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Research Article
Lukas Kaufmann*1, Mohammedyaseen Syedbasha*1, Dominik Vogt1, Yvonne Hollenstein1, Julia Hartmann1, Janina E. Linnik1,2,3, Adrian Egli1,4
1Applied Microbiology Research, Department of Biomedicine,University of Basel, 2Department of Biosystems Science and Engineering,ETH Zurich, 3Swiss Institute of Bioinformatics, 4Clinical Microbiology,University Hospital Basel
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Os protocolos apresentados descrevem como realizar um ensaio de inibição de hemaglutinação para quantificar os anticorpos específicos de gripe de amostras de soro de destinatários de vacina contra gripe. O primeiro ensaio determina as concentrações de antígeno viral ideal por hemaglutinação. O segundo ensaio quantifica anticorpos específicos da gripe através da inibição da hemaglutinação.
Anticorpos são comumente usados como marcadores de substituto para serológica proteção contra gripe e outros patógenos. Conhecimento detalhado da produção de anticorpos pré- e pós-vacinação é necessária para entender a imunidade induzida pela vacina. Este artigo descreve um protocolo ponto-a-ponto fiável para determinar anticorpos específicos de gripe. O primeiro protocolo descreve um método para especificar os montantes de antigénio necessários para hemaglutinação, que padroniza as concentrações para uso posterior no segundo protocolo (ensaio de hemaglutinação, ensaio HA). O segundo protocolo descreve a quantificação de anticorpos específicos de gripe contra diferentes cepas virais usando uma diluição serial de humana soro ou célula sobrenadantes de cultura (ensaio de inibição da hemaglutinação, ensaio HI).
Como um exemplo aplicado, mostramos a resposta imunitária de uma coorte saudável, que recebeu uma vacina trivalente inativada. Além disso, é mostrada a reactividade cruzada entre os vírus da gripe de diferentes e métodos para minimizar a reactividade cruzada usando diferentes tipos de animais células vermelhas do sangue (hemácias) são explicados. A discussão destaca vantagens e desvantagens dos ensaios apresentados e como a determinação de anticorpos específicos de gripe pode melhorar a compreensão da imunidade vacina-relacionados.
Infecção com vírus da gripe está associada com altos custos de saúde1,2,3,4, mortalidade e morbidade considerável. Em particular, idosos, recém-nascidos, gestantes e pacientes com doença crônica são em risco para desfechos clínicos mais graves. Portanto, a vacinação contra estirpes de vírus da gripe de circulação é a principal medida para diminuir o fardo da doença nessas populações de alto risco. O aumento da resposta imune individual após a vacinação, por exemplo, anticorpos específicos gripe acima de um limite de proteção, reduz o risco individual de infecção e, em geral, a probabilidade de transmissão viral dentro de uma população de 5. um entendimento detalhado de induzida pela vacina resposta imune humoral em diferentes populações e em vários grupos de idade é um elemento-chave para responder a questões clínicas importantes6,7,8 , 9, tais como: por que alguns pacientes idosos têm infecções apesar da vacinação anterior? O que é uma "bom" e "suficiente" proteção induzida pela vacina? Quantas vezes uma vacina deve ser aplicada a um paciente imunodeprimidos para alcançar títulos protetoras? Qual é a dosagem mais eficaz? Qual é o impacto de um romance adjuvante na pós-vacinação anticorpos? A medição da produção de anticorpos específicos de vacina pode ajudar a responder a estas importantes questões e melhorar os resultados da vacinação.
A quantificação de anticorpos específicos do vírus pode ser executada com vários métodos imunológicos. Isso inclui a fase sólida10 ou ensaios de11 ELISA grânulo-based, o HI ensaio12e neutralizante ensaios13. Métodos baseados em ELISA permitam o rastreio de relativamente grandes quantidades de amostras de soro contra vários antígenos. Além disso, imunoglobulinas (Ig) M e IgG patógeno-específicos podem ser separadamente explorados. Embora as características de um antígeno, por exemplo, a sequência linear de aminoácidos ou vírus-como partículas podem influenciar a ligação de anticorpos, o espectro de epítopos potenciais é muito amplo e não fornece informações sobre se um anticorpo resposta tem relevância funcional.
Em contraste, o ensaio de neutralização determina o potencial de anticorpos de funcionalmente inibir a infecção das células e, portanto, reflete a potencial de neutralização. No entanto, esse método é muito trabalhoso, exige o cultivo de específicos de linhas de células e viver o vírus, e portanto, é demorado, caro e requer equipamentos especiais.
Este artigo descreve um passo a passo o protocolo baseado na organização mundial de saúde OMS HI12 para quantificar os anticorpos específicos de gripe. Hemaglutinação é um efeito característico de alguns vírus, levando à aglutinação dos eritrócitos. A inibição deste efeito com soros de doentes permite a medição das concentrações de anticorpos inibitório, que reflete um efeito neutralizante.
Modificamos o fluxo de trabalho do WHO-protocolo para permitir uma manipulação mais eficiente de várias amostras ao mesmo tempo e reduzindo o tempo necessário. O primeiro protocolo descreve a determinação do potencial de aglutinação de um antigénio específico da gripe. Ao fazer isso, a concentração do antígeno de gripe correto é determinada para o segundo protocolo. Esta parte deve ser repetida com cada novo antígeno viral, bem como cada lote de sangue.
O segundo protocolo descreve a determinação de anticorpos específicos de gripe. Os protocolos apresentados são otimizados para a investigação de vírus da gripe e amostras de soro humano, no entanto, também pode ser aplicado para as amostras de soro de rato ou sobrenadantes de cultura de células de estimulada células imunes, por exemplo, as células específicas do vírus B. Resultados podem ser determinados como títulos de medida absolutos. Em muitos estudos de vacina, os média geométrica de títulos e o intervalo de confiança de 95% são mostradas para cada população específica. Para interpretação, soroproteção ou seroconversão são frequentemente usados para descrever a susceptibilidade de uma população a um determinado vírus. Soroproteção é definida como um título de ≥1:40 e a seroconversão como um título mais do que 4-fold aumentar com a conquista de títulos seroprotective entre dois pontos de tempo (normalmente mais vacinação pré e pós-vacinação 30 dias são utilizados).
Ambos os protocolos são fáceis de usar e podem ser adaptadas para uma ampla gama de questões de investigação. Em particular, podem ser usados para determinar de forma confiável e rapidamente os anticorpos contra vários outros vírus com capacidade para hemaglutinação, tais como polyomaviruses, sarampo, caxumba ou rubéola14,15,16 .
Os protocolos de estudo foram aprovados pelo Comitê de revisão ética local (www.EKNZ.ch) e foi obtido consentimento escrito de todos os participantes.
1. soro coleção
2. preparação de antígenos
Cuidado: Cinco antígenos diferentes são usados (ver Tabela de materiais). Prepare antígenos em um laboratório de biossegurança nível 2 (BSL-2).
3. preparação do filtrado de cólera
Nota: Filtrado de cólera é usado como um receptor de destruir a enzima (RDE), de acordo com o WHO protocolo12. Isso remove inatos inibidores do soro que iria interferir com o ensaio17.
4. HA ensaio
Nota: Para garantir que os ensaios de HI são comparáveis entre várias placas, a mesma quantidade de partículas de vírus deve ser usada por cada placa. O ensaio HA (também chamado de titulação HA) é realizado para quantificar as partículas de vírus necessárias para hemaglutinação e é gravado em unidades HA. Uma "unidade" de hemaglutinação é uma unidade operacional dependente do método utilizado para a titulação de HA e não é uma medição de uma quantidade absoluta de vírus. Assim, uma unidade HA é definida como a quantidade de vírus necessários para aglutinar um volume igual de uma suspensão padronizada do RBC. De acordo com a OMS, a quantidade padrão usada para o ensaio de HI é 4 unidades HA por 25 µ l. Para obter uma ilustração do princípio do ensaio HA ver Figura 1.

Figura 1 : Princípio de hemaglutinação e inibição da hemaglutinação. Não hemaglutinação ocorre em uma situação de controlo negativo sem vírus e anticorpos (coluna esquerda) e hemácias hemagglutinate apenas na presença de vírus da gripe (coluna do meio). No entanto, quando a hemaglutinina do vírus da gripe é bloqueada por anticorpos específicos do vírus, em seguida, sem hemaglutinação pode ocorrer (coluna direita). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Nota: As hemácias utilizadas são dependentes do tipo de vírus da gripe no ensaio (tabela 1). Além disso, vários tipos de placas de 96 poços micro de título, o tempo de incubação, bem como a aparência das células não aglutinadas diferentes (tabela 2).
| Antígeno da gripe | A/California/7/09 (H1N1) | A/Suíça/9715293/2013 (H3N2) | A/Texas/50/2012 (H3N2) | B/Brisbane/60/08 | B/Massachusetts/02/2012 | ||
| Espécie de RBC | Frango | Porquinho da Índia | Porquinho da Índia | Turquia | Turquia | ||
Tabela 1: antígenos da Influenza e correspondentes espécies de hemácias. De acordo com as instruções do fabricante (NIBSC).
| Espécie de RBC | Frango | Turquia | Porquinho da Índia | Tipo humano O |
| Concentração de glóbulos vermelhos (v/v) | 0,75% | 0,75% | 1% | 1% |
| Tipo de placa de microtitulação | Fundo de V | Fundo de V | Fundo de U | Fundo de U |
| Tempo de incubação, RT | 30 min | 30 min | 1 hora | 1 hora |
| Aparecimento de células não-aglutinadas | Botão * | Botão * | auréola | auréola |
Tabela 2: ensaio condições com diferentes espécies de glóbulos vermelhos. De acordo com o protocolo do WHO. (* flui quando inclinado).

Figura 2 : Placa de concepção do ensaio HA. A titulação de HA é executada em duplicatas. Nenhum antígeno foi adicionado para as linhas de controle. Também consulte a Figura 4 para a determinação da melhor concentração do antígeno. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3 : Padrões de aglutinação de hemácias de mamíferos e aviária. Placas em forma de V título micro são utilizadas quando se trabalha com hemácias aviária. A leitura é realizada em uma posição inclinada da placa, e hemácias aglutinadas não começarem a correr para baixo formando um formato de lágrima. Placas de microtitulação em forma de U são utilizadas quando se trabalha com hemácias de mamíferos. A leitura, em seguida, é executada em uma posição não-inclinado, e hemácias não aglutinadas formam uma pequena auréola. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4 : Leitura da titulação HA com hemácias aviária para determinar o título de 4 unidades HA. A quantidade de antígeno ideal necessária para hemaglutinação é medida pelo ensaio de hemaglutinação (ensaio de titulação de antígeno). O último poço onde ocorre a hemaglutinação completa é o ponto de extremidade de titulação de HA e contém 1 unidade HA. Devido as 2 vezes diluições do antígeno, dois poços antes do ponto final da titulação de HA, o título corresponde a 4 unidades HA. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
5. HI ensaio
Nota: O fluxo de trabalho do protocolo foi otimizado para permitir uma manipulação mais eficiente de várias amostras ao mesmo tempo, usando PCR tubo de listras e um cycler térmico (veja abaixo).

Figura 5 : Placa de design e fluxo de trabalho do ensaio HI. Cinco pontos de tempo de duas pessoas podem ser medidos em um prato. O título de HI varia de 8 a 1.024. Um antido soro antígeno utilizado serviu como um controle positivo e uma titulação de volta foi realizada para verificar se a diluição de antígeno é igual a 4 unidades HA. A série diluição da amostra soro é mostrada para 2 receptores de vacina individual. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 6 : Leitura do ensaio HI com hemácias aviária. A gripe pré e pós-vacinação induzida, resposta imunitária específica é determinada pelo ensaio de HI. Neste exemplo, a pessoa um tem maior concentração de HI que pessoa dois. Ambas as pessoas mostram uma resposta de anticorpos após a vacinação; 180 dias após a vacinação, que os anticorpos de ambas as pessoas são diminuídos novamente. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Resposta de anticorpos induzidos pré e pós-vacinação contra Influenza A H3N2
A resposta de anticorpo induzida pela vacina foi avaliada em 26 voluntários saudáveis que receberam a vacina contra a gripe uma subunidade trivalente inativada contendo Influenza A/H1N1/Califórnia/2009, A/H3N2/Texas/2012 e B/Massachusetts/02/2012 antes de 2014 / temporada de gripe de 2015. A Figura 6 mostra um exemplo representativo de 2 receptores de vacina. Curiosamente, durante essa temporada específica de gripe, A/H3N2/Texas/2012 não estava circulando, e em vez disso, a temporada incluiu a estirpe viral um pouco diferente: A/H3N2/Suíça/2013. A hemaglutinina viral de A/H3N2/Texas/2012 e A/H3N2/Suíça/2013 mostrar identidade de sequência de 97% e diferem em apenas onze aminoácidos (ver quadro 4), cujas posições são destacadas na Figura 7.

Figura 7 : Comparação de hemaglutinina de cepas A/H3N2 gripe. Comparamos a hemaglutinina das cepas virais A/Texas/50/2012 e A/Suíça/9715293/2013. Uma vez que existem estruturas cristal hemaglutinina destas tensões, usamos a estrutura de cristal da hemaglutinina altamente similar da estirpe da gripe A/Victoria/361/201118, que mostra a identidade de sequência de 98% com a estirpe de Texas e 95% identidade de sequência com a cepa de Suíça. Destacam-se as posições de aminoácidos, em que diferem cepas do Texas e Suíça. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Observamos uma resposta imune cross-reactive para as estirpes virais A/H3N2/Suíça/2013 e A/H3N2/Texas/2012. Oi títulos contra Influenza A/H3N2/Suíça/2013 foram significativamente menores em termos de concentração média geométrica e induzida soroproteção (Figura 8A) em comparação com a gripe A/H3N2/Texas/2012 (Figura 8B).

Figura 8 : Média geométrica-anticorpos de doadores saudáveis. As média geométrica-anticorpos (títulos) de 25 doadores saudáveis pré e pós-vacinação são determinados usando dois antígenos diferentes. A concentração média de A/H3N2/Suíça/2013 (A) e A/H3N2/Texas/2012 (B) é mostrada. Uma resposta imunológica devido a vacinação pode ser observada como títulos a aumentar após a vacinação (d7-d60), em comparação com os títulos antes da vacinação (d0). 180 dias após a vacinação, os títulos diminuem novamente. Digno de nota, só A/H3N2/Texas/2012 (que estava na vacina) atinge títulos protetoras. Barras indicam a média geométrica de títulos, e bigodes indicam os intervalos de confiança de 95%. Linha tracejada indica o limite de soroproteção. O % de seroprotected pessoas (título > 01:40) é mostrada no gráfico. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Após a vacinação, os anticorpos contra A/H3N2/Texas/2012 aumentaram na maioria dos Assuntos; Embora a cepa A/H3N2/Suíça/2013 não estava presente na vacina, o título contra A/H3N2/Suíça/2013 aumentou em alguns assuntos também. A Figura 9 mostra a correlação entre os dois títulos sobre todos os pontos de tempo com um R2 de 0,745 para um modelo de regressão linear. Como seria de esperar, a indução da resposta anticorpo contra A/H3N2/Suíça/2013 foi menos potente.

Figura 9 : Cross-reaction entre estirpes de gripe A/H3N2. Os títulos A/H3N2/Texas de cada ponto individual e tempo são plotados contra títulos correspondentes A/H3N2/Suíça. Um modelo de regressão linear mostra um R2 de 0,745. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Potencial de hemaglutinação baseia-se no tipo de sangue usadas
A hemaglutinina viral mostra diferente espécies dependentes potencial para hemagglutinate de hemácias. Este efeito dependente da espécie também impacta o ensaio de inibição da hemaglutinação. Para melhorar a especificidade dos títulos anti-virais medidos, avaliamos o tipo mais adequado de eritrócitos para cinco antígenos virais (Influenza B/Brisbane/60/2008 e B/Massachusetts/02/2012, Influenza A/H1N1/Califórnia/2009, A/H3N2/Texas/2012 e A / H3N2/Switzerland/2013) para alcançar a máxima hemaglutinação, mas também a mais baixa reatividade cruzada. Nós costumávamos soros de controlo positivo do Instituto Nacional para padrões biológicos e controle (NIBSC) contra cada antigénio para realizar estes ensaios.
Para Influenza B, observamos que a resposta imunitária induzida B/Massachusetts/02/2012 não fornece proteção contra B/Brisbane/60/2008. Em contraste, anticorpos contra B/Brisbane/60/2008 mostraram reatividade cruzada contra B/Massachusetts/02/2012 em um 4-fold título inferior através de eritrócitos diferentes (ver quadro 3). De interesse, sangue de porco da Guiné não corretamente hemagglutinate com Influenza B. Turquia sangue fez melhor em mostrar o potencial de hemagglutinate e a concentração mais elevada com reactividade cruzada baixa relativa, além do mencionado anteriormente A/H3N2/Texas e / Cepas de Suíça.
| Turquia | Porquinho da Índia | Frango | Tipo humano O | |
| B/Brisbane | 1024 | - | 1024 | 1024 |
| B/Massachusetts | 1024 | 384 | 768 | 1024 |
| A/H3N2/Suíça | 1024 | 1024 | - | 1024 |
| A/H3N2/Texas | 1024 | 1024 | 512 | 1024 |
| A/H1N1/Califórnia | 1024 | 1024 | 768 | 768 |
Tabela 3: Títulos de controlo positivo contra o antigénio HA gripe respectivas espécies diferentes.
| Não | Estirpe A/H3N2/Texas/2012 | Estirpe A/H3N2/Suíça/2013 | Posição |
| 1 | Asparagina (N) | Alanina (A) | 128 |
| 2 | Alanina (A) | Serina (S) | 138 |
| 3 | Isoleucina (I) | Arginine (R) | 140 |
| 4 | Arginine (R) | Glicina (G) | 142 |
| 5 | Asparagina (N) | Serina (S) | 145 |
| 6 | Fenilalanina (F) | Serina (S) | 159 |
| 7 | Glicina (G) | Valina (V) | 186 |
| 8 | Prolina (P) | Serina (S) | 198 |
| 9 | Serina (S) | Fenilalanina (F) | 219 |
| 10 | Asparagina (N) | Aspartato (D) | 225 |
| 11 * | Lisina (K) | Arginine (R) | 326 |
| * Não mostra a estrutura de cristal na Figura 8, porque a hemaglutinina foi cortada no resíduo 325. |
Tabela 4: Lista de aminoácidos diferentes de hemaglutinina entre cepas A/H3N2/Texas/2012 e A/H3N2/Suíça/2013
A.E. foi apoiado por uma pesquisa concede a partir do programa "SNSF Ambizione Score" (PZ00P3_154709), "Forschungsfond, strategischer Förderung Projekte" Universidade de Basel, Basel de Stiftungsinfektionskrankheiten e Bangeter Naraa Stiftung. L.K. foi apoiado por uma bolsa de técnico Universidade de Graz, Áustria. J.L. confirma apoio por uma comunhão IDoutora da iniciativa SystemsX.ch no programa de biologia de sistemas (9th chamada).
Os protocolos apresentados descrevem como realizar um ensaio de inibição de hemaglutinação para quantificar os anticorpos específicos de gripe de amostras de soro de destinatários de vacina contra gripe. O primeiro ensaio determina as concentrações de antígeno viral ideal por hemaglutinação. O segundo ensaio quantifica anticorpos específicos da gripe através da inibição da hemaglutinação.
nenhum.
| Reservatórios de pipeta multicanal descartáveis de 25 ml | Integra | 4312 | |
| tubos de PCR de 8 poços | Marca GMBH | 781332 | Para alíquotas de soro |
| Placa de microtitulação de 96 poços, | TPP | em forma de U92097 | Para ensaio HI ao usar hemácias de mamíferos |
| Placa de microtitulação de 96 poços, | Corning em | forma de V Costar3897 | Para ensaio HI ao usar hemácias |
| aviáriasAqua ad iniect. Steril | Bichsel AG | 1000004 | Para preparar soluções de antígeno influenza e filtrado de cólera |
| Frango RBC (10%) | Cedarlane | CLC8800 | suspensão de 10% de glóbulos vermelhos de frango em solução de Alsever |
| Filtrado de cólera | Sigma-Aldrich | C8772 | Usado como enzima destruidora de receptor (RDE) |
| Dulbecco's PBS | Sigma-Aldrich | D8537 | Para diluir as amostras de soro, hemácias e antígenos |
| Eppendorf Pipeta multicanal, 12 canais, 10-100 µ l | Pipeta multicanal Sigma-Aldrich | Z683949 | |
| Eppendorf, 8 canais, 10-100 µ l | Sigma-Aldrich | Z683930 | |
| Porquinho-da-índia RBC (10%) | Cedarlane | CLC1800 | suspensão de 10% de glóbulos vermelhos de cobaias em solução de Alsever |
| Influenza Anti-A/California/7/09 HA soro | NIBSC | 14/134 | Usado como controle positivo no ensaio HI |
| Influenza Anti-A/Suíça/9715293/2013-like HA sérum | NIBSC | 14/272 | Usado como controle positivo no ensaio HI |
| Influenza Anti-A/Texas/50/2012-Like HA Serum | NIBSC | 13/178 | Usado como controle positivo no ensaio HI |
| Influenza Anti-B/Brisbane/60/2008-HA sérum | NIBSC | 13/254 | Usado como controle positivo no ensaio HI |
| Influenza Anti-B/Massachusetts/02/2012 Soro HA | NIBSC | 13/182 | Usado como controle positivo no ensaio HI |
| Antígeno Influenza A/Califórnia/7/09 (H1N1)(NYMC-X181) | NIBSC | 12/168 | Inativado, parcialmente purificado A/California/7/09 (H1N1)(NYMC-X181) vírus (ca. 46µ gHA/ml) |
| Antígeno da gripe A/Suíça/9715293/2013 (NIB88) | NIBSC | 14/254 | Vírus A/Suíça/9715293/2013 (NIB88) inativado, parcialmente purificado (ca. 55µ gHA/ml) |
| Antígeno da gripe A/Texas/50/2012 (H3N2)(NYMCX-223) | NIBSC | 13/112 | Inativado, parcialmente purificado A/Texas/50/2012 (H3N2)(NYMCX-223) vírus (ca. 74µ gHA/ml) |
| Antígeno da gripe B/Brisbane/60/2008 | NIBSC | 13/234 | Vírus B/Brisbane/60/2008 inativado, parcialmente purificado (ca. 42µ gHA/ml) |
| Antígeno da gripe B/Massachusetts/02/2012 | NIBSC | 13/134 | Vírus B/Massachusetts/02/2012 inativado, parcialmente purificado (ca. 35µ gHA/ml) |
| Tubos de Soro | S-Monovette, Sardstedt | 01.1601.100 | Para extração de soro com ativador de coagulação |
| Único Doador Humano RBC, Tipo 0 | Pesquisa Inovadora | IPLA-WB3 | Suspensão de glóbulos vermelhos humanos de dador único em solução de Alsever (ca. 26%) |
| Turquia RBC (10%) | Cedarlane | CLC1180 | suspensão de 10% de glóbulos vermelhos de peru em solução de Alsever |
| Solução salina tamponada com fosfato (PBS) | Gibco |