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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Desenvolvemos um protocolo simples e eficiente para a preparação de grandes quantidades de protoplastas de soja estudar mecanismos complexos regulatórios e sinalização em células vivas.
Feijão de soja (Glycine max (L.) Merr.) é uma espécie de cultura importante e tornou-se um modelo de vegetal para os estudos das vias genéticas e bioquímicas. Portanto, é importante estabelecer um sistema de expressão de gene transiente eficiente em soja. Aqui, nós relatamos um protocolo simples para a preparação de protoplastas de soja e sua aplicação para análises funcionais transitórias. Nós achamos que o jovens unifoliate folhas de plântulas de soja resultaram em grandes quantidades de protoplastas de alta qualidade. Otimizando um método de transformação PEG-cálcio-mediada, atingimos a eficiência elevada de transformação usando protoplastas de unifoliate de soja. Este sistema fornece um modelo eficiente e versátil para exame dos complexos mecanismos de regulamentação e sinalização em células vivas de soja e pode ajudar a melhor compreender diversos processos celulares, fisiológicos e de desenvolvimento das leguminosas.
Protoplastas são células vegetais que possuem paredes celulares removidas. Como eles mantêm a maioria dos recursos e atividades das células vegetais, protoplastas são um bom modelo sistema para observar e avaliar diversos eventos celulares e são ferramentas valiosas para estudar a hibridação somática1 e regeneração2da planta. Protoplastas tem sido também amplamente utilizados para planta transformação3,4,5, desde paredes celulares caso contrário iria bloquear a passagem de DNA para a célula. Protoplastas de possuam algumas das respostas fisiológicas e processos celulares de plantas intactas, oferecendo, portanto, o valor fundamental na pesquisa básica para estudar a localização Subcellular da proteína6,7,8, de9,de interações proteína-proteína10e o promotor atividade11,12,13 em células vivem.
O isolamento dos protoplastas de planta foi primeiramente relatado em 196014 e os protocolos para isolamento e transformação de protoplastas foram desenvolvidos e optimizados. Um procedimento padrão de isolamento de protoplastos envolve o corte de folhas e digestão enzimática das paredes celulares, seguido de separação de protoplastas lançados de restos de tecido não-digeridos. Estratégias de transformação inclui electroporation15,16, microinjeção17,18e baseadas em polietileno glicol (PEG)4,5,19 métodos. Uma grande variedade de espécies têm sido relatados bem sucedida para o isolamento de protoplastos, incluindo cítricas20, Brassica21, Solanaceae22 e outras famílias de plantas ornamentais23,24. Enquanto o tecido diversos tipos são usados em várias espécies, um sistema de expressão transiente em protoplastos de mesofilo de Arabidopsis (TEAMP) isolado de folhas da planta modelo Arabidopsis thaliana tem sido bem estabelecida25 e amplamente adotado para diversas aplicações.
Feijão de soja (Glycine max (L.) Merr.) é uma das mais importantes proteínas e óleo para as culturas26. Ao contrário de Arabidopsis e arroz, obtenção de plantas transgênicas de soja é conhecido por ser um pouco difícil e baixa eficiência. Agrobacterium tumefaciens-mediada por infiltração foi usada popularmente para estudos de expressão transiente gene nas células epidérmicas em tabaco27 e mudas em Arabidopsis28,29, Considerando que Agrobacterium rhizogenes tem sido usado para transformação de raízes peludas na soja30. Abordagens de silenciamento de gene induzida por vírus têm sido utilizadas para downregulation de alvo genes31,32 e transiente expressão33 de forma sistêmica. Protoplastas fornecem uma alternativa valiosa e versátil para essas abordagens. Protoplastas podem ser obtidos de materiais na superfície do feijão de soja e permitam a expressão do transgene rápida e sincronizada. No entanto, desde o isolamento de sucesso inicial de protoplastas de soja no 198334, houve limitados relatórios sobre a aplicação da protoplastas em soja35,36,37, 38, principalmente devido à relativamente baixos rendimentos de protoplastas de soja.
Aqui, descrevemos um protocolo simples e eficiente para o isolamento de protoplastas de soja e sua aplicação para estudos de expressão transiente de gene. Usando o jovens unifoliate folhas de plântulas de soja, fomos capazes de obter grandes quantidades de protoplastas vitais dentro de algumas horas. Além disso, otimizamos a um método de transformação de PEG-cálcio-mediada que é simples e de baixo custo para entregar o DNA nas protoplastas de soja com alta eficiência.
1. o crescimento das plantas
2. preparação do ADN do plasmídeo
3. isolamento de protoplastos
4. transformação de protoplastos
5. protoplastos incubação e colheita
Diferentes órgãos de soja 10 dia de idade foram testados para a preparação de protoplastos (Figura 1) e rendimentos foram observados ao microscópio (Figura 2). Paredes celulares do hypocotyl e epicotyl foram mal digeridas, e algumas células ficaram anexadas ao outro (Figura 2B, 2C). No cotilédone (Figura 2D) e raiz (Figura 2A), paredes celulares foram removidas somente em uma pequena porção de células. Em contraste, um grande número de protoplastas foram observado quando unifoliate foi usado (Figura 2E-G). Unifoliate folhas em diferentes estádios de desenvolvimento foram posteriormente examinadas (Figura 2 H). Enquanto ambas as folhas unifoliate não expandidas e expandidas só resultaram em rendimentos elevados de protoplastas, o tamanho dos protoplastas de apenas expandido unifoliate eram mais uniforme (Figura 2F) do que os não expandido unifoliate (Figura 2E). Para o totalmente expandida unifoliate, as paredes celulares estavam ainda intactas na maioria das células (Figura 2). Testamos as enzimas de parede celular-digestão de três fabricantes diferentes e obteve resultados comparáveis, conforme descrito acima. Baseia-se estas observações, concluiu-se que a seleção de materiais vegetais foi um fator crucial e que apenas expandidas unifoliate folhas de plântulas de soja jovens eram o melhor material para a preparação de protoplastos.
Uma gama de diferentes quantidades de plasmídeo (0.1 µ g, 1 µ g, 5 µ g e 20 µ g) foi testada para a eficiência de transformação ideal dos protoplastas de unifoliate de soja (Figura 3A-D). 20 µ g Plasmídeo mostrou a mais alta eficiência de transformação com mais do que a taxa de transformação de 50% (Figura 3D), enquanto que 0,1 µ g apresentou a mais baixa (menos de 1%) (Figura 3A). Obtivemos a eficiência de transformação comparáveis utilizando diferentes kits de purificação de DNA de três fabricantes. Este resultado sugere que quantidades maiores de ADN do plasmídeo ajudaria enormemente para aumentar a eficiência de transformação.
Figura 4 é imagens confocal de protoplastas de soja transformadas com a construção p2GWF7-E1, que expressa a GFP fundido ao gene vegetal específico E1 (Glyma.06G207800), conduzido pelo promotor CaMV 35S em p2GWF7 o vetor 39. a proteína de fusão E1-GFP mostra localização nuclear em protoplastas de soja, que é consistente com um estudo anterior usando o de sistema de protoplastos de Arabidopsis40. Dado que E1 é um gene vegetal específico, nosso resultado usando o sistema de protoplastos de soja fornece uma visão conclusiva a Localização subcellular da proteína E1.

Figura 1. Ilustração mostrando os órgãos de um seedling de soja que são testados para a preparação de protoplastos neste estudo, incluindo raiz, hypocotyl, cotilédone, epicotyl e unifoliate. Depois de um par de folhas unifoliate, mudas de soja desenvolvem folhas trifolioladas. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2. Células de protoplastos preparadas a partir de diferentes órgãos e estádios de desenvolvimento de plântulas de soja. (A-D) Células preparadas a partir de diferentes órgãos de 10 dias de idade mudas de soja: raiz (A), hypocotyl (B), epicotyl (C), cotilédone (D). (E-G) Células de protoplastos preparadas a partir de folhas de unifoliate em diferentes estádios de desenvolvimento: não expandido (E), apenas expandido (F) e totalmente expandido (G) unifoliate, correspondente as mudas de soja em (H) à esquerda, meio e direito, respectivamente. Barra de escala é de 25 µm (A-G) ou 25 mm (H). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3. Confocal imagens mostrando a eficiência de transformação de soja unifoliate protoplastas com diferentes quantidades de ADN do plasmídeo. Imagens de GFP (representada em verde) e brilhante campo (cinza) são mescladas. Protoplastas transformaram-se com diferentes quantidades do plasmídeo p2GWF7-E1: 0,1 µ g (A), 1 µ g (B), 5 µ g (C) e 20 µ g (D). Sinal de fluorescência de GFP foi monitorado 24 horas após transformação sob microscopia. Barra de escala preta é 50 µm. clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4. Imagens confocal, mostrando a Localização subcellular de E1-GFP no núcleo de soja protoplastas unifoliate. O plasmídeo p2GWF7-E1 foi usado para a transformação. Imagens de GFP (representada em verde) e brilhante campo (cinza) são mescladas. Sinal de fluorescência de GFP foi monitorado 24 horas após a transformação. Barra de escala preta é 5 µm. clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
| Solução de enzima (preparada na hora) | |
| MES, pH 5,7 | 20mM |
| Celulase CELF | 2% (p/v) |
| Pectolyase Y-23 | 0,1% (p/v) |
| Manitol | 0,75 M |
| CaCl2 | 0,2 mM |
| BSA | 0,1% (p/v) |
| DTT | 0.5 mM |
| Solução de W5 | |
| NaCl | 154 mM |
| CaCl2 | 125 mM |
| KCl | 5 mM |
| MES, pH 5,7 | 2 mM |
| Solução de MMg | |
| MES, pH 5,7 | 4 mM |
| Manitol | 400 mM |
| MgCl2 | 15 mM |
| Solução de PEG (preparada na hora) | |
| PEG4000 | 20% (p/v) |
| Manitol | 200 mM |
| CaCl2 | 100 mM |
| Solução de WI | |
| MES, pH 5,7 | 4 mM |
| Manitol | 0,5 M |
| KCl | 20 mM |
Tabela 1. Soluções utilizadas para transformação e isolamento de protoplastos de soja.
Os autores declaram que eles têm não tem interesses financeiro concorrente.
Desenvolvemos um protocolo simples e eficiente para a preparação de grandes quantidades de protoplastas de soja estudar mecanismos complexos regulatórios e sinalização em células vivas.
Este trabalho foi financiado pelo programa de pesquisa do genoma de plantas da National Science Foundation (NSF-PGRP-IOS-1339388).
| MES | Sigma Aldrich | M8250-100G | |
| Celulase CELF | Worthington Biological Corporation | LS002611 | |
| Pectolyase Y-23 | BioWorld | 9033-35-6 | |
| CELULASE "ONOZUKA" R-10 | Bateria | 10g | |
| MACEROZYME R-10 | Polegada | 10g | |
| Manitol | ICN Biomedicals | 152540 | |
| CaCl2 | Fisher | C79-500g | |
| BSA | NEB | R3535S | |
| DTT | Sigma Aldrich | D5545-5G | |
| NaCl | Sigma Aldrich | S7653-1kg | |
| KCl | Fisher | P217-500g | |
| MgCl2 | Sigma Aldrich | M8266-100g | |
| PEG4000 | Fluka | 81240 | |
| malha de nylon | carolina | 652222N | |
| Placas de Cultura de Tecidos | USA Scientific | CC7682-7506 | |
| Lâminas de Barbear | Fisher | 12-640 | |
| hemacitômetro | hausserscientific | 1483 | |
| QIAprep Spin Miniprep Kit | Qiagen | 27104 | |
| kit de minipreparação de plasmídeo EZNA | Omega | D6942-01 | |
| GeneJET Plasmid Miniprep Kit | Thermo Scientific | K0502 | |
| Centrífuga 5810 | eppendorf | 5811000827 | |
| Centrífuga 5424 | eppendorf | 22620401 | |
| Jencons Powerpette Plus Controlador de pipeta | Jencons | 14526-202 | |
| Microscópio Confocal Zeiss 710 | Zeiss | N/A | |
| Antiaderente, Tubos de Microfuga sem RNase, 1.5 mL | Ambion | AM12450 | |
| Tubos de Centrífuga de 15 mL | Denville | C1018-P | |
| Tubos de Centrífuga de 50 mL Denville | C1060-P | ||
| Soro de Bezerro Recém-Nascido | Thermo Scientific | 16010159 | |
| Soil | Perlita de berçário | ||
| Vigoro | 100521091 | ||
| Torpedo Sand | JKS Ventures | ||
| LB Broth, Lennox (Pó) | Fisher | BP1427-500 |