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Garantir o estado nativo da proteína significa atenção especial aos padrões usados e armazenamento da amostra são necessários. Nem todas as técnicas de cromatograf ia ou técnicas de preparação da amostra podem ser empregues. É importante que os tampões utilizados durante toda a preparação da amostra e são desprovidos de cromatografia de quelantes metálicos e utilização tampões que imitam o pH e concentração de sal fisiológico. Outras condições a evitar incluem aquecimento da amostra ou adição de desnaturantes de proteínas (por exemplo, ureia). É crítico para minimizar o número de ciclos de descongelamento congelamento. A capacidade do tampão escolhido para se ligar metais divalentes é também importante e é um motivo que Tris ou tampões de amónio nitrato são escolhidos entre tampões à base de fosfato.
A resolução e baixa capacidade de pico da cromatograf ia de exclusão por tamanho em relação a outras formas de cromatograf ia é uma grande limitação desta técnica. No entanto, a natureza gentil de exclusão de tamanho chromatograPHY é importante para manter o estado nativo da proteína e, assim, conservar as ligações de metal-proteína relativamente fracas. O requisito para manter o estado nativo de proteínas exige uma especial atenção para o tratamento das amostras, incluindo a limitação do número de ciclos de descongelamento congelamento, evitando quelantes de metais (por exemplo, EDTA) ou os seus sais caotrópicos e detergentes.
Esta baixa resolução desta técnica impactos a capacidade de quantificar a quantidade de metal associada a uma proteína específica se for numa amostra complexa como os picos observados irá conter mais do que uma proteína. Portanto, a quantidade de metal determinada usando o pico de integração seria uma indicação da quantidade total de metal associado com todas as proteínas eluindo neste ponto de tempo e não apenas uma proteína específica. A fim de superar esta limitação a proteína de interesse teria que ser ainda purificado sob condições nativas. Isto permitiria a quantificação deo metal associados com esta proteína a ser comunicados com um grau mais elevado de certezas. Outra limitação potencial desta técnica seria a perda de proteína devido a ligação não reversíveis para a coluna. A fim de determinar se isto está a acontecer uma experiência de recuperação deve ser levada a cabo por meio de que a quantidade de proteína eluindo da coluna é analisado para determinar se esta corresponde à quantidade injectada. O mesmo pode ser feito por medição do teor de metal do material de eluição e do material de partida por grandes quantidades de ICP-MS. Coluna de recuperação pode diferir dependendo das condições usadas, mas demonstrou-se que a recuperação completa de proteínas a partir de uma coluna de exclusão por tamanho é possível 9. Assim, é importante verificar se há ou não qualquer perda nas condições de operação que está sendo usado.
As modificações introduzidas no protocolo pode ser relacionada com as normas metaloproteínas que são utilizados, bem como os elementos analisados. O tipo de padrão metaloproteína nósed irá variar de acordo com os elementos que são de interesse. Para elementos, tais como Cu, Fe e Zn proteínas, SOD e ferritina são empregados. Qualquer outro metaloproteína que têm stoichometries conhecidos também pode ser utilizado e alguns exemplos foram mostrados aqui.
Uma das principais complicações que podem surgir de usar esta técnica é a acumulação de cristais de sal na tocha do ICP-MS. Para evitar a acumulação de cristais de sal, o maçarico é lavada com água destilada a cada 500 - 1000 ml de tampão que foi passado através do sistema, ou quando é determinado por inspecção visual que a tocha seja lavada. Outro problema que pode surgir é um declínio mais rápido na limpeza das amostras e extração cones. Estes precisam ser limpos regularmente seguindo os protocolos do fabricante.
A preparação da amostra inicial é a etapa mais crítica no protocolo. Se houver qualquer alteração na proteína - complexo de metal do informação gerado não será válida. Esta é uma das principais limitações da técnica; Além disso, o uso de baixa resolução, coluna de exclusão de tamanho produz uma vista detalhada limitada da verdadeira complexidade de metaloproteínas em biologia.
A técnica aqui descrita permite a expansão do conhecimento do metalloproteome de um organismo. análise de massa só dá uma indicação bruta de mudanças para a quantidade de metal dentro de uma amostra. Além das considerações gerais que precisam de ser tomadas em consideração, esta técnica fornece uma ferramenta que pode ser usada para quantificar a quantidade de metal associados a proteínas, bem como para identificar metaloproteínas que diferem pela comparação dos traços obtidos. A utilização desta técnica pode ser empregue para identificar diferenças entre os estados de doença. As metaloproteínas identificados, em seguida, pode ser investigado para ajudar a determinar o papel que desempenham nos processos de doença. A aplicação de hífen ICP-MS tem um crescimentofuturo para determinar o papel dos fármacos que possuem um heteroátomo, tal como a platina, o iodo ou o cobre como o ICP-MS pode ser utilizada para identificar as proteínas que se ligam a droga.