Um procedimento é apresentado para o dobrar do domínio de ligação do ligante periplasmático dCACHE de Campylobacter jejuni chemoreceptor Tlp3 de corpos de inclusão e a purificação para produzir quantidades de miligrama de proteína.
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Um procedimento é apresentado para o dobrar do domínio de ligação do ligante periplasmático dCACHE de Campylobacter jejuni chemoreceptor Tlp3 de corpos de inclusão e a purificação para produzir quantidades de miligrama de proteína.
Identificação de ligantes naturais de quimiorreceptores e estudos estruturais destinados a elucidação da base molecular da especificidade ligante pode ser facilitada pela produção de quantidades de miligrama de domínios de ligação do ligante puro, dobrado. As tentativas de heterologously express domínios de ligação ligante periplasmático de quimiorreceptores bacterianas em Escherichia coli (e. coli) muitas vezes resultam em seu direcionamento em corpos de inclusão. Aqui, um método é apresentado para recuperação de proteína de corpos de inclusão, dobrar e purificação, usando o domínio de ligação do ligante dCACHE periplasmático de Campylobacter jejuni (c. jejuni) chemoreceptor Tlp3 como exemplo. A abordagem envolve a expressão da proteína de interesse com um cleavable seu6-tag, isolamento e solubilização mediada por ureia, de corpos de inclusão, proteína dobrar pela depleção de ureia e purificação através de cromatografia de afinidade, seguido por cromatografia de tamanho-exclusão e remoção de marca. A espectroscopia de Dicroísmo circular é usada para confirmar o estado dobrado da proteína pura. Foi demonstrado que este protocolo é geralmente útil para produção de quantidades de miligrama de domínios de ligação ligante periplasmático dCACHE de outros quimiorreceptor bacteriana na forma solúvel e crystallisable.
Quimiotaxia e a motilidade foram mostrados para desempenhar um papel importante na patogênese de Campylobacter jejuni , promovendo a colonização bacteriana e a invasão do hospedeiro1,2,3. Quimiotaxia permite que as bactérias para avançar para um ambiente ideal para o crescimento, como guiado por sinais químicos. Esse processo envolve o reconhecimento de sugestões químicas intracelulares e ambientais por um conjunto de proteínas denominadas quimiorreceptor ou transdutor, como proteínas (TIPS). A maioria dos quimiorreceptores são proteínas de membrana-incorporado com um extracytoplasmic ligand binding domain (LBD), um domínio transmembrana e um domínio citoplasmático de sinalização, o último dos quais interage com as proteínas de sinalização citosólica que transmitem o sinal o flagelar motores4,5,6,,7.
Foram identificados onze quimiorreceptor diferentes do genoma de c. jejuni 4,8. Até à data, apenas alguns destes quimiorreceptores têm sido caracterizados e a especificidade de ligante de Tlp19, Tlp310,11, Tlp411, Tlp712e Tlp1113 é conhecida. Identificação de ligantes naturais dos restantes quimiorreceptor nesta espécie e numerosos quimiorreceptor em outras bactérias, pode ser facilitada pela produção de dobrada e altamente puro recombinante chemoreceptor LBDs14, 15 , 16. no entanto, as tentativas de heterologously express LBDs periplasmático de quimiorreceptores bacterianas em Escherichia coli muitas vezes resultam em seu direcionamento em corpos de inclusão17,18,19 . No entanto, este fenómeno pode facilitar fácil isolamento e recuperação da proteína na mão. Aqui, um método é apresentado para recuperação de proteína de corpos de inclusão, dobrar e purificação, usando o LBD periplasmático do c. jejuni chemoreceptor Tlp3 como exemplo. Este exemplo foi escolhido porque Tlp3-LBD pertence a família dCACHE20 de sensoriamento domínios que são encontrados abundantemente em dois-componente histidina quinases e quimiorreceptores em procariontes20,21, 22 , 23.
Nesta abordagem, a construção de expressão, com base em um vetor TOPO-pET151/D, foi projetada para incorporar um N-terminal dele6-etiqueta, seguido de um tabaco etch local de clivagem do protease do vírus (TEV), para marca subsequente remoção19. O protocolo descreve a superexpressão da proteína em e. coli, isolamento e solubilização de ureia-mediada de corpos de inclusão e proteína dobrar pela depleção de ureia. Após dobrar, a amostra é purificada por cromatografia de afinidade, com cromatografia de remoção e tamanho-exclusão opcional marca. O estado dobrado da proteína purificada é confirmado usando espectroscopia de Dicroísmo circular. Esta é uma versão modificada do método que foi desenvolvido anteriormente para recuperar e purificar o LBD de um chemoreceptor diferente, Helicobacter pylori TlpC19. Este procedimento, resumido na Figura 1, produz 10 a 20 mg de puro, sem marcas de formatação Tlp3-LBD por 1 L de cultura bacteriana, com uma pureza de proteína de > 90%, como estimado por SDS-PAGE.
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1. a expressão de seu6-Tlp3-LBD em e. coli
2. isolamento e desnaturação de corpos de inclusão
3. proteína dobrar
4. purificação de seu6-com a tag proteína usando cromatografia de afinidade do íon do Metal imobilizado
5. seu6-marca remoção usando TEV Protease (opcional)
6. tamanho-exclusão cromatografia (Gel filtração) de Tlp3-LBD
7. SDS-PAGE de análise das amostras coletadas em vários estágios de purificação de proteínas
8. circular Dicroísmo (CD) espectroscopia análise da estrutura secundária da proteína pura reabertos
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Expressão recombinante de seu6-Tlp3-LBD em e. coli resultou na deposição de proteína em corpos de inclusão. O expressão rendimento de 1 L de cultura bacteriana, calculada na etapa 2.13 foi aproximadamente 100 mg de seu6-Tlp3-LBD depositado em corpos de inclusão. O procedimento de isolamento de proteína, aqui descrito e ilustrado na Figura 1, consiste a solubilização de corpos de inclusão, proteína dobrar e purificação, através d...
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Um procedimento simples para a expressão e dobrar de corpos de inclusão do LBD periplasmático da chemoreceptor bacteriana Tlp3 é apresentado. Preparação da proteína pura envolve sobre-expressão do gene do animal de estimação-plasmídeo-codificado em e. coli, purificação e solubilização de corpos de inclusão, dobrar de proteína desnaturada e sua purificação por afinidade a consecutivos e etapas da cromatografia de exclusão de tamanho. A desnaturação de ureia-facilitado e diluição/diálise-mediada dobrar são os pass...
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Os autores declaram não concorrentes interesses financeiros.
Agradecemos seus primeiros trabalhos sobre a produção de Tlp3-LBD-Yu C. Liu. Mayra A. Machuca está em dívida com o Departamento Admistrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación COLCIENCIAS para uma bolsa de doutorado.
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| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| Base Tris | AMRESCO | 497 | |
| Cloreto de sódio (NaCl) | MERK MILLIPORE | 1064041000 | |
| Ampicilina | G-BIOSCIENCES | A051-B | |
| Fluoreto de fenilmetanossulfonil (PMSF) | MERCK | 52332 | |
| Triton x-100 | AMRESCO | 694 | |
| Isopropil β-D-tiogalactosídeo (IPTG) | ASTRAL SCIENTIFIC PTY LTD | ||
| Ureia | AMRESCO | VWRC0568 | |
| Ditiotreitol | ASTRAL SCIENTIFIC PTY LTD | C-1029 | |
| Cloridrato de L-arginina | SIGMA-ALDRICH | A5131 | |
| L-glutationa reduzida | SIGMA-ALDRICH | G4251 | |
| L-glutationa oxidada | SIGMA-ALDRICH | G4376 | |
| Fosfato de sódio dibásico (Na2HPO4) | SIGMA-ALDRICH | 7558-79-4 | |
| Fosfato de sódio monobásico (NaH2PO4) | SIGMA-ALDRICH | 10049-21-5 | |
| Sal dissódico do ácido etilenodiaminotetracético desidratado (EDTA) | AMRESCO | VWRC20302.260 | |
| Imidazol | SIGMA-ALDRICH | I2399 | |
| Glicerol | ASTRAL SCIENTIFIC PTY LTD | ||
| Cloreto de níquel (NiCl2) | SIGMA-ALDRICH | 339350 | |
| Glicina | AMRESCO | VWRC0167 | |
| Dodecil sulfato de sódio (SDS) | SIGMA-ALDRICH | L4509 | |
| Escada de proteína não corada, larga Faixa (10-250 kDa) | NEW ENGLAND BIOLABS | P7703 | |
| Amicon Ultracel centrífugo concentrador (Millipore) | MERCK | UFC901096 | |
| 50 mL Tubo | Falcon | BDAA352070 | |
| Tubo de diálise | LIVINGSTONE INTERNATIONAL PTY | ||
| Tubo de diálise de pele de cobra | THERMO SCIENTIFIC™ | 68100 | |
| Coluna Quelante HP HiTrap Pré-embalada | GE HEALTHCARE LIFE SCIENCES | 17-0408-01 | |
| EmulsiFlex-C5 homogeneizador de alta pressão | AVESTIN | EmulsiFlex™ - | |
| P-1 | GE HEALTHCARE LIFE SCIENCES | 18-1110-91 | |
| Superdex 200 HiLoad 26/60 coluna de exclusão de tamanho | GE HEALTHCARE CIÊNCIAS DA VIDA | ||
| JASCO J-815 espectropolarímetro | JASCO | J-815 |
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