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Bancos de dados de literatura(ou seja,PubMed, Scopus e Web of Science) diferem em termos de sua cobertura, foco e a ferramenta que eles fornecem. PubMed centra-se principalmente em ciências da vida e disciplinas biomédicas, enquanto Scopus e Web of Science são multidisciplinares. O protocolo descrito no presente estudo foi usado para procurar publicações de autores jordanianos nos anos 2013-2017. Neste protocolo, como usar cada banco de dados para realizar esse tipo de pesquisa é explicado em detalhes. Uma pesquisa scopus resultou no maior número de documentos (11.444 documentos), seguido por uma pesquisa da Web of Science (10.943 documentos). PubMed resultou em um número menor de documentos devido ao seu escopo mais estreito e cobertura (4.363 documentos). Os resultados também mostram uma tendência anual em: (1) o número de publicações, (2) as disciplinas que mais possuem publicações( 3) os países de colaboração e (4) o número de publicações de acesso aberto. Em contraste, pubmed tem um sofisticado serviço de otimização de palavras-chave(ou seja,Medical Subject Heading, ou MeSH), enquanto tanto Scopus e Web of Science fornecer ferramentas de análise de pesquisa que podem produzir figuras representativas. Finalmente, os recursos de cada banco de dados são explicados em detalhes e vários índices que podem ser extraídos usando os resultados da pesquisa são fornecidos. Este estudo fornece uma base para o uso de bancos de dados de literatura para análise bibliométrica.