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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Descrevemos uma configuração experimental para visualizar com alta resolução sem precedentes a formação e fechamento de fagossomos em três dimensões em macrófagos vivos, usando microscopia de fluorescência de reflexão interna total. Permite o monitoramento da base do copo fagocítico, dos pseudópodes que se estendem, bem como do local preciso da cisão do fagossomo.
A fagocitose é um mecanismo usado por células especializadas para internalizar e eliminar microorganismos ou detritos celulares. Ele se baseia em rearranjos profundos do citoesqueleto de actina que é a força motriz para a extensão da membrana plasmática ao redor da partícula. Além disso, o engolfamento eficiente de material grande depende da exocitose focal dos compartimentos intracelulares. Este processo é altamente dinâmico e vários atores moleculares foram descritos como tendo um papel durante a formação do copo fagocítico. A regulação precisa no tempo e no espaço de todas essas moléculas, no entanto, permanece indefinida. Além disso, a última etapa do fechamento do fagossomo tem sido muito difícil de observar porque a inibição por interferência de RNA ou mutantes negativos dominantes geralmente resulta em formação de copos fagocíticos paralisados.
Montamos uma abordagem experimental dedicada usando microscopia de fluorescência de reflexão interna total (TIRFM) combinada com epifluorescência para monitorar passo a passo a extensão de pseudópodes e suas pontas em um fagossomo crescendo em torno de uma partícula frouxamente ligada a uma lamínula. Este método nos permite observar, com alta resolução, as próprias pontas dos pseudópodes e sua fusão durante o fechamento do fagossomo em células vivas para duas proteínas diferentes marcadas com fluorescência ao mesmo tempo.
Fagocitose é uma função de célula grande que começa com o reconhecimento e ligação de material para a superfície receptores, que depois leva à internalização e degradação do material ingerido. Enquanto eucariotas unicelulares como o Dictyostelium discoideum molde e amebas usar fagocitose para a alimentação de bactérias, organismos superiores evoluíram com células profissionais. Os macrófagos ou células dendríticas são a primeira linha de defesa contra agentes patogénicos em vários tecidos e órgãos, e são cruciais para activar o sistema imunitário adaptativo através de apresentação de antigénio e produção de citocinas 1-4. Sob certas circunstâncias a fagocitose pode ser realizada por células fagocíticas não profissionais, por exemplo, células endoteliais e epiteliais. Este processo é importante para manter a homeostase durante o desenvolvimento e na vida adulta de renovação do tecido normal e de remodelação. fagócitos Finalmente, especializados, tais como células de Sertoli nos testículos ou da retinanas células epiteliais pigmentares são extremamente potentes fagócitos 5.
A formação de um fagossoma onde a degradação de microrganismos ou fragmentos celulares ocorre começa com o agrupamento de receptores fagocíticos na superfície da célula fagocítica. eventos de sinalização a jusante seguintes agrupamento de receptores opsónicos, tais como receptores Fc (FcR) ou receptores de complemento (CRS) têm sido bem caracterizadas. No entanto, também existem numerosas receptores não-opsónicos incluindo receptores semelhantes a Toll (TLRs), lectinas, receptores de manose e receptores scavenger. Estes receptores reconhecem determinantes sobre a superfície das partículas, tais como resíduos de manose ou fucose, fosfatidilserina, e lipopolissacarídeos 1,6-9.
Agente patogénico ou fragmentos de células de reconhecimento envolve a ligação ao agrupamento e de vários tipos de receptores de fagocitária, que, em seguida, conduzir a uma intensa e transiente remodelação da actina. Em exocitose paralelo, focal de compartmen intracelularTS contribui para a libertação da tensão da membrana e é importante para a fagocitose eficiente de grandes partículas. Os eventos de sinalização que levam à deformação de polimerização e membrana actina foram dissecados em modelos experimentais que desencadearam um único receptor fagocítica. Durante a fagocitose FcR-mediada, há intensa polimerização de actina, que é regulada por pequenas GTPases (Rac, Cdc42). Entre os seus efectores a jusante, a proteína síndroma de Wiskott-Aldrich (WASP) conduz à activação da proteína relacionada com a actina 2/3 complexo (Arp2 / 3) que nucleia 1,2,4,10 filamentos de actina. A produção local de fosfatidilinositol-4, 5-bifosfato (PI (4,5) P 2) é crucial para a polimerização de actina inicial que dirige a formação pseudópode. Sua conversão em PI (3,4,5) P 3 é necessário para a extensão pseudopod e fechamento fagossomo 11. Diversas vias de contribuir para o desaparecimento de PI (4,5) P 2. Em primeiro lugar destacamento de fosfatidilinositol kina fosfatoses (PIPKIs) do PI prisões fagosoma (4,5) P 2 síntese. Em segundo lugar, pode ser fosforilada e consumido por PI3K de classe I-quinases (PI3K) e convertido em PI (3,4,5) P 3 12. Um papel para fosfatases e fosfolipases também tem sido implicado em PI (4,5) P 2 hidrólise e remoção de F-actina durante a fagocitose em células de mamífero e em Dictyostelium 13,14. O δ fosfolipase C (PLC) hidrolisa PI (4,5) P 2 em diacilglicerol e fosfato de tris-inositol-1,4,5-. O OCRL PI (4,5) P 2 e PI (3,4,5) P 3 fosfatase (síndrome oculocerebrorrenal de Lowe) também tem sido implicado na formação do fagossoma. formação local preciso da F-actina e sua despolimerização é estreitamente regulada no espaço e no tempo e temos demonstrado que o recrutamento de compartimentos intracelulares é importante para entregar localmente a fosfatase OCRL, contribuindo assim para a despolimerização de actina locais na base do copo fagocitária Os jogadores mecanismo e moleculares necessários para o encerramento fagossomo e cisão da membrana permanecem pouco conhecidos devido às dificuldades em visualizar e monitorar o local de encerramento fagossomo. Até recentemente, a fagocitose foi observado em células fixas ou vivos que internalizam partículas na face dorsal ou em seus lados, tornando a visualização em tempo útil do local de fechamento fagossomo difícil. Além disso, métodos de fixação pode causar retração de membranas e enviesar os resultados na extensão pseudópodos e encerramento. Em contrapartida, o ensaio que criámos e descrever aqui nos permite visualizar a extensão pseudopod ea etapa de encerramento da fagocitose em células vivas 13, com base em microscopia interna total reflexão (TIRFM) 16. Esta técnica utiliza óptica uma onda evanescente para excitar fluoróforos numa zona fina na interface entre um modo transparentetampa (lamela) e um (meio de cultura de células) de líquido. A espessura da profundidade de excitação é de cerca de 100 nm a partir da superfície sólida, permitindo a visualização de eventos moleculares perto da membrana plasmática. TIRFM permite uma elevada relação de sinal-para-fundo, e limita a fluorescência para fora de foco recolhida e a citotoxicidade devido à iluminação de células. Tomando vantagem de TIRFM, foi desenvolvido o "ensaio de encerramento fagossoma" em que lamelas são activados com poli-lisina e, em seguida, revestida com as células vermelhas do sangue de IgG-IgG-opsonizados (SRBCs). Macrófagos que expressam proteínas transitoriamente fluorescente etiquetado de interesse são, então, autorizado a engolir as IgG SRBCs. Enquanto as células separar as partículas que são alvo não-ligado de forma covalente à superfície do vidro, as pontas dos pseudopods podem ser observadas e registadas no modo de TIRF. aquisições TIRF são combinados com aquisições no modo de epifluorescência, após o deslocamento da uM fase 3 acima, o que permite a visualization da base do copo fagocítica. A adição de drogas farmacológicas, tais como os da inibição da actina ou dinamina durante o processo também é possível, para dissecar ainda mais o processo, a nível molecular. O protocolo descrito em pormenor aqui é para uma linha celular de macrófagos de murídeo e RAW264.7 partículas opsonizadas, mas virtualmente, ele pode ser adaptado a qualquer outra célula fagocítica e com outros objectivos, tais como esferas. Este método permitirá uma melhor caracterização da regulação no tempo e no espaço dos jogadores moleculares envolvidos na extensão pseudopod e fechamento fagossoma durante vários processos fagocíticas.
Nota: O plasmídeo utilizado Lifeact-mCherry é um dom tipo de Dr. Guillaume Montagnac, Institut Curie, Paris, gerada após 17.
1. Células e Transfecção
Nota: RAW264.7 de macrófagos são crescidas até à sub-confluência em meio completo (meio RPMI (Roswell Instituto Parque Memorial) 1640, HEPES 10 mM, piruvato de sódio 1 mM, 50 ^ M β-mercaptoetanol, 2 mM de L-glutamina e 10% de FCS ( soro fetal de vitelo)) em uma placa de 100 mm. Eles são transf ectadas com plasmídeos que codificam para proteínas marcadas fluorescentemente por electroporação. Rotineiramente aproximadamente 5-6 x 10 6 células são transfectadas com 20 ug ou 10 ug de plasmídeo para cada transfecção e co-transfecção, respectivamente. Note-se que outros meios de transfecção à base de electroporação ou lipofecção podem ser utilizados como abordagens alternativas.
2. Opsonização de glóbulos vermelhos
Nota: Como um modelo de meta de partículas para os macrófagos, células do sangue ovelhas vermelhas (SRBCs) são utilizados. Normalmente, cerca de 7 x 10 6 SRBCs por 35 milímetros prato fundo de vidro é usado.
3. Revestimento de poli-lisina de lamelas
4. Fixação não-covalente de SRBCs em pratos com fundo de vidro
5. A fagocitose visualizado por TIRFM
O sistema experimental descrito neste manuscrito está esquematicamente representada na Figura 1. Macrófagos RAW264.7 transfectadas que expressam as proteínas de interesse fundida com uma marcação fluorescente são colocados em contacto com glóbulos vermelhos de ovelha IgG-opsonizado (SRBCs) que eram não-covalentemente fixo sobre a lamela. Os macrófagos pode destacar o SRBC da lamela para afundá-lo. O microscópio utilizado TIRF permite a aquisição concomitante de sinais a partir da área de TIRF correspondentes às pontas dos pseudopods e sinais no modo de epifluorescência, após uma mudança de Z 3 um acima.
É essencial para determinar o ângulo crítico para a reflexão interna total de fluorescência, tal como descrito na Figura 2. Isto assegura um sinal TIRF limpa a partir de uma região de 100 nm abaixo da membrana plasmática. A Figura 3 representa o desenvolvimento de acquisitiem parâmetros através de um módulo chamado "Editor do Protocolo" incluído no software vivo Aquisição. Este módulo permite aos usuários criar e gerenciar fluxos de trabalho antes de serem enviados para o microscópio, que irá executar o processo. No final da aquisição, o utilizador recebe um fluxo TIFF.
A Figura 4 mostra, um filme TIRFM ao vivo de células representante de um "ensaio de fechamento fagossomo" em macrófagos RAW264.7 transfectadas com o plasmídeo (por exemplo, Lifeact-mCherry, um presente amável do Dr. Guillaume Montagnac, Institut Curie, Paris, gerado após 17) a seguir a polimerização da actina. Macrófagos transitoriamente plasmídeo expressando foram autorizados a envolver-IgG SRBCs ligados à lamela. À medida que as pontas das pseudopods foram justaposto à lamela de vidro em torno de um SRBC, um anel de F-actina foi detectado na área de TIRF (painel superior) que progressivamente estreitado até fechado. Em paralelo, o obscuro F-actinasinal detectado por epifluorescência, após o deslocamento da fase 3 uM de cima (painel inferior) correspondeu a despolimerização na base do copo fagocitária. Após 3 min de aquisição, a SRBC foi totalmente interiorizado, como confirmado com luz transmitida (painel à direita).
Por conseguinte, este método pode ser usado para distinguir correctamente os acontecimentos moleculares que ocorrem nas próprias extremidades dos pseudopods e os acontecimentos moleculares que ocorrem na base do copo fagocitária.

Figura 1. Representação esquemática do "Ensaio de Encerramento fagossoma" Analisado por TIRFM. O ensaio de encerramento fagossoma é realizada usando macrófagos que expressam transitoriamente um ou dois fluorescentemente marcado com proteína. Os macrófagos são depositados sobre SRBCs IgG-opsonizadas não covalentemente imobilizado no coa poli-lisinated lamelas. As imagens são gravadas no modo TIRF para detectar o local de encerramento fagossomo e em modo de epifluorescência para detectar a base da taça fagocitária. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: Determinação do ângulo crítico para TIRFM. (A) utilizando "aquisição vivo", uma célula que expressa proteínas marcadas fluorescentemente é colocado no meio do campo (uma região em vermelho). Com a opção TIRF Pilha, imagens foram adquiridas em um comprimento de onda de excitação, com ângulos diferentes a partir de 0 ° até 5 °, com um incremento de 0,01 ° (região 2 em vermelho). (B) A sequência de imagens é aberto usando ImageJ software Color Profiler ea intensidade média de fluorescência de aregion de interesse (ROI) é plotado com a função dos ângulos no eixo X usando "Pilhas" e "Plotz eixo perfil" (região 1 em vermelho). (C) A posição x do pico de fluorescência no lote corresponde a o ângulo crítico: 1,98 ° (linha pontilhada preto). Qualquer valor após esse ângulo pode ser usado. Como exemplo, 2,00 ° pode ser escolhido (linha vermelha). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3. Processo de Workflow usando o Live módulo de aquisição: "Editor do Protocolo". (A) Na janela "Editor de Protocolo", uma tela de fluxo de trabalho é criada. (B) Este protocolo compreende um "Loop" de ações que o microscópio irá repetir o número de vezes que decidiupelo utilizador. Como um exemplo: 750 (1). Um ciclo incluiu: "Canais Multi" aquisição com excitação laser de proteínas fluorescentes de interesse no modo TIRF. Como exemplo: laser 491 nm de 50% de intensidade ângulo -TIRF 2,00 (2); "Z move" do objectivo de 3 mm (3); "Canais Multi" aquisição em modo de epifluorescência (4); "Z move" do objectivo de volta para a região do TIRF (5) e um "instantâneo" em luz transmitida (6). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4. F-actina é acumulado como um ponto no local de ensaio de encerramento de fecho fagossoma. Fagossoma foi realizada usando macrófagos RAW264.7 que expressam transitoriamente o plasmídeo Lifeact-mCherry (uma gentil oferta do Dr. Guillaume Montagnac, Institut Curie, Paris, gerada após 17). O sinal de plasmídeo foi adquirida na área TIRF (superior) e no modo de epifluorescência (parte inferior). A seta vermelha indica a acumulação de actina na região de TIRF. Transmitidos imagem luz em 3 min é apresentado, indicando uma SRBC internalizado. Barra de escala, 10 um. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Filme 1: F-actina é acumulada nas pontas do pseudopods e no local da fagossomo Encerramento, enquanto que sejam retirados a partir da Base do ensaio fechamento fagocítica Cup fagossomo foi realizada usando macrófagos RAW264.7 que expressam transitoriamente o plasmídeo.. O plasmídeo de imagem na área TIRF (superior) e no modo de epifluorescência (inferior) utilizando o TIRFM foi realizada alternativaly cada 50 ms durante 3 min a 37 ° C. Por favor clique aqui para ver este vídeo.
Os autores não têm nada a divulgar.
Descrevemos uma configuração experimental para visualizar com alta resolução sem precedentes a formação e fechamento de fagossomos em três dimensões em macrófagos vivos, usando microscopia de fluorescência de reflexão interna total. Permite o monitoramento da base do copo fagocítico, dos pseudópodes que se estendem, bem como do local preciso da cisão do fagossomo.
Agradecemos ao Dr. Alexandre Benmerah (Institut Imagine Necker, Paris, França) pelas discussões iniciais sobre a abordagem experimental e ao Dr. Jamil Jubrail pela leitura do manuscrito. Nadège Kambou e Susanna Borreill são reconhecidas por realizarem experimentos com o método em nosso laboratório. Este trabalho foi apoiado por bolsas do CNRS (Programa ATIP), Ville de Paris e Agence Nationale de la Recherche (2011 BSV3 025 02), Fondation pour la Recherche Médicale (FRM INE20041102865, FRM DEQ20130326518 incluindo uma bolsa de doutorado para FMA) para FN, e Agence Nationale de Recherche sur le SIDA et les hépatites virales" (ANRS), incluindo uma bolsa de doutorado para JM.
| Glóbulos vermelhos anti-ovelha IgG | MP Biomedicals | 55806 | |
| Soro bovino Albumina fração de choque térmico, pH 7, ≥ 98% | Sigma | A7906 | |
| Elevador de células | Corning | 3008 | |
| Cuvetes 4 mm | Projeto de célula | EP104 | |
| DPBS, sem cálcio, sem magnésio | Thermo Fischer Scientific | 14190-094 | |
| Kit de eletrotampão | à temperatura ambienteProjeto | de célulaEB110 | |
| 100 mm TC-Placa de cultura de células tratada com TC | Corning | 353003 | |
| Pulsador de células X Gene | Biorad | 165-2661 | |
| Solução de gentamicina | Sigma | G1397 | |
| Pratos com fundo de vidro 35 mm sem revestimento 1.5 | MatTek corporation | P35G-1.5-14-C Case | |
| iMIC | TILL Photonics | Objetiva de imersão em óleo (N 100X, NA1.49), câmara de aquecimento com CO2, uma câmera de detecção de fóton único EMCCD (Electron Dispositivo de Multiplicação de Carga Acoplada) e uma lente 1.5X | |
| Solução de Poli-L-Lisina 0.1% | Sigma | P8920-100ml | Diluição a 0.01% em água |
| RPMI 1640 médio GLUTAMAX Suplemento | Life technologies | 61870-010 | |
| RPMI 1640 médio, sem vermelho de fenol (10 x 500 ml) | Life technologies | 11835-105 | Quente em 37 ° C banho-maria antes do uso |
| Glóbulos vermelhos de ovelha (SRBCs) | Eurobio | DSGMTN00-0Q | Conservado em tampão Alsever a 4 &graus; C antes de usar |