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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Nós fornecer um protocolo detalhado para a indução de potenciação de longo prazo na região CA1 do hipocampo e o subsequente isolamento de fracções enriquecidas nucleares da área tetanized da fatia. Esta abordagem pode ser utilizada para determinar a actividade da importação nuclear de proteína dependente em modelos celulares de aprendizagem e memória.
Estudar expressão atividade da proteína dependente, translocação subcelular, ou fosforilação é essencial para compreender os mecanismos celulares subjacentes à plasticidade sináptica. A potenciação de longa duração (LTP) e depressão a longo prazo (LTD) induzida em fatias de hipocampo agudas são amplamente aceites como modelos celulares de aprendizagem e memória. Existem inúmeros estudos que utilizam abordagens de imagiologia celular ou imunohistoquímica ao vivo para visualizar a atividade dinâmica de proteínas dependentes. No entanto, estes métodos dependem da adequação de anticorpos para imunocitoquímica ou superexpressão de proteínas marcadas com fluorescência em neurônios individuais. Immunoblotting de proteínas é um método alternativo que oferece confirmação independente dos resultados. O primeiro factor limitativo na preparação de fracções subcelulares de fatias de hipocampo tetanized individuais é a baixa quantidade de material. Em segundo lugar, o procedimento de tratamento é fundamental, porque manipulações muito curtos e menores de lumprir fatias pode induzir a ativação de algumas cascatas de sinalização. Aqui, descrevemos um processo de produção optimizado, a fim de obter uma quantidade suficiente de uma fracção enriquecida nuclear de pureza suficiente da região CA1 do hipocampo agudas fatias de cérebro de rato. Como um exemplo representativo, mostra-se que a ERK1 / 2 forma fosforilada da proteína mensageira synapto nuclear Jacob activamente transloca para o núcleo mediante indução da LTP e pode ser detectada numa fracção enriquecida nuclear de neurónios CA1.
Synaptic N-metil-D-aspartato-receptores (NMDAR) desempenham um papel crucial na plasticidade sináptica e a sobrevivência das células de sinalização enquanto a activação de NMDAR extrasynaptic pode provocar neurodegeneração e morte celular. Essas mudanças dependem de expressão rigidamente controlado gene dependente / atividade regulamentada e, portanto, requerem uma comunicação constante entre sinapses ativadas ou dendritos e do núcleo 7. O MAP-quinases ERK1 / 2 são efectores a jusante de sinalização de NMDAR sinápticas e são envolvidos na expressão de genes induzidos por NMDAR-activação, enquanto que a sinalização através de NMDAR extrasynaptic não tem ou tem um efeito inibidor sobre a ERK1 / 2 atividade 8,11.
Há um número de proteínas que têm sido mostrados para transporte entre dendritos distais e do núcleo. Muitas destas proteínas conter um sinal de localização nuclear e são activamente transportados ao longo de microtúbulos em uma maneira dependente da dineína e-importin 6,9 para o núcleo. Interestingly, alguns destes mensageiros trânsito apenas para o núcleo, em resposta a estímulos específicos sinápticos. Por exemplo, o transporte retrógrado de elemento de resposta cíclica AMP ligação às proteínas 2 (CREB2) é induzida por LTD química, mas não LTP 12. Localizada estimulação sináptica dependente de NMDAR impulsiona coactivador de transcrição regulada de CREB (CRTC1) para o núcleo, um processo de translocação, que está envolvida na plasticidade do hipocampo a longo prazo 4. Foi demonstrado recentemente que o mensageiro proteína Jacob transloca para o núcleo após tanto, a activação sináptica e extrasynaptic NMDAR e regula CREB gene dependente de transcrição 5. A origem sináptica ou extrasynaptic do sinal é codificado em uma modificação pós-tradução de Jacob. Actividade sináptica induz ERK1 / 2 dependente da fosforilação de serina-Jacob numa cruciais na posição 180 (pJacobS 180), que é um requisito necessário para a subsequente translocação para o núcleo, em cultura primária do hipocampo. Além disso, in neurônios CA1 de fatias de hipocampo agudas pJacobS 180 transloca para o núcleo após Schaffer garantia LTP mas não LTD 1,10. PS180 Jacob leva a um aumento da expressão de genes relacionados com a plasticidade e a expressão do gene realimenta a função sináptica. Em nítido contraste, Jacob que transloca para o núcleo após a ativação NMDAR extrasynaptic não é fosforilada na Ser180 e pode estar associada a diferentes complexos proteína no núcleo causando 'CREB desligado' e uma retração de contatos sinápticos 10.
A maioria dos estudos publicados sobre a importação nuclear de synapto-nuclear mensageiro proteína ter sido feito em culturas primárias de neurônios dissociados. Por isso, seria interessante ver se esses resultados podem ser reproduzidos em fisiologicamente mais relevante condições usando fatias de hipocampo onde a conectividade e função neuronal são muito mais bem preservado. Aqui apresentamos um protocolo otimizado para avaliação LTP-dependent translocação nuclear de mensageiros proteicos por imunotransferência. Este método também é adequado para a análise da actividade de fosforilação de proteínas dependentes de uma fracção nuclear em bruto. Especificamente, o protocolo atual envolve a preparação de fatias aguda CA1 do hipocampo, indução e gravação de LTP. Em seguida, a região CA1 é microscopicamente dissecados para isolar a região estimulada. Nós combinamos e modificou o protocolo para o isolamento nuclear fornecido pela CellLytic nuclear Extraction Kit com alterações introduzidas pela Zhao e seus colegas 17. O procedimento optimizado inclui a lise das regiões CA1 dissecados em tampão hipotónico permitindo inchaço celular e a libertação de núcleos. A lise celular e morfologia de núcleos pode ser determinado por exame microscópico. Enriquecimento nuclear é conseguida por um passo de centrifugação curta. Immunoblotting análise com anticorpos contra NeuN e NSE2, marcadores específicos de fracções nucleares ou citosólicas, indica que esta abordagem pode ser usada como um rápidoe protocolo reprodutível para isolar essas frações subcelulares e estudar modificações pós-tradução muito instáveis, como a fosforilação de proteínas. Além disso, este método é vantajoso para pequenas amostras de tecido derivadas de regiões CA1 dissecados de fatias do hipocampo e pode ser usado em combinação com imuno-histoquímica de fatias do hipocampo.
1 Preparação de Agudo fatias do hipocampo de ratos adultos Cérebro
2. posicionamento dos eletrodos, Base de gravação, e indução de LTP
3 Coleção de fatias após a indução da LTP e snap Congelamento
4 Isolamento de fracções nucleares enriquecidos a partir da região CA1 do hipocampo
5. Immunoblotting semiquantitativa de proteínas nucleares Synapto
Análise de Dados 6.
| Nome do buffer | Reagente | Concentração (mM) | Valor | Comentários / Descrição |
| Solução de Gey (pH: 7,3 ~ 7,4) | NaCl | 130 | 7,6 g | filtração estéril |
| 1000 ml | KCl | 4.9 | 0,37 g | |
| CaCl 2 2H 2 O | 1.5 | 0,22 g | ||
| MgSO 4 2H 2 O | 0,3 | 0,0739 g | ||
| MgCl2 · 6H 2 O | 11 | 2,24 g | ||
| KH 2 PO 4 | 0,23 | 0,0313 g | ||
| Na 2 HPO 4 · 7H 2 O | 0,8 | 0,2145 g | ||
| Glicose · H2O | 5 | 0,9909 g | ||
| HEPES | 25 | 5,96 g | ||
| NaHCO3 | 22 | 1,85 g | ||
| ACSF (pH: 7,3 ~ 7,4) | NaCl | 110 | 6,428 g | filtração estéril |
| 1000 ml | KCl | 2,5 | 0,1865 g | |
| CaCl 2 2H 2 O | 2,5 | 0,368 g | ||
| MgSO 4 2H 2 O | 1.5 | 0.370 g | ||
| KH 2 PO 4 | 1,24 | 0,169 g | ||
| Glicose · H2O | 10 | 1,9817 g | ||
| NaHCO3 | 27.4 | 2,3 g | ||
| 1x tampão hipotónico (pH: 7.9) | HEPES | 10 | 0,23 g | |
| 100 ml | MgCl2 · 6H 2 O | 1.5 | 0,0304 g | |
| KCl | 10 | 0,07455 g |
Tabela 1 Os tampões.
Nós já anteriormente demonstrado que a proteína mensageira synapto nuclear Jacob acumula no núcleo após a indução da LTP, mas não LTD 1. Além disso, a translocação de Jacob após estimulação sináptica requer a activação de MAPK ERK1 / 2 e a fosforilação de Jacob em Ser180 (Figura 1). Fosforilada Jacob transloca para o núcleo de uma forma dependente da importin e o estado fosforilado pode ser conservada durante períodos de tempo prolongados, por associação com o filamento intermediário αinternexin 15 (Figura 1). O estado de fosfo-de Jacob é importante para a expressão de genes dependentes da actividade e sobrevivência celular. Curiosamente, a activação de NMDAR extrasynaptic também impulsiona Jacob para o núcleo, mas, neste caso, Jacob não é fosforilada em Ser180 e a sua acumulação nuclear induz CREB 'desligado' 5,10. Os resultados descritos acima foram obtidos por Protocols estabelecidos no nosso estudo recente (ver Karpova et al. 10 para uma descrição detalhada do modelo).
Para provar que Jacob transloca para o núcleo, após a indução da LTP, que induzida e medida da indução de Schaffer colateral fEPSP potenciação em fatias de hipocampo agudas e subsequentemente isolado a partir de núcleos neuronais neurónios CA1 (Figuras 2 e 3). Foram comparados dois pontos de tempo diferentes após a aplicação de estimulação de alta frequência (2 min e 30 min) e registada a indução da LTP para cada fatia que foi processada posteriormente para isolamento nuclear e de Western Blot (figuras 2 e 3). Enriquecimento do marcador nuclear NeuN neuronal pode ser visto na fracção enriquecida nucleares preparados a partir da região CA1 dissecados, enquanto enolase2 específico citosólica marcador de neurónios (NSE) é na sua maioria presentes na fracção do sobrenadante obtido após a centrifugação da c lisadasells (Figura 4A). A especificidade do anticorpo PS180 Jacob tem sido caracterizada anteriormente (ver pormenores Karpova et al. 10). níveis PS180 Jacob permaneceu inalterado no total de homogeneizados de proteína CA1 e no nuclear enriquecido fração 2 min depois tetanização (Figura 4B), mas encontramos um aumento significativo na pJacobS 180 imunorreatividade 30 min após a indução da LTP (Figura 4C), confirmando que Jacob translocação para o núcleo, neste modelo de plasticidade celular é fosforilada em Ser180.

Figura 1 Jacó fosforilada no S180 codifica a origem sináptica dos sinais NMDAR. Estimulação Tetânica do hipocampo Schaffer fibras colaterais resulta em ativação de NMDAR sinápticas e consequente ativação de MAPKERK1 / 2 cascata de sinalização. Activado ERK1 / 2 e liga-se a fosforila Jacob na serina 180 e complexo de Jacob-ERK1 / 2, transloca-se para o núcleo e isto correlaciona-se com a actividade aumentada de CREB e activação da expressão do gene relacionado com a plasticidade.

Figura 2 Equipamentos e ferramentas utilizados para a indução da LTP e dissecando região CA1 de fatias de hipocampo. A) Vibratome utilizado para a preparação de fatias de hipocampo agudas (1 - Vibratome) B1-2) Eletrofisiologia e configuração de imagem (2 - Microscópio; 3 - Micromanipulator e sistema de perfusão; 4 - Recodificação eletrodo; 5 - eletrodo de estimulação; 6 - Água objectiva de ; 7 - titular fatia com fatia hipocampal) C) Os equipamentos utilizados para a dissecção da região CA1 de fatias de hipocampo (8 Stereomicroscope; 9 - seringa de insulina com agulhas; 10 - Pequenas tesoura cirúrgica; 11 - bisturi; 12 - Plastic pipeta Pasteur, 13 - espátula fina; 14-100 mm placa de cultura de plástico cheio de água gelada, e 40 milímetros cultura plástico prato usado para dissecção de fatias.

Demonstrando Figura 3 dos desenhos animados do procedimento experimental. Números indicam passos no protocolo. 2,1-2,8) Uma fatia do hipocampo aguda na câmara submersa com eletrodos de vidro colocados no estrato radiante para potenciação de Schaffer garantia-CA1 sinapses. A inserção representa os traços analógicos amostra fEPSP, a barra horizontal indica 5 ms ea barra vertical indica 0,5 mV. 3.3) Os cortes foram recolhidos em tubos de 1,5 ml depoisGravação LTP e congeladas rapidamente. 4.3) A dissecção da região CA1 de fatias do hipocampo de ratos adultos. 4,4-4,5) regiões CA1 homogeneizado em tampão de lise hipotónico, o que faz com que o inchaço osmótico das células e libertação de núcleos. 4.8) A centrifugação dos lisados a 11000 rpm durante 1 min. 4.10) A recolha das fracções enriquecidas citoplasmáticos e nucleares para immunoblotting. 5.3) O carregamento de frações enriquecidas citoplasmáticos e nucleares em SDS-PAGE e posterior padrão western-blotting.

Figura 4 Indução de CA1 LTP leva à acumulação de pJacS180 no núcleo. A) para Immunoblot homogeneizado, citosólica e fracções enriquecidas nucleares de CA1 lisado sondado com citosólica e marcadores nucleares. B) Análise de imunotransferência de nível pJac-S180 em homogeneizado de 2 min e 30 min após a inducção de tetanização. C) Análise de Imunoblot de nível pJacS180 em nuclear enriquecido fração 2 min e min após tetanização. Estes resultados fazem parte do gráfico de quantificação publicada em 10 Karpova et al. Estes imunotransfer�cias representativos não estão incluídos no à publicação original.
Os autores não têm nada a divulgar.
Nós fornecer um protocolo detalhado para a indução de potenciação de longo prazo na região CA1 do hipocampo e o subsequente isolamento de fracções enriquecidas nucleares da área tetanized da fatia. Esta abordagem pode ser utilizada para determinar a actividade da importação nuclear de proteína dependente em modelos celulares de aprendizagem e memória.
Este trabalho foi financiado pela DFG (SFB 779 TPB8, Kr1879/3-1 MRK), bolsa DIP (MRK), EU FP7 MC-ITN NPlast (MRK), Centro de Ciências Comportamentais do Cérebro (CBBS, Sahsen-Anhalt), (AK e SB), MM é um beneficiário da Bolsa de Longo Prazo da Organização Europeia de Biologia Molecular (EMBO) (EMBO ALTF 884-2011) e Marie-Curie IEF.
| Equipment | |||
| CED 1401 AD/DA converter | Cambridge Electronics Design, UK | ||
| a href="http://www.iciba.com/stereomicroscope">Stereomicroscope | Leica S4E, Alemanha | ||
| Vibrotome | Leica VT1000S, Alemanha | ||
| Estimulador de pulso isolado | A-M Sistemas, EUA | Modelo 2100 | |
| Centrífuga | Thermo Scientific | ||
| Sistema SDS-PAGE | Biorad | ||
| Cooler | Julabo | ||
| Microscópio de campo brilhante | Nikon Eclipse TS100 | ||
| Incubadora de cultura de células | Thermo Electron Corporation | ||
| Micromanipulador | Luigs & Neumann, SM-5, Alemanha | ||
| Câmara de mancha e fornecedor de energia elétrica | Hoefer Scientific Instruments, San Francisco, CA | ||
| Câmara de gravação do tipo submerso | em | ||
| forma de U feito sob medida e incubadora do tipo submerso | Tesoura cirúrgica pequena feita sob medida | ||
| Bisturi | |||
| Espátula | fina | ||
| de plástico Pasteur Prato | |||
| de cultura de plástico | |||
| Seringa | |||
| de Bunsen | Reagents | ||
| NaCl | Roth | Art.-Nr.3957.1 | ≥ 99,5%, p.a., ACS, ISO |
| KCl | Roth | Art.-Nr.6781.1 | ≥ 99,5%, a.a., ACS, ISO |
| CaCl2· 2H2O | Merck | 1.02382.0500 | pro análise |
| MgSO4· 2H2O | Merck | 5886.05 | pro análise |
| MgCl2· 6H2O | Aplicação | CAS-NO: 7791-18-6; EC-NO: 2320946 | para biologia molecular |
| KH2< / sub>PO4< / sub> | Merck | 12034.025 | para biologia molecular |
| Na2< / sub>HPO4< / sub>· 2H2O | Merck | 1.06574.1000 | extra pure |
| Glucose· H2O | Roth | Art.-Nr.6887.1 | para biologia molecular |
| HEPES | Roth | Art.-Nr.9105.4 | PUFFERAN, ≥ 99,5%, a.a. |
| NaHCO3 | Merck | 1.06329.1000 | pro análise |
| Coquetel de inibidores de protease | Roche | ||
| Phosphostop | Roche | ||
| Bicuculline | Tocris Bioscience | ||
| Isoflurano | Baxter | ||
| Anticorpos | |||
| Anticorpos primários | Número de catálogo da | empresa | Espécie |
| pJac-s180 | Biogenes | coelho (diluído 1:100) | |
| NeuN | Milipore | MAB377 | camundongo (diluído 1:1.000) |
| NSE | Cell Signaling | D20H2 | coelho (diluído 1:1.000) |
| Beta-actina | Sigma | A-5441 | camundongo (diluído 1:5.000) |
| Anticorpos secundários | Número de catálogo | da empresa | |
| Espécie IgG HRP conjugado | DAKO | cabra anti-rato (1:5,000) | |
| IgG HRP conjugado | NEB | cabra anti-coelho (1:5,000) | |