imagem confocal ao vivo fornece biólogos com uma ferramenta poderosa para estudar o desenvolvimento. Aqui, apresentamos um protocolo detalhado para a imagem confocal ao vivo de desenvolver flores Arabidopsis.
Artigo de método
imagem confocal ao vivo fornece biólogos com uma ferramenta poderosa para estudar o desenvolvimento. Aqui, apresentamos um protocolo detalhado para a imagem confocal ao vivo de desenvolver flores Arabidopsis.
O estudo do crescimento e desenvolvimento das plantas foi confiado por muito tempo em técnicas experimentais utilizando, tecidos fixados mortas e sem resolução celular adequada. Recentes avanços em microscopia confocal, combinados com o desenvolvimento de vários fluoróforos, têm superar esses problemas e abriu a possibilidade de estudar a expressão de vários genes simultaneamente, com uma boa resolução celular, em amostras vivas. imagem confocal ao vivo fornece biólogos de plantas com uma ferramenta poderosa para estudar o desenvolvimento, e tem sido amplamente utilizada para estudar o crescimento das raízes ea formação de órgãos laterais nos flancos do meristema apical atirar. No entanto, ele não tem sido amplamente aplicada ao estudo de desenvolvimento da flor, em parte devido aos desafios que são específicos para imagiologia flores, como as sépalas que crescem sobre o meristema flor, e filtrar a fluorescência dos tecidos subjacentes. Aqui, apresentamos um protocolo detalhado para executar imagem confocal ao vivo em directo, desenvolvendo árabeidopsis botões de flores, utilizando quer uma posição vertical ou um microscópio invertido.
A maioria do corpo planta forma pós-embrionariamente de grupos de células-tronco situados na ou perto da ponta - ou meristemas apicais - dos brotos e raízes. Todas as estruturas acima do solo da planta adulta derivar a partir do meristema apical (SAM), o qual produz continuamente órgãos laterais nos flancos: folhas durante a fase vegetativa, e meristemas de flores (FMS), depois ele passa para a fase de reprodução. FMs, por sua vez desenvolver em flores. Enquanto o SAM Arabidopsis produz órgãos laterais, uma de cada vez, num padrão repetitivo, espiral, o FMS produzir quatro tipos de órgãos florais dentro de quatro espirais, de uma maneira parcialmente síncrono, com vários programas de desenvolvimento desvendar simultaneamente. As redes genéticas subjacentes à especificação da identidade dos diferentes órgãos florais foram parcialmente decifrado (para revisões, ver referências 1, 2), mas muitos aspectos da developme flornt, tal como o posicionamento dos órgãos florais e a definição de limites entre giros, permanecem pouco compreendidos.
Estudos genéticos moleculares iniciais de desenvolvimento da planta confiou na técnicas tais como hibridação in situ e repórteres de GUS para analisar a expressão do gene. Embora estes métodos têm proporcionado uma riqueza de informações e contribuíram muito para a nossa compreensão do crescimento da planta e desenvolvimento da flor, existem limitações importantes: eles não têm boa resolução celular, não permitir a fácil observação do padrão de múltiplos genes expressão na mesma amostras, e mais importante, apenas pode ser aplicado a tecidos mortos, fixos. Recentes avanços em microscopia confocal têm superar essas limitações, e fornecer os biólogos do desenvolvimento com uma ferramenta poderosa para investigar os processos de morfogênese planta subjacente. Em particular, a microscopia confocal permite a observação de tecidos vivos e órgãos ao longo da sua formação, que é critical para compreender plenamente um processo essencialmente dinâmico, como o desenvolvimento.
Imagem confocal vivo tem sido extensivamente utilizado para analisar o crescimento aéreo de plantas e a produção de órgãos laterais pelo SAM (por exemplo referências 3, 4, 5, 6), mas com a excepção de alguns relatórios (por exemplo, as referências 7, 8, 9, 10), ele não tem sido amplamente aplicada para o estudo de desenvolvimento da flor. Protocolos para imagem confocal ao vivo do SAM estão disponíveis (por exemplo, faz referência 11, 12), e fornecer uma boa base para a representação do botões florais em desenvolvimento que cercam o SAM. No entanto, botões florais de imagem apresenta desafios específicos: por exemplo,botões de flores rapidamente tornar-se maior do que o SAM, e a fase 4, sépalas começar a cobrir os (FM fases como descrito na referência 13), e escurecimento da fluorescência a partir de tecidos subjacentes (Figura 2A). Aqui, nós fornecemos um protocolo detalhado explicando como realizar imagem confocal ao vivo no desenvolvimento de botões florais de Arabidopsis usando uma posição vertical ou um microscópio invertido e uma lente de água-dipping. Nós publicado anteriormente este protocolo em referência 14.
1. Mídia e pratos de preparação
2. Crescimento de Plantas
3. Dissecção do rebento Apex

Figura 1: Preparação dos ápices atirar para imagem confocal ao vivo. (A - E) de uma dissecçãoatirar ápice para a imagem latente. Inflorescência antes (A) e depois (B) a remoção de siliques e flores mais velhas. (C - D) Tiro ápice imerso em água no prato de dissecação, com uma bolha de ar presa na ponta (C) e depois da remoção da bolha de ar (D). (E) Atire ápice no prato de dissecação, após dissecção de botões florais com mais de estágio 5. (F - G) Visão de ápices no prato de imagem, no palco de um microscópio confocal vertical (F) e invertida (G) . Em (F), uma lente de água-imersão 40X está posicionado acima de um dos vértices, com a ponta da lente imerso em água. Em (G), o vértice filmagem é posicionado de cabeça para baixo por cima da lente da água de imersão-40X, com uma coluna de água que liga o meio de imagem para a ponta do cristalino. O painel mais pequeno em (F) mostra uma higsua visão de ampliação da área no retângulo vermelho, com um ápice shoot inserido no meio de imagem; linhas vermelhas e azuis indicam a superfície do meio e água, respectivamente. (H - I), Exemplos de dispositivos feitos por medida, que permitem a adição de mais água na ponta da lente água-imersão: uma manga de borracha de silicone feita a partir de um arranque a vela de ignição (H), e uma manga improvisada feita a partir do dedo de um luva de látex sem pó (G). Barras de escala = 0,5 cm em (A) e (B), de 0,1 cm em (C) e (D), e 100 ^ m em (E). Esta figura foi inicialmente publicada em 14 de referência. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
4. coloração
NOTA: As paredes celulares ou membranas de plasma podem ser coradas com iodeto de propio ou FM4-64, respectivamente, para obter uma resolução celulardurante a imagiologia. Alternativamente, as linhas de repórter com proteínas fluorescentes marcadas para a membrana de plasma pode ser utilizado 6, 16.
5. Sepal Ablação
NOTA: No estágio 4, primórdios das sépalas começar cobrindo a FM. À medida que crescem, que filtram a fluorescência a partir de tecido subjacente, e dificultar o processo de imagiologia. Sépalas pode ser removido manualmente utilizando um pino de metal Mounted em um pino-vise, ou impedidos de crescer utilizando ablação a laser no primórdio sépalas emergente. Alternativamente, é possível em alguns casos utilizar mutantes, tais como apetala1-1, em que sépalas estão ausentes ou substituídos por órgãos semelhantes a folhas que não cobrem o FM enquanto a parte central da flor se desenvolve normalmente (Figura 2F) 17.
6. Configuração de imagem
7. Considerações sobre os parâmetros de imagem
NOTA: Como configurar os parâmetros de imagem depende muito o sistema confocal usado. Abaixo estão sugestões de alguns desses parâmetros que podem ser usados com qualquer microscópio confocal. Para mais considerações sobre os parâmetros de imagem, consulte a seção Discussão e referência 14.
8. A visualização de dados confocal
A Figura 2 apresenta vistas de diferentes confocal Z-pilhas de botões de flores de Arabidopsis vivas que expressam diferentes genes repórter fluorescentes, e coradas com iodeto de propídio (Figura 2, A-C5 e G) ou FM4-64 (Figura 2, E1-F) para fornecer uma resolução celular clara. A maioria dos sistemas confocais para permitir a imagiologia de dois fluororos com não-sobreposição espectros de emissão, tais como GFP ou YFP em conjunto com qualquer um iodeto de propio ou FM4-64 (Figura 2A - 2F). Os melhores sistemas confocais também são capazes de separar vários fluoróforos com espectros de emissão que se sobrepõem parcialmente nas mesmas amostras, tais como GFP e YFP, e dsRed e iodeto de propio (Figura 2G).
Três exemplos de experiências de lapso de tempo são apresentados na Figura2 e mostram botões de flores em desenvolvimento normalmente após a ablação sépalas foi realizada quer com um sistema de ablação por laser (Figura 2, C1-C5 e D1-D5) ou manualmente com um pino do torno e um pino de metal (Figura 2, E1-E2). Note-se que o botão da flor mostrado na Figura 2, E1-E2 é a partir de uma planta mutante super-homem-1, que é por isso primórdios carpelo não são observados no centro da gema na etapa 7. A ablação por laser de emergente primórdios sépalas do botão de flor mostrado na Figura 2, C1-C5 impede-os de que cobre o modo FM, que ainda pode ser trabalhada no estádio 5 (Figura 2, C5). Por outro lado, no caso do botão de flor mostrado na Figura 2, D1-D5, ablação por laser só atrasou o crescimento sépalas, mas sépalas eventualmente cresceu para cobrir a maior parte da fase de FM por 5 (Figura 2, D5 ). Pelo contrário, se demasiado poder do laser e habitação tempo é usado durante a ablação a laser, os danos se espalha para a parte central da flor e afeta o seu crescimento e, por vezes, resulta na morte subsequente de todo o botão de flor.

Figura 2: Visualização de confocal Z-pilhas de botões de flores ao vivo. A e B2 são vistas de transparência; B1 e B4-G são projecções de intensidade máxima; B3 é uma vista em corte ortogonal. (A - E2) flores que expressam um repórter Vénus para o gene APETALA3 (verde); paredes das células foram coradas com iodeto de propio (vermelho, excepto para B4, verde). (A) A inflorescência; números indicam estágios florais; sépalas, na fase 4 e 5 flores filtrar a fluorescência do repórter Vénus, que normalmente forms um anel. Note-se que alguns botões florais aparecem inclinado em comparação com a inflorescência. (B1 - B4) Quatro vistas diferentes do mesmo confocal Z-pilha de um botão de fase 5 flor: projecções de intensidade máxima (B1 e B4) com uma intensidade de sinal Vénus codificada com intensidade de pixel na cor verde (B1) ou com o código de cor fogo (B4; código de cor é mostrada na parte inferior do painel); vista transparência (B2) e vista fatia ortogonal (B3; a orientação XY, XZ e YZ das fatias é indicada no painel). (C1 - C5) 4-dia com intervalo de tempo de um botão de flor individual a partir estados 3 e 5; ablação por laser (marcados como traços brancos) realizada no dia 1 e no dia 3 foram suficientes para impedir que os sépalas de cobrir o centro do botão de flor na etapa 5. (D1 - D5) 4-dia com intervalo de tempo de um botão de flor do indivíduo etapa3 a fase 5; ablação por laser registo realizados no dia 1, 2 e 3 eram insuficientes para impedir que as sépalas de cobrir o centro do botão de flor. (E1 - E2) botão de flor individual após a remoção manual da abaxial e sépalas adaxiais (E1), e de todos os sépalas (E2); setas brancas indicam sépalas restantes; asteriscos brancas indicam cicatrizes resultantes da remoção das sépalas. (F) fase 7 flor apetala1-1 que expressa um repórter DR5-3xVenusN7 18 (verde); membranas de plasma foram coradas com FM4-64 (vermelho); setas azuis indicam as estruturas de folha-like que substituem sépalas e não cobrem o botão de flor. (L) Fase 4 botão de flor que expressa um repórter GFP fluorescente para Dornröschen-COMO 7 (verde), um repórter para Vénus SUPERMAN (vermelho) e um repórter para dsRed CLAVATA3 19 (ciano); célulasparedes foram coradas com iodeto de propídio (cinzento). d: dias; r: fase. Barras de escala = 25? m; escala é idêntico em B1, B2 e B4, em C1-C5 e D1-D5, em. Esta figura foi modificado a partir de referência 14. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Aqui, nós fornecemos um protocolo para a imagem de, em desenvolvimento de Arabidopsis botões de flores ao vivo com um microscópio confocal e uma lente de água-dipping. Enquanto isso pode ser feito com qualquer um pé ou um microscópio invertido, é mais fácil e rápido de usar o antigo. É também importante notar que diferentes sistemas confocais variar significativamente em termos de velocidade, sensibilidade, e a capacidade de separar os comprimentos de onda. Os melhores microscópios confocais agora permitir a imagem vários canais diferentes (por exemplo, GFP, YFP, dsRed e iodeto de propidio; Figura 2G) nas mesmas amostras. Alguns microscópios confocal estão equipados com um detector espectral, que pode coletar a fluorescência de diversos fluoróforos simultaneamente e separá-los depois. Ao usar um detector regular, no entanto, um conjunto de lasers e filtros devem ser usados para excitar e separar a fluorescência de fluoróforos diferentes. Alguns fluoróforos têm espectros de emissão totalmente distinta (por exemplo, um PCPd YFP), e podem ser visualizados simultaneamente. Outros fluoróforos têm espectros de emissão de sobreposição parcial (por exemplo, GFP e YFP), e geralmente têm de ser trabalhada separadamente, o que aumenta o tempo de imagiologia. Imagiologia de fluoróforos perto também muitas vezes requer a restrição quanto do espectro é recolhido para cada canal para evitar fluorescência de um fluoróforo a partir de vazando para outro canal. Isto provoca uma perda da intensidade do sinal recolhido, o que pode ser compensado por um aumento da potência do laser e ganho. No entanto, o tempo de imagiologia prolongada e aumentou a potência do laser pode branquear e / ou danificar a amostra. potência do laser aumentado e / ou ganho também pode aumentar o ruído de fundo. Otimização da intensidade do sinal, resolução e tempo de imagem para cada amostra é feito através de um processo de tentativa e erro, e envolve trade-offs permanentes.
Este protocolo explica como executar imagem confocal ao vivo de botões florais em desenvolvimento nos flancos de um ápice shoot dissecado. istoPode-se argumentar que o fato de que o ápice shoot não está ligado ao resto da planta e cresce em meio contendo citocininas podem afetar SAM e desenvolvimento da flor. No entanto, este meio foi concebido empiricamente através de um processo de tentativa e erro para garantir a atirar dissecado meristemas apicais produzir novos botões florais no plastocrono normal, e que estes botões florais desenvolver normalmente 15. Da mesma forma, dissecção sepal não parece afetar os padrões de expressão de genes ou o desenvolvimento do resto da flor. Outros protocolos detalhes como realizar imagiologia confocal vivo do SAM ainda ligado ao resto da planta (por exemplo 11 de referência). Tais protocolos poderia ser adaptada para, e oferecer uma alternativa útil para a imagem latente de desenvolver flores, especialmente quando o estudo dos processos relacionados com a citoquinina. Eles apresentam contudo várias desvantagens: os alonga-tronco e torções, e altera a orientação dos botões de flores; umand enquanto a imagem de um ápice shoot ligado ao resto da planta funciona bem com um microscópio vertical, é muito mais complicado fazê-lo com um microscópio invertido.
Lentes de imersão tem uma melhor abertura numérica (NA) do que as lentes "seco" (isto é, lentes que são separados da amostra de ar), e, por conseguinte, proporcionar uma resolução mais fina da amostra, o que é crítico quando se utiliza um microscópio confocal. Usando uma lente de água-imersão, assim, fornece uma muito melhor do que uma lente de NA seco, evitando o ápice filmagem de desidratação durante o processo de imagiologia. Enquanto glicerina e lentes de petróleo têm uma NA ainda maior do que as lentes de água, eles requerem o uso de uma lamela, que é muito pouco prático com uma amostra do tamanho de um ápice shoot, que também continua crescendo durante as experiências de lapso de tempo. Dado o tamanho das amostras (de acordo com as fases florais, pilhas pode ser superior a 150 um de espessura), que também é importante usar uma lente com uma distância de trabalho. Normalmente, utilizar uma lente de 20 ou 40X com NA de um e uma distância de trabalho de 1,7-2,5 mm.
Software microscópio confocal oferece várias formas de visualizar dados confocal, incluindo reconstruções tridimensionais (Figura 2, B1, B2 e B4) e vistas fatia (Figura 2, B3). Enquanto as vistas tridimensionais mais vulgarmente utilizados são projecções máximos de intensidade de z-pilhas confocal (Figura 2, B1 e B4), alguns de software (por exemplo, ZEN e Imaris) também proporcionam vistas de transparência que filtra o sinal a partir das partes mais profundas de a amostra (Figura 2, B2), o que pode ser útil quando se olha para processos que tomam lugar, ou genes expressos em, a camada epidérmica. A intensidade do sinal pode ser codificada com uma única cor (Figura 2, B1), utilizando pixels intensity, ou utilizando um código de cor (Figura 2, B4).
imagem confocal ao vivo não só oferece insights qualitativos valiosas sobre o desenvolvimento da flor, mas também potencialmente fornece os biólogos do desenvolvimento com uma riqueza de dados quantitativos. Software diferente (por exemplo Imaris, Fiji, MARS-ALT, MorphographX 15, 20, 21) permite a quantificação do número ou o volume de células que expressam um ou vários repórteres, ou o nível de expressão de um repórter em células diferentes. Esse software também pode ser usado para realizar segmentação automático de células, rastrear linhagens de células e quantificar o crescimento. Este software diferente oferece ferramentas similares, mas também difere de muitas maneiras. MARS-ALT e MorphoGraphX foram concebidos especificamente para as plantas 15, 20, 21, ao contrário de um Imarisnd Fiji. MorphoGraphX permite apenas a segmentação e análise da camada de epiderme, enquanto Imaris e MARS-ALT permitir a segmentação e análise de toda a amostra. No entanto, MARS-ALT requer a imagem antes de a mesma amostra de três ângulos diferentes 15, e Imaris requer apenas uma única pilha. O acesso à informação quantitativa é fundamental para promover nossa compreensão do desenvolvimento da flor.
O autor não tem nada a divulgar.
O autor gostaria de agradecer a Prof. Elliot M. Meyerowitz por seu apoio e comentários sobre o manuscrito, assim como Ann Lavanway no Dartmouth College e Dr. Andres Collazo no Facility Imagem Biológica em Caltech por sua ajuda na resolução de problemas técnicos com o imagem confocal ao vivo. O trabalho de Nathanaël Prunet é apoiado pelos Institutos Nacionais de Saúde, através Grant R01 GM104244 para Elliot M. Meyerowitz.
| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| Fórceps | Ciências de Microscopia Eletrônica | 72701-D | Dumont Style 5 Inox, para dissecção do ápice |
| Torno de Pino | Ted Pella, Inc. | 13560 | 80 cm de comprimento, para ablação de sépalas |
| Agulhas retas de aço inoxidável | Ted Pella, Inc. | 13561-50 | 0,1 mm de diâmetro, 1,2 cm de comprimento, para ablação de sépalas |
| Caixas plásticas redondas | Microscopia Eletrônica Ciências | 64332 | transparentes, 6 cm de diâmetro, 2 cm de profundidade, para usar como pratos de dissecação |
| Caixas retangulares articuladas | Durphy Packaging Co. | DG-0730 | transparente, 2-7/8" de comprimento, 2" de largura, 1-1/4" de profundidade, para usar como placas de imagem com um microscópio vertical |
| Placas de cultura de tecidos, poliestireno, estéril | VWR | 25382-064 | transparente, 3,5 cm de diâmetro, 1 cm de profundidade, para usar como placas de imagem com um microscópio invertido |
| Pipetas P10 e P1000 | com pontas de filtro correspondentes | ||
| Estereomicroscópio | com ampliação máxima de 80-90X | ||
| de ablação a laser | para ablação de sépalas | ||
| microscópio confocal de varredura a laser | |||
| imersão em água de 20 ou 40X | com um NA de 1 e uma distância de trabalho de 1,7-2,5 mm | ||
| Agarose | |||
| Mistura de sal básico de sacarose | |||
| Mio-inositol | Sigma-Aldrich | I7508 | vitamina |
| Ácido nicotínico | Sigma-Aldrich | N0761 | vitamina |
| Cloridrato de piridoxina | vitamina | Sigma-Aldrich | P6280 |
| Sigma-Aldrich | T1270 | vitamina | |
| Glicina | Sigma-Aldrich | G8790 | vitamina |
| N6-Benziladenina | Sigma-Aldrich | B3408 | BAP, uma solução de iodeto de propídio de citocinina |
| Sigma-Aldrich | P4864 | 1 mg/mL solução em água, para manchar as paredes celulares | |
| FM4-64 | Invitrogen | F34653 | diluir em água a 80 μ g/mL, para corar as membranas plasmáticas |