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Artigo de método

Co-cultura de Vida Microbiome com Intestinal Microengineered Humano Villi num Gut-on-a-Chip Microfluidic Dispositivo

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DOI:

10.3791/54344

30 de agosto de 2016

Neste artigo

Resumo

Descreve-se um protocolo in vitro de co-cultura intestino microbiota e vilosidades intestinais por um período prolongado utilizando um sistema microphysiological intestino humano-on-a-chip.

Resumo

Aqui, descrevemos um protocolo para realizar co-cultura de longo prazo de multi-espécies microbioma intestinal humana com vilosidades intestinais microengineered em um dispositivo microphysiological gut-on-a-chip humano. Nós recapitular a interface tecido intestinal lúmen capilar num dispositivo de microfluidos, onde as deformações mecânicas e fisiológicas fluxo de cisalhamento de fluidos são constantemente aplicada para imitar o peristaltismo. No microcanal lúmen, epiteliais intestinais células Caco-2 humanos são cultivados de modo a formar um epitélio das vilosidades 'livre de germes' e regenerar pequenas vilosidades intestinais. células microbianas cultivadas são pré-inoculado para o lado do lúmen para estabelecer um ecossistema hospedeira-micróbio. Depois de células microbianas aderir à superfície apical das vilosidades, fluxo de fluido e deformações mecânicas são retomadas a produzir um micro-ambiente de estado estacionário na qual meio de cultura fresco é continuamente fornecido e bactérias não ligadas (bem como resíduos bacterianas) são continuamente removidos. Após prolongado co-cultura fdias ROM para semanas, múltiplos microcolônias são encontrados para ser localizado de forma aleatória entre as vilosidades, e tanto as células epiteliais microbiana e permanecer viável e funcional durante pelo menos uma semana de cultura. Nosso protocolo de co-cultura pode ser adaptado para proporcionar uma plataforma versátil para outros ecossistemas hospedeiras-microbiota que pode ser encontrado em vários órgãos humanos, o que pode facilitar o estudo in vitro do papel da microbiota humana na orquestração de saúde e na doença.

Introdução

O intestino humano abriga uma matriz surpreendentemente diversificado de espécies microbianas (<1.000 espécies) e um número enorme de células microbianas (10 vezes mais do que as células hospedeiras humanas) e genes (100 vezes mais do que o genoma humano) 1. Estes microbiomas humanos desempenham um papel fundamental no metabolismo de nutrientes e xenobióticos, regulação das respostas imunitárias, e a manutenção da homeostase intestinal 2. Não é de surpreender, tendo em conta estas diversas funções, o microbioma intestinal comensal extensivamente modula saúde e da doença 3. Assim, a compreensão do papel das interações microbioma intest....

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Protocolo

1. A microfabricação de um dispositivo Gut-on-a-chip

Nota: A a-chip intestino-em-um dispositivo de microfluidos feita por polímero de silicone transparente, permeável ao gás (polidimetilsiloxano, PDMS), contendo dois microcanais paralelas (1 mm de comprimento x largura de 150 um de altura x 1 cm), separadas por uma flexível porosa (10 um de diâmetro de poro, 25 um de poro no espaçamento de poro) PDMS membrana de 5,9. Fabricar o gut-on-a-chip (Figura 1A, esquerda), seguindo os passos indicados.

  1. Microfabricação Processo do 5,9 Gut-on-a-chip.
    1. Prepare PDMS não curado, desgaseificada p....

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Resultados

Para emular o ecossistema hospedeira-microbiota intestinal humano in vitro, que é necessário desenvolver um protocolo experimental para reconstituir a co-cultura estável a longo prazo das bactérias intestinais e as células epiteliais intestinais humanas sob condições fisiológicas, tais como peristalse mecânica semelhante e fluxo de fluido. Aqui, nós utilizamos um microdispositivo biomimético gut-on-a-chip (Figura 1A) para co-cultura de célu.......

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Discussão

Compreender as interacções hospedeiro-microbioma é fundamental para o avanço da medicina; No entanto, os modelos de cultura de células tradicional realizados numa placa de plástico ou de uma placa de estática não suportam a co-cultura estável de células intestinais humanas com micróbios intestinais viver durante mais de 1-2 dias na maior parte porque as células microbianas cobrir as células de mamíferos in vitro. A população microbiana overgrowing rapidamente consome oxigénio e nutrientes, produzindo subsequent.......

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Divulgações

Donald E. Ingber é fundador da Emulate Inc., detém participação acionária na empresa e preside seu Conselho Consultivo Científico. Os outros autores não têm divulgações financeiras.

Agradecimentos

Agradecemos a Sri Kosuri (Instituto Wyss da Universidade de Harvard) por fornecer a cepa de E. coli marcada com GFP. Este trabalho foi apoiado pela Agência de Projetos de Pesquisa Avançada de Defesa sob o Acordo de Cooperação Número W911NF-12-2-0036, Food and Drug Administration sob contrato #HHSF223201310079C e o Instituto Wyss de Engenharia Biologicamente Inspirada da Universidade de Harvard. As visões e conclusões contidas neste documento são de responsabilidade dos autores e não devem ser interpretadas como representando as políticas oficiais, expressas ou implícitas, do Escritório de Pesquisa do Exército, do Laboratório de Pesquisa do Exército, da Food a....

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Meio de Águia Modificado (DMEM) de Dulbecco contendo 25 mM de glicose e 25 mM HEPESGibco10564-011Aqueça-o a 37 ° C em banho-maria.
Caldo Difco Lactobacilli MRSBD288120Execute a autoclave a 121 ° C por 15 min.
Poli(dimetilsiloxano)Dow Corning3097358-100415:1 (p/p), PDMS: agente de cura
Caco-2BBE linha de carcinoma colorretal humanoHarvard Digestive Disease CenterAdenocarcinoma colorretal humano 
FBS inativado por calorGibco10082-14720% (v/v) em DMEM
Penicilina-estreptomicina-glutaminaGibco10378-016diluição de 1/100 em DMEM
4′,6-Diamidino-2-fenilindol dicloridratoSondasmoleculares D1306Coloração de
núcleos Faloidina-CF647 conjugado (25 unidades/ml)Biotium00041Coloração de
Sistema de tensão Flexcell FX-5000Flexcell International CorporationFX5KMovimento de stretcing semelhante ao peristaltismo (10% de tensão celular, frequência de 0,15 Hz)
Microscópio de epifluorescência invertidaZeissAxio Observer Z1Imaging, DIC
Microscópio confocal de varreduraLeicaDMI6000Imaging, Fluorescência
UVO CleanerJelight Company Inc342Ativação superficial do colágeno tipo I do chip intestinal
 GibcoA10483-01Componente de matriz extracelular para cultura de células no chip
MatrigelBD354234Componente de matriz extracelular para cultura de células no chip
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Referências

  1. Turnbaugh, P. J., et al. An obesity-associated gut microbiome with increased capacity for energy harvest. Nature. 444, 1027-1031 (2006).
  2. Tremaroli, V., Backhed, F. Functional interactions between the gut microbiota and host metabolism. Nature. 489

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Reimpressões e permissões

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