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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Este protocolo descreve um ensaio in vivo de fagocitose no adulto Drosophila melanogaster para quantificar o fagócito reconhecimento e apuramento das infecções microbianas.
Em todos os animais, imunidade inata fornece uma defesa imediata e robusta contra um amplo espectro de patógenos. Respostas de imune humorais e celulares são os principais ramos da imunidade inata, e muitos dos fatores regulam estas respostas são conservados evolutivamente entre invertebrados e mamíferos. Fagocitose, o componente central da imunidade inata celular, é realizada por células especializadas do sistema imunológico. Mosca da fruta, Drosophila melanogaster, tem emergido como um poderoso modelo genético para investigar os mecanismos moleculares e fisiológicos impactos de fagocitose em animais inteiros. Aqui vamos demonstrar um ensaio baseado em injeção de fagocitose in vivo para quantificar a absorção de partículas e a destruição por células do sangue de Drosophila , hemócitos. O procedimento permite que os pesquisadores controlar com precisão a concentração de partículas e dose, tornando-se possível obter resultados altamente reprodutíveis em um curto espaço de tempo. O experimento é quantitativa, fácil de realizar e pode ser aplicado para esse reconhecimento do patógeno de influência, captação e afastamento de tela para fatores do hospedeiro.
As defesas imunes inatas formam a primeira linha de defesa contra micróbios patogênicos. Estas respostas podem ser funcionalmente divididas em imunidade humoral e celular inata, ambos os quais são mediados por receptores de reconhecimento padrão germline codificado (PRRs) que detetam o patógeno associado padrões moleculares (PAMPs)1. Muitas das vias de sinalização e mecanismos efetores da imunidade inata são conservados em mamíferos e invertebrados, como o nematódeo, Caenorhabditis elegans e a mosca da fruta, Drosophila melanogaster2. A mosca de fruta tem emergido como um poderoso sistema para estudar a defesa do hospedeiro contra microorganismos infecciosos3. Drosófila é geneticamente tractable, fácil e barata, criados em laboratórios e tem um tempo de geração curto. Além disso, a mosca da fruta apresenta defesas altamente eficientes contra uma matriz de micróbios, permitindo que o exame da imunidade do hospedeiro contra patógenos virais, bacterianas, fúngicas ou parasitárias.
Drosófila imunologistas historicamente utilizaram telas genéticas para a frente, todo o genoma mediada por RNA interferência (RNAi seleção de linhas de células de inseto e pré-existentes cepas moscas mutantes para examinar a imunidade inata – levando à) identificação e caracterização de vários caminhos imune humoral evolutivamente conservada4,5,6,7,8. A resposta imune inata humoral é, sem dúvida, o melhor caracterizada a defesa imunológica em moscas de fruta. Após a infecção, a resposta humoral leva para a produção e liberação sistêmica de peptídeo antimicrobiano moléculas (AMP) para a hemolinfa, o sangue equivalente em insetos. Amplificadores são produzidos pelo pedágio altamente conservado e Imd vias de sinalização. O pathway pedágio é homólogo de mamíferos receptor TLR/IL-1R sinalização e via Imd é homóloga à sinalização de mamíferos de fator de necrose tumoral-alfa. No pedágio da drosófila, sinalização é induzida por bactérias gram-positivas, fungos e Drosophila X virus6,9,10 e Imd sinalização é induzida por bactérias Gram-negativas11 ,12.
Imunidade celular, composta de encapsulamento, melanização e fagocitose de patógenos invasivos, realizada por células especializadas de sangue chamadas de hemócitos13. Existem três classes de hemócitos na mosca da fruta: cristal células, lamellocytes e plasmatocytes13. Pilhas de cristal, que compõem 5% dos hemócitos circulantes em larvas, liberam enzimas proPhenoloxidase (proPO) levando a melanização de agentes patogénicos e tecidos do hospedeiro em locais da ferida. Lamellocytes, que normalmente não são encontrados em embriões saudáveis ou larvas, são células aderentes que encapsulam objetos estranhos. Estas células são induzidas mediante pupariation ou quando parasitam ovos de Vespa são depositados em larvas. Plasmatocytes fagocíticas, que compõem 95% da circulação hemócitos em larvas e todos os restantes hemócitos em adultos, desempenhar um papel no tecido remodelação durante o desenvolvimento e, nomeadamente, servir como a célula principais efetoras da imunidade celular de Drosophila .
Fagocitose uma linha imediata e crucial de defesa imune inata; micróbios que quebrou a barreira epitelial do hospedeiro são rapidamente tragados e eliminados por células fagocíticas (para uma revisão abrangente da biologia das células de fagocitose consulte referência 14). Esse processo é iniciado quando o reconhecimento de padrões codificados germline receptores (PRRs) sobre hemócitos reconhecem patógenos associados a padrões moleculares (PAMPs) de micróbios. Uma vez acoplado para seus destinos, PRRs iniciem cascatas de sinalização que levam à formação de pseudopods através da remodelação de citoesqueleto de actina. Os pseudopods cercam o micróbio, que posteriormente é engolido e interiorizado em uma organela nascente, o fagossomo. Os micróbios são destruídos como o fagossoma sofre o processo de maturação do fagossoma quando o fagossoma é traficado para o interior do hematócito e acidifica através de uma série de interações com lisossomos. Em vitro e célula de estudos de biologia em células de mamíferos primária têm sido fundamentais para identificar e caracterizar os fatores que regulam a fagocitose, como os mamíferos do Fc-gama e C3b receptores15,16. No entanto, a capacidade de executar telas em grande escala ou estudos in vivo são limitadas nos sistemas dos mamíferos.
Aqui nós apresentamos um ensaio in vivo para fagocitose em adultos de moscas de fruta, que é baseado em um procedimento introduzido pelo laboratório de David Schneider em 200017. O laboratório de Schneider mostrou que sessile hemócitos agrupados ao longo do vaso dorsal abdominal prontamente fagocitam bactérias e esferas de poliestireno. Para visualizar a fagocitose, moscas são injetadas com partículas fluorescente etiquetadas (tais como Escherichia coli rotulado com isotiocianato de fluoresceína (e. coli -FITC)), incubadas durante 30 minutos para permitir que o tempo de hemócitos engolir as partículas e então injetado com trypan azul, que sacia a fluorescência de partículas não fagocitados durante o período de incubação. Voar vasos dorsais são então fotografados usando um microscópio fluorescente invertido. Este trabalho seminal, utilizar um experimento relativamente simples, demonstrado que hemócitos fagocitam bactérias e grânulos de látex, a fagocitose bacteriana podem ser inibidos pela pre-injeção de moscas com grânulos de látex, e que voa sem celular e humoral respostas imunes são suscetíveis nem de Escherichia coli. O ensaio apresentado neste relatório baseia-se o trabalho do laboratório Schneider para quantificar a fagocitose in vivo medindo a intensidade da fluorescência das partículas tragado por hemócitos vaso dorsal associado.
Semelhante à abordagem tomada nos sistemas dos mamíferos, Drosophila geneticistas inicialmente usado todo o genoma in vitro RNAi telas para identificar genes necessários para a resposta imune celular18,19,20 ,21,22,23. No entanto, o desenvolvimento do ensaio fagocitose in vivo adulto habilitado experimentos de acompanhamento a efectuar facilmente em animais inteiros, permitindo assim que os investigadores para verificar o biológico o papel dos factores identificados em estudos in vitro. Tal foi o caso com o receptor do transmembrane comedor, que foi identificada pela primeira vez como um receptor bacteriano em uma tela de RNAi usando S2 células24 e então mais tarde mostrada para mediar a Escherichia coli (e. coli),, Enterococcus faecalis, e fagocitose de Staphylococcus aureus (S. aureus) em adultos25.
Nosso laboratório empregou o ensaio in vivo de fagocitose em telas de genéticas para a frente e estudos de associação de genoma-largo (usando o painel de referência genética drosófila (DGRP)) para identificar novos genes que regulam a fagocitose de hemócitos adultos. Estes estudos levaram à caracterização os receptores PGRP-SC1A e PGRP-SA26, a vesícula intracelular tráfico de proteína Rab1427, o glutamato transportador Polifemo28e RNA-proteína obrigatória Fox-129.
Nós antecipamos que futuras telas incorporando a fagocitose in vivo podem levar à identificação de genes adicionais que são importantes para a resposta imune celular em Drosophila. Telas usando linhas puras totalmente sequenciado, tais como o DGRP ou a drosófila sintético população recurso (DSPR), podem identificar variantes naturais que afectam a fagocitose ou hematócito desenvolvimento. Além disso, a técnica poderia ser adotada em outras espécies de Drosophila ou usada para recursos da comunidade nova tela, como a coleção de 250 espécies de Drosophila , mantido pelo nacional drosófila espécie Stock Center (NDSSC ) em Cornell. Estas experiências podem ser realizadas usando fluorescente-etiquetadas bacteriana ou fúngica-parede bioparticles que estão disponíveis comercialmente, ou podem ser realizadas usando qualquer número de espécies bacterianas ou fúngicas – desde que o micróbio expressa marcadores fluorescentes .
1. prepare as partículas de fluoresceína para injeção
2. preparar a estação de injeção e moscas
3. prepare agulhas capilar de vidro
4. injetar moscas
5. imagem de moscas
6. quantificar e normalizando a fluorescência

Um esquema do ensaio in vivo de fagocitose partículas de fluoresceína-etiquetado é mostrado na figura 1A. Moscas são montado lado ventral para baixo em um pedaço de fita isolante e os dois primeiros segmentos do abdome, onde se encontra o vaso dorsal, é claramente visível (figura 1B). Principais fontes de erro experimental surgem em etapas do processo (Figura 1) de imagem e a injeção. Usando a mesma agulha para injetar várias moscas possam causar-lhe ficar obstruídos com tecido voar ou partículas (painel superior esquerdo na Figura 1). Porque Drosophila autofluorescente sob luz GFP, moscas injetadas com uma agulha entupida serão fluorescem sumida mas falta a fluorescência clara, punctate de partículas internalizada pelos hemócitos. Outra potencial fonte de erro experimental pode ocorrer durante as injeções Trypan azul. Trinta minutos após a primeira injeção com partículas fluorescente-etiquetadas, moscas recebem uma segunda injeção com Trypan Blue, que sacia a fluorescência de partículas extracelulares, un-fagocitadas. Intensidade de fluorescência relativo para cada mosca é calculada dividindo-se a fluorescência do vaso dorsal pelo de uma área adjacente igualmente tamanho no abdômen. Moscas que não recebem suficiente azul Trypan fluorescem brilhantemente ao longo de seu abdômen inteiro (painel inferior esquerdo da Figura 1). Esta fluorescência pode reduzir a proporção do vaso dorsal para fluorescência de fundo, diminuindo assim a relação de intensidade de fluorescência verdadeiro do animal. Finalmente, moscas devem ser fotografadas enquanto imobilizados por CO2, como mover-se ativamente voa produzem imagens borradas que não podem ser quantificadas (superior e inferior, direito painéis da Figura 1).
A coleção de Zuker é um painel de Metanossulfonato de etila (EMS) Tratado voa com mutações autossômicas. 31 originalmente criado como um recurso comunitário, em 2004, as linhas têm sido utilizadas para realizar telas genéticas direta e inversa. Nosso laboratório identificou uma linha da coleção Zuker, o que não é capaz de fagocitar bactérias Gram-negativas (Escherichia coli estirpe de K-12) e bactérias gram-positivas (S. aureus madeira Coe sem proteína um) (Figura 2). Este mutante, chamado de argus, não mostra quase nenhuma fluorescência vaso dorsal no ensaio in vivo de fagocitose. Quando comparado com a tensão de fundo isogénicas Zuker, cn bw, argus mostra significativamente menos absorção de e. coli (p-valor = 0,019; Cohen d = 1.677) e S. aureus (p-valor = 0.0083; De Cohen d = 1.672). Argus fagocitose bacteriana também é significativamente prejudicada, Escherichia coli (p-valor = 0,045; De Cohen d = 0.850) e S. aureus (p-valor = 0.0136; De Cohen d = 1.422) quando comparado com outro comum laboratório controle cepa, Cantão-S.

Figura 1: Visão geral e imagens representativas de ensaio in vivo de fagocitose. R. esquemático do ensaio in vivo de fagocitose partículas de fluoresceína-rotulados. Duas injeções, 30 minutos, são usados para partícula visualizado reconhecimento e aceitação pelos glóbulos dorsais associada a embarcação. B. branco luz imagem mostrando uma mosca montada na fita, com segmentos abdominais anteriores claramente visíveis. C. exemplo em imagens de fagocitose vivo. (superior esquerdo) Uma mosca injectada com uma agulha entupida não tem nenhuma fluorescência de partícula. (canto inferior esquerdo) Uma mosca com alta fluorescência extracelular devido à insuficiente trypan azul. (superior direito) Uma mosca de imobilizar com nenhuma fluorescência extracelular – imagem ideal. (canto inferior direito) Uma mosca em movimento como CO2 anestesia desgasta fora cria uma imagem borrada. Barra de escala, 0,2 mm. clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: a fagocitose de bactérias mutantes e controle de moscas. R. imagens representativas das bactérias de fagocitose rotuladas com corante de fluoresceína; Escherichia coli (top painéis) e S. aureus (painéis de fundo). B. A relação de intensidade de fluorescência da voa injetado com fluoresceína - partículas deEscherichia coli . C. A relação de intensidade de fluorescência da voa injetado com fluoresceína - partículas deS. aureus . n = 3 experimentos para cada tipo de bactéria, com 6-8 moscas por experiência. Barras de erro, ± análise estatística SEM. = bicaudal t -teste. Barra de escala, 0,2 mm. clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores não têm nada para divulgar.
Este protocolo descreve um ensaio in vivo de fagocitose no adulto Drosophila melanogaster para quantificar o fagócito reconhecimento e apuramento das infecções microbianas.
Os autores agradecer Dr. Beth Gonzalez e Dr. Aprajita Garg apoio na realização dos experimentos in vivo de fagocitose. Um avanço de UMD NSF semente Grant UMD NIH T32 bolsas de formação, celular e Biologia Molecular (CMB) e as interações patógeno-hospedeiro (HPI), financiou este trabalho.
| 0.2μ m FluoSpheres modificados com carboxilato fluorescente vermelho | Invitrogen | F8810 | Grânulos de látex marcados com fluorescência para testar a capacidade fagocítica geral dos fagócitos. (~580/~605 nm) Injete uma diluição de 1:20 em PBS com corante a 5%. |
| 5430-10 Kit PicoNozzle | World Precision Instruments | 5430-10 | Suporte para pipeta de 1,0 mm |
| E. coli (cepa K-12) BioParticles, Alexa Fluor 488 conjugado | Invitrogen | E13231 | Morto E. coli marcado com Alexa Fluor 488. Use para testar o reconhecimento de fagócitos e a absorção de bactérias gram-negativas. (~495/~519 nm) |
| E. coli (cepa K-12) Biopartículas, conjugado Alexa Fluor 594 | Invitrogen | E23370 | Morto E. coli marcado com Alexa Fluor 594. Use para testar o reconhecimento de fagócitos e a absorção de bactérias gram-negativas. (~590/~617 nm) |
| E. coli (cepa K-12) Biopartículas, conjugado de fluoresceína | Invitrogen | E2861 | Morto E. coli marcado com FITC (fluoresceína). Use para testar o reconhecimento de fagócitos e a absorção de bactérias gram-negativas. (~ 494 / ~ 518 nm) |
| E. coli (cepa K-12) Biopartículas, conjugado Texas Red | Invitrogen | E2863 | Morto E. coli marcado com Texas Red. Use para testar o reconhecimento de fagócitos e a absorção de bactérias gram-negativas. (~ 595 / ~ 615 nm) |
| E. coli (cepa K-12) Biopartículas, conjugado Texas Red | Invitrogen | E2863 | Morto E. coli marcado com Texas Red. Use para testar o reconhecimento de fagócitos e a absorção de bactérias gram-negativas. (~ 595 / ~ 615 nm) |
| Extrator de pipetas de agulha | David Kopf Instruments | Modelo 725 | |
| pHrodo Red E. coli BioParticles Conjugado para fagocitose | Invitrogen | P35361 | Morto E. coli marcado com pHrodo Red. Use para testar a reconição de fagócitos, absorção e maturação de fagossomos de bactérias gram-negativas. (~ 560 / ~ 585 nm). Não há necessidade de temperar com Trypan Blue. |
| pHrodo Red S. aureus BioPartículas Conjugado para fagocitose | Invitrogen | A10010 | Morto S. aureus marcado com pHrodo Red. Use para testar a reconição de fagócitos, captação e maturação de fagossomos de bactérias gram-positivas. (~ 560 / ~ 585 nm). Não há necessidade de temperar com Trypan Blue. |
| Instrumentos pneumáticos | SYS-PV820 | da precisão do mundo de PicoPump | PV820 Os instrumentos pneumáticos PV820 da World Precision Instruments usam pressões diferenciais para guardar o líquido na agulha de vidro entre injeções. O usuário controla manualmente rajadas curtas de pressão de gás para expelir o líquido - permitindo a entrega de volumes sub-nanolitros. A quantidade de líquido fornecida depende de duas variáveis principais - o tamanho da abertura da agulha de vidro e a quantidade de tempo que a pressão de injeção é aplicada. Ajuste o instrumento para 100 ms " CRONOMETRADO" modo. |
| S. aureus (Cepa de madeira sem proteína A) Biopartículas, conjugado Alexa Fluor 488 | Invitrogen | S23371 | Morto S. aureus marcado com Alexa Fluor 488. Use para testar a reconhecimento de fagócitos e a absorção de bactérias gram-positivas. (~495/~519 nm) |
| S. aureus (Cepa de madeira sem proteína A) Biopartículas, conjugado Alexa Fluor 594 | Invitrogen | S23372 | Morto S. aureus marcado com Alexa Fluor 594. Use para testar a reconhecimento de fagócitos e a absorção de bactérias gram-positivas. (~590/~617 nm) |
| S. aureus (Cepa de madeira sem proteína A) Biopartículas, conjugado de fluoresceína | Invitrogen | E2851 | Morto S. aureus marcado com FITC (fluoresceína). Use para testar a reconhecimento de fagócitos e a absorção de bactérias gram-positivas. (~ 494 / ~ 518 nm) |
| Agulhas finas | dos instrumentosTW100F-3 | daprecisão do mundo | dos capilaresde vidro da parede para a injeção. OD = Solução |
| de Azul de Tripano de 1,0 mm (0,4%) | Sigma | T8154 | Usado para extinguir a fluorescência extracelular de partículas marcadas com Fluoresceína, Alexa Fluor ou Texas Red. |
| Microscópio ZEISS SteREO (Discovery.V8) | Zeiss | SteREO Discovery.V8 | Microscópio de fluorescência invertida para imagens de moscas. Use uma câmera digital (ex.ample: câmera AxioCam HC) e o software que a acompanha (ex.ample: software AxioVision 4.7) para tirar fotos. |
| Zymosan A (Saccharomyces cerevisiae) BioPartículas, Alexa Fluor 488 conjugado | Invitrogen | Z23373 | Morto marcado com Alexa Fluor 488. Use para testar o reconhecimento de fagócitos e a absorção de leveduras. (~495/~519 nm) |
| Biopartículas Zymosan A (Saccharomyces cerevisiae), conjugado Alexa Fluor 594 | Invitrogen | Z23374 | Morto marcado com Alexa Fluor 594. Use para testar o reconhecimento de fagócitos e a absorção de leveduras. (~590/~617 nm) |
| Zymosan A (Saccharomyces cerevisiae) Biopartículas, conjugado de fluoresceína | Invitrogen | Z2841 | Morto marcado com FITC (fluoresceína). Use para testar o reconhecimento de fagócitos e a absorção de leveduras. (~ 494 / ~ 518 nm) |
| Zymosan A (Saccharomyces cerevisiae) Biopartículas, Texas Red | Invitrogen | Z2843 | Morto marcado com Texas Red. Use para testar o reconhecimento de fagócitos e a absorção de leveduras. (~ 595 / ~ 615 nm) |