Apesar de numerosos estudos que tentam desenvolver modelos animais confiáveis que refletir o primário processa neurodegeneração subjacente, muito poucos foram amplamente aceites. Aqui, propomos um novo procedimento adaptado de conhecidos ex vivo cérebro fatia técnica, que oferece um mais perto na vivo-como cenário do que em vitro preparações para investigar os eventos iniciais provocando degeneração celular, como observada na doença de Alzheimer (AD). Esta variação consiste em etapas simples e facilmente reproduzíveis, que permitem a preservação do cytoarchitecture anatômica da região selecionada do cérebro e sua funcionalidade local em um ambiente fisiológico. Diferentes áreas anatômicas podem ser obtidas o mesmo cérebro, proporcionando a oportunidade de realizar várias experiências com os tratamentos em questão em um local-, dose e tempo-dependente. Limitações potenciais que poderiam afetar os resultados relacionados com esta metodologia estão relacionadas com a conservação do tecido, ou seja, a manutenção da sua integridade anatômica durante as etapas de corte e a incubação e a espessura de corte, que pode influenciar a análise bioquímica e imuno-histoquímica. Esta abordagem pode ser utilizada para diferentes fins, tais como explorar mecanismos moleculares envolvidos em condições fisiológicas ou patológicas, triagem de drogas ou ensaios de dose-resposta. Finalmente, este protocolo também poderia reduzir o número de animais utilizados em estudos comportamentais. O aplicativo aqui relatado foi recentemente descrito e testado pela primeira vez na ex vivo fatias cérebro rato contendo o prosencéfalo basal (BF), que é uma das regiões cerebrais afetadas principalmente no AD. Especificamente, foi demonstrado que a administração de um peptídeo tóxico derivado do C-terminal da acetilcolinesterase (AChE) poderia solicitar um AD-como o perfil, provocando, ao longo do eixo antero-posterior do BF, uma expressão diferencial de proteínas alteradas na AD, como o receptor nicotínico alpha7 (α7-nAChR), fosforilada Tau (p-Tau) e beta amiloide (Aβ).