As plantas são mais dependentes de seu ambiente do que muitas outras formas de vida. Uma vez que as plantas não podem mover-se para outros lugares, eles têm para se adaptarem às mudanças em seu ambiente (por exemplo, seca, fria e alta concentração de sal). Por conseguinte, plantas superiores desenvolveram proteínas de estresse especializadas como dehydrins, que cumprir tarefas múltiplas para reduzir o estresse de célula relacionada com alta salinidade. Estas proteínas ligam íons e água no interior das células, reduzir o estresse oxidativo vinculando Cu2 +-íons e interagir com fosfolipídios, bem como o citoesqueleto. Além disso, a vinculação Zn2 +-íons permite que estas proteínas que atuam como fatores de transcrição. Sua capacidade de Ca2 +-íons após fosforilação também tem sido relataram que1.
O multifuncional comportamento destas proteínas está relacionado com a ausência de resíduos de aminoácidos hidrofóbicos. Por conseguinte, falta-lhes qualquer interações hidrofóbicas dentro da cadeia peptídica e, também, uma estrutura restrita. No entanto, porque estas proteínas possuem uma estrutura restritiva, eles podem ocupar diferentes conformistas nas mesmas condições. Portanto, eles podem ser descritos melhor como um conjunto de estruturas em vez de uma única conformação. Proteínas com essas propriedades são conhecidas como intrinsecamente desordenado proteínas (deslocados internos) e são um conceito amplamente utilizado para proteínas de estresse e crosstalk entre diferentes caminhos em pilhas eukaryotic2.
Dentre estes deslocados internos relacionados com o stress é AtHIRD11. É uma de Arabidopsis thalianada maioria altamente seca-expresso deslocados. Portanto, os conformistas diferentes podem ser separados por seu raio eficaz de cobrar taxa, e eletroforese capilar (CE) tem sido utilizado para mais investigações. Experiências anteriores de ACE demonstraram que as interações entre os íons de metais de transição como Cu2 +- Zn2 +-, Co2 +e Ni2 +e AtHIRD11-íons. Os resultados detalhados podem ser encontrados no Hara et al . 3 e Nachbar et al 4.
O método ACE que será usado aqui baseia-se em nossos trabalhos anteriormente publicados6. No entanto, a adição da acetanilida de marcador EOF para a amostra de proteína não é adequada. AtHIRD11 mostra padrões de pico largo, e adicionar o marcador EOF para a amostra seria disfarçar dois picos. Portanto, o marcador é usado em uma execução separada. Antes do comportamento de vinculação é examinado, confirma-se que os picos encontrados durante as experiências anteriores são de diferentes conformistas. Assim, CGE é usado para distinguir entre os conformistas de proteína, o borne-translational modificado, proteína e as impurezas, tais como fragmentos de AtHIRD11, por suas massas diferentes. Posteriormente, o comportamento de vinculação do exemplo AtHIRD11 caracterizadas para vários diferentes íons metálicos é investigado.
O objetivo deste artigo é descrever uma instalação experimental para distinguir entre um IDP e outros componentes de uma amostra para avaliar as diferenças entre o comportamento de vinculação de conformistas diferentes.