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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Um método de genética reversa adaptável para peixe-zebra para avaliar a função do gene em fases posteriores do desenvolvimento e homeostase fisiológica, como a regeneração do tecido usando injeções intraventricular de morpholinos gene-específicos.
O peixe-zebra é um modelo importante para entender a biologia celular e molecular do órgão e regeneração apêndice. Contudo, as estratégias moleculares para empregar genética reversa ainda não foram adequadamente desenvolvidos para avaliar a função do gene em regeneração ou homeostase do tecido durante a fase larval após embriogênese peixe-zebra, e vários tecidos dentro do larva zebrafish são difíceis de atingir. Injecções intraventriculares morpholinos gene-específicos oferecer um método alternativo para a actual incapacidade para alvejar genes genomicamente de peixes-zebra de uma forma temporal controlada nestas fases. Este método permite a completa dispersão e subsequente incorporação da morfolino em diversos tecidos em todo o corpo, incluindo as estruturas que eram anteriormente impossíveis de alcançar, tais como os do caudal das larvas, de uma estrutura, muitas vezes utilizados para pesquisar de forma não invasiva a regeneração do tecido. Vários genes ativados durante a regeneração membrana embrionária larval também são apresent na regeneração de tecidos adultos de vertebrados, de modo a larva é um modelo útil para compreender a regeneração em adultos. Este método de dispersão morfolino permite a identificação rápida e fácil dos genes necessários para a regeneração dos tecidos das larvas, bem como outros fenómenos fisiológicos que regulam a homeostase do tecido após a embriogénese. Portanto, este método de entrega fornece uma estratégia atualmente necessário para controle temporal para a avaliação da função do gene após a embriogênese.
A regeneração de órgãos e apêndices é de fundamental importância para a sobrevivência e fitness; no entanto, vários vertebrados, incluindo o homem limitaram capacidades regenerativas. Embora existam vários modelos animais que têm ampla capacidade regenerativa, inverter técnicas genéticas para avaliar a função do gene durante o órgão e regeneração apêndice continuam a ser muito limitada ou inexistente. Por conseguinte, novas abordagens são necessárias para dissecar a biologia molecular de regeneração nestes organismos modelo.
O peixe-zebra é um modelo bem estabelecido para a compreensão da biologia celular e molecular do órgão e regeneração apêndice 1, não só devido à sua significativa capacidade de regenerar vários órgãos, tecidos e apêndices, mas também porque existem várias linhas de peixes transgênicos para rastrear células e para sobre-expressar genes constrói 2, 3. No entanto, a inibição do gene em peixes-zebra larval é limitada principalmente ao overexpression de construções dominantes-negativas, que não estão disponíveis para todos os genes de interesse ou cujo produto transgene pode adquirir efeitos ganho de função que não refletem a atividade endógena do gene. Assim, um método alternativo para remover especificamente expressão gênica por nocaute ou nocaute é necessária para superar esses problemas.
Específica do gene alvo usando TALENS existe como um meio genéticos reversa para nocautear a função do gene; no entanto, esta estratégia de nocaute é muito frequentemente limitado a avaliação funcional durante a embriogênese cedo, porque os requisitos iniciais do gene impedir a progressão do desenvolvimento embrionário. Assim, o estudo de fenômenos posteriores, como a regeneração ou a homeostase do órgão após o desenvolvimento usando TALENS é impedida 4, 5. Portanto, uma estratégia alternativa de remoção de gene é necessário que atinge a função do gene após o desenvolvimento cedo para avaliar os requisitos de genes em órgãos e estruturas totalmente formados.
Morfolino injecção foi demonstrado ser eficaz no direccionamento de genes em alguns órgãos adultos e adultos regenerar barbatana 6-8, mas estes métodos requerem a electroporação e muitos órgãos internos são difíceis para electroporar, quer devido à sua localização, ou devido à sua sensibilidade à eléctrica perturbação. Além disso, alguns tecidos, em que a larva são difíceis de administrar directamente, devido à injecção directa pode perturbar a sua integridade estrutural ou porque o seu tamanho é limitante. O caudal da larva é uma estrutura deste tipo, porque a injecção directa na membrana embrionária não é possível. Assim, foi necessária uma alternativa para eletroporação e injeção direta para atingir genes em tecidos que são demasiado pequenos para injetar ou não pode ser eletroporados.A fim de orientar e inibir a função de genes específicos durante a regeneração da nadadeira caudal larval, modificamos tecnologias morpholino existentes permitindo a umAVALIAÇÃO da função do gene durante a regeneração da nadadeira caudal em larva late-encenado. Este método emprega entrega intraventricular 9 de fluoresceína-marcado morpholinos juntamente com Endo-Porter reagente de transfecção 10. Uma vez no interior do ventrículo, a mistura de morfolino-Endo-Porter espalha-se rapidamente por toda a larva através da vasculatura e entra tecidos que tenham sido previamente impossível de atingir. Este método de injecção pode ser modificado para alvejar genes em tecidos específicos e, possivelmente, pode ser aplicado em outros modelos animais, que não têm ainda métodos de genética inversa para inibir a função do gene. Assim, oferece um método rápido e fácil com o potencial para uso amplo leque de estudar imediatamente a função do gene durante a homeostase órgão geral e regeneração em estágios larvais.
1. Preparação das agulhas de vidro (Figura 1)
2. Preparção da Solução Morfolino
3. Preparação de Injecção Morfolino (Figura 2)
4. Injecções (Figura 3)
5. Análises de injecções (Figura 4)
6. Avaliação da Regenerativa Conseqüência
O forte, agulha de injeção chanfrado é facilmente colocado no ventrículo cardíaco da larva zebrafish quando foi abordado dorsal (Figura 3A). O coração continua a bombear e o fluxo de sangue é mantido apesar da presença da agulha (figuras 3B e 3C). Injeções cuidadosas não perturbar a morfologia do ventrículo ou contrações cardíacas (Figura 3D), apesar de a injeção do morfolino para o coração (Figura 3E).
Dentro de minutos, a solução de morfolino-Endo-Porter distribui por todo o organismo através da vasculatura (Figuras 4A e 4B). O morfolino é então distribuída a partir da vasculatura em diferentes tecidos, como a membrana embrionária e no cérebro durante pelo menos 12 horas ou mais, tal como observado a partir da fluorescência (Figura 4C).
Nesta abordagem, nós removemos a ponta distal do the membrana embrionária, a ponta distal da medula espinal, músculo tronco distal, distal da notocorda e células de pigmento (figuras 4D e 4H); todos os quais são difíceis de alvejar especificamente por injecção directa, devido à compactação (músculo), tamanho pequeno (medula espinhal e notocorda) e magreza (membrana embrionária), mas parecem incorporar o morfolino após injeções ventriculares de série, que é visto por fluorescência dentro destes tecidos (Figura 4E) em comparação com os animais uninjected (Figuras 4F e 4G). Assim, este método de forma relativamente fácil promove a entrega de morfolino para tecidos que são difíceis de atingir de forma individual, e que permite a avaliação da função de genes em vários tecidos do fin regenerador de uma só vez. Para avaliar a importância de genes específicos envolvidos na regeneração, um amputa cirurgicamente parte da nadadeira caudal larval (Figura 4H), ressecção de todos os tecidos que têm incorp orated o morfolino (Figura 4I). A membrana embrionária larval regenera sua estrutura dentro de alguns dias após a amputação (dpa) (Figura 4J). Morfolino segmentação um gene necessário para a regeneração (dados não publicados) resulta em uma resposta regenerativa perturbado (Figura 4K) em comparação com não injectada (Figura 4J) e controlos morfolino desadaptação (Figura 4D). O efeito total desses experimentos morpholino em conseqüência regenerativa pode ser medida usando ferramentas morfométricas padrão nos programas Fiji publicamente disponíveis 12 traçando os tecidos regenerados e comparando as áreas (Figuras 4J-4D). Assim, este método de direccionamento de genes proporciona um ensaio rápido e relativamente fácil de testar a importância dos genes no processo de regeneração.
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Figura 1. Preparação de agulhas capilares de vidro para injeção. A) tubo capilar de vidro antes de puxar (acima) e puxou agulha (abaixo). B) aparelho puxando Needle. C) Torno para chanfro e afiar a agulha de vidro. A agulha é vista através dos binóculos. D) O torno é um disco giratório de borracha molhada. A agulha é lentamente baixado sobre o disco. E) afiado da agulha devem ter uma curta de bisel que há mais tempo (20 mm) do que a largura (20 mm) para minimizar o espaço necessário para inserir toda a extremidade da agulha no cardíaca larval ventrículo. F) imagem ampliação superior que mostra a ponta da agulha. G) Vista esquemática da ponta de agulha, mostrando a forma de o chanfro após afiar.
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Aparelho de injeção Figura 2. Configurar. A) Equipamento completo para injeção de morfolina em larva de peixe-zebra. B) Suporte para controlar o posicionamento da agulha durante as injeções. C) A bomba de pico que regula a pressão pneumática para injectáveis. D) Forma de imprensa usado para criar o molde de agarose. E) molde de agarose usado para estabilizar larva injectável.

Figura 3. Injeção de larva de peixe. A) de posicionamento da agulha em relação a larvas de peixe-zebra. B) Inserção no ventrículo cardíaco. C) da fluorescência do morfolino na agulha, mas ausente no ventrículo antes injectiem. D) imagem de campo claro mostra a relação entre o tamanho da agulha de vidro e o ventrículo larval E) Injecção da morfolino fluorescente no ventrículo do coração.. As barras de escala igual a 100 um.

Figura 4. Dispersão de morfolino em todo peixe. A) 3 dias de idade Zebrafish larva. B) Fluorescência de morfolino em todo o sistema vascular do corpo (v) 5 minutos após a injecção ventricular. C) Dispersão do morfolino em todo o animal, incluindo membrana embrionária (ff) marcado com fluoresceína, o cérebro (b) em idosos larva após injeções de morfolino a cada 12 horas D) tecidos na nadadeira caudal larval e tronco:.. notocorda (n), medula espinhal (sc), pigmento (p), e membrana embrionária (ff) E) Dispersos morfolinovários minutos após a injeção em tecidos larvais tronco, incluindo a membrana embrionária imagem Brightfield de tronco larval uninjected e nadadeira caudal. F). A linha tracejada indica o plano de amputação em potencial. G) fin uninjected fotografada com o filtro GFP mostrando autofluorescência em verde (setas). A forma dendrítica das estruturas fluorescentes sugere que estas são as células de pigmento. H) imagem de campo claro de um caudal de larvas amputado cirurgicamente através do notocórdio, músculo e da medula espinhal. Eu) imagem fluorescente, mostrando a distribuição nos tecidos morfolino coto. Morfolino incorporação no músculo, medula espinhal, notocorda e membrana embrionária. J) regenerada estruturas membrana embrionária caudais do tipo selvagem larva. Linha preta traça os tecidos regenerados para a análise de quantificação. K) inibição Morfolino mediada de regeneração. Linha de traçado Preto destaca claramente a redução re regeneraçãoposta depois knockdown morfolino. L) regenerada membrana embrionária caudal de larva injetado com uma morfolino controle incompatibilidade mostrando uma resposta regeneração semelhante à de larva não injectado (J). As barras de escala igual a 100 um.
Os autores não têm nada a revelar.
Um método de genética reversa adaptável para peixe-zebra para avaliar a função do gene em fases posteriores do desenvolvimento e homeostase fisiológica, como a regeneração do tecido usando injeções intraventricular de morpholinos gene-específicos.
Este trabalho foi apoiado pelo Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG), queremos agradecer Ayele Tsedeke Taddese para suporte técnico.
| Morfolino com 3&agudo; etiqueta de fluoresceína | Gene Tools Inc. | Personalizado Mais | informações em www.gene-tools.com |
| Endo-Porter | Gene Tools Inc. | Mais informações em www.gene-tools.com | |
| Agarose | Serva | 120623 | Para derramar placas para colocar o peixe durante injeções e imagens Tricaína |
| (L-Etil-m-amino-benzato-metano sulfonato) | Applichem | Para anestesia | |
| E3 meio (5 mM NaCl; 0,17 mM KCl; 0,33 mM CaCl2; 0,33 mM MgSO4) | Para criação de larvas | ||
| Placas de Petri | Sarstedt | 821.472 | Para colocar o peixe durante injeções e imagens |
| de capilares de vidro de parede fina | World Precision Instruments, Inc. | TW100F-3 | Para preparar agulhas de injeção |
| Pontas de pipeta Microloader | Eppendorf | 5,242,956,003 | Para carregar a agulha |
| Pipetas Pasteur (3 ml/1 ml) | Marca | 747760/ 74775 | Para transferência de larva |
| Extrator de agulha flamejante/marrom | Sutter | Mais informações em www.sutter.com | |
| Relojoeiro (Dumont) Pinças (tamanho 5) | World Precision Instrumentos, Inc. | 501985 | Para frear a agulha antes de afiar |
| Microscópio de dissecação | Olympus, Leica, Zeiss | Varia de acordo com o fabricante | Parte de toda a configuração de injeção |
| Câmera de fluorescência | Olympus, Leica, Zeiss | Varia de acordo com o fabricante | Para obter imagens da fluorescência após a injeção |
| Kit PicoNozzle (suporte de microinjetor) | World Precision Instruments | 5430-12 | Para microinjeções |
| PicoPump pneumático (microinjetor) | World Precision Instruments | SYS-PV820 | para microinjeções |