Resultados quantitativos de LC-MS/MS são na forma de íon-cromatogramas para o cromatograma de íons totais (TIC) e os cromatogramas de íons extraídos (EIC) das transições químicos específicos para produtos químicos medidos (Figura 1). A área do pico integrado de uma transição de química está relacionada com a abundância de compostos e pode ser usada para calcular a concentração exacta utilizando uma curva de calibração normalizada para um padrão interno (Figura 2). Plana ou baixa resposta dos analitos individuais indica que o intervalo de calibração está fora do intervalo linear do espectrômetro de massa, ou que o instrumento necessita de ajuste/calibração. Pobre precisão de repetições indica um problema com a injeção de amostra ou cromatografia inconsistente que requer a modificação de parâmetros de LC.
Análise não-alvo, usando uma varredura completa do MS1 produz um TIC para amostras (Figura 3), que permite a geração ad hoc de EICs de íons individuais (Figura 4). Qualquer ponto determinado momento cromatográfica contém sinais para espécies químicas e quando usando um espectrômetro de massa de alta resolução, a impressão digital isotópica do composto. Identificar compostos a partir da digitalização de MS1 é realizada por meio de programação por um algoritmo de pico-colheita usando uma das várias abordagens38,39,40. Colheita de pico produz características químicas com uma massa exata medida e tempo de retenção cromatográfica, bem como o espectro de massa do íon e a área do pico cromatográfico. Normalmente, essas informações são armazenadas em um formato de banco de dados digital para filtragem e tratamento subsequente, mas a natureza dos dados aninhada e interligada pode ser entendida conceitualmente (Figura 5).
A lista de recursos é filtrada para encontrar com um dos vários critérios a ser selecionado para investigação futura de compostos. A primeira e mais simples é a filtragem por defeito de massa (a diferença entre a massa exata de um recurso e sua massa nominal). PFAS compostos têm defeitos de massa negativos (Figura 6) devido à sua preponderância dos átomos de flúor e compostos perfluorados tem defeitos de massa positivos, mas substancialmente menores do que materiais orgânicos homólogas31,34 . Um segundo método de filtragem de etapa é identificar a série homóloga unidades comuns a espécie PFAS, tais como CF2 ou CF2O. identificar estas pode ser feito usando Kendrick massa defeito parcelas17,36, ou pacotes de software, tais como do R nontarget pacote35 (Figura 7).
Após a filtragem, atribuição de identidade química sobre a lista dos altamente diferencialmente observada e/ou provisoriamente por / perfluorados espécie pode começar. Massa exata fornece uma lista relativamente pequena de fórmulas químicas potenciais para correspondência, mas é insuficiente para identificação sem a adição de espectrais correspondentes ao padrão de isótopo do espectro de massa41. De alta resolução MS1 dados, uma ou mais fórmulas químicas putativos são comparadas com a digital isotópica de espectro de massa e marcou (Figura 8). Fórmulas para correspondência podem ser geradas usando ab initio um pool definido de átomos ou pode ser proveniente de uma combinação de literatura relatados compostos e o conteúdo de um ou mais bancos de dados. Os anfitriões nos EPA química Dashboard (https://comptox.epa.gov/dashboard/) uma lista constantemente atualizada de PFAS compostos identificados pela Agência, bem como listas compilada por outras organizações, como o de NORMAN Network42.
Fórmulas químicas podem ser confirmadas, e algumas informações estruturais podem ser recolhidas dos espectros de MS/MS (Figura 9). Estruturas do candidato estão disponíveis a partir de grandes químicos bancos de dados tais como o EPA química painel de instrumentos, Pubchem, o registo CAS, etc. Espectros previstos podem ser gerados ou adquiriram usando uma variedade de programas de fragmentação e atribuído,43 ou espectros de MS/MS podem ser interpretados manualmente.
Uma matriz de dados de exemplo está disponível na informação suplementar, contendo uma matriz de todo recurso de dez amostras (5 contra a corrente, 5 a jusante) coletado montante e a jusante de uma fonte de ponto fluorochemical. Cada linha representa uma característica química com tempo de retenção de associados, massa neutra, espectro de massa e abundância cru para cada amostra. (Tabela suplementar, folha 1). Inicial de filtragem (Tabela suplementar, folha 2) por defeito de massa negativo e significância estatística em um teste-t não pareado entre montante e jusante reduz o número de características químicas "interessantes" para ~ 120. Previu a fórmula química foram Obtida de Agilent IDBrowser e procurou contra o Dashboard de produtos químicos de Comptox EPA, que retornou a possíveis correspondências (Tabela suplementar, folha 3). O "top-hit" para cada fórmula química com base em fontes de dados37 foi atribuído (Tabela suplementar, folha 4). Observe-se que mais de metade dos recursos restantes não tem jogos de alta qualidade. Características identificadas com nenhuma correspondência pode ser o resultado da formação de código-fonte de fragmentação/aduto, atribuição de fórmula pobre, ou a identificação de PFASs não foi encontrado no banco de dados de origem. Interpretação de espectros de cru para validar as atribuições está além do escopo deste manuscrito mas mais informações podem ser encontradas em obras citadas15,30,31,44, 45.
| ID | Nome da amostra | Tipo de amostra | STD Conc | Tubo de ensaio | Método de LC | Método de MS |
| 1 | DB_001 | Em branco | | 1:, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 2 | DB_002 | Em branco | | 1:, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 3 | DB_003 | Em branco | | 1:, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 4 | DB_004 | Em branco | | 1:, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 5 | DB_005 | Em branco | | 1:, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 6 | FB | Em branco | | 1, 2: A | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 7 | 10 std | Padrão | 10 | 1, 3: A | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 8 | 25 std | Padrão | 25 | 1:, 4 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 9 | 50 std | Padrão | 50 | 1:, 5 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 10 | 100 std | Padrão | 100 | 1:, 6 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 11 | 250 std | Padrão | 250 | 1:, 7 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 12 | 500 std | Padrão | 500 | 1:, 8 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 13 | 750 std | Padrão | 750 | 1:B, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 14 | 1000 std | Padrão | 1000 | 1:B, 2 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 15 | DB_006 | Em branco | | 1:B, 3 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 16 | SB_DUP1 | Analito | | 1:B, 4 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 17 | SB_DUP2 | Analito | | 1:B, 5 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 18 | SW Site 03 | Analito | | 1:B, 6 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 19 | SW Site 16 | Analito | | 1:B, 7 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 20 | Site de SW 30 | Analito | | 1:B, 8 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 21 | DB_007 | Analito | | 1: C, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 22 | Site de SW 19 | Analito | | 1: C, 2 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 23 | SW Site 48 | Analito | | 1: C, 3 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 24 | SW Site 49 | Analito | | 1: C, 4 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 25 | Site de SW 05 | Analito | | 1: C, 5 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 26 | SW Site 47 | Em branco | | 1: C, 6 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 27 | DB_008 | Analito | | 1: C, 7 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 28 | 19_DUP Site de SW | Analito | | 1: C, 8 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 29 | Site de SW 20 | Analito | | 1: D, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 30 | Site de SW 21 | Analito | | 1: D, 2 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 31 | SW Site 46 | Analito | | 1: D, 3 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 32 | SW Site 47 | Analito | | 1: D, 4 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 33 | DB_009 | Em branco | | 1: D, 5 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 28 | Site de SW 32 | Analito | | 1: D, 6 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 29 | Site de SW 50 | Analito | | 1: D, 7 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 30 | SW Site 25 | Analito | | 1: D, 8 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 31 | 21_DUP Site de SW | Analito | | 1, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 32 | SW Site 52 | Analito | | 1, 2 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 33 | DB_010 | Em branco | | 1, 3 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 34 | FB | Em branco | | 1, 2: A | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 35 | 10 std | Padrão | 10 | 1, 3: A | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 36 | 25 std | Padrão | 25 | 1:, 4 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 37 | 50 std | Padrão | 50 | 1:, 5 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 38 | 100 std | Padrão | 100 | 1:, 6 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 39 | 250 std | Padrão | 250 | 1:, 7 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 40 | 500 std | Padrão | 500 | 1:, 8 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 41 | 750 std | Padrão | 750 | 1:B, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 42 | 1000 std | Padrão | 1000 | 1:B, 2 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 43 | DB_011 | Em branco | | 1:B, 2 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 44 | DB_012 | Em branco | | 1, 4 | PFAS grad 400uL/min - 9 min executar | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
Tabela 1: Exemplo worklist para alvo de análise e quantificação de PFAS utilizando LC-MS/MS
Tempo (min) 0 | % A (acetato de amônio 2,5 mM em 5% MeOH) 90 | % B (acetato de amônio 2,5 mM em 95% MeOH) 10 |
| 5 | 15 | 85 |
| 5.1 | 0 | 100 |
| 7 | 0 | 100 |
| 7.1 | 90 | 10 |
| 9 | 90 | 10 |
Tabela 2: Gradiente de exemplo para a separação de LC em análise orientada
| Folículo de tensão (kv) | 1,97 |
| Cone de tensão (V) | 15 |
| Extrator de tensão (V) | 3 |
| Lente de RF (V) | 0.3 |
| Temp de fonte | 150 |
| Temp desolvation | 40 |
| Fluxo de gás desolvation (L/hr) | 300 |
| Fluxo de gás do cone (L/hr) | 2 |
Tabela 3: Parâmetros de fonte de ionização para análise orientada
| CMP | Precursor | Produto | Tempo de interrupção | Cone de tensão (V) | Energia de colisão (eV) |
| PFBA | 212.80 | 168.75 | 0.01 | 15 | 10 |
| 13C 4-PFBA É | 216.80 | 171.75 | 0.01 | 15 | 10 |
| PFPeA | 262.85 | 218.75 | 0.01 | 15 | 9 |
| PFBS ° 1 | 298.70 | 79,90 | 0.01 | 40 | 30 |
| PFBS ° 2 | 298.70 | 98.80 | 0.01 | 40 | 28 |
| PFHxA ° 1 | 312.70 | 118.70 | 0.01 | 13 | 21 |
| PFHxA ° 2 | 312.70 | 268.70 | 0.01 | 13 | 10 |
| É 13C 2-PFHxA | 314.75 | 269.75 | 0.01 | 13 | 9 |
| HFPO-DA 1° | 329.16 | 168.90 | 0.01 | 10 | 12 |
| HFPO-DA 2° | 329.16 | 284.90 | 0.01 | 10 | 6 |
| HFPO-DA É O 1° | 332.16 | 168.90 | 0.01 | 10 | 12 |
| HFPO-DA É O 2° | 332.16 | 286.90 | 0.01 | 10 | 6 |
| PFHpA ° 1 | 362.65 | 168.65 | 0.01 | 14 | 17 |
| PFHpA ° 2 | 362.65 | 318.70 | 0.01 | 14 | 10 |
| PFHxS ° 1 | 398.65 | 79,90 | 0.01 | 50 | 38 |
| PFHxS ° 2 | 398.65 | 98.80 | 0.01 | 50 | 32 |
| É 13C 4-PFHxS | 402.65 | 83.90 | 0.01 | 50 | 38 |
| PFOA ° 1 | 412.60 | 168.70 | 0.01 | 15 | 18 |
| PFOA ° 2 | 412.60 | 368.65 | 0.01 | 15 | 11 |
| 13C 4-PFOA É | 416.75 | 371.70 | 0.01 | 15 | 11 |
| PFNA ° 1 | 462.60 | 218.75 | 0.01 | 15 | 17 |
| PFNA ° 2 | 462.60 | 418.60 | 0.01 | 15 | 11 |
| PFNA É | 467.60 | 422.60 | 0.01 | 15 | 11 |
| PFOS ° 1 | 498.65 | 79,90 | 0.01 | 60 | 48 |
| PFOS ° 2 | 498.65 | 98.80 | 0.01 | 60 | 38 |
| 13C 4-PFOS É | 502.60 | 79.70 | 0.01 | 60 | 48 |
| PFDA ° 1 | 512.60 | 218.75 | 0.01 | 16 | 18 |
| PFDA ° 2 | 512.60 | 468.55 | 0.01 | 16 | 12 |
| 13 2 - PFDA É | 514.60 | 469.55 | 0.01 | 16 | 12 |
Tabela 4: Tabela de transição de exemplo e parâmetros de MS/MS para o conteúdo de PFAC-MXA, juntamente com o HFPO-DA
Tempo (min) | % A (acetato de amônio 2,5 mM em 5% MeOH) | % B (acetato de amônio 2,5 mM em 95% MeOH) |
| 0 | 90 | 10 |
| 0,5 | 90 | 10 |
| 3 | 50 | 50 |
| 3.5 | 50 | 50 |
| 5.5 | 40 | 60 |
| 6 | 40 | 60 |
| 7 | 0 | 100 |
| 11 | 0 | 100 |
Tabela 5: Gradiente de exemplo para a separação de LC em análise não específico
| Parâmetro profinder | Valor de ajuste |
| Filtro de altura máxima de extração | 800 contagens |
| Ion(s) permitido | -H / + H |
| Modelo de isótopo de extração de recurso | Moléculas orgânicas comuns |
| Estados de carga permitidos | 2 - Jan |
| Limite de contagem de íon composto | Dois ou mais íons |
| Tolerância de alinhamento RT | 0,40 min + 0,0% |
| Alinhamento de tolerância em massa | 20,00 ppm + 2.0mDa |
| Filtro de altura absoluta de pós-processamento | > = 10000 contagens em uma amostra |
| Pós-processamento MFE Pontuação filtro | > = 75 em uma amostra |
| Algoritmo de integração do pico | 2 ágil |
| Pico integração altura filtro | > = 5000 contagens |
| Encontrar pelo filtro de altura absoluta do íon | > = 7500 contagens em uma amostra |
| Encontrar pelo filtro de Pontuação do íon | > = 50,00 em uma amostra |
Tabela 6: Característica Molecular extração e alinhamento as configurações para o software Profinder. Todos os valores na lista manteve suas configurações padrão para processamento de dados.
| Limiar de abundância do íon | Limiares de recurso | Replicar o limiar (n = 5) | Tempo de execução | Características | Passar o limiar replicar | Passar o limite de CV | Características de 90% das TIC |
| 1 x S/N | 2000 | Nenhum | 8.15 | 987 | 505 | 421 | 91 |
| 2 x S/N | 5000 | Nenhum | 5.02 | 707 | 357 | 313 | 93 |
| 3 x S/N | 10000 | Nenhum | 2.3 | 308 | 249 | 230 | 93 |
| 1 x S/N | 2000 | 100% | 3.3 | 603 | 339 | 297 | 92 |
| 2 x S/N | 35000 | 100% | 1.58 | 310 | 248 | 229 | 93 |
| 3 x S/N | 10000 | 100% | 1.45 | 202 | 190 | 182 | 92 |
Tabela 7: Comparação do tempo de processamento da amostra e as identificações de característica química para os limiares de extração de característica diferente.

Figura 1 : Total cromatograma de íons e íons extraídos cromatogramas para um subconjunto de normas de éter perfluorado. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2 : As curvas de calibração representativo para compostos demonstrando decrescente qualidade de construção de curva analítica. Painel de mais à esquerda indica uma calibração de alta qualidade; Painel médio indica um composto com precisão pobre através de duplicatas de preparação, particularmente nas concentrações mais elevadas; O painel direito indica uma curva com precisão pobre e uma baixa gama dinâmica linear, resultando em uma resposta plana na parte alta de calibração e nenhum sinal detectável na extremidade inferior. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3 : Sobreposto cromatogramas de íons totais (TIC) para águas superficiais extrai coletados o montante e a jusante de um site de produção de fluorochemical. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4 : Extraído do íon cromatogramas (EIC) para todos identificaram características químicas de uma amostra de água de superfície que contém várias classes de fluorochemical. Cada traço de químico é uma cor diferente para diferenciação. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 5 : Diagrama conceitual de informação crua e previsto para um recurso químico identificado como ácido de dímero de óxido de hexafluoropropylene (HFPO-DA). Características químicas são compiladas a partir da extração do software de dados brutos de medições de MS e conter cromatográficas (por exemplo, tempo de retenção (RT)) e informações de espectrometria de massa. Fórmula prevista, estruturas e identidades químicas são geradas a partir de dados brutos de medição para cada recurso. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 6 : Trama do defeito de massa para químicas características identificadas em um emissário de fabricação (vermelho, à esquerda) e a água de superfície de referência (azul, certo). Compostos fluorados cair perto e abaixo do tracejado linha zero. Observe a série PFOA/PFOS persistente na amostra de água de superfície de fundo (à direita). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 7 : Trama de defeito de massa massa vs para não identificadas características químicas de uma amostra de água de superfície com série homóloga identificado e rotulado pelo nontarget pacote R. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 8 : Espectro de massa de um desconhecido características químicas com intensidades isotópicas previstos de três possíveis fórmula química com a mesma monoisotópico Missa Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 9 : Espectro de fragmentação de um éter perfluorado composto com anotada fragmento picos. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 10 : Representação gráfica de filtragem limiares. Da esquerda para a direita, limiar de abundância de íon para espectros de massa característica química, apresentam limiar de abundância para características cromatográficas extraídas e replicar o limiar para a frequência de deteção de característica em um experimento de três vias de injeção. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.