Este trabalho apresenta um método cirúrgico para dissecando Drosophila pupal retina juntamente com protocolos para o processamento de tecido para extração de RNA, análise ocidental e imuno-histoquímica.
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Artigo de método
Este trabalho apresenta um método cirúrgico para dissecando Drosophila pupal retina juntamente com protocolos para o processamento de tecido para extração de RNA, análise ocidental e imuno-histoquímica.
A retina pupal Drosophila fornece um sistema de excelente modelo para o estudo de processos morfogenéticas durante o desenvolvimento. Neste trabalho, apresentamos um protocolo confiável para a dissecação da retina pupal Drosophila delicada. Nossa abordagem cirúrgica utiliza ferramentas prontamente disponíveis microdissection para abrir pupas e extrair precisamente complexos de olho-cérebro. Estas podem ser fixas, submetidas a imuno-histoquímica e retinas então montadas em corrediças do microscópio e fotografadas se o objetivo é detectar estruturas celulares ou subcelulares. Alternativamente, as retinas não fixadas podem ser isoladas do tecido cerebral, lysed em buffers apropriadas e utilizadas para proteína gel de electroforese ou mRNA extração (avaliar a expressão de proteínas ou gene, respectivamente). Paciência e prática significativa podem ser necessária para dominar o microdissection protocolo descrito, mas uma vez dominado, o protocolo permite isolamento relativamente rápido da retina principalmente sem danos.
A retina de Drosophila é composta de aproximadamente 750 omatídeos, rodeados por células de pigmento, dispostas em um favo de mel lattice1,2,3,4. Cada omatídeo contém oito neurônios fotoreceptor, quatro células cone secretoras de lente e duas células primárias de pigmento. Ao redor cada omatídeo são células produtoras de pigmento do retículo e grupos de cerdas sensoriais. Devido à sua natureza pós mitótica e estereotipado arranjo hexagonal, Drosophila pupal retina fornece um sistema de excelente modelo para o estudo de proc....
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1. tecido preparação
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O olho pupal é um tecido facilmente acessível que serve como um excelente modelo para investigar os processos de desenvolvimento que morfogênese da unidade. Aqui, podemos ter dissecado as retinas e usado a imunofluorescência para detectar as junções adherens apical (Figura 3A, C) ou a caspase Dcp-1 (Figura 3D) que é ativada durante a apoptose (Figura 3)25. Essas abordagens permitem observar c.......
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O método de dissecação de olho pupal drosófila descrito aqui permite o isolamento de 6 a 10 complexos de olho-cérebro dentro de 10 a 15 min. No entanto, paciência e prática são essenciais para dominar a técnica de dissecação e melhorar a qualidade e a velocidade de dissecações. Desta vez de dissecação curto garante que cada olho é aproximadamente mesmo fase de desenvolvimento, reduzindo a variabilidade na expressão do fenótipo ou gene de retina em um conjunto de dados. Enquanto protocolos alternativos podem exig.......
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Os autores não têm nada para divulgar.
Agradecemos a Zack tambor e nossos revisores para comentários úteis sobre o manuscrito. Este trabalho foi apoiado pela R15GM114729.
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| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| Adobe Photoshop | Software de processamento de imagem | Adobe | |
| Talas de bambu, 6" | Ted Pella Inc | 116 | |
| Beta mercaptoetanol | Sigma-Aldrich | M3148 | |
| Fosfato de beta-glicerol | Sigma-Aldrich | 50020 | |
| Prato | Prato de Petri de vidro preenchido até a borda com SYLG170 ou SYLG184 (colorido de preto com pó de carvão finamente moído). Deixe em temperatura ambiente por 24-48 h para polimerizar. | ||
| Porta-lâminas | Fine Science Tools | 10053 | |
| Albumina de soro bovino | Sigma-Aldrich | A7906 | |
| comprimidos de coquetel inibidores de protease completos e sem EDTA Microscópio | Roche | 4693132001 | |
| (Zeiss LSM 501) | Carl Zeiss | ou microscópio similar | |
| Dietilpirocarbonato (DEPC) | Sigma-Aldrich | 40718 | |
| Fita dupla face | 3M | 665 | |
| Drosophila meio alimentar, rico em nutrientes | 7,5% de sacarose, 15% de glicose, 2,5% de ágar, 20% de levedura de cerveja, 5% de peptona, 0,125% de MgSO4,7H2O, 0,125% de CaCl2,2H20 | ||
| Drosophila meios alimentares, receita padrão de | fubá do centro de estoque de Bloomington Drosophila. (https://bdsc.indiana.edu/information/recipes/bloomfood.html) | ||
| Ácido etilenodiaminotetracético | Sigma-Aldrich | E6758 | |
| Solução | 4% formadeído em PBS, pH 7,4. | ||
| Microscópio de fluorescência (microscópio TCS SP5 DM) | Leica Microsystems | ou microscópio similar | |
| Fórceps | Ferramentas de ciência fina | 91150-20 | A pinça deve ser afiada com frequência. |
| Formaldeído | Thermo Scientific | 28908 | |
| Pratos de vidro com 9 poços | Corning | 7220-85 | Também conhecido como pratos de 9 poços |
| Lamínulas de vidro (22 x 22 mm) | Fisher Scientific | 12-542-B | |
| Lâminas de microscópio de vidro (25 x 75 x 1 mm) | Fisher Scientific | 12-550-413 | |
| Placa de Petri de vidro | Corning | 3160-100BO | |
| Glicerol | Sigma-Aldrich | G5516 | |
| Software Image Studio versão 5.2.5 | LI-COR Biosciences | Software de processamento de imagens para quantificação de Western blots. | |
| Tampão de amostra Laemmli | Bio-Rad | 161-0737 | 2X tampão de amostra de proteína concentrada, suplemento com beta mercaptoetanol de acordo com as instruções do fabricante. |
| Marcador de pista reduzindo o buffer de amostra | Tampão de amostra de proteína concentrada | ThermoFisher Scientific | 39000 |
| Tubos de microcentrigura | Axygen | MCT-175-C | |
| Ferramentas de Ciência Fina | 15000-03 | ||
| Bandejas de Micropoços (72 x 10 µ Poços L) | Nunc | 438733 | |
| Meios | 0,5% N-propilgalato e 80% glicerol em PBS | ||
| N-propilgalato | Sigma-Aldrich | P3130 | |
| PBS livre de nuclease (PBS em 0,1% DEPC, pH 7,4) | Adicione o volume apropriado de DEPC ao PBS, misture bem e incube durante a noite em temperatura ambiente com agitação constante. Autoclave por pelo menos 20 minutos. Armazene a 4° C | ||
| PBS (solução salina tamponada com fosfato pH 7,4) | Sigma-Aldrich | P5368 | Prepare de acordo com as instruções do fabricante |
| PBS+pi (PBS mais inibidores de protease e fosfatase) | 10mM NaF, 1mM beta-glicerol fosfato e 1mM Na3VO4 em PBS, pH 7,4. | ||
| PBT | 0,15% TritonX e 0,5% de albumina de soro bovino em PBS, pH 7,4 | ||
| Suporte de pinos | Fine Science Tools | 26016-12 | |
| Anticorpo primário: cabra anti-GAPDH | Imgenex | IMG-3073 | Para Western blotting. Usado a 1:3000 |
| Anticorpo primário: Dcp-1 de coelho anticlivado | Sinalização celular | 9578S | Para imunofluorescência. Usado a 1:100 |
| Anticorpo primário: anti-DEcad de rato | Estudos de Desenvolvimento Banco de Hibridoma | DCAD2 | Para imunofluorescência. Usado a 1:20 |
| Anticorpo primário: rato anti-DEcad | DOI: 10.1006/dbio.1994.1287 | DCAD1 | Presente de Tadashi Uemura. Usado em 1:100. |
| Kit de extração de RNA: Relia Prep RNA tissue Miniprep kit | Reagente | Z6110 | |
| Rnase (RNase Away) | Molecular BioProducts | 7002 | |
| Lâminas de bisturi | Fine Science Tools | 10050 | Quebre um pequeno pedaço de lâmina de escape e prenda no suporte da lâmina. |
| Anticorpo secundário: IgG anti-rato de burro conjugado com 488 (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 712-545-153 | Para imunofluorescência. Usado a 1:200 |
| Anticorpo secundário: IgG anti-coelho de cabra conjugada com cy3 (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 111-165-144 | Para imunofluorescência. Usado a 1:100 |
| Anticorpo secundário: Tecnologia de sinalização celular anti-rato IgG (H+L) de cabra conjugada com HRP | 7077 | Para Western blotting. Usado a 1:3000 | |
| Anticorpo secundário: IgG anti-cabra de coelho conjugado com HRP (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 305-035-003 | Para Western blotting. Usado a 1:3000 |
| Cloreto de Sódio | Sigma-Aldrich | S3014 | |
| Fluoreto de Sódio | Sigma-Aldrich | 215309 | |
| Vanadato de Sódio | Espectrofotômetro Sigma-Aldrich | 50860 | |
| (NanoDrop) | ThermoFisher Scientific | 2000c | |
| Microscópio de dissecação estéreo (M60 ou M80) | Leica Microsystems | ou microscópio similar | |
| Sylgard (preto) | Dow Corning | SYLG170 | |
| Sylgard (transparente) | Dow Corning | SYLG184 | Cor preta com pó de carvão finamente moído |
| Tecido: Kimwipes | KIMTECH | 34120 | |
| TritonX | Sigma-Aldrich | T8787 | |
| Trizma hydrochloride pH7.5 | Sigma-Aldrich | T5941 | |
| Agulha de tungstênio, fina | Fine Science Tools | 10130-10 | Insira no suporte do pino |
| Agulha de tungstênio, resistente | Fine Science Tools | 10130-20 | Insira no suporte do pino |
| WTLB (tampão de lise de tecido ocidental) | NaCl 150mM, Triton X-100 a 1,5%, EDTA 1mM, glicerol a 20%, NaF 10mM, fosfato de betaglicerol 1mM e Na3VO4 1mM em Tris-HCl 50mM (pH 7,5). Suplemento com uma mesa de coquetel de protease completa por 10 mL de solução. | ||
| Pasta de levedura | (supermercado local) | Aproximadamente 2 colheres de sopa de levedura ActiveDry de Fleischmann (ou similar) dissolvida em ~20 mL de H2O destilada |
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