$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
RABV-Infected, material arquivado PFA-fixo do cérebro foi usado. Os respectivos estudos experimentais em animais foram avaliados pelo Comitê responsável de cuidados, uso e ética do escritório Estadual de agricultura, segurança alimentar e pescaria em Mecklemburgo-Pomerânia Ocidental (LALFF M-V) e obteve aprovação com permissões 7221.3-2.1-002/11 (camundongos) e 7221.3-1-068/16 (furões). Os cuidados gerais e os métodos utilizados nos experimentos com animais foram realizados de acordo com as diretrizes aprovadas.
PRECAUÇÃO: Este protocolo utiliza várias substâncias tóxicas e/ou nocivas, incluindo PFA, metanol (MeOH), peróxido de hidrogénio (H2O2), azida sódica (NaN3), TBA, BA, BB e DPE. MeOH e TBA são altamente inflamáveis. Evite a exposição usando equipamentos de proteção individual apropriados (um jaleco, luvas e proteção ocular) e conduzindo experimentos em uma capa de fumaça. Recolher os resíduos separadamente em recipientes apropriados e eliminá-lo de acordo com as regulamentações locais. O vírus da raiva é classificado como um nível de biossegurança (BSL)-2 patógeno e pode, portanto, geralmente ser tratado condições BSL-2. Algumas atividades, incluindo procedimentos que podem gerar aerossóis, trabalhar com altas concentrações de vírus, ou trabalhar com novos lissavírus, podem requerer classificação BSL-3. A profilaxia pré-exposição é recomendada para pessoal de alto risco, incluindo cuidadores de animais e trabalhadores de laboratório18,19. Consulte os regulamentos da autoridade local.
1. fixação de tecido cerebral e seccionamento
- Fixar amostras cerebrais num volume adequado de 4% de PFA em soro fisiológico tamponado com fosfato (PBS [pH 7,4]) durante pelo menos 48 h a 4 ° c (com uma relação tecido-a-fixativa aproximada de 1:10 [v/v]).
- Lave as amostras de tecido 3x em PBS por pelo menos 30 min cada lavagem e armazená-los em 0, 2% NaN3/PBS a 4 ° c até o uso.
- Corte o tecido em seções de 1 mm de espessura usando um do (taxa de avanço da lâmina: 0,3 – 0,5 mm/s, amplitude: 1 mm, espessura da fatia: 1.000 μm).
- Para manter a sequência de fatias correta, armazene cada seção de tecido separadamente em um poço de uma placa de cultura de células multipoços. Adicionar 0, 2% NaN3/PBS e guarde as secções de tecido a 4 ° c até à utilização.
2. amostra pré-tratamento com metanol
Nota: realize todas as etapas de incubação com oscilação suave e, se não indicado de outra forma, à temperatura ambiente. Proteja as amostras da luz. O pré-tratamento da amostra serve a finalidade geral de melhorar a difusão do anticorpo e de reduzir o autofluorescence do tecido pela exposição ao MeOH e ao H2o2, respectivamente14.
- Prepare 20% (v/v), 40%, 60%, e 80% MeOH soluções em água destilada. Por exemplo, para 20% MeOH, adicione 10 mL de 100% MeOH a 40 mL de água destilada em uma embarcação selável apropriada e misture invertendo-a.
- Transfira as amostras para embarcações de tamanho razoável (por exemplo, tubos de reacção de 5 mL). Tome cuidado para usar materiais quimicamente resistentes aos reagentes utilizados neste protocolo. Por exemplo, note que, enquanto o polipropileno é adequado, o poliestireno não é.
Nota: as especificações de volume neste protocolo referem-se a 5 mL de tubos de reacção. Se for utilizada uma embarcação diferente, ajuste os volumes em conformidade.
- Incubar as amostras em 4 mL de cada concentração da série preparada de soluções de MeOH em ordem ascendente para 1 h cada.
- Incubar as amostras 2x por 1 h cada em puro (100%) MeOH.
- Resfrie as amostras a 4 ° c (por exemplo, em um refrigerador de laboratório seguro).
- Prepare a solução de branqueamento (5% H2o2 em MeOH), por exemplo, diluindo uma solução de stock de 30% h2O2 em 1:6 em puro (100%) MeOH, e Chill-lo a 4 ° c.
- Retire o 100% MeOH das amostras refrigeradas e adicione 4 mL de solução de branqueamento pré-refrigerada (5% H2O2 em MeOH). Incubar durante a noite a 4 ° c.
- Troque a solução clareador por 4 mL de 80% de MeOH e incubar por 1 h. Continue usando a série preparada de soluções de MeOH em ordem decrescente para 1 h cada um até que as amostras foram incubadas por 1 h em 4 mL de 20% MeOH.
- Lave as amostras 1x por 1 h com 4 mL de PBS.
3. imunocoloração
Nota: realize todas as etapas de incubação com oscilação suave e, se não indicado de outra forma, à temperatura ambiente. Proteja as amostras da luz. Para evitar o crescimento microbiano, adicionar NaN3 a uma concentração final de 0, 2% para as soluções nesta seção. As amostras de tecido são ainda mais permeabilizadas pelo tratamento com detergentes não iônicos Triton X-100 e Tween 20. O soro normal é usado para bloquear a ligação de anticorpos inespecíficos. Glicina e heparina são adicionadas para reduzir o fundo de imunolabeling14.
- Lave as amostras 2x durante 1 h cada uma em 4 mL de 0,2% Triton X-100/PBS.
- Permeabilize as amostras por 2 dias a 37 ° c com 4 mL de 0,2% Triton X-100/20% DMSO/0.3 M Glycine/PBS.
- Bloqueie a ligação inespecífica de anticorpos incubando as amostras durante 2 dias a 37 ° c em 4 mL de 0,2% de soro/PBS normal de Triton X-100/10% DMSO/6%.
Nota: Use o soro normal da mesma espécie que o anticorpo secundário estêve levantado dentro para conseguir resultados de obstrução ideais.
- Incubar as amostras em 2 mL de solução de anticorpos primários (3% soro normal/5% DMSO/PTwH [PBS-Tween 20 com heparina] + anticorpo primário/anticorpos) durante 5 dias a 37 ° c. Atualize a solução de anticorpos primários após 2,5 dias.
- Para o PTwH, reconstitua o sal de sódio da heparina em água destilada para fazer uma solução de estoque de 10 mg/mL (armazene esta solução, aliquotados, a 4 ° c). Adicionar a solução de ações para 0,2% Tween 20/PBS a uma concentração final de 10 μg/mL.
Nota: a escolha da diluição correcta do anticorpo pode necessitar de optimização. Geralmente, as concentrações padrão de Immunohistochemistry são um bom ponto começar.
- Lave as amostras durante 1 dia em 4 mL de PTwH, trocando o tampão de lavagem pelo menos 4x – 5x durante o curso do dia e deixando a lavagem final durante a noite.
- Incubar as amostras em 2 mL de solução de anticorpos secundários (3% soro normal/PTwH + anticorpo secundário/anticorpos) durante 5 dias a 37 ° c. Refresque a solução secundária do anticorpo após 2,5 dias.
- Diluir o anticorpo secundário/anticorpos em 1:500 na solução de anticorpos secundários (i.e., 4 μL em 2 mL).
- Lave as amostras durante 1 dia, conforme descrito no passo 3,5, deixando a lavagem final durante a noite.
4. coloração nuclear
Nota: realize todas as etapas de incubação com oscilação suave e, se não indicado de outra forma, à temperatura ambiente. Proteja as amostras da luz. Se nenhuma mancha nuclear é exigida ou o espectro do comprimento de onda/emissão da excitação de a-PRO-3 é exigido para a excitação ou a deteção de um outro fluorophore, salte esta etapa.
- Diluir a mancha de ácido nucleico para-PRO-3 em 1:1000 em PTwH e incubar as amostras em 4 mL de solução de coloração nuclear por 5 h.
- Lave as amostras durante 1 dia, conforme descrito no passo 3,5, deixando a lavagem final durante a noite.
Nota: após as lavagens, as amostras podem ser armazenadas em PBS a 4 ° c até a limpeza óptica.
5. esclarecimento do tecido
Nota: realize todas as etapas de incubação com oscilação suave e, se não indicado de outra forma, à temperatura ambiente. Proteja as amostras da luz. As amostras de tecido são desidratadas em uma série graduada de soluções de TBA. Como a imunocoloração requer soluções aquosas, todos os procedimentos de coloração devem ser terminados antes da limpeza tecidual. O afastamento ótico e a harmonização do índice refração são conseguidos pelo tratamento com uma mistura de Ba, de BB, e de DPE. A solução de compensação é suplementada com DL-α-tocoferol como um antioxidante13.
- Prepare soluções de 30% (v/v), 50%, 70%, 80%, 90% e 96% de TBA em água destilada. Por exemplo, para 30% TBA, adicione 15 mL de 100% TBA a 35 mL de água destilada em uma embarcação selável apropriada e misture invertendo.
Nota: o TBA tem um ponto de fusão de 25 – 26 ° c; assim, tende a ser sólido à temperatura ambiente. A fim de preparar as soluções TBA, aqueça o frasco bem selado a 37 ° c em uma incubadora ou banho de água.
- Desidratar as amostras com 4 mL de cada concentração da série preparada de soluções de TBA em ordem ascendente para 2 h cada. Deixe o 96% TBA durante a noite.
- Desidrata as amostras mais em puro (100%) TBA para 2 h.
- Prepare solução de compensação BABB-D15.
Nota: BABB-D15 é uma combinação de BA e BB (BABB) que é misturado com o DPE em uma relação de x: 1, onde x é especificado no nome da solução, neste caso 15.
- Para BABB, misture uma parte BA com duas partes BB.
- Misture BABB e DPE em uma proporção de 15:1.
- Adicionar 0,4 vol% DL-α-tocoferol (vitamina E).
Nota: por exemplo, para 20 mL de BABB-D15, misture 6,25 mL de BA com 12,5 mL de BB. Adicionar 1,25 mL de DPE e completá-lo com 0, 8 mL de DL-α-tocoferol.
- Limpe as amostras na solução de compensação até que sejam opticamente transparentes (2 – 6 h).
- As amostras podem ser armazenadas a 4 ° c em BABB-D15, protegidas da luz, até a montagem e a imagem.
6. montagem da amostra
- Usando uma impressora 3D, imprima a câmara de imagem e a tampa (material: copoliéster [CPE], bocal: 0,25 mm, altura da camada: 0, 6 mm, espessura da parede: 0,88 mm, contagem de parede: 4, infill: 100%, sem estrutura de suporte; o correspondente. O arquivo STL pode ser encontrado nos materiais suplementares deste protocolo).
- Montar a câmara de imagem (Figura 2).
- Monte um lamela redondo (diâmetro: 30 milímetros) na câmara da imagem latente com RTV-1 (um-componente quarto-temperatura-vulcanizing) borracha de silicone. Retire o excesso de borracha de silicone com um cotonete de algodão molhado e Cure durante a noite.
- Montar uma lamínula redonda (diâmetro: 22 mm) na tampa com borracha de silicone RTV-1. Retire o excesso de borracha de silicone com um cotonete de algodão molhado e Cure durante a noite.
- Coloque a amostra em uma câmara de imagem, adicione um pequeno volume de BABB-D15 e insira a tampa. Encha a câmara com BABB-D15 através da entrada, usando uma agulha hipodérmica (27 G x 3/4 polegada [0,40 mm x 20 mm]).
- Ligue a entrada e sele a câmara de imagem com borracha de silicone RTV-1. Cure durante a noite no escuro.
7. processamento de imagens e imagens
- Configure a aquisição da imagem selecionando as respectivas linhas de laser para corresponder aos fluoróforos utilizados. Ajuste os intervalos de detecção de cada detector para evitar a sobreposição do sinal entre os canais.
Nota: intervalos de detecção exemplares para Alexa fluor 488, Alexa fluor 568 e TO-PRO-3 são 500 – 550 nm, 590 – 620 nm e 645 – 700 nm, respectivamente.
- Escolha os parâmetros de aquisição, defina a borda superior e inferior da pilha z e adquira a pilha de imagens.
Nota: os parâmetros de aquisição exemplares são uma verificação sequencial com um tamanho de pixel de 60-90 nm, um tamanho z-Step de 0,5 μm, uma média de linha de 1, uma velocidade de digitalização de 400 Hz e um tamanho de furo de pino de 1 unidade arejada.
- Processe a pilha de imagens usando um software de análise de imagem apropriado (por exemplo, Fiji) para gerar projeções 3D ou realizar análises aprofundadas.
Observação: devido ao tamanho grande dos arquivos de imagem adquiridos, o uso de uma estação de trabalho geralmente é necessário.
- Abra o arquivo de aquisição ou imagem (s) em Fiji (File | Aberto | Selecionar arquivos).
- Se estiver usando, por exemplo,. Arquivos LIF, selecione ou desmarque as opções desejadas na janela de diálogo bio-formats. Exibir pilha com hyperstack. Além disso, não são necessárias seleções ou Ticks específicos. Prima OK.
- Se o arquivo contiver várias pilhas de imagens, selecione as que serão analisadas e confirme pressionando OK.
- Realize correção de lixívia dividindo a imagem mesclada em canais individuais (Image | Cor | Channels Toole, em seguida, selecione mais | Canais divididos). Para cada canal, selecione correção de lixívia (Image | ADJUST | Correção de lixívia) e escolha a relação simples (intensidade do fundo: 0,0).
Nota: em alguns casos, por exemplo, quando não há nenhuma deterioração linear do sinal ou o sinal é demasiado fraco total, a relação simples pode falhar. Alternativamente, tente ajuste exponencial ou pule a correção de lixívia.
- Ajuste o brilho e o contraste para cada canal usando os controles deslizantes (Image | Ajustar o ajuste | Brilho | Contraste).
- Mesclar os canais (imagem | Cor | Mesclar canais), faça uma composição (imagem | Color | Channels Toole, em seguida, selecione mais | Fazer Composite), e convertê-lo para o formato RGB (Image | Color | Channels Toole, em seguida, selecione mais | Converta para RGB).
- Se necessário, redimensione a pilha de imagens para reduzir o tempo de computação e o tamanho do arquivo (Image | ADJUST | Tamanho, ambas as opções assinalada mais bilinear interpolação).
- Gerar uma projeção 3D (Image | Stacks | projeto 3D). Escolha o ponto mais brilhante como método de projeção e defina o espaçamento da fatia para corresponder ao tamanho da etapa z da pilha de imagens adquirida. Para obter a máxima qualidade, defina o incremento do ângulo de rotação para 1 e habilite a interpolação. Modifique a rotação total, os limites de transparência e a opacidade conforme necessário.
- Se necessário, reajustar o contraste e o brilho convertendo a projeção 3D de volta para o formato de 8 bits (Image | Tipo | 8 bits). Use os respectivos controles deslizantes (Image | ADJUST | Brilho | Contraste) e reconverter a pilha de imagens para o formato RGB conforme descrito na etapa 7.3.4.
- Salve a projeção 3D como. TIF arquivo (formato de arquivo de imagem) e. Arquivo AVI (formato de arquivo de vídeo).