Protocolos para investigar a dinâmica dos estromos do cloroplasto, os túbulos cheios de estroma que se estendem da superfície dos cloroplastos, são descritos.
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Protocolos para investigar a dinâmica dos estromos do cloroplasto, os túbulos cheios de estroma que se estendem da superfície dos cloroplastos, são descritos.
Stromules, ou "túbulos cheios de estroma", são extensões tubulares estreitas da superfície do cloroplasto que são universalmente observadas em células vegetais, mas cujas funções permanecem misteriosas. Juntamente com a crescente atenção sobre o papel dos cloroplastos na coordenação das respostas das plantas ao estresse, o interesse em estromos e sua relação com a dinâmica de sinalização do cloroplasto aumentou nos últimos anos, auxiliado por avanços na microscopia de fluorescência e fluoróforos de proteínas que permitem uma visualização rápida e precisa da dinâmica do estroma. Aqui, fornecemos protocolos detalhados para testar a frequência do estroma nos cloroplastos epidérmicos de Nicotiana benthamiana, um excelente sistema modelo para investigar a biologia do estroma do cloroplasto. Também fornecemos métodos para visualizar estromos de cloroplastos in vitro extraindo cloroplastos das folhas. Finalmente, delineamos estratégias de amostragem e abordagens estatísticas para analisar as diferenças nas frequências de estromulos em resposta a estímulos, como estresse ambiental, tratamentos químicos ou silenciamento de genes. Os pesquisadores podem usar esses protocolos como ponto de partida para desenvolver novos métodos para experimentos inovadores para explorar como e por que os cloroplastos produzem estromulas.
Os cloroplastos são organelas dinâmicas nas células vegetais responsáveis pela fotossíntese e uma série de outros processos metabólicos. As vias de sinalização do cloroplasto também exercem influência significativa na fisiologia e no desenvolvimento das plantas, coordenando as respostas das plantas ao estresse ambiental, patógenos e até mesmo ao formatodas folhas 1-6. Recentemente, os biólogos ganharam interesse em um aspecto pouco compreendido da estrutura do cloroplasto: estromos, túbulos muito finos cheios de estroma que se estendem da superfície do cloroplasto7.
As funções biológicas dos estromos permanecem desconhecidas, embora se saiba que a frequência dos estromos varia em resposta a estímulos ambientais7-9, e os estromos podem ser capazes de transmitir moléculas de sinalização entre organelas6. Todos os tipos de plastídios (não apenas os cloroplastos verdes e fotossintéticos, mas também leucoplastos transparentes, amiloplastos preenchidos com amido e cromoplastos pigmentados, para citar alguns tipos de plastídios) produzem estromulas, e estromules são encontrados em todas as espécies de plantas terrestres que foram examinadas até o momento. Os estromulos podem se estender e retrair dinamicamente, aparecendo ou desaparecendo em segundos, ou podem permanecer relativamente estacionários por longos períodos. Um dos principais obstáculos enfrentados pelos biólogos de estromos é que os estromos são frequentemente estudados usando métodos, tecidos e espécies dramaticamente diferentes, dificultando as comparações entre a literatura de biologia de estromos. No futuro, práticas padrão e descrições completas dos sistemas experimentais usados para estudar estromules serão essenciais para descobrir a função dessas características onipresentes da morfologia do cloroplasto.
Aqui descrevemos métodos para visualizar a formação de estromos nos cloroplastos epidérmicos das folhas de Nicotiana benthamiana. No mesofilo, os cloroplastos são densamente compactados em grandes células tridimensionais, o que dificulta a visualização precisa e rápida dos estromos por microscopia confocal. Por outro lado, as células epidérmicas são relativamente planas, contêm menos cloroplastos e estão na superfície da folha, permitindo uma visualização fácil e rápida dos estromulas. N. benthamiana é um sistema modelo ideal para esses experimentos porque, ao contrário de muitas espécies de plantas, todas as células da epiderme de N. benthamiana produzem cloroplastos10. Na epiderme da maioria das plantas, incluindo Arabidopsis thaliana, apenas as células-guarda estomáticas possuem cloroplastos, enquanto outras células epidérmicas possuem "leucoplastos", plastídios claros, relativamente amorfos e não fotossintéticos9,11,12. Assim, enquanto um único campo de visão de uma epiderme de A. thaliana pode mostrar apenas um punhado de cloroplastos em um par de células-guarda, um campo de visão de uma epiderme de N. benthamiana incluirá dezenas ou mesmo centenas de cloroplastos. Todos os métodos descritos aqui, no entanto, podem ser modificados para investigar outras questões na biologia do estromule; por exemplo, usamos a mesma abordagem para estudar os estromos leucoplastos de A. thaliana9.
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NOTA: Para este protocolo, temos nos concentrado em ensaio frequência stromule na epiderme de N. deixa benthamiana. Várias linhas transgénicas estáveis foram gerados que pode ser utilizado para este fim, incluindo a 35S PRO: FNRtp: EGFP 13 e NRIP1 Cerulean: 6. Ambas estas linhas mostram a expressão robusta de fluoróforos no estroma do cloroplasto de folhas cultivadas sob uma ampla gama de condições. Alternativamente, fluoróforos segmentados por cloroplastos pode ser transitoriamente expresso em N. benthamiana usando Agrobacterium Transformações 13. Isto é menos do que ideal as linhas transgénicas, dado que as infiltrações de Agrobacterium induzem algumas respostas de defesa basais em N. benthamiana e interacções com Agrobacterium pode alterar a frequência stromule na folha 14, potencialmente complicar a interpretação dos resultados. Finalmente, para visualizar a formação stromule in vitro,cloroplastos pode ser extraído a partir de qualquer espécie de planta, utilizando fluoróforos geneticamente codificados ou um corante fluorescente, tal como descrito na secção 5 abaixo. 9,15
NOTA:. Métodos pormenorizados de cultivo de plantas foram previamente descritos 16 Resumidamente, crescer N. plantas benthamiana em 4 potes "preenchidos com qualquer mistura de solo profissional que fornece uma boa drenagem. Cubra mudas com uma cúpula de plástico transparente para os primeiros 10-14 dias para fornecer um ambiente úmido para a germinação. adicionar qualquer combinação de fertilizantes padrão seguindo as instruções do fabricante para 14- plantas dias de idade. Cultive plantas sob luz branca, usando ~ 100 mol fótons m -2 seg -1 intensidade de luz. As plantas aquáticas regularmente.
1. Preparar as amostras de folhas para visualização
NOTA: dinâmica Stromule são afetados por ferindo 8, então a preparação do tecido deve ser realizada imediatamente antes visualizando stromules por microscopia de fluorescência confocal. Idealmente, uma amostra deve ser visualizado com 15 min após remoção a partir da planta.
2. A visualização Stromules com microscopia de fluorescência confocal
Processamento 3. Imagem
4. Desenho Experimental e Amostragem
NOTA: Stromule frequência é altamente variável entre as folhas, mas vários relatos sugerem que há pouca variação na frequência stromule dentro de uma indivi9,17 dupla folha.
5. Extrair cloroplastos intactos para Visualize Stromule Dynamics
NOTA: Vários métodostêm sido utilizados para isolar os cloroplastos de folhas, incluindo um protocolo ligeiramente diferente num estudo recente sobre a formação in vitro stromule 15. O protocolo detalhado abaixo utiliza um método relativamente simples que não se obter amostras de cloroplastos bioquimicamente puros, mas que em vez disso isolar uma quantidade grande de cloroplastos intactos, 9,18 saudáveis.
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Este protocolo foi usado para visualizar a frequência stromule de dia e à noite nos cotilédones de jovens N. mudas benthamiana. Fatias de uma pilha z foram fundidas em uma única imagem (Figura 1A). Para efeitos visuais, que a imagem foi então Saturado e invertido de modo que o estroma aparece negro (Figura 1B). Os cloroplastos foram marcados quer como não tendo stromules asterisco (verde) ou com pelo menos um stromule (asterisc...
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Ao investigar stromules, três fatores importantes devem ser considerados ao longo de: (i) a manipulação do tecido da planta devem ser mantidos a um mínimo absoluto, (ii) o sistema experimental deve ser mantido consistente, e (iii) estratégias de amostragem devem ser cuidadosamente planejado para assegurar robusto, os dados podem ser reproduzidos são analisados.
Stromules são notavelmente dinâmica: eles podem se estender e retrair rapidamente diante dos olhos de um observador sob o microscópi...
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Os autores não têm nada a divulgar.
J.O.B. e A.M.R. foram apoiados por bolsas de pré-doutorado da National Science Foundation.
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| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| Hepes | Sigma-Aldrich | H3375 | |
| NaOH | Fischer-Scientific | S320-1 | |
| Sorbitol | Sigma-Aldrich | S1876 | |
| EDTA | Fischer-Biotech | BP121 | |
| MnCl2 | Sigma-Aldrich | 221279 | |
| MgCl2 | Sigma-Aldrich | M0250 | |
| KCl | Sigma-Aldrich | P3911 | |
| NaCl | Sigma-Aldrich | S9625 | |
| Microscópio Confocal de Varredura a Laser | Carl Zeiss Inc | Modelo: LSM710 | |
| Diacetato de carboxifluoresceína (CFDA) | Sigma-Aldrich | 21879 | |
| Dimetilsulfóxido (DMSO) | EMD | MX1458-6 | |
| Waring liquidificador | Waring | Modelo: 31BL92 | |
| Fiji | fiji.sc | Software de código aberto para análise de imagens biológicas |
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