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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Apresentamos um protocolo para sincronização de timidina duplo de células HeLa, seguido de análise utilizando microscopia confocal de alta resolução. Esse método é a chave para a obtenção de grande número de células que proseguem sincronicamente de fase S de mitose, permitindo estudos sobre funções mitóticas das proteínas multifunctional que também possuem funções de interfase.
Estudo dos vários eventos reguladoras do ciclo celular de uma forma dependente da fase fornece um entendimento claro sobre o crescimento celular e divisão. A sincronização de populações de células em estágios específicos do ciclo celular foi encontrada para ser muito útil em tais esforços experimentais. Sincronização de células por tratamento com produtos químicos que são relativamente menos tóxicos pode ser vantajosa sobre o uso de drogas inibidoras farmacológicas para o estudo de eventos consequente ciclo celular e obter enriquecimento específico das fases mitóticas selecionados. Aqui, descrevemos o protocolo para Sincronizando pilhas humanas em diferentes fases da célula o ciclo, incluindo ambos na fase S e fase de M com um bloco de timidina duplo e liberar o procedimento para estudar a funcionalidade das proteínas mitóticas em alinhamento de cromossomo e segregação. Este protocolo tem sido extremamente útil para estudar as funções mitóticas das proteínas multifunctional que possuem funções de interfase estabelecida. No nosso caso, o papel mitótico da Cdt1, uma proteína essencial para o licenciamento de origem de replicação na fase G1, pode ser estudado efetivamente somente quando Cdt1 G2/M-específico pode ser esgotado. Descrevemos o protocolo detalhado para esgotamento de Cdt1 G2/M-específicos usando a sincronização de timidina duplo. Nós também explicar o protocolo de fixação da pilha e viver a imagem latente da pilha usando microscopia confocal de alta resolução após lançamento de timidina. O método também é útil para analisar a função das proteínas mitóticas em condições fisiológicas e perturbadas como para Hec1, um componente do complexo, o Ndc80, que permite um para obter os tamanhos de amostra grande de células mitóticas para celular fixo e ao vivo análise como mostramos aqui.
No ciclo celular, as células sofrem uma série de eventos altamente regulamentados e temporalmente controlados para a duplicação exata do seu genoma e proliferação. Nos mamíferos, o ciclo celular consiste em interfase e fase M. Na interfase, que consiste em três fases - G1, S, e G2, a célula duplica seu genoma e sofre o crescimento que é necessário para o ciclo celular normal progressão1,2. Na fase M, que consiste de mitose (prófase, prometafase, metáfase, anáfase e telófase) e citocinese, uma célula parental produz duas células-filhas geneticamente idênticas. Em mitose, irmã cromátides irmãs de duplicação do genoma são condensado (prófase) e são capturados em seus cinetócoros por microtúbulos do fuso mitótico montado (prometafase), que dirige o seu alinhamento na placa metafásica (metáfase) seguida por seus igual a segregação quando irmã cromátides irmãs são divididos em direção e transportados para eixo oposto polos (anáfase). As duas células-filhas são fisicamente separadas pela atividade de um anel contrátil actina-baseado (telófase e citocinese). O cinetócoro é uma estrutura especializada proteicas que monta na região centromérica de cromátides irmãs e servem como locais de fixação para os microtúbulos do fuso. Sua principal função é conduzir a captura do cromossomo, alinhamento, e ajuda na correção de acessório do microtubule imprópria do eixo, enquanto mediando o checkpoint de montagem do eixo para manter a fidelidade do cromossoma segregação3,4.
A técnica de sincronização do celular serve como uma ferramenta ideal para compreender os eventos moleculares e estruturais envolvidos na progressão do ciclo celular. Esta abordagem tem sido usada para enriquecer as populações de células em fases específicas para vários tipos de análises, incluindo a criação de perfil de expressão gênica, análises de processos bioquímicos celulares e detecção de Localização subcellular das proteínas. Células de mamíferos sincronizadas podem ser usadas não só para o estudo de produtos de genes individuais, mas também para abordagens envolvendo análise de genomas inteira, incluindo análise de microarray de gene expressão5, miRNA expressão padrões6, Regulamento de translação7e análise proteômica de proteína modificações8. Sincronização também pode ser usada para estudar os efeitos da expressão do gene ou a proteína knock-down ou mata-mata, ou de produtos químicos na progressão do ciclo celular.
As células podem ser sincronizadas em diferentes fases do ciclo celular. Métodos físicos e químicos são amplamente utilizados para sincronização do celular. Os critérios mais importantes para a sincronização de célula são que a sincronização deve ser fotoefeito e reversível. Devido as potenciais consequências celulares adversas de Sincronizando pilhas por agentes farmacológicos, métodos químico-dependente podem ser vantajosos para estudar eventos chave ciclo celular. Por exemplo, Hidroxiureia, amphidicolin, mimosine e lovastatina, podem ser usados para sincronização de célula na fase G1/S, mas, por causa de seu efeito sobre as vias bioquímicas que eles inibem, eles ativar mecanismos de ponto de verificação do ciclo celular e matar um importante fração das células9,10. Por outro lado, feedback inibição da replicação do DNA pela adição de timidina para a mídia de crescimento, conhecida como "bloco" de timidina, pode prender o ciclo celular em certos pontos11,12,13. As células também podem ser sincronizadas na fase G2/M, tratando com nocodazole e RO-33069,14. Nocodazole, que impede a montagem de microtúbulos, tem uma relativamente elevada citotoxicidade. Além disso, as células nocodazole-preso podem retornar para interphase precocemente por deslizamento mitótico. Dupla timidina bloco prisão células na fase G1/S e após o lançamento do bloco, as células encontram-se proceder de forma síncrona G2 e mitose. A normal progressão do ciclo celular por células liberado do bloco de timidina pode ser observada sob microscopia confocal de alta resolução por fixação da pilha ou imagens ao vivo. O efeito da perturbação das proteínas mitóticas pode ser estudado especificamente quando células entram e prosseguir através de mitose, após o lançamento do bloco de timidina duplo. Cdt1, uma proteína multifuncional, está envolvido em licenciamento de origem de replicação do DNA na fase G1 e também é necessária para anexos do microtubule cinetócoro durante a mitose15. Para estudar a função de Cdt1 durante a mitose, é necessário adoptar um método que evita o efeito de sua redução na replicação de licenciamento durante a fase G1, enquanto ao mesmo tempo efetuar sua redução especificamente na fase G2/M apenas. Aqui, apresentamos protocolos detalhados baseados no bloco de timidina duplo para estudar o papel mitótico das proteínas executar múltiplas funções durante as diferentes fases do ciclo celular de imagens fixas e viver-pilha.
1. double bloco de timidina e lançamento: preparações de reagente
2. protocolo para a imagem latente de célula fixa de progressão mitótica (figura 1A)
3. protocolo para a imagem latente de célula viva de progressão mitótica (Figura 3A)
Estudo de progressão mitótica e estabilidade de microtúbulos nas células fixo após o lançamento do bloco de timidina dobro
Cdt1 está envolvido no licenciamento das origens de replicação do DNA na fase G1. Ela é degradada durante a fase S, mas re-acumula-se na fase G2/M. Para estudar o seu papel na mitose, o Cdt1 endógeno precisa estar esgotado especificamente na fase de G/M, usando a técnica de sincronização de célula mais adequada, o dobro de timidina bloco15. As células foram transfectadas com siRNAs imediatamente após o lançamento do bloco 2nd timidina, quando as células são no S fase e época em que o licenciamento das origens de replicação no G1, que também requer a função de Cdt1, há muito tempo foi concluído. A depleção de Cdt1 após 9 h de Transfeccao de siCdt1 e duplo lançamento de bloco de timidina foi validada pela mancha ocidental (figura 1B). Fixação de células 9 h após o lançamento do bloco duplo timidina mostra que a maioria das células estão na fase de metáfase em controle e Cdt1 siRNA transfectadas células. Mas a fixação das células 10h após o lançamento do bloco duplo timidina mostra que siRNA-Tratado de Cdt1 maioria das células são ainda preso na fase tardia prometafase enquanto células controle digite anáfase e normalmente segregam os cromossomas como esperado (Figura 1 ). Para entender o efeito de depleção de Cdt1 na estabilidade do cinetócoro-microtubule (kMT), células foram fixadas às 9 horas após o lançamento do bloco de timidina dobro seguido de tratamento pelo frio, que apenas mantém estáveis cinetócoro-microtúbulos (kMTs). Os kMTs de células Cdt1 empobrecido são relativamente menos robustos após tratamento pelo frio comparado com a de células de controle (Figura 1). Assim, usando essa abordagem, a progressão das células mitóticas normais após a perturbação da função de somáticas mitóticas de interesse pode ser estudada efetivamente, mesmo sem o uso de imagens de células vivas.
A Figura 2 mostra que licenciamento de origem de replicação do DNA não é perturbado quando as células estão esgotadas de Cdt1 na fase G2/M usando nosso protocolo, que também foi observado em células de controle. Células empobrecidas de Cdt1 na fase G2/M não induz a acumulação de ɣH2AX fosforilada, um marcador de dano do ADN, durante a fase G2 subsequente; Considerando que a transfeccao siRNA de culturas assíncronos para esgotar Cdt1 induzidas pelo acúmulo de focos de fosfo-ɣH2AX-positivos, possivelmente devido a danos no DNA induzidos pelo licenciamento de replicação de DNA impróprio.
Estudo de progressão mitótica nas células após o lançamento do bloco duplo timidina por imagens de células vivas
Após o colapso do envelope nuclear (NEB), as células normais (na ausência de perturbação por uma proteína funcional mitótica) digite mitose e passam por início da anáfase para sair da mitose dentro de cerca de 30-60 min (Figura 3B). Mas encontra-se mediada por RNAi nocaute de Hec1, uma proteína chave cinetócoro que é necessária para a formação de apego de kMT robusto, para atrasar a progressão mitótica normal. Nesse cenário, a maioria das células entrar mitose após o NEB, mas não se submeter a início da anáfase ou sair da mitose mesmo após várias horas de atraso na mitose (Figura 3). Da mesma forma, o efeito do knockdown RNAi-mediada de qualquer outra proteína que localiza aos cinetócoros ou tendo uma função durante a mitose, portanto, observam efetivamente usando imagens de células vivas após lançamento de blocos de timidina duplo. Além de estudar a natureza da progressão mitótica, atraso e prisão, alguns dos outros principais mitóticos fenômenos que podem ser analisados usando este método incluem cromossomo alinhamento, formação do fuso mitótico e a ativação de posicionamento e silenciamento do posto de montagem do eixo.

Figura 1: análise de progressão mitótica e a estabilidade dos microtúbulos cinetócoro nas células fixas após a sincronização de timidina dobro. (A), A representação esquemática de imunofluorescência, fixação e sincronização de célula. (B) borrão ocidental para derrubada de Cdt1 após 9 h de lançamento do 2º bloco de timidina. (C) micrografias de imunofluorescência para mostrar as células mitóticas fixo 9 e 10 h após a liberação do bloco duplo timidina e tratamento com controle (topo) ou Cdt1 siRNA (parte inferior). Α-tubulina coloração em vermelho, DNA está em verde, como células expressam GFP-histona H2B. Barra de escala = 10 µm. células Prometaphase e metáfase são indicadas usando amarelo e branco pontas de seta, respectivamente. (D) HeLa células após tratamento com controle siRNA (painel superior) e depleção de Cdt1 (painel inferior) para 9 h após a saída da dupla bloco de timidina seguido por tratamento com Leibovitz gelada (L-15) médio e fixação. As células foram manchadas imunológico para eixo MT (verde) e um marcador do cinetócoro, Zwint1 (vermelho) e DAPI para DNA em preto e branco. Barra de escala = 5 µm. clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: Cdt1-esgotamento durante a fase G2/M não está no caminho da replicação licenciamento. Cdt1 siRNAs (painel central) ou dupla timidina sincronizado células HeLa tratadas com siRNA cdt1 durante a lavagem de timidina 2nd -out seguida de fixação às 10 h ou assíncronas células HeLa tratadocom com controle do luciferase (painel superior) após o lançamento (painel inferior) foram corados com DAPI (pseudo cor verde) e anticorpo antifosfo-ɣH2AX (vermelho). Barra de escala = 10 µm. clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: análise de progressão mitótica por célula viva imagem em sincronizado células. (A), A representação esquemática da sincronização de célula e imagens de células vivas. Células de HeLa estàvel expressando mCherry-histona H2B e GFP-α-tubulina foram liberados de bloco de timidina duplo para 8 h para deixá-los continuar em fase G2/M, de detenção de fase S. Imagem ao vivo foi realizada usando um microscópio confocal de alta resolução, começando 8 h após a liberação das células do bloco de timidina e continuando para até 16 h a partir desse ponto. Aqui são mostrados as imagens estáticas do vídeo capturado a cada 10 min para células de controle sem perturbação de qualquer proteína mitótica (B) ou células empobrecidas de subunidade Hec1 do Ndc80 complex (C). Barras de escala = 10 µm. clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores declaram que não têm nenhum interesse financeiro concorrente.
Apresentamos um protocolo para sincronização de timidina duplo de células HeLa, seguido de análise utilizando microscopia confocal de alta resolução. Esse método é a chave para a obtenção de grande número de células que proseguem sincronicamente de fase S de mitose, permitindo estudos sobre funções mitóticas das proteínas multifunctional que também possuem funções de interfase.
Agradecemos ao Dr. Kozo Tanaka, da Universidade de Tohoku, Japão por compartilhar as células HeLa estàvel expressando mCherry-histona H2B e GFP-α-tubulina. Este trabalho foi apoiado por uma bolsa NCI para DV (R00CA178188) e por fundos de start-up da Universidade de Northwestern.
| DMEM (1x) | Life Technologies | 11965-092 | Loja em 4 ° C |
| DPBS (1x) | Life Technologies | 14190-144 | Loja em 4 ° C |
| Leibovitz' s (1x) L-15 médio | Life Technologies | 21083-027 | Loja em 4 ° C |
| Serum reduzido médio (Opti-MEM) | Life Technologies | 319-85-070 | Armazene em 4 ° C |
| Penicilina e estreptomicina | Life Technologies | 15070-063 (Pen Strep) | 1:1,000 diluição |
| Dharmafect2 | GE Dharmacon | T-2002-02 | Loja em 4 ° C |
| Timidina | MP Biomedicals LLC | 103056 | Dissolvido em água destilada estéril |
| Cdt1 siRNA | Life Technologies | Ref 10 | |
| Hec1 siRNA | Life Technologies | Ref 13 | |
| Células HeLa expressando GFP-H2B | |||
| Células HeLa expressando GFP-&alfa;-tubulina e mCherry H2B | Presente generoso do Dr. Kozo Tanaka de Tohoku universidade, Japão | ||
| Solução de formaldeído | Sigma-Aldrich Corporation | F8775 | Tóxico, precisa de cautela |
| DAPI | Sigma-Aldrich Corporation | D9542 | Tóxico, precisa de cautela |
| Rato anti-&alfa;-tubulina | Santa Cruz Biotecnologia | Sc32293 | Diluição 1:1.000 |
| Rabbit ant-Zwint1 | Bethyl | A300-781A | diluição 1:400 |
| Anti-fosfo-&gama de camundongo; H2AX (Ser139) | Upstate Biotechnology | 05-626, clone JBW301 | Diluição 1:300 |
| Alexa 488 | Jackson ImmunoResearch | Diluição 1:250 | |
| Rodamine Red-X | Jackson ImmunoResearch | Diluição 1:250 | |
| BioLite 6 poços multiprato | Thermo Fisher Scientific | 130184 | |
| 35 mm Prato com fundo de vidro | MatTek Corporation | P35GCOL-1.5-14-C | |
| Nikon Eclipse TiE microscópio invertido | Nikon Instruments | ||
| Disco giratório para câmera confocal | Yokagawa | CSU-X1 | |
| Ultra 888 EM-CCD | Andor | iXon Ultra EMCCD | |
| 4 laser de comprimento de onda | Sistema de incubaçãoAgilent Technologies | ||
| para microscópios | Tokai Hit | TIZB | |
| Software de elementos NIS | Nikon Instruments |