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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
O cílio primário é fundamentalmente importante na proliferação de células progenitoras neurais, a diferenciação neuronal, e função neuronal adulta. Aqui, descrevemos um método para estudar ciliogênese e o tráfico de proteínas de sinalização para os cílios em células estaminais / progenitoras neuronais e neurónios diferenciados utilizando culturas primárias de neuroesferas.
O cílio primário é fundamentalmente importante para a proliferação de células-tronco neurais/progenitoras e para a diferenciação neuronal durante a vida embrionária, pós-natal e adulta. Além disso, a maioria dos neurônios diferenciados possui cílios primários que abrigam receptores de sinalização, como receptores acoplados à proteína G, e moléculas de sinalização, como adenilil ciclases. O cílio primário determina a atividade de múltiplas vias de desenvolvimento, incluindo a via do ouriço sônico durante o desenvolvimento neuronal embrionário, e também funciona na promoção da sinalização subcelular compartimentada durante a função neuronal adulta. Sem surpresa, defeitos na biogênese e função primária do cílio têm sido associados a anomalias de desenvolvimento do cérebro, obesidade central e déficits de aprendizagem e memória. Assim, é imperativo estudar a biogênese primária do cílio e o tráfego ciliar no contexto de células-tronco neurais/progenitoras e neurônios diferenciados. No entanto, os métodos de cultura para neurônios primários requerem experiência considerável e não são passíveis de ciclos de congelamento e descongelamento. Neste protocolo, discutimos métodos de cultura para populações mistas de células-tronco neurais/progenitoras usando neuroesferas primárias. Os métodos de cultura baseados em neuroesferas fornecem os benefícios combinados do estudo de células-tronco neurais primárias / progenitoras: receptividade a múltiplas passagens e ciclos de congelamento e descongelamento, potencial de diferenciação em neurônios / glia e transfectabilidade. É importante ressaltar que determinamos que as células-tronco / progenitoras neurais derivadas da neuroesfera e os neurônios diferenciados são ciliados em cultura e localizam moléculas de sinalização relevantes para a função ciliar nesses compartimentos. Utilizando essas culturas, descrevemos ainda métodos para estudar a ciliogênese e o tráfego ciliar em células-tronco neurais / progenitoras e neurônios diferenciados. Esses métodos baseados na neuroesfera nos permitem estudar as vias celulares reguladas pelos cílios, incluindo o receptor acoplado à proteína G e a sinalização sônica do ouriço, no contexto de células-tronco neurais / progenitoras e neurônios diferenciados.
O cílio primário é um compartimento subcelular dinâmico baseado em microtúbulos que funciona como uma antena sensorial na coordenação de vias de sinalização celular, incluindo a via de Hedgehog Sonic (Shh), durante o desenvolvimento neuronal embrionário 1, 2, e sinalização subcelular compartimentada em adulto função neuronal 3, 4 . Sinalização componentes destas vias, tais como o receptor de Shh Patched 5; o activador via de Smoothened (Smo) 6; e Gpr161 7, um receptor órfão de Proteína G-acoplada (GPCR) que regula negativamente a via de Shh, localizar aos cílios de uma forma dinâmica. Várias GPCRs têm sido relatados para localizar aos cílios em neurónios no cérebro 7, 8, 9, 10 sup>, 11, 12, 13, 14, 15, 16. Defeitos no cílios e vias de sinalização gerada-cílios afectar vários tecidos e são conhecidos colectivamente como ciliopathies 17, 18, 19. O espectro da doença ciliopathy inclui frequentemente defeitos do neurodesenvolvimento, tais como anomalias craniofaciais 20, 21, 22. Além disso, cílios em neurónios hipotalâmicos regulam vias centrais de saciedade, e defeitos resultam em obesidade central 23, o espelhamento da obesidade em ciliopathies sindrómicas tais como síndrome de Bardet Biedel 24. Além disso, o receptor neuropéptido de sinalização em cílios regula central saciedade vias 11, 14. Localização ciliar de adenililciclase III (ACIII) e os GPCRs, tais como o receptor de somatostatina 3 em neurónios do hipocampo resultar em defeitos de reconhecimento de objecto novos e défices de memória 25, 26 e paralelo a falta de integridade ciliar 27. Os aspectos do desenvolvimento da sinalização gerada-cílios estão intimamente ligados a homeostase do tecido; em particular, os cílios são importantes para a progressão de meduloblastomas Shh para o subtipo que derivam de progenitores granulares do cerebelo em 28, 29. Assim, cílios desempenham papéis importantes durante embrionário, pós-natal, e desenvolvimento neuronal adulto e função.
As células estaminais neurais (NSCs) residem na zona subventricular (SVZ) do ventrículo lateral, na zona subgranular do giro dentado do hipocampo, e azona ventricular do terceiro ventrículo no hipotálamo em mamíferos 30, 31, 32. NSCs são multipotentes, possuem a capacidade de auto-renovação, e são importantes para o desenvolvimento do cérebro e da medicina regenerativa 30. A maioria dos NSC no SVZ são quiescentes e possuem um cílio primário solitário que, em muitos casos, se estende para fora para o ventrículo lateral 33. Os sinais cílio primários através da localização de vários receptores, a indução de respostas celulares a jusante, particularmente em relação a Shh, TGFp, e receptor de tirosina-quinase vias 2, 34, 35, 36. Uma vez que os cílios se estender para o ventrículo lateral,-se a hipótese de que cílios detectar citoquinas no fluido cerebrospinal (CSF) para activar as NSC 37 38, 39, 40, 41. No entanto, os mecanismos através dos quais comunica com CSF NSC e se cílios estão envolvidos não são conhecidos. NSC aderentes em cultura são ciliado; localizar os componentes da via, tais como Shh, Smo e Gpr161 em cílios; e são Shh responsivo 42. Assim, NSC pode servir como um importante sistema modelo para o estudo da via de Shh, tráfico ciliar, e vias de diferenciação neuronal. Além disso, a partir de neurónios diferenciados NSC também podem ser utilizadas para ensaios de tráfico ciliar.
As neuroesferas são constituídos por aglomerados de células flutuantes resultantes da proliferação de neural células estaminais / progenitoras que crescem na presença de factores de crescimento específicos e superfícies não adesivos 43, 44. As neuroesferas servir como importante em modelos de cultura in vitro para estudar as células estaminais / progenitoras neurais em desenvolvimento normal e doença 31, 45, 46, 47. Aqui, descrevemos um ensaio baseado em neuroesfera para a cultura de células estaminais / progenitoras neuronais e para a diferenciação em neurónios / glia. Nós particularmente enfatizar o tráfico de sinalização componentes aos cílios de estaminal neuronal / células progenitoras e neurónios diferenciados (Figura 1). Em oposição a cultura de neurónios primários, neuroesferas primárias são relativamente fáceis de cultura, são passíveis de várias passagens e congelamento-descongelamento ciclos, e pode ser submetida a diferenciação em neurónios / glia. Importante, determinou-se que neural derivada-neuroesferaas células estaminais / progenitoras e neurónios diferenciados são ciliadas em cultura e localizar moléculas de sinalização importantes para a função ciliar nestes compartimentos. métodos de cultivo baseadas em Neurosphere pode servir como um sistema modelo ideal para estudar ciliogênese e ciliar tráfico de NSC e neurônios diferenciados.
1. Isolamento de neuroesferas a partir do cérebro do rato adulto
2. Análise da capacidade de diferenciação de testes neurospheres e ciliogênese
3. Análise da ciliogênese em neuroesferas
4. Cultura e Passagem de neuroesferas e NSC aderentes
5. A fome e Análise de Cilia
6. Transfecção de neuroesferas
Depois de plaqueamento das células a partir do SVZ em meio NSC durante uma semana, neuroesferas flutuantes foram observados (Figura 2A). Os tamanhos das esferas variou entre 50 e 200 um. Para examinar se as esferas foram derivados a partir de células estaminais / progenitoras neurais, as neuroesferas foram plaqueadas em lamelas e PLL- em meio NSC Laminina-revestido durante 2 dias. Eles foram então imunocoradas em relação ao marcador / células progenitoras estaminais neurais, nestina. Foram necessários dois dias para permitir que as esferas para anexar as lamelas e crescer como uma monocamada de células. A monocamada de células foi positiva para a nestina (Figura 2B). Para examinar a capacidade de diferenciação das neuroesferas, que chapeada deles seguindo os passos delineados na secção 2 para PLL- e lamelas em meio de diferenciação Laminina-revestido sem dissociação durante 7-10 dias. É preciso pelo menos uma semana para a diferenciação. Os neurospheres ligado às lamelas e expandirEd a crescer como uma monocamada de células. Fixamos as células e histoquímica contra neurônio, astrócitos e oligodendrócitos marcadores. Observamos neuroesferas aderentes que se diferenciaram em neurónios β-tubulina III-positivas, astritos GFAP-positivos, e oligodendrócitos O4-positivas (figura 2C-E). Assim, neuroesferas multipotentes podem ser derivados de SVZ adulto rato.
Para determinar se neuroesferas aderentes e neurónios diferenciados têm cílios, que imunocoradas contra Arl13b (marcador cílio primária) e 51 Gpr161 (GPCR localizada-ciliar) 7. Na nossa experiência, em modelos de rato disponíveis que expressam ARL13B-mCherry, e em estudos com o desenvolvimento de córtex de rato, a maior parte (se não todos) os cílios neuronal no cérebro expressar Arl13b, enquanto que todos os neurónios não são ACIII-positivo 52, 53, 54. quis, que se baseiam principalmente na Arl13b para detectar cílios neuronal. Detectamos cílios e a localização de Gpr161 aos cílios de células progenitoras em neuroesferas aderido (Figura 3a) e em neurónios diferenciados (Figura 3B). Assim, neuroesferas aderentes e linhagens diferenciadas são ciliadas em cultura e localizar moléculas sinalizadoras.
Para determinar se neuroesferas flutuantes têm cílios, que criosseccionada neuroesferas flutuante após a fixação, como descrito na secção 3. Observou-se cílios em células estaminais / progenitoras neurais nas neuroesferas seccionados (Figura 4A-B). É importante para adquirir Z-seções através dos neurospheres para visualizar totalmente cílios, porque é difícil para examinar os cílios primária em um único plano z. Em resumo, as neuroesferas indiferenciadas têm populações heterogéneas de células ciliadas e não ciliadas.
(Figura 5A-B). Além disso, observou-se um aumento do número de cílios Gpr161-positivo sobre a fome (% cílios Gpr161-positivo / cílios Arl13b-positivo) (Figura 5A-B). Curiosamente, um estudo anterior, utilizando linhas de células estaminais embrionárias humanas indiferenciadas demonstrado que as células estaminais embrionárias humanas em cultura também possuem cílios 55. O número e comprimento de aumento cílios sobre privação de soro nestas linhas celulares, e estas cílios também possuem componentes da maquinaria de Shh.
Nós também transfectadas aderentes neural tronco / progenitor células, como descrito na secção 6. Normalmente, detectada uma eficiência de transfecção de até 10%, semelhante ao primárias de neurónios culturas no laboratório (Figura 6).
| Solução | Componente |
| 1x PBS | Diluir 10x PBS com água autoclavada |
| médio NSC | 2 ml de 50x B27 |
| 1 mL 100x N2 | |
| 1 ml de 200 mM de L-glutamina | |
| 1 mL 100x Pen / Strep | |
| FGF-básico (bFGF humano) (da solução de 25 ng / mL em meio Neurobasal): 20 ng / ml ou 2 mg total para 100 mL de meios | |
| EGF (da solução de 25 ng / mL em meio Neurobasal): 20 ng / ml ou 2 mg no total por 100 ml de meio | |
| 95 mL de meio basal | |
| FGF-básico humano (bFGF humano) | 1 ml de meio basal de bFGF 25 ug garrafa humana comercial |
| Armazenar em microtubos estéreis em -20 ° C ou inferior. Usar uma única aliquota de 80 uL ou 2 ug / 100 mL de meios de NSC. | |
| EGF | Adiciona-se 8 mL de meio basal ao EGF 20 ug garrafa comercial |
| Armazenar microtubos estéreis em -20 ° C ou inferior. Usar uma única aliquota de 80 ug / 100 mL de meio. | |
| médio parar | 1 mL de FBS |
| 75 U de ADNase I (75 U / ul em PBS) | |
| 9 mL de PBS | |
| meio de soro | 1 mL de FBS |
| Meio 9 mL Basal | |
| meio de congelamento | 4 mL de DMSO |
| 24 mL de meio basal | |
| 12 mL 30% de FBS | |
| meio de diferenciação | 90 mL de meio basal |
| 5 mL de 5% de FBS | |
| 1 mL 100x Pen / Strep | |
| 1 ml de 200 mM de L-glutamina | |
| 1 mL 100x N2 | |
| 2 ml de 50x B27 | |
| FGF-básico (bFGF humano) (solução mãe de 25 ng / mL em meio Neurobasal): 10 ng / mL ou 1 mg no total por 100 ml | |
| médio fome | 95 mL de meio basal |
| 1 mL 100x Pen / Strep | |
| 1 ml de 200 mM de L-glutamina | |
| 1 mL 100x N2 | |
| 2 ml de 50x B27 |
Tabela 1: Receita de Soluções.
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Figura 2: As neuroesferas exposições Diferenciação Capacidade. (A) neuroesferas representativos são mostrados. (B) As neuroesferas foram plaqueadas em lamelas e PLL- Laminina-revestidas em meio NSC durante 2 dias e foram imunocoradas contra nestina (marcador de células estaminais / progenitoras neurais). (CE) As neuroesferas foram plaqueadas seguindo as etapas descritas na secção 2 para PLL- e lamelas em meio de diferenciação Laminina-revestido durante 7 dias without dissociação; fixo; e imunocoradas contra β-tubulina III (marcador neuronal), GFAP (marcador de astrócitos), e O4 (marcador de oligodendrócitos). Os núcleos foram coradas por DAPI. Barra de escala = 100 pm. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: As neuroesferas e neurónios em Aderente Diferenciadas As neuroesferas são ciliado. (A) não dissociado neuroesferas foram plaqueadas em lamelas revestidas em meio NSC de 2 d; fixo; e imunocoradas contra Gpr161 (verde), Arl13b (vermelho), e ADN (azul). (B) neurónios diferenciados foram imunocoradas contra Gpr161 (verde), Arl13b (vermelho, A) ou β-tubulina III (vermelho, B), e ADN (azul). setas brancas indicam Gpr161 localização em cílios.Os painéis à direita em (A) são vistas ampliadas do cílio primário indicado pela seta branca. O cílio Gpr161-positiva no neurónio branco-box é mostrada no lado direito em (B). Escala = 10 um (A); 50 um (B). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4: flutuação, indiferenciado neuroesferas Possuir células ciliadas. neuroesferas flutuantes foram fixados, embebidos em OCT, criosseccionada, e processado por imunofluorescência contra Arl13b (vermelho) e de ADN. cílios Arl13b-positiva num neuroesfera são mostrados. O painel em (A) é uma projecção de intensidade máxima de 14 z-secções em intervalos de 0,8? M a partir de uma neuroesfera. Os painéis em (b) mostra a vista ampliada de ccélulas iliated na região branco-box em (A). A imagem de projecção máxima de todos os z secções é mostrado como uma pilha, enquanto que os números de 1 a 14 indicam-z secções individuais. As setas brancas indicam cílios. Escala da barra = 50 m. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 5: A inanição Induz ciliogênese em Caule Dissociated Aderente Neural / células progenitoras. As células dissociadas (A) foram plaqueadas em lamelas de cobertura revestidas em NSC, ou em meio de fome durante 24 h; fixo; e imunocoradas contra Gpr161 (verde), Arl13b (vermelho), e ADN (azul). cílios Gpr161-positivo são observados em células em jejum (direita) de controlo (esquerda) e. Os pains inferiores s vistas ampliadas das caixas brancas indicado na respectivapainéis superiores. As setas brancas e pontas de seta indicam cílios Gpr161 positivos e negativos, respectivamente. Barra de escala = 100 pm. (B) Quantificao de culas positivas Arl13b-ciliadas (gráfico da esquerda) e Gpr161 localizar no cílios Arl13b-positivo (direito do gráfico) no controle e células esfomeados. As percentagens de ambas as células ciliadas Arl13b-positivos e Gpr161 localizar no cílios Arl13b-positivo aumentado por inanição. A quantificação foi realizada a partir de dois campos de visão a partir de cada duas repetições técnicos de uma única experiência. Os dados são representados como a média de todos os campos de visão 4 ± o desvio padrão. *, P <0,05; **, P <0,01. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 6: A transfecção emCaule dissociado Aderente Neural / células progenitoras. As células dissociadas plaqueadas em lamelas revestidas foram transfectadas com um LAP-TULP3 N-terminal (aa 1-183) mut12 construção que não se liga ao núcleo IFT-se um complexo 56. O meio foi mudado para meio de privação 24 h pós-transfecção. As células foram fixadas após 24 h e imunocoradas contra GFP (verde), Gpr161 (vermelho), Arl13b (magenta) e de ADN (azul). Uma célula transfectada com e Gpr161- Arl13b-positivo cílio é marcado por uma seta branca, ao passo que uma célula transfectada sem cílios é mostrado com uma seta branca. As setas amarelas e pontas de seta apontam para células não transfectadas, com ou sem Gpr161 / Arl13b, respectivamente. Escala da barra = 10 m. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores declaram não haver interesses financeiros concorrentes.
O cílio primário é fundamentalmente importante na proliferação de células progenitoras neurais, a diferenciação neuronal, e função neuronal adulta. Aqui, descrevemos um método para estudar ciliogênese e o tráfico de proteínas de sinalização para os cílios em células estaminais / progenitoras neuronais e neurónios diferenciados utilizando culturas primárias de neuroesferas.
O trabalho no laboratório de S.M. é financiado por bolsas de recrutamento do CPRIT (R1220) e do NIH (1R01GM113023-01).
| Tampa de vidro redonda de 12 mm | Fisherbrand | 12-545-80 | |
| Placa de 24 poços | Falcon | 353047 | |
| paraformaldeído a 4% (PFA) | Affymetrix | 19943 | |
| Tubo de 50 mL | Placa de | PetriFalcon 352098 | |
| 95 mm x 15 mm, tampa deslizável | Fisherbrand | FB0875714G | prato de 10 cm |
| 70 µ filtro de células m | Falcon | 352350 | |
| Alexa Fluor 488 Affinipure Donkey Anti-Rabbit IgG (H + L) | Jackson Immunoresearch | 711-545-152 | Donkey anti Rabbit, Alexa 488 anticorpo secundário |
| Arl13B, Clone N295B / 66 | Neuromab | AB_11000053 | |
| B-27 Suplemento (50X), sem soro | ThermoFisher Scientific | 17504001 | B27 |
| Centrifuge | Frasco | criogênico científico Thermo ST40R | |
| Corning | 430488 | ||
| DAPI | Sigma | D9542-10MG | |
| Desoxirribonuclease I do pâncreas bovino | Sigma | D5025-15KU | Dnase I |
| Dimetilsulfóxido Sigma | D8418-100ML | DMSO | |
| Moldes de Espécime de Vinil Descartável | Sakura Tissue-Tek Cryomold | 4565 | 10 mm x 10 mm x 5 mm |
| Dulbecco's Phosphate-buffered Saline 10X, Modificado, sem cloreto de cálcio e cloreto de magnésio, líquido, filtrado estéril, adequado para cultura de células | Sigma | D1408-500ML | DPBS |
| Dumont #5 Fórceps | Ferramentas de ciência fina | 11254-20 | |
| Soro Fetal Bovino (FBS) | Sigma | F9026-500ML | |
| Solução | Fluoromount-GSouthern Biotech | 0100-01 | solução de montagem |
| GFAP | DAKO | Z0334 | |
| Cabra anti camundongo IgG1 Anticorpo secundário, Alexa Fluor 555 conjugado | ThermoFisher Scientific | A-21127 | Cabra anti camundongo IgG1, Alexa 555 anticorpo secundário |
| Cabra anti camundongo IgG2a Anticorpo secundário, Alexa Fluor 555 conjugado | ThermoFisher Scientific | A-21137 | Cabra anti camundongo IgG2a, Alexa 555 anticorpo secundário |
| Gpr161 | caseiro | N/A | |
| humano bFGF | Sigma | F0291 | FGF |
| hemocitômetro | Hausser Scientific | 0,100 mm de profundidade | melhorado neubauer |
| Isothesia | Henry Schein | NDC 11695-0500-2 | Isofluorano |
| Laminina da membrana basal do sarcoma Engelbreth-Holm-Swarm Sigma | L2020 | Laminina | |
| L-Glutamina (200 mM) | Sigma | G7513 | |
| Lipofectamine 3000 Reagente de Transfecção | ThermoFisher Scientific | L3000 | |
| Mr. Frosty | Nalgene | 5100-0036 | |
| Suplemento N-2 (100X) | ThermoFisher Scientific | 17502001 | N2 |
| Meio neurobasal | Gibco | 21103-049 | |
| Soro de burro normal | Jackson ImmunoResearch | 017-000-121 | |
| Composto de outubro | Sakura Tissue-Tek | 4583 | OCT |
| Penicilina-estreptomicina | Sigma | P4333-100ML | |
| de Poli-L-lisina (PLL) | Sigma | P4707 | |
| , | sistemas CF R e D | 236-EG-200 | EGF |
| Tesoura | Ferramentas de ciência fina | 14060-10 | |
| Superfrost mais lâmina de microscópio | Fisher scientific | 12-550-15 | slides |
| Triton X-100 | Bio-Rad | 161-0407 | |
| Solução de tripsina-EDTA (10X) | Sigma | T4174-100 | Tripsina |
| COSTAR Placa de 6 poços, com tampa Fundo plano Ultra-baixa Superfície de fixação Poliestireno, Estéril | Corning | 3471 | placa de 6 poços de ligação ultrabaixa |
| β-tubulina III | Covance | MMS-435P | TUJ1 |