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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Este protocolo descreve um rim completo check-up que deve ser realizado em modelos do rato da doença glomerular. Os métodos permitem análise detalhada funcional, estrutural e mecanicista da função glomerular, que pode ser aplicada a todos os modelos do rato da doença glomerular.
O uso de modelos murino para imitar a doença de rim humano está se tornando cada vez mais comum. Nossa pesquisa enfoca a avaliação da função glomerular na nefropatia diabética e podocyte específicos VEGF-A mata-mata ratos; Portanto, este protocolo descreve o rim completo check-up usado em nosso laboratório para avaliar estes modelos do rato da doença glomerular, permitindo uma vasta quantidade de informações sobre o rim e função glomerular para ser obtido um único rato. Em comparação com métodos alternativos apresentados na literatura para avaliar a função glomerular, o uso do método descrito neste artigo permite que o fenótipo glomerular ser completamente avaliada de múltiplos aspectos. Usando esse método, o pesquisador pode determinar o fenótipo de rim do modelo e avaliar o mecanismo quanto por que desenvolve o fenótipo. Esta informação vital sobre o mecanismo da doença é necessária quando examinar o potenciais terapêuticas avenidas nesses modelos. Os métodos permitem avaliação funcional detalhada da barreira de filtração glomerular através da medição da creatinina urinária de albumina e permeabilidade de água glomerular individual, bem como exame estrutural e ultra-estruturais usando o ácido periódico-Schiff mancha e microscopia eletrônica. Além disso, análise da desregulação de genes no nível de mRNA e proteína permite análise mecanicista da função glomerular. Este protocolo descreve os métodos genéricos mas adaptávelas que podem ser aplicados a todos os modelos do rato da doença glomerular.
O uso de modelos murino para imitar a doença de rim humano está se tornando cada vez mais comum. Tais modelos murino incluem modelos espontâneos como espontaneamente hipertensos (SHR) de ratos1, estreptozotocina (STZ)-induzida ratos diabéticos e ratos2, e o db/db tipo II ratos diabéticos3, modelos geneticamente modificados tais como primário podocyte específicas focal segmentar glomerular esclerose (FSGS) modelos4, o específico das endotelial fator de crescimento vascular (VEGF-A) nocaute (KO VEGF-A) modelo5, e a síndrome de Alport modelos6e adquiriu modelos como o de nefrectomia 5/6,7 e o modelo de obstrução ureteral unilateral (UUO)8. A fim de avaliar os diferentes aspectos da função glomerular nestes modelos, várias técnicas estão disponíveis. O propósito deste trabalho método é demonstrar um completo check-up deve ser executada em modelos do rato da doença renal para avaliar plenamente a função glomerular.
A lógica por trás do uso deste método é que ele permite que o fenótipo glomerular ser completamente avaliada de múltiplos aspectos. Isso inclui avaliar a permeabilidade glomerular, a proteína e a água, o glomerulares anormalidades estruturais e mudanças na expressão/emenda de mRNAs e proteínas essenciais para a função glomerular normal. Usando esse método, o pesquisador é capaz de determinar o fenótipo de rim do modelo e avaliar o mecanismo quanto por que desenvolve o fenótipo. Esta é a informação vital sobre o mecanismo da doença, que é necessária, ao examinar o potenciais terapêuticas avenidas nesses modelos.
Na literatura, é uma ocorrência comum para ser apresentado com um modelo do rato da doença glomerular, onde o fenótipo é determinado por um aumento do nível de albumina na urina. No entanto, há evidências que sugerem que um único método para determinar a função glomerular não é sempre eficaz; apenas medir a taxa de excreção de albumina urinária ou a creatinina urinária de albumina (uACR) fornece informações sobre a função renal total e não de glomérulos individuais. Estudos anteriores demonstraram que a permeabilidade pode variar em diferentes glomérulos do mesmo rim5,9,10. Além disso, a avaliação da permeabilidade dos glomérulos individuais é uma maneira mais sensível de avaliação de função glomerular; a técnica de medir a permeabilidade de água glomerular individual (LpA / V eeu) tem demonstrado ser mais sensível às mudanças na função glomerular do que medir a uACR9. Este ensaio é benéfico em modelos do rato que são resistentes a proteinúria, tais como os de um fundo de c57BL/611. A vantagem do papel presente método é que ele examina a total permeabilidade renal de albumina, bem como a permeabilidade glomerular individual para água.
Exame de anormalidades estruturais glomerulares é muitas vezes avaliado por uma bateria de manchas, tais como ácido periódico Schiff (PAS), tricromo e manchas de prata. Estes permitem uma patologista renal treinada avaliar o nível de doença renal, através de um método de pontuação. Apesar de todos os bons métodos, alterações à macroestrutura glomerular não são sempre observados na lesão renal aguda modelos12. Este método propõe que além de realizar as técnicas de histologia renal descritas acima, a ultraestrutura glomerular também deve ser avaliada através de microscopia eletrônica (EM). Um glomérulo manchado pode parecer relativamente normal sob um microscópio de luz normal; no entanto, após avaliação com EM, pequenas mudanças na largura da membrana basal glomerular (MBG), apagamento de processo podocyte pé, fenestrações endoteliais e a cobertura do espaço sub-podocyte é analisado. Portanto, é vital que a ultraestrutura glomerular e a microestrutura é avaliado para determinar o mecanismo da disfunção glomerular.
Além de avaliar anormalidades glomerulares estruturais, alterações em mRNA e expressão de proteínas e de emenda, bem como ativação de proteína (por exemplo, a fosforilação), devem ser examinadas para elucidar ainda mais os mecanismos de doença glomerular. Quando se olha para uma doença glomerular, ou, por exemplo, quando KO/over-expressing um gene especificamente em células glomerulares, como por exemplo o podocyte específico VEGF-A KO rato5, é importante que as alterações da proteína e do mRNA são examinadas apenas dentro do células glomerulares e não o rim. Este protocolo descreve um método em que os glomérulos são isolados do córtex renal do mouse, e então o proteína/RNA são isolados. Isto permite a análise da desregulação da proteína/mRNA em glomérulos do modelo de doença.
Este protocolo descreve um rim completo check-up que deve ser realizado em modelos do rato da doença glomerular, permitindo uma vasta quantidade de informações sobre o rim e função glomerular para ser obtido um único rato. Os métodos permitem análise detalhada funcional, estrutural e mecanicista da função glomerular, que pode ser aplicada a todos os modelos do rato da doença glomerular.
Todos os experimentos foram conduzidos em conformidade com a legislação de UK e aprovação do Comitê de ética local. Estudos em animais foram aprovados pela Universidade de Bristol Comitê de ética de pesquisa.
1. urinária albumina creatinina (uACR)
Nota: O uACR é usada para avaliar a permeabilidade da GFB à albumina. A presença de albumina na urina indica aumento da permeabilidade do outro lado da GFB, que é normalizado para creatinina para controle das variações de taxa de fluxo de urina. Albuminúria é um marcador comum de doença renal crônica.
2. tecido e coleta de sangue
Nota: O rim e tecido glomerular podem ser usados para avaliar estruturais, proteínas e RNAm marcadores de expressão da doença renal. O sangue pode ser usado para avaliar os marcadores da função renal, tais como a creatinina, que pode ser regulada até na doença renal, indicando uma redução da capacidade de filtração dos glomérulos.
3. plasma creatinina
Nota: A creatinina do Plasma pode ser acima-está regulada na doença renal, indicando uma redução da capacidade de filtração dos glomérulos. Os níveis de nitrogênio (BUN) de ureia do sangue também podem ser avaliados, apesar do protocolo não está descrito aqui.
4. isolamento de glomérulos
Nota: Glomérulos podem ser isolados para avaliar a permeabilidade dos glomérulos individuais ex vivo, bem como a expressão da proteína específica e marcadores de mRNA da doença glomerular.
5. permeabilidade de água glomerular (LpA / V eeu)
Nota: O glomerular LpA / Veu ensaio de ativa a ex vivo medição da permeabilidade dos glomérulos individuais em um rápido uma maneira reproduzível. Aumento o glomerular LpA Veu indica perturbação da GFB, que é sugestivo de doença renal.
6. ácido periódico mancha de Schiff (PAS)
Nota: A mancha PAS irá destacar as membranas do porão de loops capilares glomerulares e o epitélio tubular. Permite visualização detalhada do células glomerulares, mesangiais matriz e potencial de expansão e possíveis alterações do GBM (ou seja, espessamento e irregularidades).
7. transmissão microscopia de elétron (TEM)
Nota: TEM permite o exame de anormalidades ultra-estruturais no rim, tais como o GBM, podocyte processos de pé e fenestrações endoteliais, que não são visíveis com microscopia de luz. Isso é importante em modelos onde dano renal não é tão pronunciado (ou seja, sem albuminúria e anormalidades estruturais principais).
8. imunofluorescência para Podocyte e marcadores endoteliais
Nota: Immunostaining permite a visualização dos padrões de expressão da proteína, como loops capilares endoteliais, que podem entrar em colapso na doença glomerular.
9. a proteína extração e mancha ocidental
Nota: Mancha ocidental nos permite avaliar as proteínas de expressão, conhecidas por ser prejudicado em doença renal. Por exemplo, uma redução na expressão podocin e Nefrina indica perda de podocyte.
10. RNA extração e reação em cadeia da polimerase (PCR)
Nota: análise da expressão do mRNA permite determinar como os genes são regulados na doença renal, tais como mudanças na expressão gênica e splicing alternativo.
Urina foi coletada usando gaiolas metabólicas do tipo selvagem (WT), inducible podocyte específicos VEGF-A nocaute (KO VEGF-A) e VEGF-A KO X Neph-VEGF165b ratos (os ratos VEGF-A KO que excesso expressam a isoforma de b humano VEGF-A165nos podócitos em um forma constitutiva). Sobre medição de creatinina a albumina urinária em semanas 0, 4, 10 e 14 após a indução de doxiciclina de VEGF-A KO, KO VEGF-A ratos desenvolveram albuminúria progressiva por 10 semanas em comparação com controles de littermate WT. Os valores absolutos pode ser vistos na Figura 2Ae o normalizado para a linha de base de cada valores do mouse na Figura 2B. No entanto, albuminúria em não observado nos ratos b165VEGF-A X Neph-VEGF-A (Figura 2), indicando o VEGF-A165b é protetora no modelo de albuminúria5.
O glomerular LpAVeu foi medido em glomérulos individuais peneirados de WT, VEGF-A KO e rins de b VEGF-A X Neph-VEGF-A165. Um exemplo de como um glomérulo é detectado e o encolhimento observado quando perifused com 8% BSA é mostrado na Figura 3A. Este encolhimento é usado para determinar o glomerular LpA / V para cada glomérulo (Figura 3B). Camundongos KO de VEGF-A tinham um significativamente aumento glomerular LpA / V com 14 semanas pós indução VEGF-KO, em comparação com glomérulos de controle do WT. Embora menor em camundongos de b VEGF-A X Neph-VEGF-A165, o aumento glomerular LpA / V, não foi impedido por excesso de expressão de VEGF-A165b às 14 semanas5.
Coloração de PAS de seções de córtex renal 14 semanas após a indução de VEGF-A KO não revelaram qualquer anormalidade estrutural glomerular nos VEGF-A KO ou VEGF-A X Neph-VEGF-A165b ratos (Figura 4A). No entanto, após a análise da ultraestrutura glomerular através EM, ratos VEGF-A KO tinham desenvolvido uma maior largura GBM, diminuiu o número de fenestras endoteliais, diminuição da cobertura SPS e aumentou a média podocyte fenda de largura (Figura 4-4F ). O pé de média podocyte processo de largura e número de fendas permanecido inalterado (Figura 3B e 3 G). Excesso de expressão de VEGF-A165b nos ratos VEGF-A KO impediu as alterações para o GBM e fenda de largura (Figura 4 e 4F). No entanto, VEGF-A165b não teve efeito sobre o número de fenestras alterados e SPS cobertura (Figura 4 e 4E)5.
RT-PCR, realizada na RNA extraído de glomérulos peneirados revelou que a humana VEGF-165b mRNA só está presente nos ratos VEGF-A KO X Neph-VEGF-A165b (Figura 5A). Quando extrair proteína de glomérulos peneirados e avaliar os níveis de proteínas através da mancha ocidental, a expressão da proteína glomerular de VEGFR-2 foi encontrada para ser diminuída em camundongos VEGF-A KO, que foi impedido por excesso de expressão de VEGF-A165b ( Figura 5B e C 5)5.

Figura 1. Diagramática configurar o equipamento de permeabilidade glomerular (LpA). (A) o glomérulo é capturado em (B) a micropipeta dentro de um suporte usando sucção, que é fixada em um monte de estabilidade. (C) microslide retangular. (D) 4 X objetivo um microscópio com uma câmera de vídeo. (E) solução a 1% BSA aquecido a 37 ° C. (F) solução a 8% BSA aquecido a 37 ° C. (G) controle remoto toque rolamento de duas linhas que contêm perifusate, que permite a troca rápida de perifusate. (H) rota de perifusate em direção a microslide, que então banha o glomérulo. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2. Creatinina de albumina urinária. (A) os valores uACR em semanas 0, 4, 10 e 14 após a indução de VEGF-A KO em ratos de b165WT, VEGF-A KO e VEGF-A X Neph-VEGF-A. (B) os mesmos valores de uACR normalizados para o valor de base (semana 0) de cada rato individual. A uACR aumentou significativamente em camundongos VEGF-A KO em semanas 10 e 14 em comparação com controles de littermate WT, que foi impedida nos ratos b VEGF-A X Neph-VEGF-A165(* p < 0,05; ANOVA de duas vias, correção para comparação entre pares; n = 4-12 ratos por ponto de tempo; barras de erro: erro padrão da média [SEM]). Esta figura foi modificada de Stevens et al.5. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3. Medição da permeabilidade de água glomerular. (A) o glomérulo é apanhado sobre a micropipeta através de sucção; o perifusate é mudado de 1% de BSA (Ai) para 8% BSA (todos), e encolhimento glomerular é observado. (B) as medições realizadas antes e após o interruptor de BSA 8% são usadas para determinar o glomerular LpA / V eeu. (C) ratos VEGF-A KO desenvolvem um aumento glomerular LpA / V com 14 semanas pós indução de VEGF-A KO comparados aos controles do WT. Isto não foi significativamente impedido em ratos de b VEGF-A X Neph-VEGF-A165(* p < 0,05; One-way ANOVA, correção de Bonferroni para comparação entre pares; n = ratos de 4-9, 15-30 glomérulos; barras de erro: SEM). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4. Análise estrutural glomerular. (A) coloração PAS do córtex renal não indicaram quaisquer anormalidades estruturais nos glomérulos dos ratos de b165WT, VEGF-A KO e VEGF-A X Neph-VEGF-A (Ai - iii). EM revelou anormalidades ultra-estruturais em glomérulos VEGF-A KO (Aiv - vi). (B) o FPW média não se alterou entre grupos. (C) o GBM aumentou em glomérulos VEGF-A KO, que foi impedido por VEGF-A165b (D) o número de fenestras diminuiu em glomérulos VEGF-A KO, que permaneceu inalterados por VEGF-A165b. cobertura do SPS (E) foi diminuído em glomérulos VEGF-A KO, que também permaneceram inalterados por VEGF-A165b (F) a cortar a largura média foi aumentada em glomérulos VEGF-A KO, que foi impedido por VEGF-A165b (G) o número de fenda foi inalterado entre os três grupos (* p < 0,05; One-way ANOVA, correção de Bonferroni para comparação entre pares; n = 3 ratos, 9 glomérulos; barras de erro: SEM). Esta figura foi modificada de Stevens et al.5. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 5. expressão do mRNA e proteína de marcadores. (A) RT-PCR mostrou que a expressão humana VEGF-A165b mRNA só era evidente em glomérulos peneirados de ratos de b165VEGF-A KO X Neph-VEGF-A. (B) mancha ocidental indicou que expressão da proteína de VEGFR-2 foi para baixo-regulado em glomérulos VEGF-A KO, o que foi evitado em glomérulos de b VEGF-A KO X Neph-VEGF-A165(* p < 0,05; One-way ANOVA, correção de Bonferroni para comparação entre pares; n = 3 - 6 ratos; barras de erro: SEM). Esta figura foi modificada de Stevens et al.5. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores não têm nada para divulgar.
Este protocolo descreve um rim completo check-up que deve ser realizado em modelos do rato da doença glomerular. Os métodos permitem análise detalhada funcional, estrutural e mecanicista da função glomerular, que pode ser aplicada a todos os modelos do rato da doença glomerular.
Este trabalho foi apoiado pela Fundação britânica do coração, Richard Bright VEGF pesquisa Trust e o MRC.
| Gaiolas metabólicas | Harvard Apparatus | 52-6731 | |
| Tris tamponado com solução salina (10x) | Sigma-Aldrich | T5912-1L | |
| Albumina de soro bovino | Sigma-Aldrich | A2058 | |
| Conjunto de quantificação ELISA de albumina de camundongo | Bethyl Laboratories | E90-134 | |
| TMB ELISA Solução de substrato | ThermoFisher Scientific | 34028 | |
| Ácido sulfúrico | Sigma-Aldrich | 339741 | |
| SPECTRstar nano | BMG Labtech | SPECTRstar nano ou equivalente | |
| RNAlater solução de estabilização | ThermoFisher Scientific | AM7020 | |
| 4-15% gel de proteína pré-fabricada | BIORAD | 4568084 | |
| 4x Laaemmli Tampão de amostra | BIORAD | 161-0747 | |
| Mini célula Trans-Blot | BIORAD | 1703930 | |
| 10x Tris running buffer | BIORAD | 1610732 | |
| Coomassie Corante Azul Brilhante | ThermoFisher Scientific | 20278 | |
| Creatinina Companion | Exocell | 1012 Placa de Tira | |
| Solução de Glutaraldeído | Sigma-Aldrich | G5882 | |
| Cacodilato de Sódio | Sigma-Aldrich | C0250 | |
| 10x Fosfato Tampolado Salino | ThermoFisher Scientific | AM9625 | |
| Cloreto de Sódio | Sigma-Aldrich | S7653 | |
| Acetato de Sódio | Sigma-Aldrich | S2889 | |
| Fosfato de Sódio | Sigma-Aldrich | 342483 | |
| Bicarbonato de Sódio | Sigma-Aldrich | S5761 | |
| Sulfato de magnésio | Sigma-Aldrich | M2643 | |
| Cloreto | de cálcio Sigma-Aldrich | C5670 | |
| D (+) Glicose | Sigma-Aldrich | G8270 | |
| Tubos de coleta de sangue EDTA | BD | 367835 | |
| 23-25G Agulha | BD | PMC0735 | |
| EDTA | Sigma-Aldrich | E9884 | |
| Frasco de vidro de 10 ml | Thomas Scientific | 0914X10 | |
| Falcon Tubos de polipropileno de 10 ml | ThermoFisher Scientific | 10110101 | |
| Tubos de 0,5 ml | ThermoFisher Scientific | 10681894 | |
| Moldes de tecido descartáveis | ThermoFisher Scientific | 22-363-553 | |
| Kit de dissecção cirúrgica de camundongo | ThermoFisher Scientific | 13-005-204 | |
| Meio de corte ideal | ThermoFisher Scientific | 23-730-571 | |
| 4% Paraformaldeído | ThermoFisher Scientific | AAJ19943K2 | |
| Tubos capilares de vidro | Harvard Apparatus | EC1 64-0770 | |
| Plataforma de permeabilidade glomerular | construída na Universidade de Bristol - não disponível comercialmente | Citação da plataforma LpA: Salmon et al. 2006; J. Peneiras | de aço inoxidável Physiol|
| Cole-Parmer | WZ-59984 | ||
| Sistema de coloração de ácido periódico-Schiff (PAS) | Sigma-Aldrich | 395B-1KT | |
| Hematoxilina | Sigma-Aldrich | H3136 | |
| Xileno | MerckMillipore | 108298 | |
| Lâminas Poly-Prep | Sigma-Aldrich | P0425-72EA | |
| Meio de montagem | ThermoFisher Scientific | 8030 | |
| Solução de tetróxido de ósmio | Sigma-Aldrich | 75632 | |
| Ágar Resina de Arodita | Ágar Scientific | CY212 | |
| Ágar Acetato de Uranila | Scientific | AGR1260A | |
| Ágar Citrato de Chumbo | Scientific | AGR1210 | |
| Criostato | ThermoFisher Scientific | por exemplo, 957000H | |
| Caneta hidrofóbica | Abcam | ab2601 | |
| Nefrina (1243-1256) Anticorpo | Acris | BP5030 | |
| Anti-Podocina | Sigma-Aldrich | P0372-200UL | |
| Anti-CD31 | BD Biosciences | 550274 | |
| Alexa Fluor Anticorpo Secundário | ThermoFisher Scientific | A32732 | |
| Meio de montagem Vectashield com DAPI | Vector Labs | H-1200 | |
| NP40 Cell Lysis Buffer | ThermoFisher Scientific | FNN0021 | |
| Halt Protease e Inibidor de Fosfatase Coquetel | ThermoFisher Scientific | 78437X4 | |
| 10x Buffer de transferência | BIORAD | 1610734 | |
| PVDF | ThermoFisher Scientific | LC2002 | |
| Anticorpos secundários conjugados com HRP | Abcam | ab6721 | |
| ECF Substrato para Western Blotting | Fisher | 10713387 | |
| TRIzol | ThermoFisher Scientific | 15596018 | |
| Dnase I | New England Biolabs | M0303S | |
| M-MLV Transcriptase reversa | New England Biolabs | M053S | |
| Oligo dT | ThermoFisher Scientific | 18418012 | |
| Random Primers | ThermoFisher Scientific | 48190011 | |
| dNTP | ThermoFisher Scientific | 18427088 | |
| Inibidor de Ribonuclease | ThermoFisher Scientific | 10777019 | |
| DEPC Water | ThermoFisher Scientific | AM9915G | |
| Fluorescente Light Miscroscope | Leica Microsystems | ||
| Image J Analysis Software | Image J | ||
| PCR Thermocycler | ThermoFisher Scientific | ||
| TEM Microscópio | Britannica |