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Artigo de método

Self-standing eletroquímica set-up para enriquecer o ânodo-proliferação de bactérias no local

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DOI:

10.3791/57632

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24 de julho de 2018

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Neste artigo

Resumo

Técnicas de cultivo microbianas no local da enriquecimento ou em situ podem facilitar o isolamento dos táxons de difícil-para-cultura microbianos, especialmente de ambientes de baixa biomassa ou geoquímica extremas. Aqui, descrevemos um set-up eletroquímico sem usar uma fonte de alimentação externa para enriquecer cepas microbianas capazes de transporte de elétrons extracelular (EET).

Resumo

Respiração anaeróbica, juntamente com o transporte de elétrons para minerais insolúveis (referido como o transporte de elétrons extracelular [EET]) é pensada para ser crítico para a produção de energia microbiana e persistência em muitos ambientes de subsuperfície, especialmente aqueles falta de aceitadores de electrões terminal solúvel. Enquanto micróbios capazes de EET foram isolados com sucesso de vários ambientes, a diversidade de bactérias capazes de EET é ainda mal compreendida, especialmente em difícil-para-amostra, baixa energia ou ambientes extremos, como muitos subsuperficial ecossistemas. Aqui, descrevemos um sistema eletroquímico no local para enriquecer bactérias EET-capaz usando um ânodo como um aceptor de elétron terminal respiratória. Este ânodo está ligado a um cátodo capaz de catalisar a redução de oxigênio abióticos. Comparar esta abordagem com electrocultivation métodos que usam um potentiostat para equilibrar o potencial de eletrodo, o sistema de dois-eletrodo não requer uma fonte de energia externa. Nós apresentamos um exemplo de nosso enriquecimento no local utilizado em um lago alcalino, cedros, um site serpentinization terrestres no norte da Califórnia. Tentativas anteriores para cultivar bactérias redutoras minerais foram infrutíferas, que é provavelmente devido a natureza de baixa biomassa deste site e/ou a baixa abundância relativa de metal reduzindo os micróbios. Antes de implementar nosso enriquecimento de dois elétrodos, medimos o perfil vertical da concentração de oxigénio dissolvido. Isso nos permitiu colocar o carbono de feltro ânodo e platina-galvanizado carbono feltro cátodo em profundidades que apoiaria aeróbias e anaeróbias processa, respectivamente. Após incubação no local, estamos ainda mais enriquecido o elétrodo anódico em laboratório e confirmou uma comunidade microbiana distinta em comparação com a superfície-anexado ou comunidades de biofilme normalmente observadas nos Cedros. Este enriquecimento que posteriormente levado ao isolamento do primeiro micróbio electrogenic de cedros. Este método de enriquecimento microbiano no local tem o potencial para aumentar consideravelmente o isolamento de bactérias EET-capaz de baixa biomassa ou difícil a habitats de amostra.

Introdução

Vários minerais-reduzindo micróbios foram mostrados para utilizar minerais de fase sólida como aceitadores de electrões terminal, por processos de transporte de elétrons extracelular (EET) que conduzir elétrons para o exterior da célula através de de enzimas redox1. EET é fundamental, não apenas para processos de micróbio-mineral mas também energia aplicada e tecnologias ambientais, tais como células de combustível microbianas2, síntese de eletrodo3e biorremediação4. Nova bactéria capaz de EET é muito procuradas e têm sido muito estudadas a partir de uma perspectiva fundame....

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Protocolo

1. construção de um sistema de dois-eletrodo para incubação ambiental

  1. Preparação do material do ânodo e tratamento de carbono sentiram eletrodo (Figura 2).
    1. Corte o carbono sentiu igual dimensões dependendo do enriquecimento de biomassa desejado. Mergulhe cada eletrodo em etanol a 90% por 30 min e, em seguida, enxágue pelo menos 8 vezes com água desionizada, sonicating por 1 min depois de cada lavagem.
    2. Lave os eletrodos duas vezes em 1 M de HCl, mexendo durante um período mínimo de 12 h para cada lavagem.
    3. Seque os eléctrodos em forno quente (37 ° C) por 6-12 h ou até livre de líqu....

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Resultados

Produção atual foi medida com êxito durante cerca de 3 meses usando um registrador de dados de tensão conforme mostrado na Figura 3. Desta vez foi escolhida como era o mais longo período de incubação estável para a primavera, devido à forte queda de chuvas que afetam a primavera. Um período mais curto pode ser suficiente, apesar de um período mais longo poderia fornecer mais forte enriquecimento da biomassa. Nós confirmou a conexão do sistema de dois-eletrodo.......

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Discussão

O estudo descrito, vamos mostrar o enriquecimento de um consórcio microbiano, ligado com a produção atual em situ . Dimensiona os padrões observados no atual apoio atividade microbiana neste sistema ao longo do tempo curto e longo. O passo fundamental para a construção de um sistema funcional dois elétrodos (tipo de célula de combustível) está identificando e utilizando um local com um estábulo nível de água e concentração de oxigênio no ambiente. O cátodo é exposto ao oxigênio na interface água ar, enquanto o â.......

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Divulgações

Os autores não têm nada para divulgar.

Agradecimentos

Nós gostaríamos de reconhecer Roger Raiche e David McCrory nos permitir acesso aos cedros e consultoria sobre locais para a incubação de longo prazo. Agradecemos também a equipe de campo de cedros durante a temporada de 2013-2014: Shino Suzuki, Shunichi Ishii, Greg Wanger, Grayson Chadwick, Bonita Lam e Matthew Schechter. Adicional graças a Shino Suzuki e Gijs Kuenen para investigação perspicaz e cultivo de apoio. Este trabalho foi financiado através de um subsídio para jovens cientistas, A e B da sociedade para a promoção da ciência (JSPS) KAKENHI Grant Japão número 17H 04969 e 26810085, respectivamente e o Japão agência de pesquisa médica e desenvolvimento (17gm6010....

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Folha de feltro de carbonon / an / aUsado para ânodo e cátodo
Fio de titânioA Nilaco CooporationTI-451485Usado para construir sistema de célula de combustível
Epóxi de grafiteElectrolytica lnc.n/aUsado para conectar os eletrodos
e o fio de Ti
Forno de secagemYamatoDY300assar o eletrodo para
solidificar epóxi grafite condutor
Multímetro digitalFluke616-1454para verificar o valor ôhmico
de resistência Sonda de
oxigênio dissolvidoSper Science#  850045para verificar a concentração de oxigênio
no ambientes
ResistorSodialUsado para construir sistema de célula de combustível
Fio condutorPico81141sUsado para construir sistema de célula de combustível
Voltímetro e registrador de dadosT& D corporationVR-71Usado para gravação de dados
Hexacloroplatinato de hidrogênio (IV) Hexahidratadowako18497-13-7Usado para eletropolação
Ácido cítricoWako038-06925Usado para eletropolação
Ácido sulfúricoWako192-04696Usado para eletropolação
HClWako083-01095Usado para lavagem de eletrodos
Cilindro de vidroN/AN/AFeito sob medida, usado como reator eletroquímico
Tampa e base de PTFEN/AN/AFeito sob medida, usado como cobertura e fundação do reator eletroquímico
Borracha butílicaN/AN/AFeito sob medida, inserido entre cada componente do reator eletroquímico
SeptaGL Science3007-16101Usado como uma porta de injeção do reator eletroquímico
Eletrodo de óxido dopado com estanho de índio (ITO)GEOMATECNo.0001Usado como um eletrodo de trabalho, eletrodo saturado de 5Ω/sq
Ag/AgCl KClHOKUTO DENKOHX-R5Usado como um eletrodo de referência, Φ fio da platina de 0.30mm
O Nilaco CooporationPT-351325usado como um elétrodo contrário
NaHCO3Wako191-01305usado para os meios dos cedros (CMS)
CaCO3Wako030-00385usado para o CMS
NH4ClWako011-03015usado para o CMS
MgCl2  &touro; 6H2OWako135-00165Usado para CMS
NaOH Wako198-13765Usado para CMS
Na2SO4Wako194-03355Usado para CMS
K2HPO4Wako164-04295Usado para
CMS CABSSANTA CRUZSC-285279Usado para incubadora
CMS TOKYO RIKAKIKAI CO., LTD.LTI-601SDUsado para máquina de autoclave de pré-cultivo
TOMY SEIKO CO., LTD.LSX-500Usado para esterilização do reator eletroquímico e do meio
Bancada limpaSANYOMCV-91BNFUsado para evitar a contaminação do reator eletroquímico e do meio com outros micróbios
Separador de centrífugaEppendorf5430RVelocidade de rotação de até 6000× g é necessário
Gerador de gás nitrogênioPuequ CO. LTD.PNTN-2O cilindro de gás nitrogênio também pode ser usado em vez do gerador de gás
Espectrômetro UV-visSHIMADZUUV-1800Usado para otimização da densidade celular
PotenciostatoBioLogicVMP3Usado para formação de biofilme e experimentos de efeito de isótopos cinéticos
Circulador de água térmicaCOMO UMTR-1AUsado para manutenção da temperatura do reator eletroquímico
Gaiola de FaradayHOKUTO DENKOHS-201SUsado para experimentos eletroquímicos
anaeróbicaCOYTypeB (Vinil)TO realizar experimentos
sob condição anaeróbica
Ultraclean DNA Extraction kitMoBio
Câmara

Referências

  1. Nealson, K. H., Saffarini, D. Iron and manganese in anaerobic respiration: environmental significance, physiology, and regulation. Annual Reviews of Microbiology. 48, 311-343 (1994).
  2. Lovley, D. R. Bug juice: harvesting elect....

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Reimpressões e permissões

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