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Todas as experiências em animais foram realizadas de acordo com as orientações para o cuidado e o uso de animais de laboratório e foram aprovadas pelas autoridades responsáveis (Regierung von Oberbayern, Munique, Alemanha e Stanford cuidados institucionais do Animal e usar Comité, Stanford, CA, EUA). Uma lista de todos os plasmídeos de clonagem (passo 1 a 4) é fornecida na tabela complementar S1.
1. a clonagem de um Transgene para expressão gênica constitutiva
- Desenho de primers para amplificação de transgene13,14.
- Adicione restrição sites para PacI (TTAATTAA) à extremidade 5' do primer para a frente. Adicione sites de restrição para AscI (GGCGCGCC) ou FseI (GGCCGGCC) à extremidade 5' do primer reverso.
- Amplifica o transgene por PCR usando condições otimizadas para o transgene desejado14. Purifica usando um kit de purificação de DNA disponível comercialmente.
Nota: Tempo de recozimento depende os primers desenhados na etapa 1.1., tempo de alongamento depende do comprimento da construção. Por exemplo, para uma construção de 1.000 bp comprimento uso 60 s de tempo de alongamento.
- Digerir o transgene e vector de expressão de gene constitutivo15 com nucleases de restrição respectiva (consulte a etapa 1.2) e buffer em um volume total de 50 µ l a 37 ° C durante a noite. Por exemplo, digerir construção com 5 unidades PacI e 5 unidades FseI se apropriado (consulte a etapa 1.2).
- Gel de purificar vetor digerido e insert usando um kit de extração do gel de comerciais de acordo com as instruções do fabricante. Execute uma ligadura padrão de 100 ng do vetor e 100 – 1.000 ng de insert usando 400 U T4 ligase a 14 ° C, durante 16 h. calor inativar a 65 ° C por 10 min.
- Transforme bactérias competentes, usando um padrão de calor-choque-protocolo16.
- Placa de ágar placas contendo ampicilina de 100 µ g/mL. Incube a 30 ° C por 24 h.
- Escolha única colônias, purificar DNA do plasmídeo usando um kit miniprep comercial de acordo com as instruções do fabricante e verificar a sequência de sequenciamento Sanger17 (cartilha de sequenciamento: 5' TGCTGGAGTTCTTCGCC 3').
- Use positivo colônias para maxi escala de amplificação do ADN do plasmídeo e purificam usando um kit preparação livre de endotoxinas plasmídeo18 de acordo com as instruções do fabricante.
- Construção está pronta para a injeção, assim, continue com o passo 5.
2. clonagem de um Transgene para expressão gênica Inducible
- Desenho de primers para amplificação de transgene13,14.
- Adicione sites de restrição para SacI (GAGCTC), SpeI (ACTAGT) ou KpnI (GGTACC) à extremidade 5' do primer para a frente. Adicione sites de restrição para NotI (GCGGCCGC) ou XhoI (CTCGAG) à extremidade 5' do primer reverso.
- Amplifica o transgene por PCR usando condições otimizadas para o transgene desejado14. Purifica a utilização de um kit de purificação de DNA comercial.
- Digerir o transgene purificado e 4 µ g do vetor de entrada (pEN_TTmcs-vetor, consulte Tabela de materiais)19 separadamente com nucleases de restrição apropriada (consulte a etapa 2.2) e buffer em um volume total de 50 µ l a 37 ° C durante a noite.
- Gel de purificar vetor digerido e insert usando um kit de extração do gel de comerciais de acordo com as instruções do fabricante. Realize a Ligadura padrão com 100 ng do vetor e 100 – 1.000 ng de insert usando 400 U T4 ligase a 14 ° C, durante 16 h. calor inativar a 65 ° C por 10 min.
- Transforme bactérias competentes, usando um padrão de calor-choque-protocolo16.
- Placa de ágar placas contendo gentamicina 15 µ g/mL. Incube a 37 ° C, durante 16 h.
- Escolha única colônias, purificar o Plasmídeo e verificar inserir por sequenciamento17 usando o primer frente pCEP: 5' AGAGCTCGTTTAGTGAACCG 3'.
Nota: PCR em colônias simples pode ser realizada sem prévia purificação com pCEP primers para a frente e pCEP reversa (5' AGA AAG CTG GGT CTA GAT ATC TCG 3'). Esta etapa pode útil para pré-selecção das colônias positivas.
- Prossiga para a etapa 4.
3. clonagem de um miR-shRNA para Inducible Gene Knock-down
- Projeto miR-shRNA oligonucleotides de acordo com o pSLIK protocolo19de clonagem. Recoze e purificar oligonucleotides e diluir 01:20 em ddH2O.
- Digest 3 µ g do vetor de entrada com 5 U BfuAI, a 50 ° C por 3 h, então inativar a reação a 65 ° C por 20 min.
Nota: Se for desejado co expressão da proteína verde fluorescente (GFP), uso pEN_TTGmiRc19 como um vetor de entrada, caso contrário use pEN_TTmiRc219.
- Gel de purificar vetor digerido como na etapa 2.5. Realizar a Ligadura padrão de 100 ng do vetor e 1 µ l de purificado e diluído oligonucleotides shRNA (passo 3.1) usando 400 U T4 ligase em temperatura ambiente por 1 h. calor inativar a 65 ° C por 10 min.
- Transforme bactérias competentes, usando um padrão de calor-choque-protocolo16.
- Placa de ágar placas contendo gentamicina 15 µ g/mL. Incube a 37 ° C, durante 16 h.
- Escolher o única colônias, purificar o Plasmídeo e verificar inserir por Sanger sequenciamento17 (cartilha de sequenciamento: 5' TAGTCGACTAGGGATAACAG 3').
- Prossiga para a etapa 4.
4. recombinational clonagem para gerar Clones pronto-para-injeção
- Mix 150 ng do vetor de entrada (da etapa 2 ou etapa 3) e 150 ng do pTC TET-vetor20.
- Adicionar um volume total de 8 µ l tampão TE (pH = 8).
- Transfira a mistura de enzima LR-clonase II (ver Tabela de materiais) para gelo, incubar por 2 min. Vortex duas vezes.
- Adicionar 2 µ l do mix de enzima LR-clonase II para a reação e incubar a 25 ° C, durante 1 h.
- Pare a reação adicionando 1 µ l de Proteinase K-solução. Incube a 37 ° C por 10 min.
- Transforme Stbl3 bactérias competentes com 2 µ l de clonagem recombinational misturam usando um padrão de calor-choque-protocolo16.
- Placa de ágar placas contendo ampicilina de 100 µ g/mL. Incube a 30 ° C por 24 h.
- Escolher o única colônias, purificar DNA do plasmídeo usando um kit preparação livre de endotoxinas plasmídeo18 de acordo com as instruções do fabricante e confirmar a integridade do vetor por Sanger sequenciamento17 (cartilha de sequenciamento 5' AGGGACAGCAGAGATCCAGTTTGG 3').
- Construção está pronta para a injeção, continue com o passo 5.
5. preparar solução injectável de veia de cauda hidrodinâmica
Nota: Preparação das construções para a expressão do gene constitutivo e inducible são descritas na etapa 1, 2, 3 e 4.
- Preparar a solução salina 0,9% estéril para injeção (que não uso PBS). Use o volume correspondente a cerca de 10% do peso do corpo do mouse. Exemplo: para um mouse com 20 g, prepare-se 2 mL de solução.
- Prepare os vetores de injeção que foram purificados usando um plasmídeo livre de endotoxinas purificação kit18 (ver passo 1.8 ou 4.8, respectivamente).
- Adicionar 10 µ g ou 15 µ g de construção de vetor livre de endotoxinas a bela adormecida (do passo 1 uso 10 µ g, da etapa 4 µ 15 g uso, respectivamente) e 1 µ g de endotoxinas-free pc-HSB521 / mL de solução salina estéril.
- Solução de armazenamento para até 4 h a 4 ° C. Não congele.
6. realizar a injeção de veia de cauda hidrodinâmica
- Use uma retenção para injeção de veia de cauda (comercial ou preparada de um tubo cónico de 50 mL com furos para respirar e para a cauda). Preencha o fundo do tubo com papel absorvente.
- Para a injeção, use ratos de cerca de 8-10 semanas de idade com pesos de 20 – 25 g.
- Pesar os ratos antes da injeção e prepare-se volume de injeção de acordo com o peso corporal (correspondentes a 10% do peso corporal, consulte a etapa 5.1). Prepare um estéril 3 mL-seringa com uma agulha G 27 para injeção e encha-a com o volume necessário.
- Coloque o mouse a retenção. Ajustar a quantidade de papel tissue (consulte a etapa 6.1) para deixar um espaço mínimo para o movimento mas espaço suficiente para respirar.
- Certifique-se de que o rato está respirando regularmente.
- Quente a cauda usando uma lâmpada infravermelha para 30-60 s. cuidadosamente atenção aos sinais de superaquecimento.
- Limpe o rabo com um algodão embebido em álcool.
- Inserir a agulha quase horizontalmente em qualquer um das duas veias laterais da cauda perto da base da cauda.
Nota: Se for colocado com êxito, uma pequena quantidade de sangue pode fluir de volta ao cone da agulha. Não é recomendável para aspirar ativamente como qualquer movimento adicional da agulha pode resultar em seu deslocamento e/ou lesão da veia.
- Injete o volume total da veia da cauda dentro de 8-10 s.
- Imediatamente, remova o mouse a retenção. Comprimir a injeção ferida pelo menos 30 s ou até algum sangramento diminui.
- Coloque o mouse em uma gaiola separada. Uma vez que o mouse se recuperou do procedimento (cerca de 30 a 60 min), transferi o mouse volta para sua gaiola original. Checar o mouse regularmente para as próximas 24 horas.
Nota: A sedação leve do mouse é observada rotineiramente para até 2 h após a injeção.
- Antes de prosseguir com mais experiências (ou seja, passo 7), espere 10 a 15 dias para habilitação de vetores não-integrados.
7. indução de CreER Transfectada com tamoxifeno
Atenção: O tamoxifeno é prejudicial, pode ser canceroso ou danificar a fertilidade. Por favor, consulte a ficha de dados de segurança.
- Plano de injeções intraperitoneal tamoxifeno em três dias consecutivos.
- No dia 1, dissolvem-se 10 mg de tamoxifeno em etanol a 40 µ l. Incube a 55 ° C durante 10 min. Vortex várias vezes até que se dissolva o tamoxifeno.
- Adicione o óleo de milho 960 µ l. Incubar durante 5 min. a 55 ° C. Vórtice várias vezes para obter uma solução límpida.
- Prepare a solução em uma seringa de insulina 1 mL com agulha 27G.
- Nuca o mouse, agarrando o pescoço do mouse cuidadosamente com o polegar e o segundo dedo, fixação da cauda entre a base da mão e o quarto e o quinto dedo.
- Injete 0,1 mL (= 1 mg de tamoxifeno) da solução intraperitonealmente no quadrante inferior esquerdo do abdômen.
- Repeti as injeções nos dias 2 e 3.
8. indução do Gene de tetraciclina dependente ou expressão de shRNA
Cuidado: A doxiciclina pode ser prejudicial. Por favor, consulte a ficha de dados de segurança.
Nota: Dependendo do tipo e duração do experimento, a doxiciclina pode ser fornecida em água potável (passo 8.1) ou chow (passo 8.2)
-
Para experiências de curto prazo (< 10 dias) administrar doxiciclina através da água potável, utilizando o seguinte protocolo.
- Dissolva sacarose 5 g em 100 mL de água da torneira. Autoclave.
- Dissolva 100 mg de doxiciclina-hyclate em 5 mL de solução de sacarose (etapa 8.1.1) em um tubo cônico de 15 mL.
- Utilizando uma seringa de 10 mL, estéril filtrar a solução através de um filtro de 0,2 µm. Adicione a solução de sacarose, preparada na etapa 8.1.1.
- Fornecer a solução de sacarose-doxiciclina como água potável para o mouse. Verifique diariamente e substituir quando a solução torna-se turva, indicando o overgrowth bacteriano (substituir a solução clara depois de três dias no máximo).
- Para experimentos de longo prazo (> 10 dias) ou experimentos sensíveis a mudanças metabólicas, usar doxiciclina-chow comercial (por exemplo, Doxycycline Hyclate Chow 0,625 g/kg) para evitar a desidratação e/ou alterações induzidas pelo sacarose em fígados de animais tratados.
9. preparação do fígado de rato para análise por imunocoloração
Cuidado: Paraformaldehyde pode ser prejudicial. Por favor, consulte a ficha de dados de segurança.
Nota: O commit quando ratos serão analisados varia de acordo com o experimento. Recomenda-se analisar o tecido hepático após não menos de três dias de tratamento doxiciclina para garantir suficiente da indução da expressão do transgene ou shRNA.
- Prepare uma seringa de 1 mL com agulha 27G com 1 mL de solução de paraformaldeído 4% (PFA).
- Eutanásia o mouse por um método adequado de acordo com um protocolo aprovado do animal.
Nota: Diretrizes para métodos adequados de eutanásia podem variar dependendo da instituição.
- Usando dissecação tesoura e pinça anatômica, abra cuidadosamente a cavidade abdominal com uma laparotomia mediana para expor o fígado. Mova o intestino delgado para o direito de expor a veia porta e a veia cava inferior (VCI).
- Insira a agulha da seringa preparada (ver passo 9.1) na veia cava inferior e corte a veia porta. 1 mL de PFA lentamente injete a veia cava inferior para perfundir o tecido do fígado e remover autofluorescente células vermelhas do sangue (desejáveis se coloração imunofluorescente será executada).
- Remova o fígado. Enxaguar em água e transferir para 5 a 10 mL de solução PFA 4%.
- Para cortes de parafina, tecido de correção para 36-48 h tecido está pronto para desidratação e incorporação de parafina.
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Para seções congeladas, fixe o tecido em 4% PFA por 1h.
- Por cryoprotection, transferência para a solução de sacarose a 10%. Incube 60 min.
- Transferir a solução de sacarose 20%. Incube 60 min.
- Transferir a solução de sacarose de 30%. Incubar 12 – 16 h. Embed em incorporação composto por seções congeladas e congelar a-20 ° C.