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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Drosophila é amplamente usado como um sistema modelo para estudar a neurodegeneração. Este protocolo descreve um método pelo qual a degeneração, como determinado pela formação de vacúolo no cérebro, podem ser quantificados. Ela também minimiza os efeitos devido ao procedimento experimental por meio de processamento e controlo de moscas e de seccionamento experimentais como uma amostra.
doenças neurodegenerativas progressivas como a doença de Alzheimer (AD) ou a doença de Parkinson (DP) é uma ameaça crescente para a saúde humana em todo o mundo. Embora os modelos de mamíferos forneceram importantes insights sobre os mecanismos subjacentes da patogenicidade, a complexidade dos sistemas de mamíferos, juntamente com seus altos custos estão limitando a sua utilização. Portanto, o simples, mas bem estabelecida modelo de sistema de Drosophila fornece uma alternativa para investigar as vias moleculares que são afetados nessas doenças. Além défices comportamentais, doenças neurodegenerativas são caracterizadas por fenótipos histológicos, tais como a morte neuronal e axonopatia. Para quantificar a degeneração neuronal e determinar como ela é afetada por fatores genéticos e ambientais, usamos uma abordagem histológica que é baseado na medição dos vacúolos no cérebro mosca adulta. Para minimizar os efeitos do erro sistemático e comparar diretamente as seções de controle e expmoscas erimental em uma preparação, usamos o método "colar" para cortes de parafina. A neurodegeneração é então avaliada medindo o tamanho e / ou o número de vacúolos que se desenvolveram no cérebro da mosca. Isto pode ser feito concentrando-se em uma região específica de interesse ou analisando todo o cérebro através da obtenção de cortes seriados que se estendem da cabeça completa. Por conseguinte, este método permite um para medir não só a degeneração severa mas também fenótipos relativamente suaves que só são detectáveis em algumas secções, como ocorre durante o envelhecimento normal.
Com o aumento da expectativa de vida, doenças neurodegenerativas, como a doença de Alzheimer ou de Parkinson tornaram-se uma ameaça crescente de saúde para a população em geral. De acordo com os Institutos Nacionais de Saúde, 115 milhões de pessoas em todo o mundo estão previstos para ser afetada pela demência em 2050. Embora um progresso significativo tem sido feito na identificação de genes e fatores de risco envolvidos em pelo menos algumas dessas doenças, para muitos deles, o subjacente mecanismos moleculares ainda são desconhecidos ou não bem compreendida.
Simples organismos modelo de invertebrados como Caenorhabditis elegans e Drosophila melanogaster oferecem uma variedade de vantagens experimentais para estudar os mecanismos de doenças neurodegenerativas, incluindo um ciclo de vida curta, grande número de descendentes, e da disponibilidade de métodos genéticos e moleculares bem estabelecidas e, por vezes únicas 1 -12. Além disso, estes organismos são passíveis de imparcialtelas de interação que podem identificar fatores que contribuem para estas doenças por seus efeitos agravantes ou melhorar em fenótipos neurodegenerativas.
Analisar tais interações genéticas e avaliar os efeitos do envelhecimento requer protocolos quantitativos para detectar neurodegeneração e medir a sua gravidade. Esta avaliação pode ser feita de forma relativamente fácil quando se mede aspectos comportamentais em Drosophila, como a aprendizagem olfactiva, geotaxis negativos, ou fototaxia rápido, que fornecem um valor de desempenho numérico 13-21. É também possível determinar os efeitos sobre a sobrevivência neuronal contando os neurónios. No entanto, isso só é possível quando o foco em uma população específica que é claramente identificável, como os neurónios dopaminérgicos que são afectados na doença de Parkinson, e mesmo assim, os resultados têm sido controversos 22-24.
O protocolo aqui descrito utiliza o método de colar para realizar cortes seriados de parafina, um métodoque foi originalmente desenvolvido por Heisenberg e Böhl, que o usou para isolar mutantes cerebrais anatômicas em Drosophila 25. A utilização do método de colar foi subsequentemente adaptado, incluindo em criocortes, vibratome secções, e secções de plástico 26-28. Aqui, este método é empregue para obter secções em série de toda a cabeça da mosca, que pode então ser utilizado para medir os vacúolos que se desenvolvem em moscas com fenótipos 16,21,29-32 neurodegenerativas. Estas medições podem ser feitas em regiões específicas do cérebro, ou pode cobrir todo o cérebro; esta última abordagem permite um para identificar os fenótipos fracos mesmo degenerativas, como observado durante o envelhecimento. Finalmente, quando se utiliza os colares, até 20 moscas pode ser processada como uma preparação, que não só é menos demorado, mas também permite a análise de controlo e as moscas experimentais na mesma preparação, minimizando artefactos devido a ligeiras alterações na a preparação.
1. Fixação da cabeça em coleiras e inclusão em parafina
Nota: Todos os passos no processo de fixação deve ser feito numa hotte. Metilbenzoato, embora não representam um risco para a saúde, tem um odor altamente distinta, que pode ser avassaladora se não for tratado em um exaustor.
2. corte e montagem
3. fotografando e analisando as Secções
Usando os resultados do método descrito em cortes seriados corados pelo pigmento do olho 33, que abrangem toda a cabeça da mosca. Uma parte desta é mostrado na Figura 1B, em que as secções de uma cabeça individual são mostrados de cima para baixo. As secções de diferentes moscas são vistos esquerda para a direita neste exemplo. Para facilitar a orientação e a identificação das moscas, de uma mosca sem olhos (oculis seno) é inserido como um marcador na posição 3 (seta, Figura 1B).
Para quantificar a neurodegeneração, medimos a formação de vacúolos, que podem ser detectadas nestas secções. Vacúolos são definidos como redonda, manchas escuras que estão dentro do neuropil fluorescente verde (pontas de seta na figura 2 e 3) ou córtex e que são visíveis em pelo menos 2 secções consecutivas do cérebro da mosca. Quantificar neurodegeneração porvacúolos de medição pode ser feito concentrando-se em uma região específica do cérebro ou analisando o cérebro inteiro. Limitando a análise para uma região específica do cérebro é útil nos casos em que uma mutação só afecta uma região específica, como os lóbulos olfactivas na futsch 'OLK mutante 34, mas também pode ser utilizado quando há degeneração severa em todos ou muitos regiões do cérebro. Um exemplo para o último é o mutante de queijo suíço (SWS) (Figura 2), em que todos os vacúolos de medição seria muito demorado. Por isso, teve apenas uma imagem e, para garantir que as medições foram realizadas sempre ao mesmo nível, tomámos todas as imagens ao nível do grande comissura (GC, Figura 2A), que só está contido em uma ou duas secções. Considerando que não se detectou a formação de vacúolo em 1 moscas 'SWS 1 dia de idade (dados não mostrados), um alelo 35 por perda de função, alguns vacúolos estavam i detectável1 moscas n 'SWS 7 dias de idade (setas, Figura 2A). Envelhecimento as moscas a 14 d (Figura 2B) e 21 d (Figura 2C) aumentou ainda mais esse fenótipo, mostrando sua natureza progressiva. Contar o número de vacúolos na neurópilo deutocerebral (DN) usando o método descrito confirmou um aumento significativo no número de vacúolos com a idade. Além disso, a área combinada englobados pela formação de vacúolos foi aumentada significativamente com o envelhecimento (Figura 2D).
No entanto, nem todos os mutantes mostram um fenótipo tão grave como SWS, e nesses casos, as diferenças na degeneração são difíceis de determinar quando o foco sobre uma pequena área. Da mesma forma, a degeneração que ocorre durante o envelhecimento é muito leve (Figura 3A - C) e, por conseguinte, analisamos o cérebro inteiro ao quantificar este fenótipo. Determinando a soma de todos os vacúolos no cérebro revelaramum aumento significativo com a idade, e este foi também o caso quando se mede a área combinada desses vacúolos (Figura 3D).

Figura 1. parafina cortes seriados. A) Usando o método colarinho, moscas experimentais e de controle pode ser processado como uma amostra enfiando-os em um colar. São inseridos sem olhos moscas Oculis seno para orientação (setas). B) Esquema mostrando a orientação das cabeças de mosca no colar. C) Nesta imagem, as secções de diferentes cabeças de mosca são orientados esquerda para a direita no slide. De cima para baixo no slide, cortes seriados da mesma cabeça mosca pode ser visto. Neste caso, uma mosca oculis seno foi inserido na posição três (seta). As secções são coradas pelo pigmento olho fluorescente que lava sobre a seções após o corte. A barra de escala em A = 5 mm e em C = 0,5 mm. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2. Progressive neurodegeneração no mutante Swiss-queijo. Secção da cabeça de parafina a partir de 7 dia- (A), 14-dia-(B) e 21-dia- 'SWS (C) idade 1 moscas. As pontas de seta apontam para vacúolos que se desenvolveram com o envelhecimento. A degeneração relacionada com a idade é quantificada por contagem do número de vacúolos e medição da sua área combinada (D). A MEV e o número de moscas analisadas está indicado. A barra de escala = 25 um. *** P <0,001.csource.jove.com/files/ftp_upload/54809/54809fig2large.jpg "target =" _ blank "> Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3. neurodegeneração ocorre com a idade. Secção da cabeça de parafina de 10-dia-(A), 30-dia-(B) e 60-dia- (C) idade do tipo selvagem moscas. As setas apontam para vacúolos que se desenvolveram em moscas envelhecidas. A degeneração relacionada com a idade é quantificada por contagem do número de vacúolos e medição da sua área combinada (D). A MEV e o número de moscas analisadas está indicado. A barra de escala = 25 um. *** P <0,001. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura. </ A>
Os autores não têm nada para revelar.
Drosophila é amplamente usado como um sistema modelo para estudar a neurodegeneração. Este protocolo descreve um método pelo qual a degeneração, como determinado pela formação de vacúolo no cérebro, podem ser quantificados. Ela também minimiza os efeitos devido ao procedimento experimental por meio de processamento e controlo de moscas e de seccionamento experimentais como uma amostra.
Este trabalho foi apoiado por doações para DK da Medical Research Foundation of Oregon e do NIH / NINDS (NS047663). ES foi apoiado por uma bolsa de treinamento do NIH (T32AG023477).
| Nome do Reagente/Equipamento | Número | deCatálogo | |
| da Empresa Coleira | Genesee Scientific | TS 48-100 | Estamos usando colares personalizados que são feitos de uma peça de metal em vez de camadas como as da Genesee. Uma descrição sobre como fazer coleiras pode ser encontrada em http://flybrain.neurobio.arizona.edu/Flybrain/html/atlas/fluorescent/index.html |
| Bandeja de cubos de gelo de borracha para embutir | Loja | doméstica | O tamanho pode ser feito sob medida, colando em paredes adicionais |
| Prato de cristalização | Fisher Scientific company | 08-762-3 | |
| Éter | Fisher Scientific Company | E138-1 | |
| Etanol | Decon Laboratories Inc. | 2701 | |
| Choloroform | Fisher Scientific Company | C298-500 | |
| Ácido Acético Glacial | Fisher Scientific Company | A38-212 | |
| Metilbenzoato | Fisher Scientific Company | M205-500 | Odor Distinto - Use em capela de exaustão! |
| Cera de Parafina de Baixo Ponto de Fusão | Fisher Scientific Company | T565 | Certifique-se de manter o extra derretido em um 65° C |
| Micrótomo | de Banho de ÁguaLeica Biosystems | Reichert Jung 2040 Autocut | |
| Lâmina de Microscópio | Fisher Scientific Company | 12-550D | |
| Vidro de Cobertura de Microscópio | Fisher Scientific Company | 12-545-M | |
| SafeClear | Fisher Scientific Company | 314-629 | Três recipientes diferentes para lavagens |
| Frasco de Coloração Vertical com Capa | Ted Pella Inc. | 432-1 | |
| Permount | Fisher Scientific Company | SP15-500 | |
| Solução de Poli-L-Lisina (PLL) | Sigma Life Science | P8290-500 |