |
| Bálsamo do Canadá | Fisher Scientific | B10-100 | - |