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Research Article
Adekunle T. Bademosi1, Elsa Lauwers2, Rumelo Amor3, Patrik Verstreken2, Bruno van Swinderen3, Frédéric A. Meunier1
1Clem Jones Centre for Ageing Dementia Research, Queensland Brain Institute,The University of Queensland, 2VIB Centre for Brain and Disease Research, KU Leuven Department of Neurosciences,Leuven Institute for Neurodegenerative Disease (LIND), 3Queensland Brain Institute,The University of Queensland
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Aqui ilustramos como microscopia de foto-ativado localização única molécula pode ser realizada no terminal nervoso motor de um vivo Drosophila melanogaster terceiro estádio de larva.
Um número crescente de técnicas de microscopia de super-resolução está ajudando a desvendar os mecanismos que regem o mundo celular nanoescala. Imagem de único-molécula está ganhando força como ele fornece acesso excepcional para a visualização de moléculas individuais em pilhas vivas. Aqui, descrevemos uma técnica que desenvolvemos para executar o rastreamento da único-partícula microscopia de Localização foto-ativado (sptPALM) em larvas de Drosophila . Comunicação sináptica se baseia em proteínas pré-sináptica chaves que atuam por encaixe, primer e promover a fusão do neurotransmissor contendo vesículas com a membrana plasmática. Uma gama de interações proteína-proteína e proteína-lipídio firmemente regula esses processos e as proteínas pré-sináptica, portanto, apresentam alterações na mobilidade associada com cada um desses eventos chaves. Investigar como mobilidade destas proteínas correlaciona-se com sua função fisiológica em um animal vivo intacta é essencial para a compreensão de seu mecanismo preciso de ação. Extração de mobilidade de proteína com alta resolução na vivo requer superar limitações como transparência óptica, acessibilidade e profundidade de penetração. Descrevemos como photoconvertible proteínas fluorescentes marcadas à pré-sináptica proteína Syntaxin-1A pode ser visualizado através de ligeira iluminação oblíqua e rastreadas no terminal do nervo motor ou ao longo do axônio do neurônio motor do terceiro ínstar drosófila larva.
A comunicação baseia-se na liberação de neurotransmissores, que ocorre através da fusão regulamentada de neurotransmissor contendo vesículas sinápticas com a membrana plasmática1. Este processo chamado exocitose2,3,4,5,6 é altamente dinâmico e pode ser de cima - ou para baixo-regulado de acordo com as flutuações da taxa de estimulação7. As proteínas envolvidas nesses processos estão sujeitos a movimento browniano e, portanto, exibir nanoscópico organização capaz de sustentar uma gama de ações que sustentam essas funções fisiológicas de vinculação. Proteínas de membrana plasmática são altamente dinâmicas, permitindo o ajuste de registro lateral de moléculas em nanoclusters na membrana plasmática7,8,9,10,11, 12. Como tal, investigando a mobilidade destas proteínas ajuda a elucidar o seu modo de ação8. Sinápticas proteínas como os solúvel N-proteà fator acessório proteína receptores (armadilhas), por exemplo Syntaxin-1A, são conhecidas por apresentar mobilidade rápida lateral, bem como lateral armadilhas dentro de nanoclusters que possam servir como molecular depósitos e sites para vesículas fusão9,13,14,15.
O desenvolvimento recente de proteínas fluorescentes photoconvertible, tais como monomérico (m) Eos16,17 e Kaede18, permitiu a resolução nanoscópico das proteínas de membrana de plasma neuronal através da utilização de abordagens tais como microscopia Localização foto-ativado (PALM) e reconstrução óptica estocástico microscopia (Tempestade)14,15,19. Estes desenvolvimentos permitiram investigações sobre a mobilidade e a nanoclustering de proteínas biológicas em culturas de células vivas e os neurônios. Mais recentemente, têm sido realizados estudos para elucidar (em similares em alta resolução) a dinâmica e a organização destas proteínas de membrana nos neurônios de organismos vivos intactos tais Mus musculus, Caenorhabditis elegans e Melanogaster da drosófila14,20,21,22.
Investigar a dinâmica e a organização de uma proteína na vivo requer não só a utilização das ferramentas de imagem recentemente desenvolvido Super-resolução (como fluorophores PALM, tempestade e photoconvertible), mas também a capacidade de superar obstáculos tais como a acessibilidade da proteína e a profundidade de penetração do laser de imagem. Imagem latente proteínas intracelulares em um animal intacto é inerentemente desafiadora como é imagem de proteínas em estruturas incorporadas profundamente dentro de tecidos vivos do animal intacto, tais como o hipocampo de um rato intacto. Portanto, proteínas sobre ou perto da superfície do tecido são mais facilmente fotografadas. Outra dificuldade com imagem latente na vivo é no sentido de garantir reprodutibilidade através de animais. Como a anatomia de uma amostra pode diferir para o outro, selecionar uma estrutura com facilidade de replicação em diferentes amostras animais intactas pode também constituir um desafio. O uso de estruturas estereotipadas, tais como as sinapses, ajudar a superar algumas destas dificuldades.
Estudos recentes têm fotografado mobilidade de proteína em animais com uma epiderme opticamente transparente como Caenorhabditis elegans22, enquanto outras investigações têm fotografado organização de proteína na superfície de um tecido/órgão, por exemplo imagem de actina em neurônios corticais através do crânio de um rato ao vivo21. Em alguns casos, anestésicos têm sido utilizados para manter o animal imóvel; no entanto, anestésicos específicos podem afetar adversamente a proteína de interesse. Meios alternativos para manter animais imóvel durante a imagem latente na vivo , portanto, devem ser explorados para minimizar o erro.
Outra ressalva a Super-resolução de imagem na vivo é que os lasers usados para iluminar as proteínas de interesse poderiam afetar adversamente o tecido circundante, e, portanto, manter a intensidade da excitação mais baixa possível é recomendado. Iluminação do tecido circundante pelo laser também tende a aumentar o sinal de fundo. O uso de intensidade baixa excitação ajuda a reduzir o plano de fundo, a advertência, sendo também pode levar a uma diminuição do rendimento de fóton de proteína fluorescente. Subtração de fundo durante a análise pode ser usada como um meio alternativo reduzir o sinal de fundo antes da análise de imagem.
Drosófila apresenta um organismo ideal para na vivo de imagens que fornece ferramentas de genéticas bem estabelecidas para a investigação da função da proteína específica. A sequência de ativação upstream (UAS)-sistema Gal4 permite a expressão temporal e espacial das proteínas e, portanto, pode ser usado para manipular a neurotransmissão23, tal que estimulação thermo-genética utilizando drosófila transitória família de sub potenciais receptores A1 (dTRPA1)24 ou estimulação opto-genética usando far-vermelhos-desloc CsChrimson25 pode ser combinada com imagem14. Nós superaram muitas das complicações da realização na vivo de imagem único-molécula neste sistema e agora descrever como único-partícula de rastreamento pode ser realizado em Drosophila melanogaster terceiro ínstar larvas.
1. projeto de transgénicos Drosophila expressando proteínas mEos2-Tagged
2. dissecação de terceiro ínstar de Larva
3. ligeiramente oblíqua iluminação microscopia de rastreamento da único-partícula
4. single-molécula localização em larvas fixas
Usando o protocolo transgénico listados acima, Syntaxin-1A-mEos2 Drosophilamelanogaster foram gerados (Figura 1). Transgênico terceiro estádio Drosophila larvas foram dissecadas na base cilíndrica PDMS (Fig. 2A-F). Para visualizar moléculas simples de Syntaxin-1A, usamos o PALM em um microscópio TIRF com iluminação de laser ligeiramente oblíqua14.
Moléculas simples de Syntaxin-1A foram seguidas nos terminais do nervo motor pré-sináptica no músculo 6 do segundo segmento abdominal. A fluorescência verde de mEos2 poderia ser detectada como mostra a imagem de baixa resolução de Syntaxin-1A-mEos2 na boutons de 1b do tipo quando animado usando o 488 nm laser (Figura 3A). Nas experiências de geração de imagens, a 405 nm e 561 nm da excitação do laser de imagem profundidades foram 133,5 nm e 165,6 nm, respectivamente. A imagem verde foi adquirida como uma média de 16 quadros individuais. Esta imagem verde foi usada para criar a região de interesse, usado para limitar a análise de suas localizações no filme photoconverted para os terminais de nervo motor pré-sináptica sozinhos.
A análise dos filmes sptPALM photoconverted adquirida gerou uma intensidade super resolvida, coeficiente de difusão, e trajetória de mapas (Figura 3A). Mobilidade Syntaxin-1A-mEos2 mais foi quantificada pela análise do deslocamento quadrático (MSD) das trajectórias individuais (Figura 3B). Comparações estatísticas podem ser feitas usando a área sob a curva MSD (Figura 3B). Uma análise mais aprofundada da mobilidade produz a distribuição do coeficiente de difusão de Syntaxin-1A-mEos2, e isto pode ser estatisticamente avaliado pela comparação do mobile para as populações de imóveis (Figura 3).

Figura 1 : Gerando construções com tag mEos2. O pFL44S-attB-MCS-w + vetor é linearizada com BamHI e XbaI. Codificação da proteína de interesse (POI) de fragmentos sobrepostos reação em cadeia da polimerase (PCR) e mEos2, respectivamente, podem ser clonados, por exemplo, por recombinação em vivo em ura3 - células de levedura ou pela Assembleia de Gibson. Observe que, para gerar o transgene Syntaxin-1A-mEos2, nós clonados a construção ladeada pelas sequências de promotor e terminator Syntaxin-1A endógenas. A construção resultante pode ser posteriormente injetada embriões da drosófila para criar uma linha de mosca transgênica expressando a proteína de interesse (POI) fundida-se para mEos2. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2 : Drosophila dissecção de larva e iluminação oblíqua. (A) esquema mostrando a dissecação de larva de drosófila realizada na base PDMS meia-cilíndrica. Realizou-se uma larva em filetes para os PDMS do gel pelo uso dos pinos de minutien. (B-C) A preparação de larva-PDMS foi colocada dentro de um prato de cultura com fundo de vidro contendo meio de Schneider inseto. Um microscópio TIRF em uma configuração de iluminação ligeiramente oblíqua foi usado para visualizar Syntaxin-1A-mEos2 nos terminais de nervos motores. (D-F) Uma base PDMS meia-cilíndrica com larvas de Drosophila dissecada. A preparação de larva-PDMS foi colocada em um prato de imagem preenchido com meio de Schneider e a larva foi fotografada no microscópio Super-resolução PALM. Barra de escala, 10 mm. (este valor foi modificado de14). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3 : Na vivo rastreamento de Syntaxin-1A-mEos2 o nervo motor pré-sináptica terminal. (A), A baixa resolução TIRF imagem de Syntaxin-1A-mEos2 em uma tipo 1b nervosa motora terminal. Análise de filmes photoconversion fotografada em 33 Hz gerado sptPALM intensidade super resolvido, coeficiente de difusão e trajetória mapas. 5.309 trajetórias individuais foram imagem aquisição de filme de mais de 16.000 quadros. Barra de escala, 3 μm. (B-C) Deslocamento de quadrático (MSD) de Syntaxin-1A-mEos2 foi plotado de 6 terminais de nervos motores diferentes; área sob a curva MSD (AUC) foi utilizada para quantificar o nível de mobilidade. A distribuição do coeficiente de difusão revela populações de Syntaxin-1A móveis e imóveis que possam ser quantificadas como rácios do outro; uma média de 2.400 ~ trajetórias foram obtidos por terminal do nervo motor (n = 3 larvas). Os dados apresentados como médio erro-padrão da média. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores não têm nada para divulgar.
Aqui ilustramos como microscopia de foto-ativado localização única molécula pode ser realizada no terminal nervoso motor de um vivo Drosophila melanogaster terceiro estádio de larva.
Agradecemos a Jean-Baptiste Sibarita e Daniel Choquet (IINS, CNRS/Universidade de Bordeaux) por seu apoio gentil com a análise de único-molécula. Agradecemos especialmente Nick Valmas e Jessica Mcgaw (QBI, Universidade de Queensland) por sua ajuda com o vídeo, gravação de voz-over, bem como design gráfico de figura. Este trabalho foi financiado pelo projecto de descoberta de Conselho de pesquisa australiano (AR) (DP170100125 a F.A.M.), o Conselho australiano de pesquisa (LIEF Grant LE0882864 a F.A.M.), futuro Fellowship (FT100100725 a B.V.S.), Australian Research Council (LIEF Grant LE130100078 a F.A.M.) e projeto NHMRC conceder (APP1103923 a B.V.S.). F.A.M. é um NHMRC Senior Research Fellow (ONT1060075).
| PDMS (kit de elastômero de silicone Sylgard 184) | Dow Corning Corporation | 000000000001064291 | |
| Prato de Cultura com Fundo de Vidro | In Vitro Scientific | D29-20-1.5-N | |
| Microscópio Óptico Estereo-microscópio | Olympus | SZ51 | |
| Pinças Curvas (Estilo 5/45) | Pinos Minutiende Ciências de Microscopia Eletrônica | 0208-5AC-PO | |
| (0.1mm) | Ferramentas de Ciência Fina | 26002-10 | |
| Schneider's Insect Medium | Sigma, Ciências da Vida | S0146 | |
| Tesoura de Mola Vannas | Ferramentas de Ciência Fina | 15000-00 | |
| Pinça Fina (Dumont #5) | Ferramentas de Ciência Fina | 11254-20 | |
| ELYRA PS.1 Microscópio | Zeiss | PS.1 | |
| Tamponado com Fosfato Salino (PBS) | Lonza | 17-515Q | |
| Paraformaldeído (16%)Ciências de | Microscopia Eletrônica | 15710 | |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T-9284 | |
| Soro de Cabra Normal | Sigma-Aldrich | G9023 | |
| Maxyclear snaplock microcentrífuga Tubo (1,7 mL) | Axygen | MCT-175-C | |
| Zen Black software de aquisição | Carl Zeiss, 2012 | ||
| Metamorph software | Molecular Devices | 7.7.8 | PALM Tracer Plugin |
| Fly strain | w1118; HA-Sx1A-mEos2 |