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Research Article
Yongyang Huang1, Jinyun Zou1, Mudabbir Badar1, Junchao Liu1, Wentao Shi5, Shunqiang Wang2, Qiongyu Guo3, Xiaofang Wang1, Sarah Kessel4, Leo Li-Ying Chan4, Peter Li4, Yaling Liu2,5, Jean Qiu4, Chao Zhou1,5,6
1Department of Electrical and Computer Engineering,Lehigh University, 2Department of Mechanical Engineering,Lehigh University, 3Department of Biomedical Engineering,Southern University of Science and Technology, 4Department of Technology R&D,Nexcelom Bioscience LLC, 5Department of Bioengineering,Lehigh University, 6Center for Photonics and Nanoelectronics,Lehigh University
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Tomografia de coerência óptica (OCT), uma tecnologia de imagem tridimensional, foi usada para monitorar e caracterizar a cinética de crescimento de esferoides tumor multicelulares. Precisa quantificação volumétrica de esferoides tumor usando um voxel contando a abordagem e deteção de tecido livre de rótulo morto nos esferoides baseado no contraste intrínseco atenuação óptica, foram demonstradas.
Esferoides de tumor foram desenvolvidas como um modelo de cultura tridimensional (3D) célula na descoberta de medicamentos de investigação e anti-câncer de câncer. No entanto, atualmente, elevado-throughput modalidades de imagem utilizando a deteção de campo ou fluorescência brilhante, são incapazes de resolver a estrutura geral 3D do spheroid tumor devido à limitada penetração de luz, difusão de corantes fluorescentes e profundidade-resolução. Recentemente, nosso laboratório demonstrou o uso de tomografia de coerência óptica (OCT), um rótulo livre e não-destrutiva de imagem 3D modalidade, para realizar a caracterização longitudinal de esferoides multicelulares tumor em uma placa de 96 poços. OCT foi capaz de obter informações morfológicas e fisiológicas 3D de esferoides de tumor que cresce até cerca de 600 µm de altura. Neste artigo, vamos demonstrar um sistema de imageamento de OCT (HT-OCT) de alto rendimento que verifica a placa toda multi bem e obtém os dados 3D OCT de esferoides tumor automaticamente. Descrevemos os detalhes das orientações de construção e sistema de HT-OCT no protocolo. A partir dos dados de OCT 3D, se pode visualizar a estrutura geral do spheroid com 3D renderizados e fatias ortogonais, caracterizar a curva de crescimento longitudinal do spheroid tumor baseado na informação morfológica de tamanho e volume e monitorar o crescimento de as regiões de mortos-célula no spheroid tumor baseado no contraste óptico atenuação intrínseca. Mostramos que, HT-OCT pode ser usado como uma modalidade de imagem de alto rendimento para droga triagem, bem como a caracterização de amostras de biofabricated.
Câncer é a segunda principal causa de morte no mundo1. Desenvolvimento de medicamentos, alvejando câncer é de importância crucial para os pacientes. No entanto, estima-se que mais de 90% das novas drogas anti-câncer falhar na fase de desenvolvimento devido à falta de eficácia e toxicidade inesperada em ensaios clínicos2. Parte do motivo pode ser atribuída ao uso de modelos de cultura simples bidimensional (2D) célula para triagem composta, que fornecem resultados com valores preditivos limitados de compostos eficácia e toxicidade para as fases seguintes da droga descoberta2 , 3 , 4. recentemente, foram desenvolvidos modelos de esferoide tridimensional (3D) tumor para fornecer dados fisiológicos e farmacológicos clinicamente relevantes para drogas anti-câncer descoberta3,4,5 ,6,7,8,9,10,11,12,13,14, 15,16,17,18,19,20,21,22,23, 24,25. Desde que esses esferoides podem imitar propriedades específicas do tecido de tumores no vivo, como nutrientes e oxigênio núcleo gradiente, hipóxico, bem como drogas resistência19, o uso desses modelos pode potencialmente encurtar cronogramas de descoberta de drogas, reduzir os custos de investimento e trazer novos medicamentos para pacientes mais efetivamente. Uma abordagem crítica para avaliar composta eficácia no desenvolvimento de tumor 3D esferoide é monitorar o crescimento de esferoide e recorrência sob tratamentos9,26. Para fazer isso, caracterizações quantitativas da morfologia do tumor, envolvendo o seu diâmetro e volume, com modalidades de imagem de alta resolução, são imperativas.
Modalidades de imagem convencionais, como campo claro, contraste fase7,9,22,de24e fluorescência microscopia8,9,16, 18,22 pode fornecer uma medida do diâmetro do spheroid, mas não é possível resolver a estrutura geral do spheroid em espaço 3D. Muitos fatores contribuem para essas limitações, incluindo penetração da luz sondagem no spheroid; difusão dos corantes fluorescentes para o spheroid; emitindo sinais fluorescentes de corantes fluorescentes animados no interior ou na superfície oposta do spheroid devido à forte absorção e espalhamento; e profundidade-resolução destas modalidades de imagem. Isto conduz frequentemente a uma medida de volume imprecisas. Desenvolvimento do núcleo necrótico em esferoides imita necrose na vivo tumores6,10,15,19,25. Esta característica patológica é improvável reproduzida na célula 2D culturas19,25,,27,28. Com um tamanho de esferoide superior a 500 µm de diâmetro, uma estrutura de três camadas concêntrica, incluindo uma camada exterior de pilhas proliferating, uma camada intermediária de células quiescentes e um núcleo necrótico, pode ser observado no esferoide6,10 ,15,19,25, devido à falta de oxigênio e nutrientes. Imagem latente da fluorescência de pilha de vivo e morto é a abordagem padrão para rotular o limite do núcleo necrótico. No entanto, outra vez, Penetrações tanto destes corantes fluorescentes e luz visível impedem o potencial para sondar sobre o núcleo necrótico para monitorar seu desenvolvimento em sua forma real.
Uma modalidade de imagem de 3D alternativa, tomografia de coerência óptica (OCT) é introduzida para caracterizar os esferoides de tumor. OCT é uma técnica de imagem biomédica que é capaz de adquirir dados 3D etiqueta-livre, não-destrutiva de até 1-2 mm de profundidade em tecidos biológicos29,30,31,32,33 ,34. OCT emprega interferometria de baixa coerência para detectar sinais espalhados por trás de diferentes profundidades da amostra e fornece imagens reconstruídas profundidade-resolvido em nível de mícron resoluções espaciais nas direções laterais e verticais. OCT foi adotado extensamente em oftalmologia35,36,37 e angiografia38,39. Estudos anteriores têm usado a OCT para observar a morfologia do in vitro esferoides de tumor na matriz da membrana basal (por exemplo, Matrigel) e avaliar suas respostas a terapia fotodinâmica40,41. Recentemente, nosso grupo estabeleceu uma plataforma de imagem da OCT do elevado-throughput para sistematicamente monitorar e quantificar a cinética de crescimento de esferoides tumor 3D em placas multi bem42. Precisa quantificação volumétrica de esferoides tumor 3D usando um voxel contando a abordagem e deteção de tecido necrótico rótulo livre nos esferoides baseado no contraste intrínseco atenuação óptica foram demonstradas. Este artigo descreve os detalhes de como a plataforma de imagem OCT foi construída e utilizada para obter imagens 3D de alta resolução de esferoides de tumor. Os passo a passo análises quantitativas da cinética de crescimento de esferoides tumor 3D, incluindo medições precisas de diâmetro esferoide e volumes, é descrita. Além disso, o método da detecção não-destrutiva de regiões do tecido necrosado usando a OCT, baseado no contraste a atenuação óptica intrínseca é apresentado.
1. preparação das células
2. elevado-throughput OCT plataforma de imagem
Nota: Ver referenciado trabalho29,30,31,32,33,34 para uma revisão aprofundada dos princípios e aplicações da OCT. Ver Figura 1 e Huang et al . 42 para obter detalhes da OCT Personalizada sistema utilizado neste estudo de imagem.
3. out digitalização e processamento de esferoides de Tumor
4. quantificação morfológica do Tumor 3D esferoides
Nota: Um código personalizado escrito em MATLAB processa esta quantificação. Clique no botão executar para iniciar o processo. Ver Figura 2B para o fluxograma das etapas de quantificação morfológica dos esferoides.
, com a presunção da forma esférica do tumor.5. mortos-célula região deteção de esferoides Tumor 3D
Nota: Em um meio homogêneo, intensidade de dispersão traseira OCT detectada em função da profundidade (eu(z)) pode ser descrita pela lei de Beer-Lambert49:
, onde z representa a profundidade, μ é a atenuação óptica coeficiente, e 0 a intensidade incidente à amostra. Portanto, o coeficiente de atenuação óptica derivada pode ser expressa como:
. Desde imagens OCT frequentemente são plotadas em uma escala logarítmica, a inclinação do perfil OCT intensidade pode ser recuperada para derivar o coeficiente de atenuação óptica. Consulte a Figura 2 para um fluxograma da geração de mapas de atenuação óptica.
6. histologia e imunohistoquímica
Nota: Histologia e imunohistoquímica (IHC) manchado imagens de esferoides de tumor são obtidos para correlacionar com os resultados correspondentes da OCT.
Imagem de tomografia computadorizada coerência óptica alto Throughput de esferoides em uma placa de 96 poços
A Figura 3 exibe o resultado de HT-OCT digitalização de uma placa de 96 poços com 116 HCT esferoides de tumor no dia 3. A varredura sequencial da placa inteira começa a partir do poço do canto inferior direito (H12). Figura 3B mostra o fluxograma da implementação do software do sistema de HT-OCT. Depois de um esferoide dados foram recolhidos e processados, a placa mudaria para em seguida, esperar por ~ 2 s para permitir que o spheroid para descansar e coletar os dados de esferoide. Cada PTU dados consistem de 400 x 400 x 1024 voxels, o que correspondeu a um volume real de 1.0 x 0,84 x 2,3 mm3. Figura 3 mostra uma colagem de pt-face imagens de OCT de esferoides HCT 116 gerados a partir de dados processados. O resultado é comparável com imagens de outros 2D da elevado-produção de imagem sistema22. Dada a capacidade de geração de imagens 3D da OCT, nós pode também gerar a colagem de imagens 2D esferoide transversal de 96 poços (Figura 3D) para monitorar a alturas de esferoide e visualizar a homogeneidade de esferoide na direção vertical. Uma colagem de imagens em 3D-rendered esferoide é também viável de qualquer ângulo predefinido (Figura 3E) para visualizar a forma geral 3D e avaliar o arredondamento do spheroid. Observe que a imagem global do OCT e o processo de tempo para a placa de 96 poços toda seria ~ 21 min e ~ 25 min, quando a câmera de varredura de linha está funcionando a uma velocidade de 92 kHz e 47, respectivamente. Ver vídeo 1 para obter um exemplo.
Longitudinal morfológicas e fisiológicas monitoramento de esferoide do Tumor
Depois que obtivemos as imagens estruturais OCT de esferoides de tumor da placa para vários pontos de tempo, nós poderia analisar mais estes dados quantificando as informações morfológicas e fisiológicas de esferoides o tumor. A Figura 4 mostra as diferentes abordagens para caracterizar esferoides de tumor e obter informações morfológicas e fisiológicas longitudinais com eles.
Figura 4B mostra diferentes maneiras de visualizar o spheroid do tumor. Com o auxílio do software livre ou comercial, podemos carregar os dados 3D no software e criar um "volume" do spheroid do tumor (renderização 3D), que mostra a estrutura geral do esferoide de tumor no espaço 3D. Com limites adequados, poderia gerar uma trama de superfície do esferoide de tumor (Figura 4B), o que poderia ser usado para segmentar o spheroid e medir o volume. Podemos também gerar os slides ortogonais (ortho slides) de aviões de seção transversal diferente em diferentes orientações (Figura 4B, XZ, XY e YZ) e medir o diâmetro e a altura do spheroid tumor destes slides orto.
Coligir dados OCT do spheroid mesmo de vários ponto do tempo, podemos quantificar as informações morfológicas e gerar a curva de crescimento do spheroid para mostrar suas mudanças longitudinais. A Figura 4 mostra dados representativos de um esferoide de tumor HCT 116 sendo monitorado por 21 dias. De dados segmentados e slides orto, medimos o diâmetro, altura e volume baseada em voxel do spheroid para todo o ponto do tempo, que foram listados na tabela. Também calculamos o volume baseado no diâmetro para uma comparação. As curvas de crescimento em tamanho e volume foram plotadas, respectivamente. Partir das curvas de crescimento, podemos ver que este esferoide de tumor HCT 116 seguiu um padrão de crescimento linear no volume antes do dia 11. Antes deste ponto do tempo, o spheroid continuou crescendo e mantido de uma forma relativamente uniforme. No entanto, após o dia 11, o spheroid tornou-se interrompida, achatado e totalmente recolhido no dia 21. A curva de crescimento de volumes baseada em voxel mostra claramente a tendência, com um volume gradualmente diminuída após o dia 11.
Baseado nos dados de OCT, nós também pode obter as informações fisiológicas da distribuição dos mortos-células dentro de esferoides o tumor, analisando a atenuação óptica pixel por pixel de 2D imagens transversais. Seguindo os métodos ilustrados na Figura 2 e 5 do protocolo, quantitativamente poderíamos determinar as regiões de mortos-célula e monitorar o crescimento destas regiões, em função do tempo. Figura 4 mostra um resultado representativo de acompanhamento longitudinal do aumento das áreas de células mortos no spheroid do tumor. As áreas destacadas em vermelho, que tinha alta atenuação óptica, mostram as áreas de necrose rotuladas. O 3D renderizados mapa de atenuação óptica durante o desenvolvimento do dia 14, vimos o setor vermelho se expandindo, indicando o aumento das regiões necróticas. A percentagem das áreas necrosadas aumentada, o spheroid tumor não podia manter a sua forma perfeita. Portanto, eles tenderiam a interromper e entrar em colapso, que foram vistos no acompanhamento longitudinal da morfologia do tumor na Figura 4.
Comparando o mapa de atenuação óptica OCT de esferoide de tumor HCT 116 com correspondentes imagens obtidas pela histologia e IHC, verificou-se a técnica de deteção de região proposto não destrutiva de tecido morto. A Figura 4 apresenta essa comparação com um esferoide dia 14 HCT 116. Mapear uma boa correspondência entre a atenuação da OCT e correspondente H & E e TUNEL fatias foram encontradas, que foi indicado ao analisar as características dentro das regiões em fatias H & E e TUNEL, marcadas por linhas de traço derivadas do contorno de alta atenuação OCT regiões. Em fatias H & E, nas regiões de tecido morto foram indicadas pelo menos estrutura densa e agregada, localizada na região da linha tracejada. Em fatias TUNEL, observou-se uma boa correspondência entre alta atenuação e região celular apoptótica TUNEL-rotulados.

Figura 1: construção de um sistema de tomografia computadorizada (HT-OCT) de coerência óptica de alta produtividade para a imagem latente de esferoide tumor. (A) esquema do sistema de HT-OCT. Um diagrama da placa de 96 poços é plotado junto ao sistema da OCT. Cinco poços (D2, D11, B6, D6, G6) marcados em amarelo são usados para o ajuste fino das fases (D). (B) a configuração actual do sistema HT-OCT. Consulte Tabela de materiais para componentes ópticos utilizados para cada parte do sistema. (C) espectrômetro design para o sistema HT-OCT. (D) fase de instalação para o sistema HT-OCT. Alinhamento adequado da fase 6 eixos e sincronização entre a aquisição da OCT e o movimento de palco são necessários para a imagem latente de alta produtividade. (E) e (F) mostram os efeitos de rotação e inclinação na imagem final de diferentes poços. Rotação faz com que as imagens de OCT de diferentes poços para deslocar horizontalmente enquanto inclinando levará ao deslocamento vertical de diferentes poços. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: processamento de dados para imagens de OCT de esferoides tumor. (A) fluxograma de etapas gerais de pós-processamento de dados OCT. (B) fluxograma de quantificação morfológica de esferoide o tumor. (C) fluxograma de detecção de região celular morto de esferoide o tumor. Barra de escala: 100 µm para todos os subfigures. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: elevado-throughput OCT digitalização de um 96 bem placa contendo esferoides de tumor de U-87 MG. (A), a configuração real com a 96-placa bem no âmbito do objectivo. (B) fluxograma da implementação do software de sistema HT-OCT. Colagens de 96 pt enfrentar (C), transversal (D) e projeção 3D renderizada de intensidade máxima (MIP) (E) OCT imagens do dia 3 HCT 116 esferoides foram gerados a partir dos dados processados. Barra de escala: 200 µm para todos os subfigures. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4: Longitudinal morfológicas e fisiológicas quantificação de Tumor esferoides com dados 3D OCT. (A) obtido 3D OCT estruturais as imagens de um esferoide de tumor após geral pós-processamento OCT. A partir dos dados da OCT, podemos gerar uma trama de superfície 3D e fatias ortogonais XZ e YZ XY para visualizar a estrutura do spheroid de tumor em qualquer direção (B). Podemos realizar acompanhamento longitudinal de um esferoide de tumor único (C), caracterizando a sua altura, diâmetro e volume baseada em voxel (listado na Tabela de materiais) e traçar as curvas de crescimento em tamanho e volume durante os 21 dias desenvolvimento. No exemplo, como o spheroid desenvolvido, ele tornou-se interrompeu no dia 11 e totalmente recolhido no dia 21. Ainda mais, nós podemos monitorar o estado fisiológico de um esferoide de tumor longitudinalmente, com base no contraste óptico atenuação intrínseca (D). 3D imagens renderizadas de um esferoide de tumor mostrou a aparência e o crescimento das regiões de mortos-célula do dia 7 ao dia 14. As áreas de mortos-pilha alta-atenuação-etiquetadas em vermelho foram emparelhadas com histológico e imuno-histoquímica (IHC) resultados. Mapa de atenuação de OCT, H & E e TUNEL resultado na Figura 4 são modificados de ref. 42. Barras de escala: 100 µm para todos os subfigures. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Video 1: imagem latente de alta produtividade OCT de esferoides tumor. Um fluxo de trabalho de imagem em 3D OCT, processamento básico de OCT e movimento de palco foi apresentado no vídeo com uma velocidade de 5x. Também foram apresentadas pré-visualizações de imagens estruturais da OCT processadas de esferoides. Por favor clique aqui para ver este vídeo. (Botão direito do mouse para fazer o download.)
Os autores não divulgar nenhum interesse de concorrente.
Tomografia de coerência óptica (OCT), uma tecnologia de imagem tridimensional, foi usada para monitorar e caracterizar a cinética de crescimento de esferoides tumor multicelulares. Precisa quantificação volumétrica de esferoides tumor usando um voxel contando a abordagem e deteção de tecido livre de rótulo morto nos esferoides baseado no contraste intrínseco atenuação óptica, foram demonstradas.
Este trabalho foi apoiado pela NSF concede IDBR (DBI-1455613), PFI:AIR-TT (PII-1640707), fundo de inicialização do NIH grants Lehigh University, R15EB019704 e R01EB025209 e R21EY026380.
| Desenvolvido em nosso laboratório | |||
| Diodo superluminescente (SLD) | luz | ||
| 2 vezes; 2 acopladores de fibra fundida de modo único, taxa de divisão de 50:50 | AC Photonics | WP13500202B201 | |
| Reference Arm | |||
| Lens Tube | Thorlabs | ||
| Adapter | Thorlabs | ||
| Collimating Lens | Thorlabs | AC080-020-C | |
| Lente de focagem | Thorlabs | ||
| Montagem de espelho cinemático | Thorlabs Espelho Thorlabs | ||
| 1D Estágio Translacional | Thorlabs | ||
| Filtro de densidade neutra contínua | Thorlabs | ||
| Poste Pedestrial | Thorlabs | ||
| Garfo de fixação | Thorlabs | ||
| Sample Arm | |||
| Lens Tube | Thorlabs | ||
| Adaptador | Thorlabs | ||
| Collimating Lens | Thorlabs | AC080-020-C | |
| Galvanômetro | Thorlabs | ||
| Relay Lens | Thorlabs | AC254-100-C | duas lentes de relé para fazer uma configuração de telescópio |
| Triângulo Espelho Montagem | Thorlabs | ||
| Espelho | Thorlabs | ||
| Objetivo | Mitutoyo | ||
| Pedestrial Post | Thorlabs | ||
| Garfo de Fixação | Thorlabs Controlador de Polarização Thorlabs | ||
| 30mm Montagem em Gaiola | Thorlabs | ||
| Gaiola Rod | Thorlabs | ||
| Stage | |||
| 3D motorizado estágio de tradução | Beijing Mao Feng Optoelectronics Technology Co., Ltd. | JTH360XY | |
| de estágio | |||
| de rotação de estágio | de inclinação | ||
| 2D impresso em 3D | < forte > espectrômetro< / forte > tubo de lente Adaptador Thorlabs Lente colimadora Thorlabs|||
| Lente de grade | Thorlabs | AC080-020-C | |
| G | = 1145 lpmm | ||
| F-theta | Thorlabs | FTH-1064-100 | |
| InGaAs Sensor de câmera de varredura de linha | Unlimited | SU1024-LDH2 | |
| Nome | Empresa | Número do catálogo | Comentários |
| Componente de cultura celular | |||
| HCT 116 Linha celular | ATCC | CCL-247 | |
| Frasco de cultura celular | SPL Life Sciences | 70025 | |
| Pipeta | Fisherbrand | 14388100 | |
| Ponteiras de pipeta | Sorenson Bioscience | 10340 | |
| Gibco GlutaMax DMEM | Thermo Fisher Scientific | 10569044 | |
| Fetal Soro Bovino, certificado, origem americana | Thermo Fisher Scientific | 16000044 | |
| Antibiótico-Antimicótico (100X) | Thermo Fisher Scientific | 15240062 | |
| Corning Microplaca de Fixação Ultrabaixa de Fundo Redondo Transparente de 96 poços | Corning | 7007 | |
| Gibco PBS, pH 7.4 | Thermo Fisher Scientific | 10010023 | |
| Gibco Tripsina-EDTA (0,5%) | Thermo Fisher Scientific | 15400054 | |
| Forma Série II 3110 Incubadoras de CO2 com camisa de água | Thermo Fisher Scientific | 3120 | |
| Luvas | VWR | 89428-750 | |
| Parafilm | Sigma-Aldrich | P7793 | |
| Pipetas de transferência | Globe Scientific | 138080 | |
| Centrífuga | Eppendorf | 5702 R | Para centrifugar o tubo de 15 mL |
| Centrífuga | NUAIRE | AWEL CF 48-R | Para centrifugar o microscópio de placas de 96 poços |
| Olympus | |||
| Nome | Empresa< | strong>Número de catálogo | Comentários |
| Histologia & IHC | |||
| Scanner de lâminas digital | Leica | Aperio AT2 | Obter imagens histológicas de alta resolução |
| Serviço | deHistologia Histowiz | Solicitar serviço para coloração histológica e imuno-histológica de esferoides tumorais | |
| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
| Lista de PTU Comerciais | |||
| SD-OCT system | Thorlabs | Telesto Series | |
| SD-OCT system | Wasatch Photonics | WP OCT 1300 nm | |
| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comments |
| Software para análise de dados | |||
| Basic Image Analysis | NIH | ImageJ Fiji também funciona. | |
| Renderização 3D | Thermo Fisher Scientific | Amira | Software comercial. Opção 1 |
| Renderização 3D | Bitplane | Imaris | Software comercial. Opção 2. Utilizado no protocolo |
| OCT software | de aquisição desenvolvido sob medida em C++. | ||
| Controle de palco | Beijing Mao Feng Optoelectronics Technology Co., Ltd. | MRC_3 | Incorporado ao código de aquisição de OCT personalizado |
| Software | de processamento de OCT | desenvolvido em C++. Utilize GPU. Incorporado ao código de aquisição personalizado da OCT. | |
| Análise Morfológica e Fisiológica | desenvolvida sob medida no MATLAB |