Aparecimento de células imediatamente após o plaqueamento e após a totalização
Imediatamente após o plaqueamento, pode-se observar a presença de células individuais dentro de cada poço da placa de 96 poços com um padrão invertido microscópio de cultura de tecidos (Figura 1B). Dentro de 8 horas de cultivo, estas células vão ter começado a descer para o fundo do poço devida à gravidade e começaram a fundir-se em aglomerados discretos (Figura 1C). Após 24 h, as células de coalescência terá completado a agregação primária, e vai ter compactado em bem definidas, ainda agregados irregulares onde as células individuais são indistintos uma da outra (Figura 1D). Até ao final do segundo dia (48 horas), os agregados devem olhar 'clean', depois de ter tomado todas as células dentro do poço (Figura 1E); o fundo da cavidade pode ter algumas células que foram expelidas do agregado neste estágio. Fornecimentoque os agregados foram agregadas em N2B27, neste ponto em tempo, eles devem ser de forma esférica, cerca de 150-200 um de diâmetro e movendo-se livremente no interior da cavidade (isto é., não aderiram ao fundo dos poços). Agregação em outros meios (ou seja., ESLIF N2B27 ou com factores específicos) tem o potencial de alterar tanto a morfologia dos agregados inicial e a resposta a estímulos subsequentes (Turner et ai., Em preparação).
Representante Alterações Morfológicas
A adição de um pulso de 24 horas de forma secundária Chi contendo entre 48 e 72 horas (Figura 1A, 5A) gera bem definido agregados alongados polarizado que mostram a expressão dos marcadores específicos das camadas germinativas 19,21. Imediatamente após o pulso de Chi (72 h), os agregados começam a verter e as células começam a mostrar a sua resposta a estes sinais para o fim deste dia (Figura 3A). Estas respostasmanifestam-se por alterações na expressão génica e na morfologia, ambos os quais são dependentes do tratamento que os agregados têm recebido após o período inicial de 48 horas na agregação N2B27 (Figura 3B). Se é necessário apenas uma análise de ponto de extremidade, o momento ideal para a imagem dos agregados é de cerca de 96-120 horas. Neste ponto, os agregados terão desenvolvido morfologias cristalinas e padrões de expressão de gene (Figura 3A), e o seu tamanho e massa são ainda suficientemente baixo de modo que a expulsão de forma de P200 pipeta é suficiente para desalojar quaisquer que possam estar conectados. A falta de impedir a fixação do agregado para o poço vai afectar adversamente a formação de agregados (Figura 5Biv). O padrão dos agregados morfologias e expressão de genes pode ser alterada dependendo do tratamento. Os resultados representativos para regimes sustentados ou pulsados com qualquer tratamento único ou combinações de fatores são mostrados para BMP4, Dorsomorphin H1 (BMP inibidor do receptor), ActivinA, SB43 (Activina / inibidor nodal), bFGF ou PD03 (inibidor MEK) (Figura 3B).
Imagem agregado e Análise de Imagem Quantitative
Agregados são passíveis de imagiologia por qualquer microscopia widefield (principalmente para time-lapse imaging 19), ou fixo e histoquímica para imagem confocal 19,21 (Figura 2). O actual protocolo e imagem descrição acima permite que a informação quantitativa a ser adquirida a partir destes agregados. Seguindo confocal ou de campo amplo de captura de imagem, o comprimento e a expressão do gene correspondente ao longo do diâmetro ou da coluna vertebral do agregado (esférica ou alongada, respectivamente; A Figura 4A, B) pode ser medido. Estas análises também são directamente aplicáveis a imagens de lapso de tempo, onde se pode obter informação da taxa de crescimento, o tamanho eo alongamento dos agregados sob diferentes condições (Figura 4 ).

Figura 1.-curso de tempo típica e início morfologias. (A) O curso de tempo típico para experimentos de agregação. As células são agregadas durante 48 horas em N2B27 contendo uma suspensão de células de rato ES (10 células / mL) em uma placa de 96 poços (P1, P2). (B) Imediatamente após o plaqueamento (t = ~ 5 minutos), as células individuais podem ser visto na suspensão e começaram a formar aglomerados por 8h (C) (D). Depois de 24 horas as células formaram um agregado único em cada cavidade, que é de aproximadamente 100 um de diâmetro. (E) Depois de agregação de 48 h, o agregado diâmetro varia de 150-200 uM. Neste ponto, o meio de agregação (N2B27) é removida e um meio secundário é adicionado, quer durante o resto da experiência (P1 na parte A) ou durante 24 horas antes de ser mudado bACK para N2B27 (p2 em parte A). A barra de escala representa 100 um. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2. agregados montagem sobre lâminas de microscópio. Uma vez que os agregados foram corrigidos, imunocoradas e colocadas em meio de montagem, cada agregado é pipetada sobre uma lâmina de microscópio, como uma gota de 17 ul (A, B, B '). Bastante espaço é deixado entre as gotículas de agregação para evitar a sua fusão. Os espaçadores são feitos com uma fita de dupla face e colocado em cada canto da lâmina de microscópio (A, A ', B). É sobre estes que uma lamela de vidro é colocado. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3. O efeito de diferentes tratamentos sobre a morfologia de células ES agregados. Após 2 dias de N2B27, células ES formaram agregados. A adição de factores específicos, quer como um pulso de 1 dia (A) ou continuamente (B) pode alterar o fenótipo dos agregados com respeito à polaridade da expressão do gene, o potencial de alongamento, ou a sua forma geral. Os exemplos nesta figura são agregados formados a partir de qualquer Bra :: GFP 30 (A) ou Sox1 :: GFP células ES 27 (B) de ratinho fotografadas após 120 h e tratados como indicado. Chi: CHIR 99021 31; SB43: SB 431542 32; DM: DorsomorphinH1 33,34; PD03:. PD0325901 Por favor clique aqui para ver uma versão maior do thé figura.

Figura 4. A análise quantitativa de Agregados. Um agregado típico formado a partir de Bra :: mESCs GFP 25,30 após um pulso de 24 horas de Chi e fotografada a 120 horas. Incorporada da imagem de campo brilhante e canal de GFP é mostrado com a marcação "coluna vertebral" do agregado do ponto A para B (A) A linha segmentada, ao longo do qual a fluorescência e comprimento do agregado pode ser medida (B). O comprimento (C) e «circularidade» (D) a partir de 24 agregados na mesma experiência são mostrados. Descritores de forma, como o arredondamento (D), circularidade, o perímetro ea área pode ser medida usando a Análise de Imagem Cookbook plug-in do software de análise de imagem FIJI 35. A média indicada pela linha horizontal em cada ponto de tempo;barras de erro indicam o desvio padrão; barra de escala em (A) indica 200 um. Como existem diferenças subtis entre linhas de células repórter, espera-se que, após um pulso de Chi, o comprimento máximo e médio arredondamento mínima média dos agregados pode variar. Entre diferentes linhagens celulares, descobrimos que o comprimento máximo médio pode estar dentro da faixa de ~ 400-800 mm e a redondez mínima média entre 0,4 e 0,6. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 5. Exemplos de falhas na formação de agregados. A capacidade de gerar agregados reprodutíveis (A) depende de factores críticos, tais como (Bi) meio secundário fresco e bem misturados, (Bii, BIII) a precisão na contagem do n inicialúmero de células e (Biv), assegurando os agregados não se formam colónias aderentes ie., "acidente" para dentro da superfície do poço. Exemplos típicos dos erros na formação de agregados para cada uma das condições mencionadas (B) são mostrados. Scale-bar, como indicado; veja a tabela de resolução de problemas para obter detalhes (Tabela 1). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Tabela 1. Guia para solução de problemas. Erros típicos associados com o protocolo de agregação são dadas com sugestões para a sua resolução.

Tabela 2. Tabela de linhas celulares testadas para a formação dos aggRegates. Uma série de linhas celulares foram caracterizadas 19,22,27,30,36-40 para a formação de agregados e, embora sejam esperadas diferenças subtis entre linhas de células e foram observados, todas as linhas acima mostram dinâmica semelhantes em termos de alongamento e morfologia. Em termos de expressão do gene, o padrão de expressão é específica para o gene expresso, mas dentro de cada linha celular, o padrão de expressão é geralmente consistente ao longo de um número de passagens. Para consistência, geramos agregados de células que não tenham ultrapassado 15 passagens em cultura.

Tabela 3. Lista de anticorpos representativos utilizados nestes estudos. A selecção dos anticorpos e os factores de diluição utilizados para imunocoloração agregado.